单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7141 - 7160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7141 | 2025-10-06 |
Aligning Single-Cell Developmental and Reprogramming Trajectories Identifies Molecular Determinants of Myogenic Reprogramming Outcome
2018-09-26, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2018.07.006
PMID:30195438
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析MYOD介导的成纤维细胞向肌管重编程过程，并开发轨迹对齐技术比较发育与重编程轨迹 | 引入轨迹对齐这一新型分析技术，能够定量比较两个生物过程中的基因表达动力学 | 仅研究MYOD介导的特定重编程系统，结果可能不适用于其他重编程模型 | 揭示重编程效率低下的分子障碍，识别决定重编程结果的关键分子因素 | 人类成纤维细胞向肌管的重编程过程 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹对齐分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7142 | 2025-10-06 |
Large-Scale Single-Cell RNA-Seq Reveals Molecular Signatures of Heterogeneous Populations of Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Endothelial Cells
2018-08-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.118.312913
PMID:29986945
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研究论文 | 通过大规模单细胞RNA测序揭示人诱导多能干细胞来源内皮细胞异质性群体的分子特征 | 首次利用液滴单细胞RNA测序技术系统分析人iPSC-EC分化过程中的细胞异质性，鉴定出四个主要内皮细胞亚群 | 分化技术效率不足，存在非内皮细胞污染 | 解析人诱导多能干细胞来源内皮细胞的异质性特征 | 人诱导多能干细胞分化后的内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个人iPSC细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴单细胞RNA测序平台 |
| 7143 | 2025-10-06 |
RNA velocity of single cells
2018-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0414-6
PMID:30089906
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研究论文 | 本研究提出并验证了通过区分未剪接和已剪接mRNA来直接估计单细胞RNA速度的方法 | 首次提出RNA速度概念，通过分析未剪接和已剪接mRNA的比例来预测细胞未来状态 | 仅能预测数小时时间尺度内的细胞状态变化 | 开发能够分析时间分辨生物学过程的新计算方法 | 单细胞基因表达数据 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7144 | 2025-10-06 |
Genome-Scale Oscillations in DNA Methylation during Exit from Pluripotency
2018-07-25, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2018.06.012
PMID:30031774
|
研究论文 | 本研究揭示了多能性退出过程中DNA甲基化存在基因组尺度的振荡现象 | 首次发现DNA甲基化在全基因组范围内存在协调振荡，且振幅与CpG密度相关 | NA | 探索早期胚胎发育过程中表观遗传异质性的产生机制 | 多能性干细胞及其向体细胞谱系分化的过程 | 表观遗传学 | NA | 单细胞测序,定量生物物理建模 | 生物物理模型 | 表观遗传数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序,平行单细胞转录和表观遗传分析 | NA | NA |
| 7145 | 2025-10-06 |
Interferon gene therapy reprograms the leukemia microenvironment inducing protective immunity to multiple tumor antigens
2018-07-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-05315-0
PMID:30042420
|
研究论文 | 本研究通过单核细胞介导的IFNα基因疗法重塑白血病微环境，诱导针对多种肿瘤抗原的保护性免疫 | 首次证明IFN基因疗法能逆转白血病诱导的免疫抑制性髓系细胞扩增，并通过单细胞转录组分析揭示微环境重编程机制 | 研究仅使用小鼠模型，临床转化潜力尚需进一步验证 | 开发通过基因疗法改善肿瘤微环境以增强免疫治疗效果的新策略 | 白血病小鼠模型 | 免疫治疗 | 白血病 | 基因治疗，单细胞转录组分析，批量转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 7146 | 2025-10-06 |
Detection and removal of barcode swapping in single-cell RNA-seq data
2018-07-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-05083-x
PMID:29991676
|
研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序数据中的条形码交换问题，并开发了相应的校正算法 | 首次使用两种统计方法量化条形码交换比例，并开发了针对10x Genomics实验的分子级校正算法 | 研究主要基于HiSeq 4000平台，在其他测序平台上的适用性需要进一步验证 | 检测和校正单细胞RNA测序中的条形码交换现象 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 测序数据 | 两个板式单细胞RNA测序数据集 | Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | HiSeq 4000, 10x Chromium | Illumina HiSeq 4000图案化流动槽测序仪，10x Genomics单细胞测序平台 |
| 7147 | 2025-10-06 |
Human in vivo-generated monocyte-derived dendritic cells and macrophages cross-present antigens through a vacuolar pathway
2018-07-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-04985-0
PMID:29967419
|
研究论文 | 本研究揭示了人类体内产生的单核细胞来源树突状细胞和巨噬细胞通过液泡途径交叉呈递抗原的机制 | 首次证明人类自然发生的单核细胞来源树突状细胞具有交叉呈递能力，并阐明其独特的液泡途径机制 | 研究样本仅来源于腹水，未涉及其他组织或疾病模型 | 探究人类单核细胞来源免疫细胞的抗原交叉呈递能力及分子机制 | 人类腹水中的单核细胞来源树突状细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 腹水来源的免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7148 | 2025-10-06 |
