单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7101 - 7120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7101 | 2025-10-06 |
Endothelial-to-haematopoietic transition: an update on the process of making blood
2019-04-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20180320
PMID:30902922
|
综述 | 本文总结了内皮-造血转化过程的最新研究进展及其在造血干细胞生成中的应用前景 | 整合多种模型系统的最新研究成果，重点介绍活体成像技术和单细胞RNA测序等先进技术对EHT研究的重要推动 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要依赖已有文献的总结和分析 | 阐明内皮-造血转化过程的分子机制及其在临床造血干细胞生成中的应用 | 小鼠、鸡和斑马鱼胚胎以及多能干细胞分化系统 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA-Seq, 活体成像技术, 转录谱分析 | NA | 转录组数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7102 | 2025-10-06 |
Comparative analysis of sequencing technologies for single-cell transcriptomics
2019-04-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1676-5
PMID:30961669
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研究论文 | 比较BGISEQ-500和Illumina HiSeq平台在单细胞转录组测序中的性能表现 | 首次系统比较低成本BGISEQ-500平台与主流Illumina HiSeq平台在scRNA-seq中的应用效果 | 仅使用两种细胞系和有限样本量进行验证 | 评估不同测序平台在单细胞转录组测序中的技术性能 | 人类细胞系（含RNA spike-ins） | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 468个单细胞和1297个匹配单cDNA样本 | 华大基因,Illumina | 单细胞RNA-seq | BGISEQ-500,HiSeq | 采用单端和双端测序模式，使用SMARTer和Smart-seq2建库协议 |
| 7103 | 2025-10-06 |
Multimodal Single-Cell Analysis Reveals Physiological Maturation in the Developing Human Neocortex
2019-04-03, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.01.027
PMID:30770253
|
研究论文 | 通过多模态单细胞分析揭示发育中人类新皮质的生理成熟过程 | 首次将细胞内钙响应测量与单细胞RNA测序相结合，揭示了生理异质性与细胞类型的关联，并发现人类特异性HTR2A受体在放射状胶质细胞中的功能 | 研究主要关注神经递质受体介导的钙响应，可能未覆盖其他类型的生理响应机制 | 探索发育中人类新皮质细胞的生理异质性与分子特征的关系 | 发育中人类新皮质的祖细胞和新生神经元 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序, 钙成像 | NA | 单细胞转录组数据, 生理响应数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多模态单细胞分析 | NA | NA |
| 7104 | 2024-08-05 |
Cerebral organoids at the air-liquid interface generate diverse nerve tracts with functional output
2019-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-019-0350-2
PMID:30886407
|
研究论文 | 本文探讨了大脑类器官在气液界面培养条件下的神经轨迹形成及其功能输出 | 通过气液界面培养，显著提高了神经元存活率和轴突生长，显示出不同的神经轨迹形态及功能 | 研究未提及样本数量的限制或长期功能观察 | 旨在改善对人脑发育和神经疾病的理解 | 研究对象为大脑类器官及其形成的神经网络 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7105 | 2025-10-06 |
EmptyDrops: distinguishing cells from empty droplets in droplet-based single-cell RNA sequencing data
2019-03-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1662-y
PMID:30902100
|
研究论文 | 提出一种新的统计方法EmptyDrops，用于区分液滴单细胞RNA测序数据中的真实细胞与空液滴 | 基于检测与周围溶液表达谱显著偏离的新统计方法，相比现有方法具有更高检测效能且能控制假发现率 | NA | 开发区分液滴单细胞RNA测序数据中真实细胞与空液滴的计算方法 | 液滴单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 液滴单细胞RNA测序 |
| 7106 | 2025-10-06 |
Unravelling Intratumoral Heterogeneity through High-Sensitivity Single-Cell Mutational Analysis and Parallel RNA Sequencing
2019-03-21, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2019.01.009
PMID:30765193
|
研究论文 | 开发了TARGET-seq方法，用于在单细胞水平同时进行高灵敏度突变检测和全转录组分析 | 开发了TARGET-seq技术，能够在同一单细胞中并行检测基因组和编码DNA的多个突变，同时进行无偏倚的全转录组分析 | NA | 解析肿瘤内异质性，关联遗传突变与转录组特征 | 骨髓增生性肿瘤（MPN）干细胞和祖细胞 | 单细胞多组学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞RNA测序，突变分析 | NA | 基因组DNA，转录组数据 | 4,559个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | NA | TARGET-seq（作者开发的新方法） |
| 7107 | 2025-10-06 |
PAGA: graph abstraction reconciles clustering with trajectory inference through a topology preserving map of single cells
2019-03-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1663-x
PMID:30890159
|
研究论文 | 提出一种名为PAGA的图抽象方法，用于在单细胞数据分析中协调聚类与轨迹推断 | 通过估计流形分区的连通性，提供可解释的图状数据流形映射，保持数据全局拓扑结构 | NA | 开发单细胞RNA测序数据的拓扑保持可视化与分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图抽象模型 | 基因表达数据 | 四个造血数据集、成年涡虫、斑马鱼胚胎及一百万神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7108 | 2025-10-06 |
In Vivo Generation of Post-infarct Human Cardiac Muscle by Laminin-Promoted Cardiovascular Progenitors
2019-03-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.02.083
PMID:30893597
|
研究论文 | 开发了一种基于层粘连蛋白的方法生成心血管祖细胞，用于心肌梗死后的心脏肌肉再生 | 首次鉴定层粘连蛋白-221促进人多能干细胞向心血管谱系分化，建立了化学限定、无动物源成分的分化方案 | 研究仅在心肌梗死小鼠模型中进行验证，尚未进行人体临床试验 | 开发可重复生成临床级心血管祖细胞的方法用于心脏再生 | 人胚胎干细胞、心血管祖细胞、心肌梗死小鼠模型 | 再生医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 超声心动图, 组织学分析 | NA | 基因表达数据, 影像数据, 组织学数据 | 多个人胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7109 | 2025-10-06 |
Dissecting Cell Lineage Specification and Sex Fate Determination in Gonadal Somatic Cells Using Single-Cell Transcriptomics
2019-03-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.02.069
PMID:30893600
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序研究性腺体细胞谱系特化和性别命运决定机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示性腺早期祖细胞通过非性别特异性转录程序分化为支持细胞，并发现XX细胞在类固醇生成前体细胞命运获得中存在相对延迟 | 研究仅聚焦于卵巢Nr5a1-GFP体细胞，未涵盖所有性腺细胞类型 | 解析性腺体细胞谱系特化和性别命运决定的分子机制 | 小鼠卵巢Nr5a1-GFP体细胞，包括XX和XY性腺体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 时间序列单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7110 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-seq identifies the origins of heterogeneity in efficient cell transdifferentiation and reprogramming
2019-03-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.41627
PMID:30860479
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究细胞转分化和重编程过程中异质性的起源 | 发现起始细胞群体中Myc活性的差异可预测重编程效率，揭示了细胞命运转换异质性的起源机制 | 研究主要基于小鼠前B细胞模型，在其他细胞类型中的普适性需进一步验证 | 理解细胞转分化和重编程过程中效率异质性的分子机制 | 小鼠前B细胞的转分化和重编程过程 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算分析模型 | 单细胞基因表达数据 | 小鼠前B细胞单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7111 | 2025-10-06 |
Endothelial miR-30c suppresses tumor growth via inhibition of TGF-β-induced Serpine1
2019-03-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI123106
PMID:30855280
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研究论文 | 本研究揭示内皮细胞miR-30c通过抑制TGF-β诱导的Serpine1表达来抑制肿瘤生长 | 首次发现miR-30c通过调节纤溶酶原激活物抑制剂1(Serpine1/PAI-1)平衡，在肿瘤微环境中发挥抑癌作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究内皮细胞中miR-30c对肿瘤血管生成和生长的调控机制 | Cdh5-CreERT2 Tgfbr2fl/fl转基因小鼠的内皮细胞及肺部和乳腺肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, miRNA芯片分析, 纳米颗粒递送技术 | NA | 基因表达数据, miRNA表达数据 | 转基因小鼠模型和肿瘤模型的内皮细胞 | NanoString | 单细胞RNA-seq, miRNA阵列 | NanoString miRNA阵列 | 单细胞RNA测序技术和NanoString miRNA表达分析平台 |
| 7112 | 2025-10-06 |
Quiescence Modulates Stem Cell Maintenance and Regenerative Capacity in the Aging Brain
2019-03-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.01.040
PMID:30827680
|
研究论文 | 本研究揭示了衰老大脑中神经干细胞通过增加静息状态维持干细胞池并影响再生能力的机制 | 发现衰老大脑中神经干细胞数量减少但静息状态增强，并鉴定出炎症信号和sFRP5是诱导静息的关键因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类大脑中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老过程中神经干细胞功能衰退的分子机制 | 衰老小鼠大脑中的神经干细胞 | 干细胞生物学 | 老年性疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7113 | 2025-10-06 |
Seizing Sequencing Data to Consider Cell and Circuit Complexity
2019 Mar-Apr, Epilepsy currents
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/1535759719835658
PMID:30955433
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示海马CA1区抑制性神经元的类别和连续变异模式 | 首次在海马CA1区抑制性神经元中发现连续变异模式与离散类别并存，并识别出新的细胞类别 | 研究仅聚焦海马CA1区，结果可能不适用于其他脑区 | 解析海马CA1区抑制性神经元的多样性分类体系 | 小鼠海马CA1区GABA能抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | 潜在因子分析 | 基因表达数据 | 3663个CA1抑制性细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7114 | 2025-10-06 |
Single-cell imaging and RNA sequencing reveal patterns of gene expression heterogeneity during fission yeast growth and adaptation
2019-03, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-018-0330-4
PMID:30718845
|
研究论文 | 通过单细胞成像和RNA测序技术研究裂殖酵母在不同环境条件下的基因表达异质性模式 | 结合成像、单细胞RNA测序和贝叶斯真实计数恢复方法，首次在基因组水平系统研究裂殖酵母基因表达异质性 | 研究仅限于裂殖酵母这一单细胞真核生物，结果可能不适用于其他生物系统 | 探索微生物表型变异背后的基因表达异质性机制 | 裂殖酵母单细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 细胞成像, 贝叶斯统计 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据, 图像数据 | 超过2,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7115 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Diverse Pathogen Responses Defines a Molecular Roadmap for Generating Antigen-Specific Immunity
2019-02-27, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.01.001
PMID:30772378
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析不同病原体免疫反应的早期事件，揭示抗原特异性免疫生成的分子路线图 | 首次结合荧光标记病原体与大规模平行单细胞RNA测序，系统表征先天免疫应答早期阶段的细胞类型和通路 | 仅观察免疫后48小时内的早期事件，未追踪长期适应性免疫应答 | 阐明指导稳健适应性免疫应答的先天免疫细胞类型和通路 | 淋巴结细胞、抗原阳性细胞、NK细胞、单核细胞 | 系统免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7116 | 2025-10-06 |
Dysfunctional CD8 T Cells Form a Proliferative, Dynamically Regulated Compartment within Human Melanoma
2019-02-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.11.043
PMID:30595452
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现人类黑色素瘤中存在一个增殖活跃、动态分化的功能失调CD8 T细胞亚群 | 揭示了传统认为'耗竭'的CD8 T细胞实际上是肿瘤微环境中高度增殖、克隆性且动态分化的细胞群体 | 样本量相对有限（25例患者），且仅针对黑色素瘤这一特定癌症类型 | 深入表征人类癌症病灶中免疫浸润细胞的异质性和动态变化 | 黑色素瘤患者的肿瘤浸润CD4和CD8 T细胞 | 单细胞生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 25例黑色素瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7117 | 2025-10-06 |
A component overlapping attribute clustering (COAC) algorithm for single-cell RNA sequencing data analysis and potential pathobiological implications
2019-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006772
PMID:30779739
|
研究论文 | 本研究开发了一种用于单细胞RNA测序数据分析的组件重叠属性聚类算法 | 提出COAC算法进行局部基因共表达网络分析，能够从单细胞RNA测序数据中识别特定基因共表达模式的子网络 | 未明确说明算法在特定数据类型或规模下的性能限制 | 开发新的计算方法分析单细胞RNA测序数据，识别与疾病相关的功能基因集和调控网络 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | COAC算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7118 | 2025-10-06 |
Transcriptional Heterogeneity in Naive and Primed Human Pluripotent Stem Cells at Single-Cell Resolution
2019-01-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.12.099
PMID:30673604
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类初始态和始发态多能干细胞在转录水平的异质性 | 首次在单细胞分辨率下揭示人类初始态多能干细胞中存在具有始发态特征的中间亚群，并发现跨物种保守的多能性调控轴 | 未深入验证已识别标记基因的功能机制 | 解析人类初始态和始发态多能干细胞的转录组特征差异 | 人类初始态和始发态多能干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7119 | 2025-10-06 |
The Emergence and Functional Fitness of Memory CD4+ T Cells Require the Transcription Factor Thpok
2019-01-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.12.019
PMID:30638736
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了转录因子Thpok在记忆CD4+ T细胞生成和功能适应性中的关键作用 | 首次发现Thpok转录因子通过拮抗Blimp1和Runx3表达来保护记忆细胞免于功能失调，连接了记忆细胞分化和功能适应性这两个先前未关联的免疫属性 | 研究主要关注急性病毒感染模型，在慢性感染或其他疾病背景下的适用性需要进一步验证 | 阐明控制记忆CD4+ T细胞从早期抗原应答细胞中产生的转录调控机制 | 病毒特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7120 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing of iPSC-Dopamine Neurons Reconstructs Disease Progression and Identifies HDAC4 as a Regulator of Parkinson Cell Phenotypes
2019-01-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.10.023
PMID:30503143
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析iPSC来源的多巴胺神经元，重建帕金森病进展过程并发现HDAC4是疾病表型的关键调控因子 | 利用单细胞转录组分析揭示帕金森病进展的基因表达轴，首次发现HDAC4在疾病进程中的上游调控作用 | 研究仅针对GBA-N370S PD风险变异的iPSC衍生神经元，未涵盖其他帕金森病遗传变异类型 | 解析帕金森病进展机制并识别潜在治疗靶点 | 携带GBA-N370S PD风险变异的iPSC来源多巴胺神经元 | 单细胞组学 | 帕金森病 | 单细胞转录组测序 | 假时间分析 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |