单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 7121 - 7140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7121 | 2024-10-19 |
Single-cell profiling of cellular changes in the somatic peripheral nerves following nerve injury
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1448253
PMID:39415832
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在周围神经损伤后背根神经节和周围神经中的最新发现，揭示了周围神经的细胞异质性和损伤后的变化 | 提供了单细胞分辨率下周围神经损伤后细胞变化的全面和深入的视角 | NA | 探讨周围神经损伤后的病理变化，为神经再生治疗的发展提供基础 | 周围神经损伤后的背根神经节和周围神经的单细胞转录组状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7122 | 2024-10-19 |
Attenuation of aggressive tumor progression of anaplastic thyroid cancer by p53
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/KXJJ8824
PMID:39417187
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研究论文 | 研究探讨了野生型p53在抑制未分化甲状腺癌（ATC）进展中的作用 | 首次证明了外源表达的野生型p53能够抑制突变型p53的致癌作用，并提出了使用CRISPR/Cas9基因编辑技术修改p53等位基因以治疗ATC的可能性 | 研究仅限于细胞和动物模型，尚未在临床试验中验证 | 探讨野生型p53在抑制未分化甲状腺癌进展中的作用 | 未分化甲状腺癌细胞（8505C细胞）和其异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了8505C细胞及其表达野生型和突变型p53的变体，以及相应的异种移植小鼠模型 |
| 7123 | 2024-10-19 |
Comprehensive analysis of the potential biological significance of cuproptosis-related gene LIPT2 in pan-cancer prognosis and immunotherapy
2023-12-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50039-x
PMID:38129565
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研究论文 | 本文分析了铜死亡相关基因LIPT2在泛癌预后和免疫治疗中的潜在生物学意义 | 首次全面评估了LIPT2基因在多种癌症中的表达水平及其对预后的影响，并探讨了其在免疫治疗中的潜在作用 | 研究主要基于生物信息学方法，缺乏实验验证 | 探讨LIPT2在泛癌中的生物学功能及其在预后和免疫治疗中的潜在意义 | LIPT2基因在多种癌症中的表达及其对预后和免疫治疗的影响 | NA | NA | 生物信息学方法，单细胞测序 | NA | 基因表达数据，突变数据，甲基化数据，免疫状态数据 | 涉及多种癌症类型的样本 |
| 7124 | 2024-10-19 |
Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis
2023-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.16.537094
PMID:37131626
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研究论文 | 评估GPT-4在单细胞RNA测序分析中进行细胞类型注释的性能 | 利用GPT-4这一强大的大型语言模型，自动且准确地通过标准单细胞RNA测序分析管道生成的标记基因信息进行细胞类型注释 | NA | 评估GPT-4在细胞类型注释中的应用潜力，并开发相应的开源软件包 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GPT-4 | 基因表达数据 | 数百种组织类型和细胞类型 |
| 7125 | 2024-10-19 |
Fishing Innate Immune System Properties through the Transcriptomic Single-Cell Data of Teleostei
2023-Dec-12, Biology
DOI:10.3390/biology12121516
PMID:38132342
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研究论文 | 本文总结了与鱼类先天免疫系统（IIS）相关的单细胞RNA测序（scRNAseq）和空间转录组学实验数据 | 本文首次系统地总结了鱼类先天免疫系统的单细胞RNA测序数据，并提出了对非模式鱼类进行新实验的必要性 | 目前只有少数scRNAseq数据可用于其他鱼类，且缺乏对非模式鱼类的研究 | 研究鱼类先天免疫系统的特性和多样性 | 鱼类的先天免疫系统 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 涉及多种鱼类器官和发育阶段的多个scRNAseq实验数据 |
| 7126 | 2024-10-19 |
Consensus scHPF Identifies Cell Type-Specific Drug Responses in Glioma by Integrating Large-Scale scRNA-seq
2023-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.570193
PMID:38105955
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研究论文 | 本文介绍了一种名为共识scHPF的贝叶斯矩阵分解算法，用于整合大规模单细胞RNA测序数据，以识别胶质瘤中特定细胞类型的药物反应 | 提出了共识scHPF算法，通过分析多个随机初始化的scHPF模型，识别最稳健的基因特征并自动确定给定数据集的因子数量 | NA | 开发一种新的算法来整合复杂的单细胞RNA测序数据，以识别特定细胞类型的药物反应 | 胶质瘤切片培养样本，包括19名患者、10种药物治疗条件和52个样本 | 单细胞RNA测序 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯矩阵分解 | 基因表达数据 | 19名患者，10种药物治疗条件，52个样本 |
| 7127 | 2024-10-19 |
Single-cell DNA methylome and 3D multi-omic atlas of the adult mouse brain
2023-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06805-y
PMID:38092913
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研究论文 | 本研究使用单核甲基化测序和多组学测序技术，构建了成年小鼠大脑的单细胞DNA甲基化和3D多组学图谱 | 首次在空间背景下全面解析了成年小鼠大脑的DNA甲基化多样性，并整合了转录组和染色质可及性数据，构建了基于甲基化的细胞分类和调控网络 | 研究仅限于成年小鼠大脑，未涵盖其他物种或发育阶段 | 理解大脑发育和神经疾病的DNA甲基化机制，构建全面的分子图谱 | 成年小鼠大脑的单细胞DNA甲基化和染色质构象 | 数字病理学 | NA | 单核甲基化测序（snmC-seq3）和多组学测序（snm3C-seq） | NA | 基因组数据 | 301,626个甲基化图谱和176,003个染色质构象-甲基化联合图谱，来自117个解剖区域 |
| 7128 | 2024-10-19 |
Spatial transcriptomic analysis of the mouse brain following chronic social defeat stress
2023-Dec, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20220133
PMID:38264685
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研究论文 | 研究使用空间转录组学分析慢性社会挫败应激对小鼠大脑的影响 | 首次全面比较了慢性社会挫败应激在多个脑区的转录变化，并揭示了不同脑区基因表达的空间差异 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨慢性社会挫败应激对小鼠大脑多个脑区的转录变化 | 小鼠大脑在慢性社会挫败应激下的基因表达 | 空间转录组学 | 抑郁症 | 空间转录组学 (ST) | NA | 基因表达数据 | 控制组、抗压组 (RES) 和易感组 (SUS) 的小鼠大脑样本 |
| 7129 | 2024-10-19 |
Identification of monocyte-associated pathways participated in the pathogenesis of pulmonary arterial hypertension based on omics-data
2023-Oct, Pulmonary circulation
IF:2.2Q3
DOI:10.1002/pul2.12319
PMID:38130888
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研究论文 | 本研究基于组学数据，探讨了单核细胞相关通路在肺动脉高压发病机制中的作用 | 首次结合微阵列数据和单细胞RNA测序数据，分析了单核细胞在肺动脉高压中的浸润情况及其相关信号通路 | 研究主要基于现有数据库中的数据，缺乏体内实验验证 | 评估免疫细胞浸润在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉高压患者中的单核细胞及其相关信号通路 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 微阵列数据分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于GEO数据库中的微阵列数据集和单细胞RNA测序数据 |
| 7130 | 2024-10-19 |
Amphiregulin couples IL1RL1+ regulatory T cells and cancer-associated fibroblasts to impede antitumor immunity
2023-08-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add7399
PMID:37611111
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研究论文 | 研究揭示了IL1RL1+调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞通过AREG/EGFR轴相互作用，阻碍抗肿瘤免疫 | 首次揭示了AREG/EGFR轴在调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞之间的相互作用，控制成纤维细胞功能状态的分叉 | NA | 探讨调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的相互作用及其分子机制 | 调节性T细胞、癌症相关成纤维细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7131 | 2024-10-19 |
Synergism Between IL21 and Anti-PD-1 Combination Therapy is Underpinned by the Coordinated Reprogramming of the Immune Cellular Network in the Tumor Microenvironment
2023-08, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0012
PMID:37546701
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研究论文 | 通过综合分析多个单细胞RNA测序数据集，研究了IL21与抗PD-1联合治疗在肿瘤微环境中通过协调重编程免疫细胞网络的协同机制 | 揭示了IL21在肿瘤微环境中通过增强CD4 T细胞的辅助功能，促进CD8 T细胞介导的免疫反应，并与抗PD-1阻断剂协同驱动肿瘤抗原特异性CD8 T细胞的克隆扩增和功能状态分化 | NA | 探讨IL21与抗PD-1联合治疗在肿瘤微环境中的协同机制 | 肿瘤微环境中的免疫细胞网络 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 7132 | 2024-10-19 |
Integrative in situ mapping of single-cell transcriptional states and tissue histopathology in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01251-x
PMID:36732642
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STARmap PLUS的方法，结合高分辨率空间转录组学和蛋白质检测，用于在小鼠阿尔茨海默病模型中进行单细胞转录状态和组织病理学的整合原位映射 | 本文创新性地将高分辨率空间转录组学与蛋白质检测结合，提供了疾病进展的综合细胞图谱 | NA | 揭示阿尔茨海默病在小鼠模型中的时空动态变化，理解疾病机制和进展 | 小鼠阿尔茨海默病模型的大脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 8个月和13个月龄的小鼠阿尔茨海默病模型大脑组织样本 |
| 7133 | 2024-10-19 |
Application of single-cell RNA sequencing methods to develop B cell targeted treatments for autoimmunity
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1103690
PMID:37520578
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研究论文 | 本文探讨了利用单细胞RNA测序方法开发针对自身免疫病的B细胞靶向治疗 | 本文提出利用单细胞RNA测序技术识别自身免疫病中的致病性自身反应性B细胞，以开发更精确的靶向治疗 | NA | 开发针对自身免疫病的B细胞靶向治疗 | 自身反应性B细胞 | 数字病理学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7134 | 2024-10-19 |
Single-cell RNA-sequencing atlas of bovine caudal intervertebral discs: Discovery of heterogeneous cell populations with distinct roles in homeostasis
2021-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101149R
PMID:34591994
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了牛尾椎间盘的细胞图谱，揭示了椎间盘中不同细胞群的异质性及其在稳态中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了牛尾椎间盘中15个独特细胞群的基因表达特征，并识别了这些细胞群在椎间盘稳态和结构维持中的作用 | 研究仅限于牛尾椎间盘，结果的普适性和对人类椎间盘的适用性尚需进一步验证 | 通过单细胞RNA测序技术揭示椎间盘中细胞的异质性，以期为椎间盘再生疗法的开发提供新的见解 | 牛尾椎间盘中的细胞群及其基因表达特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 牛尾椎间盘样本 |
| 7135 | 2024-10-18 |
A regulatory variant rs9379874 in T1D risk region 6p22.2 affects BTN3A1 expression regulating T cell function
2024-Oct-17, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-024-02389-9
PMID:39417845
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研究论文 | 研究揭示了6p22.2区域中的调控变异rs9379874通过影响BTN3A1表达来调节T细胞功能，从而与1型糖尿病（T1D）风险相关 | 发现了rs9379874变异通过FOXA1结合增加BTN3A1表达，扩展了T1D风险的基因组图谱，并提供了潜在的治疗靶点 | 研究未发现该变异与胰岛功能或自身免疫的显著关联 | 揭示6p22.2区域与T1D亚型及相关临床特征的关联，并识别该区域的因果变异和目标基因 | 6p22.2区域中的基因变异与T1D风险的关系 | NA | 糖尿病 | 全基因组关联研究（GWAS）、双荧光素酶报告基因检测、表达数量性状位点（eQTL）分析 | NA | 基因型数据、单细胞RNA测序数据 | 2608例T1D患者和4814例健康对照 |
| 7136 | 2024-10-18 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomics to elucidate the role and potential mechanisms of autophagy in aging tissue
2024-Oct-16, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00996-w
PMID:39414741
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研究论文 | 研究通过整合bulk和单细胞转录组数据，揭示了自噬在衰老组织中的作用及其潜在机制 | 首次通过整合大量bulk RNA-seq和单细胞测序数据，揭示了血液组织中自噬与衰老的最高正相关性，并发现了经典单核细胞在衰老过程中的关键作用 | 研究主要集中在血液组织和急性髓系白血病，其他组织和疾病的相关性未被探讨 | 识别与自噬和衰老最相关的组织，并探索自噬在衰老组织微环境中的功能和机制 | 正常组织样本、不同年龄的血液样本、急性髓系白血病的bulk RNA-seq和单细胞数据 | 生物信息学 | 血液疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过7000个正常组织样本、2000多个急性髓系白血病bulk RNA-seq样本和多组AML单细胞数据 |
| 7137 | 2024-10-18 |
Cross-tissue human fibroblast atlas reveals myofibroblast subtypes with distinct roles in immune modulation
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.020
PMID:39303725
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了来自517个人类样本的纤维母细胞，揭示了不同亚型在免疫调节中的独特作用 | 识别了四种转录上不同的肌纤维母细胞亚群，并揭示了它们在肿瘤微环境中的不同功能 | NA | 深入理解纤维母细胞生物学，并探索针对特定纤维母细胞亚群的癌症治疗策略 | 人类纤维母细胞及其在不同组织和病理状态下的亚型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 517个人类样本，涵盖11种组织类型和多种病理状态 |
| 7138 | 2024-10-18 |
Coagulation factor X promotes resistance to androgen-deprivation therapy in prostate cancer
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.018
PMID:39303726
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研究论文 | 研究探讨了凝血因子X在前列腺癌中促进对雄激素剥夺疗法抵抗的作用 | 首次揭示了免疫抑制性中性粒细胞（PMN-MDSCs）是凝血因子X的关键非肝源性来源，并阐明了其在肿瘤微环境中通过激活PAR2和ERK1/2促进肿瘤生长的机制 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类患者中验证 | 探讨凝血因子X在前列腺癌中的作用及其对雄激素剥夺疗法的影响 | 前列腺癌、免疫抑制性中性粒细胞（PMN-MDSCs）、凝血因子X | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型中的前列腺肿瘤微环境样本 |
| 7139 | 2024-10-18 |
Single-cell transcriptomic profiling uncovers cellular complexity and microenvironment in gastric tumorigenesis associated with Helicobacter pylori
2024-Oct-14, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.10.012
PMID:39414226
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了幽门螺杆菌相关胃癌发生过程中的细胞复杂性和微环境变化 | 首次构建了包含幽门螺杆菌感染和未感染的胃炎、胃肠化生和胃癌样本的单细胞图谱，揭示了不同细胞类型的独特癌症相关表达谱和细胞间通信网络 | 研究仅限于特定样本和数据集，可能无法完全代表所有胃癌病例 | 揭示幽门螺杆菌感染驱动胃癌发生过程中的细胞异质性和分子机制 | 胃炎、胃肠化生和胃癌样本中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 18个胃炎、胃肠化生和胃癌样本 |
| 7140 | 2024-10-18 |
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.12.618004
PMID:39416197
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研究论文 | 研究探讨了神经相关巨噬细胞在生命周期中控制脂肪稳态的作用，并揭示了其对年龄相关炎症的抑制作用 | 首次定义了生命周期中脂肪组织巨噬细胞的多样性和变化，并发现神经相关巨噬细胞在防止儿茶酚胺抵抗中的关键作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步验证在人类中的适用性 | 探讨脂肪组织巨噬细胞在年龄相关炎症中的作用及其对脂肪稳态的影响 | 脂肪组织巨噬细胞、神经相关巨噬细胞、年龄相关巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 小鼠模型 |