Early metazoan cell type diversity and the evolution of multicellular gene regulation
2018-07, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-018-0575-6
PMID:29942020
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究早期后生动物细胞类型多样性及其基因调控机制的演化 | 首次在非两侧对称动物（海绵、栉水母、扁盘动物）中系统绘制细胞类型特异性转录图谱，发现扁盘动物存在多种未知的肽能细胞类型 | 研究仅涵盖三种早期后生动物类群，尚未扩展到更广泛的后生动物谱系 | 探索后生动物细胞类型及其基因调控程序的演化 | 海绵（Porifera）、栉水母（Ctenophora）和扁盘动物（Placozoa）物种 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种早期后生动物类群的全生物体单细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7149 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal the dynamic of haematopoietic stem cell production in the aorta
2018-06-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-04893-3
PMID:29955049
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了小鼠胚胎主动脉中造血干细胞生成的动态过程 | 首次在体内完整解析了造血干细胞生成过程中内皮细胞向造血细胞转变及主动脉内造血细胞簇形成的分子事件 | 研究仅限于小鼠胚胎模型，人类系统中的适用性需要进一步验证 | 深入理解造血干细胞在体内生成的分子机制 | 小鼠胚胎主动脉中的非造血内皮细胞、造血内皮细胞、内皮-造血转化细胞、主动脉内造血细胞簇细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从小鼠胚胎主动脉分离的多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7150 | 2025-10-06 |
Dissection of Influenza Infection In Vivo by Single-Cell RNA Sequencing
2018-06-27, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2018.05.008
PMID:29886109
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析流感病毒感染过程中肺组织细胞的异质性反应 | 首次在单细胞水平同时分析病毒和宿主转录组，揭示旁观者细胞与感染细胞的差异，并发现流感感染特异性新标志物 | NA | 研究流感病毒感染过程中不同细胞类型的宿主反应异质性 | 流感病毒感染的小鼠肺组织细胞 | 单细胞组学 | 流感病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7151 | 2025-10-06 |
Genetic identification of brain cell types underlying schizophrenia
2018-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-018-0129-5
PMID:29785013
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别精神分裂症相关的特定脑细胞类型 | 首次将精神分裂症的基因组位点与特定脑细胞类型进行系统性映射，发现风险基因主要集中于特定神经元类型 | 研究主要基于常见变异，未深入探讨罕见变异的作用；细胞类型分析可能存在技术局限性 | 确定精神分裂症遗传基础所对应的特定脑细胞类型 | 人脑细胞类型及其基因表达谱 | 基因组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7152 | 2025-10-06 |
Classes and continua of hippocampal CA1 inhibitory neurons revealed by single-cell transcriptomics
2018-06, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.2006387
PMID:29912866
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示海马CA1区抑制性神经元的分类谱系和连续变异模式 | 发现抑制性神经元多样性不仅需要离散分类描述，还需要连续变异模式；识别出3个先前被认为不同的细胞类型实际上相同；通过潜在因子分析揭示单个连续变量可预测多个基因表达水平 | 研究仅聚焦于海马CA1区，结果可能无法直接推广到其他脑区；样本量相对有限（3,663个细胞） | 解析海马CA1区抑制性神经元的分子分类和多样性特征 | 小鼠海马CA1区的GABA能抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | 潜在因子分析 | 单细胞转录组数据 | 3,663个CA1抑制性细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7153 | 2025-10-06 |
Batch effects in single-cell RNA-sequencing data are corrected by matching mutual nearest neighbors
2018-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4091
PMID:29608177
|
研究论文 | 提出一种基于互近邻匹配的单细胞RNA测序数据批次效应校正方法 | 不依赖预定义的细胞群体组成或批次间相同群体组成的假设，仅要求批次间共享部分细胞群体 | NA | 开发单细胞RNA测序数据批次效应校正方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 互近邻匹配算法 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,液滴式单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7154 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals the origin and the order of mutation acquisition in T-cell acute lymphoblastic leukemia
2018-06, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-018-0127-8
PMID:29740158
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示T细胞急性淋巴细胞白血病中突变获取的起源和顺序 | 首次使用靶向单细胞测序技术结合图论算法解析T-ALL突变获取顺序，发现白血病发展可从多能祖细胞起始 | 仅分析了4例T-ALL病例，样本量较小 | 探究T-ALL中突变获取的顺序和起源细胞 | T细胞急性淋巴细胞白血病患者 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 靶向单细胞测序 | 图论算法 | 基因组测序数据 | 4例T-ALL病例 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7155 | 2025-10-06 |
Simultaneous lineage tracing and cell-type identification using CRISPR-Cas9-induced genetic scars
2018-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4124
PMID:29644996
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研究论文 | 提出一种结合CRISPR-Cas9基因编辑与单细胞RNA测序的技术，实现单细胞谱系追踪与细胞类型鉴定同步进行 | 开发LINNAEUS技术，通过核酸酶激活的通用序列编辑实现数千个单细胞中谱系追踪与转录组分析同步完成 | NA | 理解单个细胞如何发育成包含多种细胞类型的完整生物体 | 斑马鱼幼体和成体的心脏、肝脏、胰腺及端脑组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 谱系条形码计算分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因编辑条形码数据 | 数千个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7156 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional profiling: a window into embryonic cell-type specification
2018-06, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-018-0002-5
PMID:29666443
|
综述 | 本文综述单细胞转录组分析技术在胚胎发育研究中的应用与进展 | 系统整合单细胞转录组学与成像技术的最新进展，并概述相关生物信息学分析方法 | 未明确说明具体技术限制，但提及单细胞研究面临的当前挑战 | 探讨单细胞技术如何促进对哺乳动物胚胎发育过程中细胞命运决定机制的理解 | 哺乳动物早期胚胎发育过程中的细胞谱系分化 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学、成像技术 | NA | 单细胞转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7157 | 2025-10-06 |
Cnidarian Cell Type Diversity and Regulation Revealed by Whole-Organism Single-Cell RNA-Seq
2018-05-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.05.019
PMID:29856957
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研究论文 | 通过全生物体单细胞RNA测序揭示刺胞动物细胞类型多样性及其调控机制 | 首次在非两侧对称动物Nematostella vectensis中开展全生物体单细胞转录组分析，整合转录因子表达、染色质分析和序列 motif 识别揭示细胞特异性表达的调控机制 | 研究仅限于单一刺胞动物物种，未与其他动物门类进行广泛比较 | 探索刺胞动物细胞类型多样性及基因调控程序的进化 | 星虫海葵(Nematostella vectensis)的成年和幼体细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，染色质分析，序列motif分析 | NA | 单细胞转录组数据，染色质数据 | 全生物体细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7158 | 2025-10-06 |
BGP: identifying gene-specific branching dynamics from single-cell data with a branching Gaussian process
2018-05-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1440-2
PMID:29843817
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研究论文 | 开发了一种名为分支高斯过程(BGP)的非参数模型，用于从单细胞数据中识别基因特异性分支动态 | 能够识别单个基因的分支动态，并为每个基因提供分支时间估计及相关可信区间 | NA | 识别细胞分化过程中的基因特异性分支动态 | 单细胞基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分支高斯过程(BGP) | 单细胞基因表达数据 | 模拟数据、造血单细胞RNA-seq研究、小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴条形码技术 |
| 7159 | 2025-10-06 |
Evolution of pallium, hippocampus, and cortical cell types revealed by single-cell transcriptomics in reptiles
2018-05-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aar4237
PMID:29724907
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研究论文 | 通过爬行动物大脑皮层的单细胞转录组学研究揭示了哺乳动物皮层细胞类型的进化起源 | 首次在爬行动物中构建了大脑皮层的单细胞基因表达图谱，揭示了哺乳动物新皮层细胞类型的进化路径 | 仅研究两种爬行动物物种，可能无法完全代表所有羊膜动物的进化特征 | 探究羊膜动物大脑皮层中谷氨酸能和GABA能神经元的进化历程 | 两种爬行动物的大脑皮层细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 两种爬行动物物种的大脑皮层细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7160 | 2025-10-06 |
A single-cell hematopoietic landscape resolves 8 lineage trajectories and defects in Kit mutant mice
2018-05-24, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2017-12-821413
PMID:29588278
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析小鼠骨髓造血干祖细胞的8种谱系分化轨迹，并揭示Kit突变小鼠的造血缺陷 | 识别了共同的嗜碱性粒细胞/肥大细胞骨髓祖细胞，并在单细胞水平表征其分子特征 | 研究仅基于小鼠模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 解析造血干祖细胞向特定血液谱系的分化轨迹和系统性疾病解释 | 小鼠骨髓造血干祖细胞 | 单细胞转录组学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 44,802个小鼠骨髓HSPCs + 13,815个c-Kit突变小鼠HSPCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |