单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7161 - 7180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7161 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Lymph Node Stromal Cells Reveals Niche-Associated Heterogeneity
2018-05-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.04.006
PMID:29752062
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示淋巴结基质细胞的异质性及其在免疫微环境中的功能 | 首次使用液滴单细胞RNA测序技术系统鉴定出9个淋巴结非内皮基质细胞亚群，包括多个新型基质细胞类型 | 研究仅关注外周淋巴结，未涉及其他淋巴组织；单细胞测序技术本身存在技术限制 | 解析淋巴结基质细胞的多样性及其在免疫微环境中的功能 | 小鼠外周淋巴结基质细胞 | 单细胞组学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴单细胞RNA测序平台 |
| 7162 | 2025-10-06 |
Parental haplotype-specific single-cell transcriptomics reveal incomplete epigenetic reprogramming in human female germ cells
2018-05-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-04215-7
PMID:29760424
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示人类女性生殖细胞中不完全的表观遗传重编程过程 | 首次结合外显子组测序和单细胞RNA测序，重建完整亲本单倍型并量化全基因组范围内的亲本等位基因特异性表达变化 | 研究仅包含五名供体样本，样本量相对有限 | 探究人类女性生殖细胞中转录和表观遗传重塑的复杂性和细胞间异质性 | 人类女性生殖细胞（包括原始生殖细胞、减数分裂前和减数分裂期细胞） | 单细胞生物学 | NA | 外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 五名人类供体的生殖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7163 | 2025-10-06 |
Whole-Body Single-Cell Sequencing Reveals Transcriptional Domains in the Annelid Larval Body
2018-05-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msx336
PMID:29373712
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研究论文 | 通过全幼虫单细胞测序揭示了环节动物幼虫体内的转录域结构 | 首次在环节动物幼虫中通过全身体单细胞测序识别出基于差异基因表达的空间转录域 | 研究仅针对海洋环节动物Platynereis dumerilii的幼虫阶段 | 表征整个动物体内的细胞身份和空间转录组织 | 海洋环节动物Platynereis dumerilii的幼虫细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，全胚胎原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，空间表达数据 | 从全幼虫中随机挑选的单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7164 | 2025-10-06 |
Identification of spatial expression trends in single-cell gene expression data
2018-05, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4634
PMID:29553578
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研究论文 | 提出了一种基于标记点过程的trendsceek方法，用于识别具有显著空间表达趋势的基因 | 开发了基于标记点过程的创新计算方法，能够识别空间基因表达数据中的统计显著表达趋势 | NA | 开发计算分析策略来处理单细胞分辨率空间基因表达数据 | 空间转录组数据、连续荧光原位杂交数据和单细胞RNA-seq数据的低维投影 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、连续荧光原位杂交、单细胞RNA-seq | 标记点过程 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 荧光原位杂交 | NA | NA |
| 7165 | 2025-10-06 |
Sensitivity to sequencing depth in single-cell cancer genomics
2018-04-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-018-0537-2
PMID:29661213
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞癌症基因组数据，评估测序深度对变异检测敏感性的影响 | 首次系统评估单细胞癌症基因组测序中测序深度对变异检测、克隆推断和系统发育重建的影响 | 研究基于已发表的五个数据集，可能受原始数据质量和特定癌症类型的限制 | 探索单细胞癌症基因组测序中成本效益最优的测序策略 | 单细胞癌症基因组数据集 | 单细胞基因组学 | 癌症 | 单细胞全基因组测序, 单细胞全外显子组测序 | NA | 基因组测序数据 | 5个单细胞癌症数据集，共生成6280个单细胞BAM文件 | NA | 单细胞全基因组测序, 单细胞全外显子组测序 | NA | NA |
| 7166 | 2025-10-06 |
Early emergence of cortical interneuron diversity in the mouse embryo
2018-04-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aar6821
PMID:29472441
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了小鼠胚胎中皮质中间神经元多样性的早期起源机制 | 首次在胚胎期神经节隆起中识别出具有时空限制性转录模式的祖细胞和新生神经元类型 | 研究仅限于小鼠模型，未验证其他物种的普适性 | 探究哺乳动物大脑皮质中间神经元多样性的发育起源 | 小鼠胚胎期神经节隆起的祖细胞和新生神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7167 | 2025-10-06 |
The use of single-cell RNA-Seq to understand virus-host interactions
2018-04, Current opinion in virology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.coviro.2018.03.001
PMID:29558678
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综述 | 本文探讨了利用单细胞RNA测序技术揭示病毒-宿主相互作用的研究进展 | 通过单细胞转录组分析揭示病毒感染过程中的细胞异质性和特定细胞亚群表型 | NA | 理解病毒与宿主之间的相互作用机制 | 病毒感染过程中的细胞异质性 | 生物信息学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7168 | 2025-10-06 |
Repurposing Tin Mesoporphyrin as an Immune Checkpoint Inhibitor Shows Therapeutic Efficacy in Preclinical Models of Cancer
2018-04-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-17-2587
PMID:29339440
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研究论文 | 本研究评估了锡中卟啉作为免疫检查点抑制剂在癌症治疗中的疗效 | 首次将锡中卟啉重新用作免疫检查点抑制剂，靶向血红素加氧酶-1以增强化疗引发的抗肿瘤免疫反应 | 临床前研究阶段，尚未进行人体临床试验 | 评估锡中卟啉作为免疫检查点阻断疗法在癌症治疗中的疗效 | 乳腺癌小鼠模型和人类乳腺癌患者数据 | 免疫肿瘤学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，肿瘤微阵列分析 | NA | 基因表达数据，临床生存数据 | 乳腺癌患者临床数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序，微阵列分析 | NA | NA |
| 7169 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals hidden transcriptional variation in malaria parasites
2018-03-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.33105
PMID:29580379
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了疟原虫中隐藏的转录变异 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于单细胞生物疟原虫，发现了生命周期中隐藏的离散转录特征和性别特异性表达模式 | 研究仅针对疟原虫特定种类，样本数量相对有限（500多个个体） | 探究单细胞水平上疟原虫的转录变异特征 | 啮齿类和人类疟原虫，包括无性和有性生活周期阶段 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 500多个个体疟原虫 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7170 | 2025-10-06 |
Defining the Transcriptional Landscape during Cytomegalovirus Latency with Single-Cell RNA Sequencing
2018-03-13, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.00013-18
PMID:29535194
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人巨细胞病毒潜伏感染期间的转录组景观 | 颠覆了传统对疱疹病毒潜伏期相关基因表达程序的认识，发现潜伏期基因表达主要体现为定量变化而非定性变化 | 研究主要基于实验性潜伏模型，自然感染环境下的验证仍需进一步研究 | 阐明人巨细胞病毒潜伏感染期间的病毒基因表达特征 | 人巨细胞病毒在造血细胞中的潜伏感染 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 转录组RNA测序 | NA | RNA测序数据 | GTEx项目生成的大规模转录组图谱 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7171 | 2025-10-06 |
Defining the earliest step of cardiovascular lineage segregation by single-cell RNA-seq
2018-03-09, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aao4174
PMID:29371425
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠心血管祖细胞在早期发育阶段的谱系分离机制 | 首次在单细胞水平上定义了心血管祖细胞从多能状态退出的最早步骤，并识别了与不同心脏区域和细胞谱系承诺相关的分子特征 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 阐明心血管祖细胞早期区域和谱系分离的分子调控机制 | 野生型和Mesp1缺失型小鼠的心血管祖细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠心血管祖细胞单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7172 | 2025-10-06 |
Observation weights unlock bulk RNA-seq tools for zero inflation and single-cell applications
2018-02-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1406-4
PMID:29478411
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研究论文 | 本文提出一种基于零膨胀负二项模型的加权策略，使传统bulk RNA-seq差异表达分析方法适用于单细胞RNA测序数据 | 开发了基因和细胞特异性权重策略，首次实现将传统bulk RNA-seq工具应用于零膨胀的单细胞RNA测序数据 | NA | 解决单细胞RNA测序中零膨胀导致的差异表达分析能力下降问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7173 | 2025-10-06 |
scNMT-seq enables joint profiling of chromatin accessibility DNA methylation and transcription in single cells
2018-02-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-03149-4
PMID:29472610
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研究论文 | 开发了一种可同时分析单细胞染色质可及性、DNA甲基化和转录组的测序方法 | 首次实现了在单细胞水平上同时分析三种分子层面（染色质可及性、DNA甲基化和转录组）的方法 | NA | 研究表观基因组与转录组之间的调控关系 | 小鼠胚胎干细胞分化过程 | 表观基因组学 | NA | scNMT-seq, GpC甲基转移酶标记, 亚硫酸氢盐测序, RNA测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | scNMT-seq（单细胞核小体、甲基化和转录测序） |
| 7174 | 2025-10-06 |
A molecular atlas of cell types and zonation in the brain vasculature
2018-02-22, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature25739
PMID:29443965
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研究论文 | 通过血管单细胞转录组学绘制小鼠大脑血管系统的细胞类型和分区图谱 | 首次在分子水平定义大脑血管主要细胞类型，揭示沿动静脉轴的连续表型变化模式，发现内皮细胞与壁细胞的连续模式差异 | 研究仅限于成年小鼠模型，人类血管系统可能存在差异 | 解析大脑血管系统的细胞组成和组织结构 | 成年小鼠大脑血管系统 | 单细胞生物学 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 成年小鼠大脑血管细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7175 | 2025-10-06 |
Graded Arrays of Spinal and Supraspinal V2a Interneuron Subtypes Underlie Forelimb and Hindlimb Motor Control
2018-02-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2018.01.023
PMID:29398364
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研究论文 | 本研究揭示了脊髓V2a中间神经元的分级阵列结构及其在前肢和后肢运动控制中的作用机制 | 首次发现V2a中间神经元存在I型和II型两种主要类型，并呈反向梯度分布，揭示了脊髓不同节段运动输出的特异性处理机制 | 研究主要基于发育过程中的观察，对成年后该系统的功能维持和可塑性需要进一步验证 | 探究脊髓中控制肢体运动的神经回路组织结构 | 小鼠脊髓V2a中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7176 | 2025-10-06 |
Defining murine organogenesis at single-cell resolution reveals a role for the leukotriene pathway in regulating blood progenitor formation
2018-02, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-017-0013-z
PMID:29311656
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序绘制小鼠原肠胚形成后器官发生的细胞图谱，揭示白三烯途径在血液祖细胞形成中的调控作用 | 首次在原肠胚形成后阶段(E8.25)对小鼠发育进行大规模单细胞转录组分析，识别出20种主要细胞类型及其亚结构，并发现白三烯途径在造血祖细胞生成中的新功能 | 研究仅聚焦于小鼠胚胎发育的特定时间点(E8.25)，未涵盖整个器官发生过程 | 解析小鼠器官发生阶段的细胞类型组成和分子调控机制 | 小鼠胚胎发育E8.25阶段的细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过20,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7177 | 2025-10-06 |
Troy+ brain stem cells cycle through quiescence and regulate their number by sensing niche occupancy
2018-01-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1715911114
PMID:29311336
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研究论文 | 本研究揭示了成年小鼠脑室下区神经干细胞通过感知生态位占用情况来调节自身数量的新机制 | 发现Wnt靶基因Troy可同时标记活跃和静息态神经干细胞，并证实干细胞数量在共享生态位中随时间波动的随机命运决定模型 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 探究神经干细胞的分子特征、自我更新潜能和命运决定机制 | 成年小鼠脑室下区神经干细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因谱系追踪,命运图谱分析 | NA | 基因表达数据,细胞谱系数据 | 小鼠神经干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7178 | 2025-10-06 |
A general and flexible method for signal extraction from single-cell RNA-seq data
2018-01-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02554-5
PMID:29348443
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研究论文 | 提出一种通用灵活的单细胞RNA测序数据信号提取方法ZINB-WaVE | 开发了零膨胀负二项模型，能同时处理数据中的零膨胀、过度离散和计数特性 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的低维表示方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | ZINB-WaVE（零膨胀负二项模型） | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7179 | 2025-10-06 |
Transcriptomic Profiling of Zebrafish Hair Cells Using RiboTag
2018, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2018.00047
PMID:29765956
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研究论文 | 开发了一种转基因斑马鱼模型，用于在原生组织环境中分析内耳和侧线毛细胞的翻译组 | 创建了首个用于斑马鱼毛细胞特异性翻译组分析的RiboTag转基因模型，避免了组织解离导致的基因表达变化 | 研究仅限于斑马鱼模型，结果向哺乳动物系统的直接转化需要进一步验证 | 开发一种能够在原生组织环境中特异性分析斑马鱼毛细胞基因表达的方法 | 斑马鱼内耳器官和侧线神经丘中的毛细胞 | 功能基因组学 | 听力障碍 | RiboTag技术，RNA-Seq，免疫沉淀 | 转基因动物模型 | 转录组数据 | 斑马鱼幼虫 | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 7180 | 2025-10-06 |
States and Origins of Mammalian Embryonic Pluripotency In Vivo and in a Dish
2018, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2017.11.002
PMID:29477162
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综述 | 探讨哺乳动物早期胚胎多能性状态及其在体内外的起源与维持机制 | 通过单细胞转录组学揭示不同物种胚胎发育中细胞互作与命运决定的新机制 | 主要基于比较研究，尚未建立统一的跨物种多能性理论框架 | 解析哺乳动物早期胚胎多能性的发育原理与物种差异 | 小鼠和人类等哺乳动物的早期胚胎及多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多物种胚胎样本（未明确具体数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |