单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7101 - 7120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7101 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-seq identifies the origins of heterogeneity in efficient cell transdifferentiation and reprogramming
2019-03-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.41627
PMID:30860479
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究细胞转分化和重编程过程中异质性的起源 | 发现起始细胞群体中Myc活性的差异可预测重编程效率，揭示了细胞命运转换异质性的起源机制 | 研究主要基于小鼠前B细胞模型，在其他细胞类型中的普适性需进一步验证 | 理解细胞转分化和重编程过程中效率异质性的分子机制 | 小鼠前B细胞的转分化和重编程过程 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算分析模型 | 单细胞基因表达数据 | 小鼠前B细胞单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7102 | 2025-10-06 |
Endothelial miR-30c suppresses tumor growth via inhibition of TGF-β-induced Serpine1
2019-03-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI123106
PMID:30855280
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研究论文 | 本研究揭示内皮细胞miR-30c通过抑制TGF-β诱导的Serpine1表达来抑制肿瘤生长 | 首次发现miR-30c通过调节纤溶酶原激活物抑制剂1(Serpine1/PAI-1)平衡，在肿瘤微环境中发挥抑癌作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究内皮细胞中miR-30c对肿瘤血管生成和生长的调控机制 | Cdh5-CreERT2 Tgfbr2fl/fl转基因小鼠的内皮细胞及肺部和乳腺肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, miRNA芯片分析, 纳米颗粒递送技术 | NA | 基因表达数据, miRNA表达数据 | 转基因小鼠模型和肿瘤模型的内皮细胞 | NanoString | 单细胞RNA-seq, miRNA阵列 | NanoString miRNA阵列 | 单细胞RNA测序技术和NanoString miRNA表达分析平台 |
| 7103 | 2025-10-06 |
Quiescence Modulates Stem Cell Maintenance and Regenerative Capacity in the Aging Brain
2019-03-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.01.040
PMID:30827680
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研究论文 | 本研究揭示了衰老大脑中神经干细胞通过增加静息状态维持干细胞池并影响再生能力的机制 | 发现衰老大脑中神经干细胞数量减少但静息状态增强，并鉴定出炎症信号和sFRP5是诱导静息的关键因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类大脑中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老过程中神经干细胞功能衰退的分子机制 | 衰老小鼠大脑中的神经干细胞 | 干细胞生物学 | 老年性疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7104 | 2025-10-06 |
Seizing Sequencing Data to Consider Cell and Circuit Complexity
2019 Mar-Apr, Epilepsy currents
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/1535759719835658
PMID:30955433
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示海马CA1区抑制性神经元的类别和连续变异模式 | 首次在海马CA1区抑制性神经元中发现连续变异模式与离散类别并存，并识别出新的细胞类别 | 研究仅聚焦海马CA1区，结果可能不适用于其他脑区 | 解析海马CA1区抑制性神经元的多样性分类体系 | 小鼠海马CA1区GABA能抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | 潜在因子分析 | 基因表达数据 | 3663个CA1抑制性细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7105 | 2025-10-06 |
Single-cell imaging and RNA sequencing reveal patterns of gene expression heterogeneity during fission yeast growth and adaptation
2019-03, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-018-0330-4
PMID:30718845
|
研究论文 | 通过单细胞成像和RNA测序技术研究裂殖酵母在不同环境条件下的基因表达异质性模式 | 结合成像、单细胞RNA测序和贝叶斯真实计数恢复方法，首次在基因组水平系统研究裂殖酵母基因表达异质性 | 研究仅限于裂殖酵母这一单细胞真核生物，结果可能不适用于其他生物系统 | 探索微生物表型变异背后的基因表达异质性机制 | 裂殖酵母单细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 细胞成像, 贝叶斯统计 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据, 图像数据 | 超过2,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7106 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Diverse Pathogen Responses Defines a Molecular Roadmap for Generating Antigen-Specific Immunity
2019-02-27, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.01.001
PMID:30772378
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析不同病原体免疫反应的早期事件，揭示抗原特异性免疫生成的分子路线图 | 首次结合荧光标记病原体与大规模平行单细胞RNA测序，系统表征先天免疫应答早期阶段的细胞类型和通路 | 仅观察免疫后48小时内的早期事件，未追踪长期适应性免疫应答 | 阐明指导稳健适应性免疫应答的先天免疫细胞类型和通路 | 淋巴结细胞、抗原阳性细胞、NK细胞、单核细胞 | 系统免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7107 | 2025-10-06 |
Dysfunctional CD8 T Cells Form a Proliferative, Dynamically Regulated Compartment within Human Melanoma
2019-02-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.11.043
PMID:30595452
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现人类黑色素瘤中存在一个增殖活跃、动态分化的功能失调CD8 T细胞亚群 | 揭示了传统认为'耗竭'的CD8 T细胞实际上是肿瘤微环境中高度增殖、克隆性且动态分化的细胞群体 | 样本量相对有限（25例患者），且仅针对黑色素瘤这一特定癌症类型 | 深入表征人类癌症病灶中免疫浸润细胞的异质性和动态变化 | 黑色素瘤患者的肿瘤浸润CD4和CD8 T细胞 | 单细胞生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 25例黑色素瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7108 | 2025-10-06 |
A component overlapping attribute clustering (COAC) algorithm for single-cell RNA sequencing data analysis and potential pathobiological implications
2019-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006772
PMID:30779739
|
研究论文 | 本研究开发了一种用于单细胞RNA测序数据分析的组件重叠属性聚类算法 | 提出COAC算法进行局部基因共表达网络分析，能够从单细胞RNA测序数据中识别特定基因共表达模式的子网络 | 未明确说明算法在特定数据类型或规模下的性能限制 | 开发新的计算方法分析单细胞RNA测序数据，识别与疾病相关的功能基因集和调控网络 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | COAC算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7109 | 2025-10-06 |
Transcriptional Heterogeneity in Naive and Primed Human Pluripotent Stem Cells at Single-Cell Resolution
2019-01-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.12.099
PMID:30673604
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类初始态和始发态多能干细胞在转录水平的异质性 | 首次在单细胞分辨率下揭示人类初始态多能干细胞中存在具有始发态特征的中间亚群，并发现跨物种保守的多能性调控轴 | 未深入验证已识别标记基因的功能机制 | 解析人类初始态和始发态多能干细胞的转录组特征差异 | 人类初始态和始发态多能干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7110 | 2025-10-06 |
The Emergence and Functional Fitness of Memory CD4+ T Cells Require the Transcription Factor Thpok
2019-01-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.12.019
PMID:30638736
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了转录因子Thpok在记忆CD4+ T细胞生成和功能适应性中的关键作用 | 首次发现Thpok转录因子通过拮抗Blimp1和Runx3表达来保护记忆细胞免于功能失调，连接了记忆细胞分化和功能适应性这两个先前未关联的免疫属性 | 研究主要关注急性病毒感染模型，在慢性感染或其他疾病背景下的适用性需要进一步验证 | 阐明控制记忆CD4+ T细胞从早期抗原应答细胞中产生的转录调控机制 | 病毒特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7111 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing of iPSC-Dopamine Neurons Reconstructs Disease Progression and Identifies HDAC4 as a Regulator of Parkinson Cell Phenotypes
2019-01-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.10.023
PMID:30503143
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析iPSC来源的多巴胺神经元，重建帕金森病进展过程并发现HDAC4是疾病表型的关键调控因子 | 利用单细胞转录组分析揭示帕金森病进展的基因表达轴，首次发现HDAC4在疾病进程中的上游调控作用 | 研究仅针对GBA-N370S PD风险变异的iPSC衍生神经元，未涵盖其他帕金森病遗传变异类型 | 解析帕金森病进展机制并识别潜在治疗靶点 | 携带GBA-N370S PD风险变异的iPSC来源多巴胺神经元 | 单细胞组学 | 帕金森病 | 单细胞转录组测序 | 假时间分析 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7112 | 2025-10-06 |
Identification of Embryonic Neural Plate Border Stem Cells and Their Generation by Direct Reprogramming from Adult Human Blood Cells
2019-01-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.11.015
PMID:30581079
|
研究论文 | 通过直接重编程将成体人类血细胞转化为诱导神经板边界干细胞，并鉴定其胚胎起源 | 首次实现从成体人类血细胞直接重编程获得神经板边界干细胞，并确定其起源于胚胎前脑后脑区域 | 研究主要基于体外实验，尚未进行体内功能验证 | 探索神经板边界干细胞的起源及其在再生医学中的应用潜力 | 人类成纤维细胞、血细胞、小鼠胚胎神经褶、人多能干细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 直接重编程, 基因编辑 | NA | 基因表达数据 | 人类成纤维细胞和血细胞，E8.5小鼠胚胎神经褶 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7113 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis of CD8 + T-cell memory inflation
2019, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.15115.1
PMID:31448339
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究持续病毒感染诱导的CD8+T细胞记忆膨胀现象 | 首次在脾脏和肠道不同部位对记忆膨胀T细胞进行单细胞转录组比较分析，定义了区分脾脏记忆膨胀与肠道组织驻留记忆T细胞的基因表达模块 | 研究仅限于MCMV感染模型，未验证其他持续病毒感染情况 | 阐明持续病毒感染和疫苗诱导的CD8+T细胞记忆膨胀的转录调控机制 | MCMV感染小鼠的病毒特异性CD8+T细胞 | 单细胞生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，四聚体分选 | NA | 单细胞转录组数据 | MCMV感染小鼠的脾脏和肠道上皮内淋巴细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7114 | 2025-10-06 |
Trans-ethnic association study of blood pressure determinants in over 750,000 individuals
2019-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-018-0303-9
PMID:30578418
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研究论文 | 一项跨种族多组学研究，通过大规模基因组关联分析重新阐释血压的遗传结构 | 发现208个新的常见血压SNPs和53个罕见变异，在45个组织中检测到4,043个血压关联，并通过小鼠肾脏单细胞RNA测序识别肾小管细胞中上调的血压基因 | NA | 识别血压稳态相关的基因、组织、表型组和药物背景 | 来自百万退伍军人计划(MVP)和合作研究的776,078名参与者 | 基因组学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 转录组关联研究(TWAS), 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床表型数据 | 最多776,078名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析, 转录组关联分析 | NA | NA |
| 7115 | 2025-10-06 |
Cell Type- and Sex-Dependent Transcriptome Profiles of Rat Anterior Pituitary Cells
2019, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2019.00623
PMID:31620083
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了大鼠垂体前叶细胞的细胞类型和性别依赖性转录组特征 | 首次在大鼠垂体前叶细胞中揭示了细胞类型特异性和性别依赖性的转录组特征，发现了许多新的遗传标记 | 研究仅针对青春期后大鼠，未涵盖其他发育阶段 | 探究垂体前叶不同细胞类型的转录组特征及其性别差异 | 大鼠垂体前叶细胞 | 单细胞生物学 | 内分泌疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫细胞化学 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过6,800个新鲜分散的垂体前叶细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7116 | 2025-10-06 |
Single-cell landscape in mammary epithelium reveals bipotent-like cells associated with breast cancer risk and outcome
2019, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-019-0554-8
PMID:31428694
|
研究论文 | 通过无标记算法分析人类乳腺上皮单细胞RNA测序数据，发现与乳腺癌风险和预后相关的双能干细胞样状态 | 开发无标记计算框架识别乳腺上皮中的新型双能干细胞样状态，解决了单细胞数据高丢失率导致的干细胞识别难题 | 未明确说明样本规模和具体技术平台的详细信息 | 识别人类乳腺上皮中的干细胞样状态及其与乳腺癌的关联 | 人类乳腺上皮细胞 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | scRNA-Seq, FACS | 无标记算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7117 | 2025-10-06 |
Spatially resolved transcriptomics reveals plant host responses to pathogens
2019, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-019-0498-5
PMID:31624491
|
研究论文 | 开发了一种名为GaST-seq的低成本空间转录组学方法，用于研究植物组织对病原体的空间响应 | 提出了GaST-seq这一新型空间转录组学工作流程，成本仅为现有测序方法的一小部分，能够同时获取宿主和病原体的空间转录组 | 植物模型系统的适用性仍具挑战性，现有转录组学方法稀疏可用 | 研究植物宿主对病原体的空间响应机制 | 拟南芥叶片及其对细菌分子flagellin-22和真核病原体Albugo laibachii感染的响应 | 空间转录组学 | 植物病害 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | Illumina | 空间转录组学 | Illumina TruSeq | GaST-seq（网格辅助空间转录组测序）工作流程 |
| 7118 | 2025-10-06 |
Seq-Well: A Sample-Efficient, Portable Picowell Platform for Massively Parallel Single-Cell RNA Sequencing
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_8
PMID:31028635
|
研究论文 | 介绍Seq-Well这一低成本、便携式皮孔平台，用于大规模并行单细胞RNA测序 | 开发了一种简单便携的皮孔平台，能够从多样化的低输入临床样本中同时分析数千个细胞的转录组 | NA | 开发一种高效、低成本的单细胞RNA测序平台 | 单细胞转录组 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | Seq-Well | 使用带有独特条形码的mRNA捕获珠和细胞共限制在皮孔中，通过半透膜密封实现高效细胞裂解和mRNA捕获 |
| 7119 | 2025-10-06 |
Genomic encoding of transcriptional burst kinetics
2019-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0836-1
PMID:30602787
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研究论文 | 本研究通过等位基因敏感的单细胞RNA测序揭示了哺乳动物基因转录爆发动力学的基因组编码机制 | 首次在转录组范围内量化内源性基因的爆发频率和大小，发现增强子主要控制爆发频率而核心启动子控制爆发大小的新机制 | 研究主要基于小鼠和人类基因，可能需要在其他物种中验证；单细胞RNA测序技术本身存在技术噪音 | 探究顺式调控序列如何编码转录爆发动力学 | 小鼠和人类内源性基因 | 基因组学 | NA | 等位基因敏感的单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7120 | 2025-10-06 |
Human bone marrow assessment by single-cell RNA sequencing, mass cytometry, and flow cytometry
2018-12-06, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.124928
PMID:30518681
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和流式细胞术对20名健康成人骨髓细胞进行全面评估 | 首次系统比较单细胞RNA测序与多参数流式细胞术在人类骨髓样本分析中的一致性，并利用质谱流式细胞术进行正交验证 | 样本量相对有限（20名健康成人），未包含疾病状态样本 | 评估单细胞分析技术在人类骨髓样本中的交叉验证能力和可重复性 | 健康成人骨髓细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 20名健康成人骨髓捐赠者 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 流式细胞术 | NA | NA |