单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 7161 - 7180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7161 | 2024-10-17 |
Spatiotemporal transcriptomic mapping of regenerative inflammation in skeletal muscle reveals a dynamic multilayered tissue architecture
2024-Aug-27, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173858
PMID:39190487
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研究论文 | 研究重建了急性损伤和早期肌营养不良肌肉中分离的骨髓细胞的动态轨迹，揭示了再生炎症的动态多层组织结构 | 首次揭示了巨噬细胞在再生组织中空间适应和功能多样化的机制，并发现了支持再生过程的多层炎症区域 | 研究主要集中在急性损伤和早期肌营养不良肌肉，未涵盖其他类型的肌肉损伤或再生情况 | 探讨巨噬细胞在肌肉再生中的作用及其在组织结构中的动态分布 | 急性损伤和早期肌营养不良肌肉中的骨髓细胞 | 数字病理学 | 肌营养不良 | 空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 急性损伤和早期肌营养不良肌肉中的骨髓细胞样本 |
| 7162 | 2024-10-17 |
KRT17high/CXCL8+ Tumor Cells Display Both Classical and Basal Features and Regulate Myeloid Infiltration in the Pancreatic Cancer Microenvironment
2024-Jun-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-1421
PMID:37851080
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析胰腺导管腺癌样本，发现并表征了一种具有中间特征的KRT17high/CXCL8+癌细胞亚型，该亚型在肿瘤微环境和系统性免疫中影响髓系细胞 | 本文首次发现并表征了KRT17high/CXCL8+癌细胞亚型，该亚型兼具经典和基底特征，并能影响肿瘤微环境和系统性免疫中的髓系细胞 | 本文主要基于单细胞RNA测序数据和患者来源的胰腺癌类器官进行研究，未来需要更多临床数据验证其发现 | 表征胰腺导管腺癌中一种新的中间癌细胞亚型，并研究其在肿瘤微环境和系统性免疫中的作用 | 胰腺导管腺癌中的KRT17high/CXCL8+癌细胞亚型及其对髓系细胞的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 18例人类胰腺导管腺癌样本 |
| 7163 | 2024-10-17 |
A Path to Persistence after EGFR Inhibition
2024-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0274
PMID:38616658
|
研究论文 | 研究EGFR抑制后残留癌细胞的持久性机制 | 首次使用患者来源的异种移植模型，结合批量和单细胞RNA测序，揭示了ASCL1在EGFR-突变型肺癌中诱导药物耐受持久性的机制 | 研究主要基于体外实验和患者来源的异种移植模型，缺乏直接的人体临床数据 | 探讨EGFR抑制后残留癌细胞的持久性机制及其潜在的治疗靶点 | EGFR-突变型非小细胞肺癌中的药物耐受持久性细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 患者来源的异种移植模型 |
| 7164 | 2024-10-17 |
The chemokine receptor CXCR3 promotes CD8+ T cell-dependent lung pathology during influenza pathogenesis
2024-Jan-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj1120
PMID:38170765
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研究论文 | 研究探讨了CXCR3在流感发病过程中对CD8+ T细胞介导的肺病理的影响 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了流感感染期间CD8 T细胞亚群的多样性，并发现CXCR3阻断可以减轻流感相关的肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型，结果是否适用于人类尚需进一步验证 | 探讨CXCR3在流感发病过程中对CD8+ T细胞介导的肺病理的影响 | 流感感染的小鼠肺部CD8 T细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 7165 | 2024-10-17 |
Highlighting fibroblast plasticity in lung fibrosis: the WI-38 cell line as a model for investigating the myofibroblast and lipofibroblast switch
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.93519
PMID:38948058
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研究论文 | 研究使用WI-38细胞系探讨肺纤维化中肌成纤维细胞和脂成纤维细胞的转换 | 首次使用WI-38细胞系研究肺纤维化中肌成纤维细胞和脂成纤维细胞的可逆转换 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内验证 | 探讨肺纤维化中肌成纤维细胞和脂成纤维细胞的转换机制 | WI-38细胞系在肺纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肺纤维化 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | WI-38细胞系和IPF患者来源的肺成纤维细胞 |
| 7166 | 2024-10-17 |
The intricate cellular ecosystem of human peripheral veins as revealed by single-cell transcriptomic analysis
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0296264
PMID:38206912
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人体外周静脉复杂的细胞生态系统 | 首次在单细胞水平上解析了上臂静脉的微解剖结构，并探讨了其与壁结构、重塑过程和炎症反应的关系 | 研究样本仅限于非疾病的静脉，且样本量较小 | 探讨静脉系统的细胞组成及其在血管炎症和重塑过程中的作用 | 人体上臂静脉的细胞组成和功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4个非疾病的人体静脉样本（3个贵要静脉，1个头静脉），共20,006个细胞 |
| 7167 | 2024-10-17 |
IGFBP7+ subpopulation and IGFBP7 risk score in astrocytoma: insights from scRNA-Seq and bulk RNA-Seq
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1434300
PMID:39403379
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序探讨了星形细胞瘤中IGFBP7+亚群及其风险评分的影响 | 首次揭示了C0 IGFBP7+胶质瘤细胞在星形细胞瘤分化和进展中的重要作用，并开发了基于IGFBP7风险评分的预测模型 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏临床试验验证 | 深入理解星形细胞瘤的细胞组成多样性，探讨影响其预后的多种因素 | 星形细胞瘤中的IGFBP7+亚群及其风险评分 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 预测模型 | RNA序列数据 | 七个不同亚组的星形细胞瘤样本 |
| 7168 | 2024-10-17 |
Macrophage Dysfunction in Respiratory Disease
2024, Results and problems in cell differentiation
DOI:10.1007/978-3-031-65944-7_9
PMID:39406908
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研究论文 | 本文探讨了肺泡巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制 | 利用谱系追踪和单细胞RNA测序技术，深入理解了肺泡巨噬细胞在肺部稳态调节中的作用 | 未详细讨论具体的靶向治疗方法 | 研究肺泡巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制，为开发针对性治疗提供理论基础 | 肺泡巨噬细胞及其在呼吸系统疾病中的功能变化 | NA | 呼吸系统疾病 | 谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 7169 | 2024-10-17 |
Transcription factors in fibroblast plasticity and CAF heterogeneity
2023-Dec-20, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02934-4
PMID:38124183
|
综述 | 本文综述了转录因子在癌症相关成纤维细胞（CAF）异质性和可塑性中的作用 | 强调了单细胞RNA测序技术在揭示转录因子在不同癌症类型中将正常成纤维细胞转化为不同CAF亚型中的作用 | 目前尚未形成统一的CAF亚群功能分类，这为临床上开发靶向CAF疗法带来了挑战 | 揭示CAF的异质性，并识别不同肿瘤中的共性，以更有效地靶向肿瘤微环境中的促肿瘤基质 | 癌症相关成纤维细胞（CAF）及其异质性和可塑性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7170 | 2024-10-17 |
scNAT: a deep learning method for integrating paired single-cell RNA and T cell receptor sequencing profiles
2023-12-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03129-y
PMID:38111007
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scNAT的深度学习方法，用于整合配对的单细胞RNA和T细胞受体测序数据 | scNAT方法能够将配对的scRNA-seq和scTCR-seq数据整合到一个统一的潜在空间中，用于下游分析 | NA | 开发一种能够整合单细胞RNA和T细胞受体测序数据的深度学习方法 | 单细胞RNA测序数据和T细胞受体测序数据 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | 深度学习 | 单细胞RNA和T细胞受体测序数据 | NA |
| 7171 | 2024-10-17 |
Atypical B cells consist of subsets with distinct functional profiles
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108496
PMID:38098745
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了慢性暴露于疟疾寄生虫的个体中非典型B细胞的转录组、细胞表面标记和B细胞受体，发现了三种先前未被描述的非典型B细胞亚群，并揭示了它们在适应性免疫反应中的不同功能 | 发现了三种先前未被描述的非典型B细胞亚群，并揭示了它们在适应性免疫反应中的不同功能 | NA | 更好地定义非典型B细胞在人类适应性免疫反应中的作用 | 非典型B细胞的转录组、细胞表面标记和B细胞受体 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 慢性暴露于疟疾寄生虫的个体 |
| 7172 | 2024-10-17 |
Challenges and opportunities to computationally deconvolve heterogeneous tissue with varying cell sizes using single-cell RNA-sequencing datasets
2023-12-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03123-4
PMID:38098055
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研究论文 | 本文讨论了使用单细胞RNA测序数据进行异质组织解卷积的挑战和机遇 | 提出了使用正交的“黄金标准”数据集来评估解卷积方法 | 现有方法可能量化总mRNA而非细胞类型比例，缺乏细胞参考图谱和单细胞与空间转录组数据整合的标准 | 探讨如何解决使用单细胞RNA测序数据进行异质组织解卷积的关键挑战 | 异质组织中的细胞混合物 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7173 | 2024-10-17 |
GNTD: reconstructing spatial transcriptomes with graph-guided neural tensor decomposition informed by spatial and functional relations
2023-Dec-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44017-0
PMID:38092776
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GNTD的图引导神经张量分解模型，用于重建组织中的全空间转录组 | GNTD模型通过分层张量结构和三层神经网络的非线性分解，结合捕获点之间的空间关系和基因功能关系，提高了从高度稀疏的空间转录组数据中进行准确重建的能力 | NA | 开发一种新的方法来克服空间转录组技术在组织切片制备和RNA捕获与固定方面的技术限制，从而实现全空间转录组的重建 | 组织中的空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组技术 | 神经网络 | 基因表达数据 | 22个Visium空间转录组数据集和3个高分辨率Stereo-seq数据集以及模拟数据 |
