单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7101 - 7120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7101 | 2025-10-06 |
Dysfunctional CD8 T Cells Form a Proliferative, Dynamically Regulated Compartment within Human Melanoma
2019-02-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.11.043
PMID:30595452
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现人类黑色素瘤中存在一个增殖活跃、动态分化的功能失调CD8 T细胞亚群 | 揭示了传统认为'耗竭'的CD8 T细胞实际上是肿瘤微环境中高度增殖、克隆性且动态分化的细胞群体 | 样本量相对有限（25例患者），且仅针对黑色素瘤这一特定癌症类型 | 深入表征人类癌症病灶中免疫浸润细胞的异质性和动态变化 | 黑色素瘤患者的肿瘤浸润CD4和CD8 T细胞 | 单细胞生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 25例黑色素瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7102 | 2025-10-06 |
A component overlapping attribute clustering (COAC) algorithm for single-cell RNA sequencing data analysis and potential pathobiological implications
2019-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006772
PMID:30779739
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研究论文 | 本研究开发了一种用于单细胞RNA测序数据分析的组件重叠属性聚类算法 | 提出COAC算法进行局部基因共表达网络分析，能够从单细胞RNA测序数据中识别特定基因共表达模式的子网络 | 未明确说明算法在特定数据类型或规模下的性能限制 | 开发新的计算方法分析单细胞RNA测序数据，识别与疾病相关的功能基因集和调控网络 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | COAC算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7103 | 2025-10-06 |
Transcriptional Heterogeneity in Naive and Primed Human Pluripotent Stem Cells at Single-Cell Resolution
2019-01-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.12.099
PMID:30673604
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类初始态和始发态多能干细胞在转录水平的异质性 | 首次在单细胞分辨率下揭示人类初始态多能干细胞中存在具有始发态特征的中间亚群，并发现跨物种保守的多能性调控轴 | 未深入验证已识别标记基因的功能机制 | 解析人类初始态和始发态多能干细胞的转录组特征差异 | 人类初始态和始发态多能干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7104 | 2025-10-06 |
The Emergence and Functional Fitness of Memory CD4+ T Cells Require the Transcription Factor Thpok
2019-01-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.12.019
PMID:30638736
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了转录因子Thpok在记忆CD4+ T细胞生成和功能适应性中的关键作用 | 首次发现Thpok转录因子通过拮抗Blimp1和Runx3表达来保护记忆细胞免于功能失调，连接了记忆细胞分化和功能适应性这两个先前未关联的免疫属性 | 研究主要关注急性病毒感染模型，在慢性感染或其他疾病背景下的适用性需要进一步验证 | 阐明控制记忆CD4+ T细胞从早期抗原应答细胞中产生的转录调控机制 | 病毒特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7105 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing of iPSC-Dopamine Neurons Reconstructs Disease Progression and Identifies HDAC4 as a Regulator of Parkinson Cell Phenotypes
2019-01-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.10.023
PMID:30503143
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研究论文 | 通过单细胞测序分析iPSC来源的多巴胺神经元，重建帕金森病进展过程并发现HDAC4是疾病表型的关键调控因子 | 利用单细胞转录组分析揭示帕金森病进展的基因表达轴，首次发现HDAC4在疾病进程中的上游调控作用 | 研究仅针对GBA-N370S PD风险变异的iPSC衍生神经元，未涵盖其他帕金森病遗传变异类型 | 解析帕金森病进展机制并识别潜在治疗靶点 | 携带GBA-N370S PD风险变异的iPSC来源多巴胺神经元 | 单细胞组学 | 帕金森病 | 单细胞转录组测序 | 假时间分析 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7106 | 2025-10-06 |
Identification of Embryonic Neural Plate Border Stem Cells and Their Generation by Direct Reprogramming from Adult Human Blood Cells
2019-01-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.11.015
PMID:30581079
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研究论文 | 通过直接重编程将成体人类血细胞转化为诱导神经板边界干细胞，并鉴定其胚胎起源 | 首次实现从成体人类血细胞直接重编程获得神经板边界干细胞，并确定其起源于胚胎前脑后脑区域 | 研究主要基于体外实验，尚未进行体内功能验证 | 探索神经板边界干细胞的起源及其在再生医学中的应用潜力 | 人类成纤维细胞、血细胞、小鼠胚胎神经褶、人多能干细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 直接重编程, 基因编辑 | NA | 基因表达数据 | 人类成纤维细胞和血细胞，E8.5小鼠胚胎神经褶 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7107 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis of CD8 + T-cell memory inflation
2019, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.15115.1
PMID:31448339
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究持续病毒感染诱导的CD8+T细胞记忆膨胀现象 | 首次在脾脏和肠道不同部位对记忆膨胀T细胞进行单细胞转录组比较分析，定义了区分脾脏记忆膨胀与肠道组织驻留记忆T细胞的基因表达模块 | 研究仅限于MCMV感染模型，未验证其他持续病毒感染情况 | 阐明持续病毒感染和疫苗诱导的CD8+T细胞记忆膨胀的转录调控机制 | MCMV感染小鼠的病毒特异性CD8+T细胞 | 单细胞生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，四聚体分选 | NA | 单细胞转录组数据 | MCMV感染小鼠的脾脏和肠道上皮内淋巴细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7108 | 2025-10-06 |
Trans-ethnic association study of blood pressure determinants in over 750,000 individuals
2019-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-018-0303-9
PMID:30578418
|
研究论文 | 一项跨种族多组学研究，通过大规模基因组关联分析重新阐释血压的遗传结构 | 发现208个新的常见血压SNPs和53个罕见变异，在45个组织中检测到4,043个血压关联，并通过小鼠肾脏单细胞RNA测序识别肾小管细胞中上调的血压基因 | NA | 识别血压稳态相关的基因、组织、表型组和药物背景 | 来自百万退伍军人计划(MVP)和合作研究的776,078名参与者 | 基因组学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 转录组关联研究(TWAS), 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床表型数据 | 最多776,078名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析, 转录组关联分析 | NA | NA |
| 7109 | 2025-10-06 |
Cell Type- and Sex-Dependent Transcriptome Profiles of Rat Anterior Pituitary Cells
2019, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2019.00623
PMID:31620083
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了大鼠垂体前叶细胞的细胞类型和性别依赖性转录组特征 | 首次在大鼠垂体前叶细胞中揭示了细胞类型特异性和性别依赖性的转录组特征，发现了许多新的遗传标记 | 研究仅针对青春期后大鼠，未涵盖其他发育阶段 | 探究垂体前叶不同细胞类型的转录组特征及其性别差异 | 大鼠垂体前叶细胞 | 单细胞生物学 | 内分泌疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫细胞化学 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过6,800个新鲜分散的垂体前叶细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7110 | 2025-10-06 |
Single-cell landscape in mammary epithelium reveals bipotent-like cells associated with breast cancer risk and outcome
2019, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-019-0554-8
PMID:31428694
|
研究论文 | 通过无标记算法分析人类乳腺上皮单细胞RNA测序数据，发现与乳腺癌风险和预后相关的双能干细胞样状态 | 开发无标记计算框架识别乳腺上皮中的新型双能干细胞样状态，解决了单细胞数据高丢失率导致的干细胞识别难题 | 未明确说明样本规模和具体技术平台的详细信息 | 识别人类乳腺上皮中的干细胞样状态及其与乳腺癌的关联 | 人类乳腺上皮细胞 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | scRNA-Seq, FACS | 无标记算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7111 | 2025-10-06 |
Spatially resolved transcriptomics reveals plant host responses to pathogens
2019, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-019-0498-5
PMID:31624491
|
研究论文 | 开发了一种名为GaST-seq的低成本空间转录组学方法，用于研究植物组织对病原体的空间响应 | 提出了GaST-seq这一新型空间转录组学工作流程，成本仅为现有测序方法的一小部分，能够同时获取宿主和病原体的空间转录组 | 植物模型系统的适用性仍具挑战性，现有转录组学方法稀疏可用 | 研究植物宿主对病原体的空间响应机制 | 拟南芥叶片及其对细菌分子flagellin-22和真核病原体Albugo laibachii感染的响应 | 空间转录组学 | 植物病害 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | Illumina | 空间转录组学 | Illumina TruSeq | GaST-seq（网格辅助空间转录组测序）工作流程 |
| 7112 | 2025-10-06 |
Seq-Well: A Sample-Efficient, Portable Picowell Platform for Massively Parallel Single-Cell RNA Sequencing
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_8
PMID:31028635
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研究论文 | 介绍Seq-Well这一低成本、便携式皮孔平台，用于大规模并行单细胞RNA测序 | 开发了一种简单便携的皮孔平台，能够从多样化的低输入临床样本中同时分析数千个细胞的转录组 | NA | 开发一种高效、低成本的单细胞RNA测序平台 | 单细胞转录组 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | Seq-Well | 使用带有独特条形码的mRNA捕获珠和细胞共限制在皮孔中，通过半透膜密封实现高效细胞裂解和mRNA捕获 |
| 7113 | 2025-10-06 |
Genomic encoding of transcriptional burst kinetics
2019-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0836-1
PMID:30602787
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研究论文 | 本研究通过等位基因敏感的单细胞RNA测序揭示了哺乳动物基因转录爆发动力学的基因组编码机制 | 首次在转录组范围内量化内源性基因的爆发频率和大小，发现增强子主要控制爆发频率而核心启动子控制爆发大小的新机制 | 研究主要基于小鼠和人类基因，可能需要在其他物种中验证；单细胞RNA测序技术本身存在技术噪音 | 探究顺式调控序列如何编码转录爆发动力学 | 小鼠和人类内源性基因 | 基因组学 | NA | 等位基因敏感的单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7114 | 2025-10-06 |
Human bone marrow assessment by single-cell RNA sequencing, mass cytometry, and flow cytometry
2018-12-06, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.124928
PMID:30518681
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和流式细胞术对20名健康成人骨髓细胞进行全面评估 | 首次系统比较单细胞RNA测序与多参数流式细胞术在人类骨髓样本分析中的一致性，并利用质谱流式细胞术进行正交验证 | 样本量相对有限（20名健康成人），未包含疾病状态样本 | 评估单细胞分析技术在人类骨髓样本中的交叉验证能力和可重复性 | 健康成人骨髓细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 20名健康成人骨髓捐赠者 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 流式细胞术 | NA | NA |
| 7115 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing in Normal and Malignant Hematopoiesis
2018 Mar-Apr, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1097/HS9.0000000000000034
PMID:31723762
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在正常和恶性造血系统中的最新研究进展 | 应用新兴单细胞测序技术解析造血系统细胞群体异质性和群体间关系，并比较正常与疾病状态的差异 | NA | 探讨单细胞测序技术在造血系统研究中的应用 | 造血干细胞及其分化产生的10多种成熟细胞类型 | 单细胞生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个单个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7116 | 2025-10-06 |
Maturing Human CD127+ CCR7+ PDL1+ Dendritic Cells Express AIRE in the Absence of Tissue Restricted Antigens
2018, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2018.02902
PMID:30692988
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研究论文 | 本研究识别并分析了人类扁桃体中表达AIRE的树突状细胞及其特征 | 首次在人类外周组织中明确识别AIRE表达细胞为树突状细胞，并发现其表达与组织限制性抗原无关 | 研究主要基于扁桃体组织，未验证其他外周组织中的情况 | 探索人类外周组织中AIRE表达细胞的来源和功能特征 | 人类扁桃体组织中的AIRE+树突状细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 流式细胞术,CyTOF,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据 | 人类扁桃体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7117 | 2025-10-06 |
GPseudoRank: a permutation sampler for single cell orderings
2019-02-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty664
PMID:30052778
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研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序数据排序的置换采样方法GPseudoRank | 能够从复杂多峰分布中采样细胞排序，并估计生物过程中伪时间不确定性的变化 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞排序不确定性的建模问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞排序 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型，MCMC | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7118 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Microglia throughout the Mouse Lifespan and in the Injured Brain Reveals Complex Cell-State Changes
2019-01-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.11.004
PMID:30471926
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠生命周期和脑损伤中的小胶质细胞状态变化 | 首次系统揭示小胶质细胞在整个生命周期和脑损伤条件下存在至少9种转录组学不同状态 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探索小胶质细胞在不同生理和病理状态下的分子和功能特征 | 小鼠小胶质细胞 | 单细胞组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过76,000个小胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7119 | 2025-10-06 |
Metabolic regulation of pluripotency and germ cell fate through α-ketoglutarate
2019-01-03, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.201899518
PMID:30257965
|
研究论文 | 本研究探讨了α-酮戊二酸通过代谢调控在多能性维持和生殖细胞命运决定中的功能机制 | 揭示了线粒体三羧酸循环活性通过IDH2介导的α-酮戊二酸产生调控表观遗传机制的新途径 | 研究基于小鼠早期胚胎发育模型，在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 探索代谢与细胞身份决定之间的分子联系机制 | 小鼠早期胚胎发育过程中的幼稚多能性细胞和原始生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 统计建模, 能量代谢调控 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7120 | 2025-10-06 |
foxF-1 Controls Specification of Non-body Wall Muscle and Phagocytic Cells in Planarians
2018-12-03, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2018.10.030
PMID:30471994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了foxF-1作为涡虫非体壁肌肉和吞噬细胞的主转录调控因子 | 首次鉴定foxF-1为涡虫所有非体壁肌肉的主转录调控因子，并发现其同时调控多种吞噬细胞的特化 | 未明确foxF-1调控的部分细胞类型功能 | 解析涡虫不同类型肌肉纤维和吞噬细胞的转录调控程序 | 涡虫的背腹肌、肠肌、咽肌及吞噬细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |