单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 701 - 720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
701 2026-03-25
Spatial transcriptomics reveals altered communities and drivers of aberrant epithelia and pro-fibrotic fibroblasts in interstitial lung diseases
2026-Mar-11, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了间质性肺疾病中远端肺的细胞网络变化,并识别了纤维化过程中的关键分子驱动因素 通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,首次全面描绘了间质性肺疾病中远端肺的细胞网络变化,并识别了异常上皮细胞和促纤维化成纤维细胞共定位的致病生态位 NA 探究间质性肺疾病中肺纤维化的细胞和分子机制 间质性肺疾病患者的远端肺组织 空间转录组学 间质性肺疾病 单核RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 NA NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
702 2026-03-25
AGPAT3 reshapes tumor cell vulnerability to IFNγ-mediated ferroptosis and enhances immunotherapy efficacy through lipid remodeling
2026-Mar-10, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了IFN-γ通过IRF1上调AGPAT3表达,驱动脂质重塑并增强肿瘤细胞对铁死亡的敏感性,从而提升免疫检查点抑制剂疗效 首次发现IFN-γ-IRF1-AGPAT3轴通过脂质重塑调控铁死亡敏感性,并构建了基于铁死亡相关基因的机器学习模型预测免疫治疗反应 未明确AGPAT3在不同肿瘤类型中的普适性,且临床样本验证需进一步扩大 探究铁死亡在增强免疫检查点抑制剂疗效中的作用机制 肿瘤细胞、单细胞RNA测序数据集、临床患者样本 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序、脂质组学、转录组学、ChIP-seq、CUT&Tag分析 机器学习预测模型 基因表达数据、脂质组数据、转录组数据 大规模单细胞RNA测序数据集及临床患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
703 2026-03-25
scGPT: end-to-end protocol for fine-tuned retinal cell type annotation
2026-03, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文提供了一个针对单细胞RNA测序数据中细胞类型分类的scGPT模型微调完整指南 提出了一套端到端的scGPT微调协议,实现了自动化数据处理、模型微调和评估,并在视网膜数据集上达到99.5%的F1分数 需要用户具备基本的生物信息学知识,对Python和Linux有最低要求 解决单细胞研究中高分辨率细胞类型注释的挑战,特别是针对大规模数据集和罕见细胞群体 单细胞RNA测序数据中的视网膜细胞类型 单细胞分析 NA 单细胞RNA测序 Transformer (scGPT) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
704 2026-03-25
An integrative multi-omics study reveals glutamine metabolism dysregulation connecting Alzheimer's disease and age-related macular degeneration
2026-Mar, Journal of Alzheimer's disease : JAD
研究论文 本研究采用整合多组学策略,揭示了谷氨酰胺代谢失调是连接阿尔茨海默病和年龄相关性黄斑变性的共同机制 首次通过整合孟德尔随机化、转录组学和靶向代谢组学,系统性地揭示了AD与AMD之间共享的谷氨酰胺代谢通路异常 研究主要基于动物模型(APP/PS1小鼠)和遗传推断数据,需要在人类临床样本中进行进一步验证 探索阿尔茨海默病与年龄相关性黄斑变性之间的共享代谢特征和通路 阿尔茨海默病(AD)和年龄相关性黄斑变性(AMD)两种神经退行性疾病 多组学整合分析 阿尔茨海默病, 年龄相关性黄斑变性 孟德尔随机化, 转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向代谢组学 孟德尔随机化模型, 差异表达分析 遗传数据, 转录组数据, 代谢组数据 APP/PS1小鼠模型(5月龄) NA 单细胞RNA-seq, 靶向代谢组学 NA NA
705 2026-03-25
Integrating Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Ischemic Injury Promoting Polyomavirus Replication by DNA Damage Response
2026-Mar, Journal of medical virology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示了缺血性损伤通过激活DNA损伤应答通路促进多瘤病毒复制的分子机制,并鉴定出CDK1为关键枢纽基因 首次结合单细胞与批量转录组数据,系统解析缺血性损伤促进BK多瘤病毒复制的分子通路,并跨物种验证CDK1的关键作用 研究主要基于测序数据的生物信息学分析,实验验证部分仅限于细胞水平的siRNA敲降,缺乏动物模型或临床样本的进一步验证 阐明缺血性损伤促进BK多瘤病毒复制的分子机制,寻找关键调控通路和基因 BK多瘤病毒(BKPyV)及其在肾移植患者中的再激活机制 生物信息学 肾移植相关病毒感染 单细胞RNA测序,批量RNA测序,siRNA敲降实验 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
706 2026-03-25
Systems Biology of Metabolic Dysregulation in Ankylosing Spondylitis Using scRNA-Seq Data
2026-Mar, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,通过构建基因组尺度代谢模型,分析了强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的代谢失调,并识别了关键的蛋白质相互作用网络重连 整合单细胞RNA测序与基因组尺度代谢模型,首次在强直性脊柱炎中系统量化免疫细胞类型的代谢通路活性和反应通量差异,并识别了跨细胞类型的重连蛋白质枢纽 研究基于外周血单个核细胞,可能无法完全反映疾病在关节等靶组织中的局部代谢变化,且样本量未明确说明 揭示强直性脊柱炎的免疫细胞代谢重编程机制,以发现转化治疗靶点和生物标志物 强直性脊柱炎患者和健康对照的外周血单个核细胞,包括CD14单核细胞、CD4记忆T细胞、CD4初始T细胞和CD8 T细胞等免疫细胞亚型 系统生物学 强直性脊柱炎 单细胞RNA测序 基因组尺度代谢模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
707 2026-03-25
Old Blood, Young Bones: Identification of Middle-Aged Myeloid Cells That Limit Cortical Bone Loss
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过骨髓移植实验和单细胞RNA测序分析,揭示了中年小鼠骨髓中CD11BCD36髓系细胞通过分泌Wnt配体(特别是Wnt6)增强皮质骨形成的机制 首次识别出中年骨髓中CD11BCD36髓系细胞作为促进皮质骨合成的关键细胞群,并发现其通过Wnt6信号通路发挥作用,这一发现在人类骨髓中同样适用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;未详细探讨中年髓系细胞在其他骨骼部位或疾病状态下的作用 探究中年阶段骨髓细胞对皮质骨流失的调控机制 8周和40周龄小鼠的骨髓细胞,以及人类骨髓样本 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),流式细胞术,显微CT分析,谱系追踪实验 NA 单细胞转录组数据,图像数据,流式细胞数据 使用8周和40周龄小鼠进行骨髓移植实验,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
708 2026-03-25
Unraveling the tapestry: Lessons from multi-omics and spatial biology in hepatocellular cancer
2026-Feb-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
综述 本文综述了空间组学技术在肝细胞癌研究中的应用进展,探讨了肿瘤微环境的空间结构如何影响疾病进展和治疗反应 整合了多种空间组学技术(转录组、蛋白质组、基因组、表观基因组、代谢组)来解析肝细胞癌的肿瘤微环境空间结构,揭示了传统批量或单细胞分析无法发现的细胞间通讯网络 NA 总结空间组学技术在肝细胞癌研究中的最新进展,探讨其转化应用前景 肝细胞癌的肿瘤微环境空间结构 空间生物学 肝细胞癌 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间基因组学、空间表观基因组学、空间代谢组学 NA 空间组学数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间基因组学, 空间表观基因组学, 空间代谢组学 NA NA
709 2026-03-25
Generating and characterizing human telencephalic brain organoids from stem cell-derived single neural rosettes
2026-02, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文开发了一种从干细胞衍生的单个神经玫瑰花结生成人端脑类器官的方法,并描述了相关实验协议 使用单个神经玫瑰花结生成类器官,模拟体内神经组织从单一神经管发育的过程,提供更一致和可重复的端脑神经细胞组成 协议完成需5-6个月,且需要细胞培养经验,可能限制了广泛适用性 研究人端脑中不同神经细胞的规范和组织,以及模拟与神经网络破坏相关的神经发育障碍 人端脑类器官、干细胞衍生的单个神经玫瑰花结、CRISPR-Cas9工程化人干细胞 数字病理学 神经发育障碍 单细胞RNA测序、免疫组织化学、切片膜片钳电生理学、CRISPR-Cas9基因编辑 类器官模型 基因表达数据、图像数据、电生理数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
710 2026-03-25
Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial
2026-01-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究是一项单臂前瞻性1b/2期临床试验,评估了改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗新辅助治疗在临界可切除胰腺导管腺癌患者中的安全性和病理反应率 首次在临界可切除PDAC患者中评估改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗的新辅助治疗方案,并展示了良好的安全性和病理反应率,同时通过探索性分析揭示了治疗后肿瘤微环境中浆细胞和CD8 T细胞的增加 研究为单臂设计,缺乏随机对照,样本量较小(28例患者),且为1b/2期试验,需要更大规模的随机试验验证结果 评估改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗新辅助治疗在临界可切除胰腺导管腺癌中的安全性和疗效 临界可切除胰腺导管腺癌患者 NA 胰腺导管腺癌 基因表达分析、免疫组织化学、空间转录组学 NA 临床数据、基因表达数据、免疫组织化学数据、空间转录组学数据 28例患者 NA 空间转录组学 NA NA
711 2026-03-25
Single-cell sequencing and network pharmacology coupled with molecular docking and experimental validation reveal the effects of YPFS on macrophages in stage I non-small cell lung cancer
2026-Jan-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究结合单细胞测序、网络药理学、分子对接和实验验证,揭示了玉屏风散(YPFS)对I期非小细胞肺癌(NSCLC)中巨噬细胞的影响 首次将单细胞测序与网络药理学、分子对接及实验验证相结合,系统研究了传统中药玉屏风散(YPFS)对NSCLC肿瘤微环境中巨噬细胞亚群极化的调控作用,并鉴定出关键靶点AHSA1及活性成分槲皮素 研究主要聚焦于I期NSCLC,未涵盖更晚期肿瘤;分子对接和体外实验的发现需进一步的体内实验和临床研究验证 探究I期非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤微环境中巨噬细胞的异质性,并评估传统中药玉屏风散(YPFS)对其极化的调控作用及潜在治疗价值 I期非小细胞肺癌(NSCLC)患者的肿瘤组织样本(用于单细胞测序),以及巨噬细胞系(用于实验验证) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),网络药理学,分子对接,体外细胞实验 NA 单细胞转录组数据,化合物结构数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
712 2026-03-25
Acute Phase Response-driven Hepatic Niche Remodeling Promotes Fibrosis Resolution After Alcohol Cessation
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,探究了酒精戒断后急性期反应驱动的肝微环境重塑如何促进纤维化消退的机制 首次通过空间转录组学识别了酒精戒断后肝内独特的纤维生成与纤维溶解微环境,并揭示了血清淀粉样蛋白A(SAA)通过HDL介导的巨噬细胞摄取促进纤维化消退的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;空间转录组学数据可能受技术分辨率限制;未全面评估长期戒断效果 探究酒精戒断后酒精相关性肝病(ALD)纤维化消退的分子与细胞机制 酒精相关性肝病(ALD)小鼠模型及人类肝组织样本 空间转录组学 酒精相关性肝病 空间转录组学、体外细胞分析、基因敲除模型 小鼠疾病模型 空间转录组学数据、基因表达数据 未明确指定样本数量,但涉及小鼠模型和人类肝样本 Nanostring 空间转录组学 CosMx 1000-plex CosMx空间转录组学检测
713 2026-03-25
Proteasome Assembly Chaperone 3 Defines Metabolic-Immune Programs and Poor Prognosis in Breast Cancer via Multi-Omics Approaches
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合多组学方法,揭示了蛋白酶体组装伴侣PSMG3在乳腺癌中的关键作用,其高表达与不良预后、代谢重编程及肿瘤免疫微环境特征相关 首次系统性地将PSMG3家族基因与乳腺癌的代谢-免疫程序及临床预后联系起来,并利用多队列基因组学、转录组学及单细胞RNA测序数据进行综合分析 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本数据来源于公共数据库,可能存在批次效应或选择偏倚 探究PSMG家族基因在乳腺癌中的作用,特别是PSMG3与临床预后、代谢通路及肿瘤免疫微环境的关系 乳腺癌患者的多组学数据,包括TCGA-BRCA、METABRIC及多个NCBI GEO队列 生物信息学 乳腺癌 RNA测序、单细胞RNA测序、基因集富集分析、免疫浸润分析、分子对接 生物信息学分析模型(如CIBERSORT、TIMER) 基因组数据、转录组数据 多个乳腺癌队列(具体样本数未明确说明) NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
714 2026-03-25
NUP85 as a Pan-Cancer Immune Biomarker: Integrated Multi Omics and Functional Analyses Reveal Its Role in Tumor Prognosis
2026, ImmunoTargets and therapy IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过多组学分析和功能验证,探讨NUP85作为泛癌免疫生物标志物在肿瘤预后中的作用 首次全面整合多组学数据和功能实验,揭示NUP85在肿瘤免疫和预后中的关键作用,特别是在增殖性T细胞中的表达特征 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接验证 阐明NUP85在癌症发病机制中的潜在作用,探索其作为肿瘤标志物的价值 多种肿瘤类型,重点关注肺腺癌和口腔鳞状细胞癌的细胞系 生物信息学 泛癌研究 多组学分析,包括转录组、蛋白质组、表观遗传组和单细胞测序 NA 多组学数据,包括基因表达、蛋白质表达、甲基化、拷贝数变异等 基于TCGA、GTEx、CPTAC等多个公共数据库的大规模样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,多组学分析 NA NA
715 2026-03-25
Integrative Multi-Omics and Single-Cell Profiling Identify Chitinase Domain Containing Protein 1 (CHID1) as a Prognostic Biomarker in Glioblastoma
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合多组学和单细胞分析,鉴定CHID1作为胶质母细胞瘤的预后生物标志物 首次全面探索CHID1在胶质母细胞瘤中的表达模式及其与代谢和氧化还原相关通路的关联 研究主要基于生物信息学分析,缺乏深入的实验验证 探究CHID1在胶质母细胞瘤中的表达、功能及其作为预后标志物的潜力 胶质母细胞瘤患者样本及正常脑组织 生物信息学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、转录组学分析、分子对接 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 TCGA-GBM和CGGA数据集中的胶质母细胞瘤样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
716 2026-03-25
Spatial Omics in Gastrointestinal Oncology: Recent Advances, Therapeutic Insights, and Clinical Translation
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
综述 本文综述了空间组学技术在胃肠道肿瘤学中的最新进展、治疗见解及临床转化应用 整合了空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学和表观基因组学等多组学技术,以高分辨率解析肿瘤微环境,揭示空间定义的生态位,为个性化治疗提供新视角 面临标准化、数据整合和临床验证等挑战,尚未完全融入常规肿瘤学实践 探讨空间组学技术在胃肠道肿瘤诊断、治疗分层和疗效监测中的应用潜力 胃肠道癌症,包括结直肠癌、胃癌和食管癌 数字病理学 胃肠道癌症 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间表观基因组学 NA 空间多组学数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间表观基因组学 NA NA
717 2026-03-25
Mapping Myeloid Cell Diversity in Diffuse Large B-Cell Lymphoma: Impact on T Cell Exhaustion and Clinical Prognosis
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞测序技术分析了超过3000名弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的免疫微环境,揭示了恶性B细胞和髓系细胞的多样性及其与临床预后的关联 利用单细胞测序技术大规模描绘DLBCL肿瘤微环境中的髓系细胞多样性,并发现巨噬细胞与CD8 T细胞间的相互作用可能导致T细胞耗竭,为免疫抑制微环境提供了新见解 研究主要基于单细胞和RNA表达微阵列数据的回顾性分析,缺乏实验验证和前瞻性临床研究 研究弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中的免疫细胞多样性及其对临床预后的影响 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者肿瘤组织中的恶性B细胞和髓系细胞 数字病理学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 单细胞测序,RNA表达微阵列 NA 单细胞数据,RNA表达数据 超过3000名DLBCL患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
718 2026-03-25
CellPhoneDB v5: inferring cell-cell communication from single-cell multiomics data
2025-12, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文介绍了CellPhoneDB v5,一个用于从单细胞多组学数据推断细胞间通信的生物信息学工具包 扩展了配体-受体相互作用库,新增约1000个非肽类配体介导的相互作用;引入了新的数据库查询方式,允许用户根据实验设计定制查询;整合了新的策略,利用空间转录组学或单细胞ATAC-seq数据优先考虑特定细胞间相互作用;新增了CellPhoneDBViz模块用于交互式可视化和结果共享 需要基本的Python知识,且协议执行时间约为15分钟,可能对非专业用户有一定门槛 开发并优化一个生物信息学工具包,以从单细胞多组学数据中推断细胞间通信 单细胞多组学数据,包括配体-受体相互作用、空间转录组学和单细胞ATAC-seq数据 生物信息学 NA 单细胞多组学分析、空间转录组学、单细胞ATAC-seq NA 单细胞多组学数据、空间转录组学数据、单细胞ATAC-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 NA NA
719 2026-03-25
Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过条件性敲除小鼠模型,探讨了PRMT5在表皮发育中的作用,揭示了其通过抑制Cdkn1a防止基底角质形成细胞衰老的机制 首次在体内模型中证明PRMT5通过表观遗传调控防止基底角质形成细胞衰老,并鉴定出一类非典型的基底角质形成细胞样细胞群 研究主要基于小鼠模型,人类皮肤疾病中的直接应用仍需进一步验证 探究PRMT5在表皮发育和分层过程中的功能及其在先天性皮肤疾病中的作用 条件性敲除Prmt5的小鼠表皮细胞 表观遗传学 先天性皮肤疾病 单细胞RNA测序,ATAC-seq 条件性敲除小鼠模型 单细胞转录组数据,染色质可及性数据 条件性敲除小鼠表皮组织 NA 单细胞RNA-seq,ATAC-seq NA NA
720 2026-03-25
Microplastic exposure elicits sex-specific atherosclerosis development in lean low-density lipoprotein receptor-deficient mice
2025-Dec, Environment international IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了环境相关剂量微塑料暴露对低密度脂蛋白受体缺陷小鼠动脉粥样硬化发展的性别特异性影响 揭示了微塑料暴露在瘦小鼠中诱导性别特异性动脉粥样硬化发展的新现象,并通过单细胞RNA测序提供了机制性见解 研究仅使用小鼠模型,且暴露剂量和持续时间可能无法完全模拟人类长期低剂量暴露情况 评估微塑料暴露对心血管系统的影响,特别是动脉粥样硬化的发展 低密度脂蛋白受体缺陷小鼠(雄性和雌性)以及原代内皮细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序 动物模型(小鼠) 基因表达数据 低密度脂蛋白受体缺陷小鼠群体(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部