| 7174 | 2024-10-17 |
The molecular cytoarchitecture of the adult mouse brain
2023-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06818-7
PMID:38092915
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研究论文 | 本文通过结合高通量单核RNA测序和Slide-seq空间转录组学方法，构建了成年小鼠大脑中每个脑结构的细胞类型图谱 | 本文首次全面揭示了小鼠大脑中不同神经解剖结构的细胞类型组成，并开发了一个框架用于遗传访问每种细胞类型 | NA | 构建一个全面的成年小鼠大脑细胞类型图谱，并揭示其分子身份和空间位置 | 成年小鼠大脑的细胞类型及其在神经解剖结构中的分布 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序和Slide-seq空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 整个小鼠大脑的细胞样本 |
| 7175 | 2024-10-17 |
STAT4 facilitates PD-L1 level via IL-12R/JAK2/STAT3 axis and predicts immunotherapy response in breast cancer
2023-Dec, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.464
PMID:38107057
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研究论文 | 研究STAT4在乳腺癌中的作用及其通过IL-12R/JAK2/STAT3轴调节PD-L1水平的机制，并探讨其作为免疫治疗反应预测因子的潜力 | 揭示了STAT4通过STAT4/IL-12R/JAK2-STAT3-STAT4轴间接调节PD-L1表达的新分子机制，并提出其作为预测抗PD-1免疫治疗反应的潜在应用 | NA | 探讨STAT4在乳腺癌中的功能及其在免疫治疗中的作用 | STAT4在乳腺癌中的表达及其对PD-L1水平的影响 | NA | 乳腺癌 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个临床乳腺癌队列 |
| 7176 | 2024-10-17 |
Identification of RP11-770J1.4 as immune-related lncRNA regulating the CTXN1-cGAS-STING axis in histologically lower-grade glioma
2023-Dec, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.458
PMID:38116063
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研究论文 | 本文研究了长非编码RNA RP11-770J1.4在低级别胶质瘤中的免疫调节作用 | 揭示了RP11-770J1.4-CTXN1作为潜在的免疫调节轴，具有治疗低级别胶质瘤的潜力 | NA | 探讨长非编码RNA在低级别胶质瘤中的免疫调节机制 | 长非编码RNA RP11-770J1.4及其在低级别胶质瘤中的作用 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括胶质母细胞瘤干细胞模型和患者样本 |
| 7177 | 2024-10-17 |
Genetic Insights of Schizophrenia via Single Cell RNA-Sequencing Analyses
2023-07-04, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbad002
PMID:36805283
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了精神分裂症的遗传机制 | 本文首次使用单细胞RNA测序数据识别出54个精神分裂症风险基因，其中三分之二未在传统组织测序数据中被发现 | 本文的研究结果依赖于单细胞RNA测序数据，未来需要更多研究来进一步验证这些发现 | 揭示精神分裂症的遗传机制 | 精神分裂症风险基因及其在特定脑细胞类型中的表达 | 基因组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 54个精神分裂症风险基因 |
| 7178 | 2024-10-17 |
Adversarial training improves model interpretability in single-cell RNA-seq analysis
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad166
PMID:38099262
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研究论文 | 本文探讨了通过对抗训练提高单细胞RNA测序数据分析中模型鲁棒性和可解释性的方法 | 本文首次展示了对抗训练不仅提高了模型的鲁棒性，还增强了模型的可解释性 | 本文仅在一个特定任务上验证了方法的有效性，需要在更多任务上进行评估 | 提高预测计算模型在生物学和医学领域的鲁棒性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据的细胞类型预测 | 机器学习 | NA | 对抗训练 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 7179 | 2024-10-17 |
Macrophages in intestinal fibrosis and regression
2022-11, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2022.104614
PMID:36182587
|
综述 | 本文综述了肠道巨噬细胞在肠道纤维化和消退中的作用 | 基于最新进展的谱系追踪和单细胞测序技术，详细描述了肠道巨噬细胞的特征，并提出了针对巨噬细胞的潜在抗肠道纤维化疗法 | NA | 探讨肠道巨噬细胞在肠道纤维化和消退中的作用，并提出潜在的治疗策略 | 肠道巨噬细胞及其在肠道纤维化中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 7180 | 2024-10-17 |
Synthesis and application of POLYseq for profiling human liver organoids
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100976
PMID:34934958
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研究论文 | 本文详细介绍了POLYseq的合成、表征及其在单细胞测序中的应用 | POLYseq通过商业化试剂合成，具有高度可定制性，并且在合成过程中仅需要一个能保持90°C的恒温浴 | 合成过程中需注意试剂的初始混合比例，因为最终产品对初始混合比例敏感 | 开发和应用POLYseq技术以进行单细胞测序 | 人类肝脏类器官细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |