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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-12-25 |
Single-cell analysis of differential fat deposition in chicken pectoral muscle and abdominal fat tissues
2025-Dec, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105938
PMID:41108936
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了固始鸡胸肌和腹部脂肪组织的细胞类型和分子特征,揭示了脂肪沉积的组织特异性差异 | 首次在固始鸡中应用单细胞RNA测序技术比较胸肌和腹部脂肪组织的细胞类型特异性基因表达,并验证了G0S2基因在腹部脂肪细胞中的特异性促脂肪生成作用 | 研究仅针对2周龄鸡的组织样本,未涵盖其他发育阶段;样本量有限,且仅针对固始鸡一个品种 | 探究固始鸡胸肌和腹部脂肪沉积的机制差异 | 固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 2周龄固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 702 | 2025-12-25 |
Decoding the B-cell immune landscape in duck hepatitis A virus type 3 through single-cell genomics
2025-Dec, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105929
PMID:41056664
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和B细胞受体分析,解码了鸭甲型肝炎病毒3型感染下小鼠脾脏B细胞的免疫景观 | 创新性地识别了一个新的IGHV1种系克隆IGHV1-20,并发现了一个新的B细胞亚群Gm37915+ B细胞与Nuggc+ B细胞之间增强的细胞通讯趋势 | 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映鸭或其他物种中的免疫反应,且样本量未明确说明 | 探索DHAV-3免疫机制并识别潜在治疗靶点 | 用DHAV-3免疫的小鼠脾脏B细胞 | 单细胞基因组学 | 鸭病毒性肝炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),B细胞受体(BCR)文库分析 | NA | 单细胞基因表达数据,BCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 703 | 2025-12-25 |
Stress-Induced Disruption of Circadian and Neuroimmune Networks in Lacrimal Glands Drives Dry Eye Pathogenesis
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.15.53
PMID:41400313
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研究论文 | 本研究探讨了慢性心理压力如何通过破坏泪腺的昼夜节律和神经免疫网络,驱动干眼病的发病机制 | 揭示了慢性压力导致泪腺中核心时钟振荡器保持完整但节律基因表达丧失的“昼夜节律输出解耦”现象,并明确了神经内分泌信号在其中的关键作用 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别差异;且干预措施仅部分恢复了节律和功能 | 研究慢性压力如何改变泪腺的昼夜节律调控及神经内分泌信号在压力诱导干眼病中的作用 | 雄性C57BL/6J小鼠的泪腺组织 | 生物医学研究 | 干眼病 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、组织学、免疫组化、血浆激素检测 | JTK_CYCLE算法 | RNA测序数据、组织图像、激素水平数据 | 未明确具体数量,但涉及多时间点采集的泪腺组织 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 704 | 2025-12-25 |
Single-cell transcriptome analyses reveal disturbed decidual microenvironment in women of advanced maternal age
2025-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70541
PMID:41407538
|
研究论文 | 本研究通过整合组织学、类器官模型和高分辨率单细胞RNA测序,揭示了高龄产妇蜕膜微环境的病理重塑特征 | 首次提供了高龄产妇人类蜕膜的单细胞图谱,并鉴定出PRR15-TGF-β轴这一新的调控通路 | 研究样本仅限于孕早期蜕膜组织,未涵盖整个妊娠期变化 | 表征高龄产妇的蜕膜微环境,以确定关键病理变化和调控通路 | 高龄产妇和适龄产妇的孕早期蜕膜组织 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 高龄产妇和适龄产妇的蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 高分辨率单细胞RNA测序 |
| 705 | 2025-12-23 |
Correction to "Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal a Novel Mechanism of Oligodendrocyte-Neuron Interaction in Cognitive Decline After High-Altitude Cerebral Edema"
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70723
PMID:41424021
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 706 | 2025-12-25 |
Roxadustat enhances inflammation and metabolic reprogramming in human leukocytes by affecting oxygen sensing
2025-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf167
PMID:40796302
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研究论文 | 本研究探讨了罗沙司他对人类外周血单个核细胞的影响,重点关注其通过影响氧感应机制增强炎症反应和代谢重编程的作用 | 首次在临床相关浓度下系统评估罗沙司他对人类PBMCs的免疫调节作用,结合单细胞RNA测序揭示白细胞亚群动态变化,并模拟炎症性缺氧条件探索联合效应 | 研究主要基于体外实验,未在体内模型或患者中验证;样本量有限;未长期观察罗沙司他的免疫效应 | 探究HIF稳定剂罗沙司他对循环白细胞免疫活性和代谢的影响 | 人类外周血单个核细胞(PBMCs) | 免疫学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序,蛋白质和基因表达分析,氧消耗和细胞外酸化率测定 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 707 | 2025-12-25 |
Phylogenomic Analysis of Deep-Branching Telonemid
2025-Nov-28, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaf202
PMID:41157959
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序和系统基因组分析,探讨了Telonemia门中TEL2亚群新物种对真核生物超群演化关系的影响 | 首次从太平洋远洋中分离出Telonemia门TEL2亚群的单细胞,并利用单细胞转录组测序数据填补了该门系统基因组数据的空白 | 贝叶斯分析未能收敛于特定拓扑结构,且不同数据子集分析结果存在不一致性,表明演化关系仍不稳定 | 研究Telonemia门与SAR超群及其他稀疏采样真核生物超群(如Hemimastigophora、Provora、Haptista)的演化关系 | Telonemia门中的TEL2亚群单细胞样本 | 系统基因组学 | NA | 单细胞转录组测序、系统基因组分析、最大似然法、贝叶斯分析 | NA | 转录组序列数据 | 1个从太平洋远洋分离的Telonemia门TEL2亚群单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 708 | 2025-12-25 |
Injury-induced connexin 43 expression regulates endothelial wound healing
2025-Nov-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00153.2025
PMID:41060772
|
研究论文 | 本研究揭示了机械损伤诱导连接蛋白43(Cx43)上调,并通过间隙连接介导的细胞间通讯促进内皮细胞迁移和增殖,从而加速血管损伤后的伤口愈合 | 首次证明大动脉内皮机械损伤可诱导间隙连接蛋白Cx43表达,并阐明其磷酸化依赖的调控机制在内皮愈合中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类血管组织中得到验证;单细胞测序样本量相对有限(10,829个细胞) | 探究Cx43在血管内皮损伤修复中的分子机制 | 小鼠颈动脉内皮细胞 | 分子生物学 | 血管疾病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq | 基因敲除小鼠模型,点突变小鼠模型 | 基因表达数据 | 10,829个细胞(来自野生型和Cx43敲除小鼠的损伤颈动脉) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 709 | 2025-12-25 |
How to drug a leukemic stem cell: deciphering heterogeneity for better specificity
2025-Nov, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2025.100146
PMID:41424935
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综述 | 本文综述了白血病干细胞(LSCs)的独特生物学特性,探讨了其异质性对药物靶点发现的影响以及单细胞测序等技术如何帮助解决这一问题 | 通过整合全球和亚型特异性特征,系统总结了LSCs的生物学特性,并强调了单细胞测序等技术在解析异质性、推动LSC特异性治疗方面的创新应用 | 作为一篇综述,本文未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行总结,可能无法涵盖所有最新研究进展 | 探讨如何针对白血病干细胞(LSCs)开发特异性治疗方法,以预防或治疗急性髓系白血病(AML)的复发 | 白血病干细胞(LSCs),特别是其在急性髓系白血病(AML)复发中的作用 | NA | 白血病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 710 | 2025-12-25 |
CMV-specific clonal expansion of Th1, GZMK+ CD8+, and TEMRA T cells revealed by human PBMC single cell profiling
2025-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.661167
PMID:40666903
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序等技术系统揭示了人类巨细胞病毒(CMV)感染引起的免疫细胞克隆性扩增特征 | 首次发现GZMK+ CD8+ T细胞和Th1细胞是CMV特异性克隆扩增的新组分,并开发了CMVerify预测模型 | 研究主要基于外周血样本,未直接检测组织驻留免疫细胞;队列样本量相对有限 | 系统解析CMV感染引起的免疫系统重塑特征 | 人类外周血单个核细胞(PBMC) | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,流式细胞术 | 预测模型(CMVerify) | 单细胞转录组数据,TCR序列数据,蛋白质表达数据 | 六个独立人类队列(包含两个新建队列) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 711 | 2025-12-25 |
Epigenomic subtypes of late-onset Alzheimer's disease reveal distinct microglial signatures
2025-Aug-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7232080/v1
PMID:40799738
|
研究论文 | 本研究通过分析死后脑组织的全基因组DNA甲基化数据,识别了晚发性阿尔茨海默病的两种表观基因组亚型,并揭示了它们与特定小胶质细胞特征和功能通路的关联 | 首次在晚发性阿尔茨海默病中识别出两种一致的表观基因组亚型,并深入揭示了它们与特定小胶质细胞炎症状态和功能通路的关联,为疾病异质性提供了新的分子机制见解 | 研究基于死后脑组织样本,可能无法完全反映疾病早期或活体状态下的表观遗传变化,且样本量相对有限 | 识别晚发性阿尔茨海默病的表观基因组亚型,并探索其与细胞类型特异性甲基化、基因表达以及临床病理特征的关系 | 晚发性阿尔茨海默病患者的死后脑组织样本 | 表观基因组学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组DNA甲基化分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | 无监督聚类方法 | DNA甲基化数据、RNA-seq数据 | 831个死后脑组织样本,来自三个独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 712 | 2025-12-25 |
Identifying Combinatorial Regulatory Genes for Cell Fate Decision via Reparameterizable Subset Explanations
2025-Aug, KDD : proceedings. International Conference on Knowledge Discovery & Data Mining
DOI:10.1145/3711896.3737000
PMID:41426294
|
研究论文 | 本文提出了一种名为MetaVelo的全局特征解释框架,用于识别影响细胞命运转变的关键调控基因组合 | 通过将问题重新参数化为可控数据生成过程,克服了细胞命运动力学的不可微性挑战,并能够区分独立与协同调控基因 | 未在摘要中明确说明 | 识别调控细胞命运决定的组合基因 | 细胞命运决定过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经常微分方程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 713 | 2025-12-25 |
Multiplexed single-cell transcriptomics reveals diverse phenotypic outcomes for pathogenic SHP2 variants
2025-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.30.662374
PMID:40631144
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学、蛋白质生物化学、结构分析和细胞生物学,揭示了致病性SHP2变异如何失调信号传导,并阐明了不同突变类型对细胞状态的多样化影响 | 首次在单细胞水平系统比较了临床多样性SHP2变异对基因表达的影响,发现催化活性丧失并不等同于基因敲除的表型,揭示了不同突变机制可能产生趋同表型效应,而同一热点残基的不同突变可导致截然不同的细胞状态 | 研究主要基于体外细胞模型,尚未在动物模型或临床样本中全面验证;单细胞转录组分析可能未完全捕捉蛋白质水平和功能层面的变化 | 阐明致病性SHP2变异如何通过结构扰动影响细胞信号传导和基因表达,从而理解其与人类疾病的关联 | 表达临床多样性SHP2变异(包括增强催化活性、失活型和影响蛋白质相互作用的突变)的细胞 | 单细胞组学 | 发育障碍(如努南综合征)和多种癌症 | 单细胞转录组测序、蛋白质生物化学、结构分析、细胞生物学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质结构数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体细胞数量,但涉及表达多种临床SHP2变异的细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 714 | 2025-12-25 |
SPP1+ macrophages in tumor immunosuppression: mechanisms and therapeutic implications
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1711015
PMID:41425545
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综述 | 本文综述了SPP1+巨噬细胞在肿瘤免疫抑制中的作用机制及其治疗意义 | 系统总结了SPP1+巨噬细胞作为跨多种癌症类型的关键免疫抑制性细胞亚群的最新研究进展,并强调了靶向该亚群作为新兴治疗策略的潜力 | 本文为综述性文章,主要基于现有文献进行总结,未提供新的原始实验数据 | 阐明SPP1+巨噬细胞在肿瘤微环境中的分化机制、免疫抑制功能及作为治疗靶点的潜力 | SPP1+巨噬细胞及其在多种人类恶性肿瘤中的作用 | 肿瘤免疫学 | 多种癌症类型 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 715 | 2025-12-25 |
Neutrophil-mediated immune dysregulation in recurrent miscarriage: implications of APP-CD74 signaling and CXCL1 as diagnostic biomarkers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707497
PMID:41425547
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和单细胞RNA测序,揭示了中性粒细胞在复发性流产中的免疫失调作用,并识别了APP-CD74信号轴和CXCL1作为潜在诊断生物标志物 | 首次深入探索中性粒细胞在复发性流产中的先天免疫角色,并识别了TNF-α驱动的极化表型及APP-CD74信号轴作为关键通路 | 研究主要基于转录组和单细胞数据,实验验证主要在滋养层细胞中进行,缺乏体内模型验证 | 探究复发性流产中中性粒细胞介导的免疫失调机制,并寻找诊断生物标志物 | 复发性流产患者、自身免疫疾病数据、蜕膜组织单细胞数据、滋养层细胞 | 数字病理学 | 复发性流产 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 716 | 2025-12-25 |
Histone-related gene WDR77 promotes tumor progression through cell cycle regulation in skin cutaneous melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1611112
PMID:41425556
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,识别了组蛋白相关基因WDR77作为皮肤黑色素瘤的关键预后生物标志物和功能调节因子 | 首次整合10种机器学习算法构建了101个预后模型,并识别出WDR77作为皮肤黑色素瘤中与细胞周期失调相关的关键组蛋白修饰基因 | 研究主要基于生物信息学分析,体外实验验证有限,缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 | 探索组蛋白相关基因在皮肤黑色素瘤中的预后价值和功能机制 | 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者样本和细胞系 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组测序,单细胞转录组学,空间转录组学 | 随机森林,多种机器学习算法集成 | 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 | TCGA-SKCM数据集和五个GEO数据集中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 717 | 2025-12-25 |
Integration of single-cell and bulk RNA-seq via machine learning to reveal ferroptosis- and lipid metabolism-driven immune landscape heterogeneity and predict immunotherapy response in colon cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1699079
PMID:41425595
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据,利用机器学习揭示了结肠癌中铁死亡和脂质代谢驱动的免疫景观异质性,并预测了免疫治疗反应 | 首次整合单细胞和批量RNA-seq数据,结合铁死亡和脂质代谢相关基因,通过多种机器学习算法构建预后模型,并预测免疫治疗反应 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型在临床中的实际应用效果 | 探索结肠癌中铁死亡与脂质代谢的相互作用,建立预后模型以阐明免疫微环境异质性,并评估免疫治疗前景 | 结肠癌患者 | 机器学习 | 结肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化 | 支持向量机, 随机森林, 极端梯度提升, LASSO回归 | 转录组测序数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的转录组和单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 718 | 2025-12-25 |
Identification of a ubiquitin-binding domain protein, CD2AP, in predicting the prognosis and treatment of lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1726531
PMID:41425578
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析与实验验证,识别出CD2AP作为肺腺癌的关键预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次系统性地将CD2AP鉴定为肺腺癌中与泛素化相关的关键致癌蛋白,并揭示了其通过调节肿瘤细胞与单核/巨噬细胞间通讯影响肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,缺乏大规模临床队列验证和体内动物模型实验 | 识别肺腺癌中关键的泛素化相关调控因子并探究其临床意义 | 肺腺癌组织样本、A549细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 转录组测序、蛋白质组学、单细胞RNA测序、qPCR、Western Blot、免疫荧光 | 分子对接模型 | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库的肺腺癌样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 719 | 2025-12-25 |
Advancing breast cancer biomarkers: a centromere-related gene signature integrated with single-cell analysis for prognostic prediction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1678603
PMID:41425594
|
研究论文 | 本研究整合多组学数据,首次建立了一个基于着丝粒蛋白(CENP)的乳腺癌预后模型,用于风险分层并识别新的生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次建立基于CENP家族的乳腺癌预后模型,结合单细胞RNA测序分析揭示了CENPA高表达亚群与增殖性肿瘤细胞及免疫抑制微环境的关联 | NA | 开发一个基于着丝粒相关基因特征的预后预测模型,以改善乳腺癌(特别是三阴性乳腺癌)的分子分层和个性化治疗 | 乳腺癌患者,重点关注三阴性乳腺癌亚型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA转录组分析,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,Cox回归,LASSO算法 | 预后风险模型(基于Cox回归和LASSO) | RNA转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 720 | 2025-12-25 |
SULF1's Role in Endothelial Senescence and Atherosclerosis: Insights from Single-Cell and Bulk Transcriptomics
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S544852
PMID:41426245
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组学分析,揭示了SULF1在动脉粥样硬化内皮细胞衰老中的关键作用 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,首次在动脉粥样硬化背景下识别出SULF1作为内皮细胞衰老的关键基因,并通过体内外实验验证其功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类样本验证有限,且未深入探讨SULF1的具体作用机制 | 探究动脉粥样硬化中内皮细胞衰老的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化斑块组织、ApoE-/-小鼠、人主动脉内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA敲低, Western印迹, RT-qPCR, β-半乳糖苷酶染色 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 动脉粥样硬化斑块及邻近正常组织的单细胞RNA测序数据、早期和晚期斑块的批量RNA测序数据、ApoE-/-小鼠模型、ox-LDL处理的人主动脉内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |