单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 7101 - 7120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7101 | 2024-10-19 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2024-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579846
PMID:38370670
|
研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学技术，发现脂肪酸结合蛋白在肺动脉高压中的调控作用 | 首次揭示了FABP4和FABP5在肺动脉高压中的异常表达及其对内皮细胞糖酵解和远端动脉编程的影响 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本，需要进一步在更多临床样本中验证 | 探讨肺动脉高压的细胞和分子机制，为开发新的治疗方法提供依据 | 肺动脉高压患者的内皮细胞和肺组织 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、空间转录组学分析 | NA | RNA | 包括CKO小鼠、IPAH患者和PH大鼠的肺动脉内皮细胞及肺组织 |
| 7102 | 2024-10-19 |
Aneuploid embryonic stem cells drive teratoma metastasis
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45265-4
PMID:38316790
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研究论文 | 研究探讨了非整倍体胚胎干细胞驱动的畸胎瘤转移机制 | 首次证明了非整倍体胚胎干细胞衍生的畸胎瘤能够转移到多个器官，且不需要额外的拷贝数变异 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类癌症中验证 | 探索非整倍体在癌症转移中的因果关系 | 非整倍体和二倍体胚胎干细胞衍生的畸胎瘤 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胚胎干细胞及其衍生的畸胎瘤 |
| 7103 | 2024-10-19 |
Single-cell sequencing dissects the transcriptional identity of activated fibroblasts and identifies novel persistent distal tubular injury patterns in kidney fibrosis
2024-01-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50195-0
PMID:38172172
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析，揭示了激活的成纤维细胞和肾小管上皮细胞损伤的转录特征，并发现了肾纤维化中新的远端小管损伤模式 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了肾纤维化中激活的成纤维细胞的分子和细胞景观，并发现了新的远端小管损伤模式 | NA | 深入理解肾纤维化的机制，并为慢性肾病（CKD）的靶向治疗提供新策略 | 肾纤维化中的激活成纤维细胞和肾小管上皮细胞损伤 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 两个临床相关的肾纤维化模型 |
| 7104 | 2024-10-19 |
An overview of the detection of bovine respiratory disease complex pathogens using immunohistochemistry: emerging trends and opportunities
2024-Jan, Journal of veterinary diagnostic investigation : official publication of the American Association of Veterinary Laboratory Diagnosticians, Inc
IF:1.2Q3
DOI:10.1177/10406387231210489
PMID:37982437
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综述 | 本文综述了使用免疫组织化学（IHC）检测牛呼吸道疾病复合体（BRDC）病原体的技术和方法，并探讨了新兴趋势和机会 | 本文介绍了多重IHC用于检测共感染、数字成像和自动化、改进的荧光染料检测系统以及IHC与空间转录组学的整合等新兴趋势 | NA | 探讨IHC在BRDC研究中的应用及其未来发展方向 | 牛呼吸道疾病复合体（BRDC）病原体及其相关技术 | NA | 牛呼吸道疾病 | 免疫组织化学（IHC） | NA | NA | NA |
| 7105 | 2024-10-19 |
Inflammatory Alterations to Renal Lymphatic Endothelial Cell Gene Expression in Mouse Models of Hypertension
2024, Kidney & blood pressure research
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000539721
PMID:38972305
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研究论文 | 研究了高血压模型小鼠肾脏淋巴内皮细胞基因表达的炎症变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了高血压模型小鼠肾脏淋巴内皮细胞的基因表达变化，并发现了与炎症相关的基因和通路 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 评估高血压状态下肾脏淋巴内皮细胞的具体变化 | 高血压模型小鼠的肾脏淋巴内皮细胞 | 心血管疾病 | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了高血压模型小鼠的肾脏CD31+和podoplanin+细胞 |
| 7106 | 2024-10-19 |
Lung lymphatic endothelial cells undergo inflammatory and prothrombotic changes in a model of chronic obstructive pulmonary disease
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1344070
PMID:38440076
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研究论文 | 研究了慢性阻塞性肺疾病（COPD）模型中肺淋巴内皮细胞的炎症和促凝血变化 | 首次探讨了香烟烟雾和凝血酶对肺淋巴内皮细胞的直接影响，并发现这些因素导致细胞的纤维蛋白溶解活性降低和炎症标志物表达增加 | 需要进一步研究这些变化如何影响淋巴功能并驱动COPD中的组织损伤 | 探讨COPD中肺淋巴内皮细胞的炎症和促凝血变化 | 肺淋巴内皮细胞 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序，免疫组织化学染色 | NA | RNA | 使用了来自COPD患者和对照组的肺组织样本，以及暴露于香烟烟雾的小鼠肺淋巴内皮细胞 |
| 7107 | 2024-10-19 |
Cluster of differentiation-44 as a novel biomarker of lupus nephritis and its role in kidney inflammation and fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1443153
PMID:39411720
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研究论文 | 研究CD44作为狼疮性肾炎的新型生物标志物及其在肾脏炎症和纤维化中的作用 | 首次探讨CD44在狼疮性肾炎中的病理作用，并验证其作为早期诊断标志物的潜力 | 研究仅限于小鼠模型和部分患者样本，需进一步临床验证 | 探讨CD44在狼疮性肾炎中的作用及其作为生物标志物的潜力 | CD44在狼疮性肾炎患者和小鼠模型中的表达及其与肾脏炎症和纤维化的关系 | NA | 狼疮性肾炎 | ELISA, ScRNA-Seq | NA | 血液, 肾脏组织 | NZB/W F1小鼠模型, 狼疮性肾炎患者 |
| 7108 | 2024-10-19 |
Single-cell profiling of cellular changes in the somatic peripheral nerves following nerve injury
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1448253
PMID:39415832
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在周围神经损伤后背根神经节和周围神经中的最新发现，揭示了周围神经的细胞异质性和损伤后的变化 | 提供了单细胞分辨率下周围神经损伤后细胞变化的全面和深入的视角 | NA | 探讨周围神经损伤后的病理变化，为神经再生治疗的发展提供基础 | 周围神经损伤后的背根神经节和周围神经的单细胞转录组状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7109 | 2024-10-19 |
Attenuation of aggressive tumor progression of anaplastic thyroid cancer by p53
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/KXJJ8824
PMID:39417187
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研究论文 | 研究探讨了野生型p53在抑制未分化甲状腺癌（ATC）进展中的作用 | 首次证明了外源表达的野生型p53能够抑制突变型p53的致癌作用，并提出了使用CRISPR/Cas9基因编辑技术修改p53等位基因以治疗ATC的可能性 | 研究仅限于细胞和动物模型，尚未在临床试验中验证 | 探讨野生型p53在抑制未分化甲状腺癌进展中的作用 | 未分化甲状腺癌细胞（8505C细胞）和其异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了8505C细胞及其表达野生型和突变型p53的变体，以及相应的异种移植小鼠模型 |
| 7110 | 2024-10-19 |
Comprehensive analysis of the potential biological significance of cuproptosis-related gene LIPT2 in pan-cancer prognosis and immunotherapy
2023-12-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50039-x
PMID:38129565
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研究论文 | 本文分析了铜死亡相关基因LIPT2在泛癌预后和免疫治疗中的潜在生物学意义 | 首次全面评估了LIPT2基因在多种癌症中的表达水平及其对预后的影响，并探讨了其在免疫治疗中的潜在作用 | 研究主要基于生物信息学方法，缺乏实验验证 | 探讨LIPT2在泛癌中的生物学功能及其在预后和免疫治疗中的潜在意义 | LIPT2基因在多种癌症中的表达及其对预后和免疫治疗的影响 | NA | NA | 生物信息学方法，单细胞测序 | NA | 基因表达数据，突变数据，甲基化数据，免疫状态数据 | 涉及多种癌症类型的样本 |
| 7111 | 2024-10-19 |
Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis
2023-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.16.537094
PMID:37131626
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研究论文 | 评估GPT-4在单细胞RNA测序分析中进行细胞类型注释的性能 | 利用GPT-4这一强大的大型语言模型，自动且准确地通过标准单细胞RNA测序分析管道生成的标记基因信息进行细胞类型注释 | NA | 评估GPT-4在细胞类型注释中的应用潜力，并开发相应的开源软件包 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GPT-4 | 基因表达数据 | 数百种组织类型和细胞类型 |
| 7112 | 2024-10-19 |
Fishing Innate Immune System Properties through the Transcriptomic Single-Cell Data of Teleostei
2023-Dec-12, Biology
DOI:10.3390/biology12121516
PMID:38132342
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研究论文 | 本文总结了与鱼类先天免疫系统（IIS）相关的单细胞RNA测序（scRNAseq）和空间转录组学实验数据 | 本文首次系统地总结了鱼类先天免疫系统的单细胞RNA测序数据，并提出了对非模式鱼类进行新实验的必要性 | 目前只有少数scRNAseq数据可用于其他鱼类，且缺乏对非模式鱼类的研究 | 研究鱼类先天免疫系统的特性和多样性 | 鱼类的先天免疫系统 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 涉及多种鱼类器官和发育阶段的多个scRNAseq实验数据 |
| 7113 | 2024-10-19 |
Consensus scHPF Identifies Cell Type-Specific Drug Responses in Glioma by Integrating Large-Scale scRNA-seq
2023-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.570193
PMID:38105955
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研究论文 | 本文介绍了一种名为共识scHPF的贝叶斯矩阵分解算法，用于整合大规模单细胞RNA测序数据，以识别胶质瘤中特定细胞类型的药物反应 | 提出了共识scHPF算法，通过分析多个随机初始化的scHPF模型，识别最稳健的基因特征并自动确定给定数据集的因子数量 | NA | 开发一种新的算法来整合复杂的单细胞RNA测序数据，以识别特定细胞类型的药物反应 | 胶质瘤切片培养样本，包括19名患者、10种药物治疗条件和52个样本 | 单细胞RNA测序 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯矩阵分解 | 基因表达数据 | 19名患者，10种药物治疗条件，52个样本 |
| 7114 | 2024-10-19 |
Single-cell DNA methylome and 3D multi-omic atlas of the adult mouse brain
2023-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06805-y
PMID:38092913
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研究论文 | 本研究使用单核甲基化测序和多组学测序技术，构建了成年小鼠大脑的单细胞DNA甲基化和3D多组学图谱 | 首次在空间背景下全面解析了成年小鼠大脑的DNA甲基化多样性，并整合了转录组和染色质可及性数据，构建了基于甲基化的细胞分类和调控网络 | 研究仅限于成年小鼠大脑，未涵盖其他物种或发育阶段 | 理解大脑发育和神经疾病的DNA甲基化机制，构建全面的分子图谱 | 成年小鼠大脑的单细胞DNA甲基化和染色质构象 | 数字病理学 | NA | 单核甲基化测序（snmC-seq3）和多组学测序（snm3C-seq） | NA | 基因组数据 | 301,626个甲基化图谱和176,003个染色质构象-甲基化联合图谱，来自117个解剖区域 |
| 7115 | 2024-10-19 |
Spatial transcriptomic analysis of the mouse brain following chronic social defeat stress
2023-Dec, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20220133
PMID:38264685
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研究论文 | 研究使用空间转录组学分析慢性社会挫败应激对小鼠大脑的影响 | 首次全面比较了慢性社会挫败应激在多个脑区的转录变化，并揭示了不同脑区基因表达的空间差异 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨慢性社会挫败应激对小鼠大脑多个脑区的转录变化 | 小鼠大脑在慢性社会挫败应激下的基因表达 | 空间转录组学 | 抑郁症 | 空间转录组学 (ST) | NA | 基因表达数据 | 控制组、抗压组 (RES) 和易感组 (SUS) 的小鼠大脑样本 |
| 7116 | 2024-10-19 |
Identification of monocyte-associated pathways participated in the pathogenesis of pulmonary arterial hypertension based on omics-data
2023-Oct, Pulmonary circulation
IF:2.2Q3
DOI:10.1002/pul2.12319
PMID:38130888
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研究论文 | 本研究基于组学数据，探讨了单核细胞相关通路在肺动脉高压发病机制中的作用 | 首次结合微阵列数据和单细胞RNA测序数据，分析了单核细胞在肺动脉高压中的浸润情况及其相关信号通路 | 研究主要基于现有数据库中的数据，缺乏体内实验验证 | 评估免疫细胞浸润在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉高压患者中的单核细胞及其相关信号通路 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 微阵列数据分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于GEO数据库中的微阵列数据集和单细胞RNA测序数据 |
| 7117 | 2024-10-19 |
Amphiregulin couples IL1RL1+ regulatory T cells and cancer-associated fibroblasts to impede antitumor immunity
2023-08-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add7399
PMID:37611111
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研究论文 | 研究揭示了IL1RL1+调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞通过AREG/EGFR轴相互作用，阻碍抗肿瘤免疫 | 首次揭示了AREG/EGFR轴在调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞之间的相互作用，控制成纤维细胞功能状态的分叉 | NA | 探讨调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的相互作用及其分子机制 | 调节性T细胞、癌症相关成纤维细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7118 | 2024-10-19 |
Synergism Between IL21 and Anti-PD-1 Combination Therapy is Underpinned by the Coordinated Reprogramming of the Immune Cellular Network in the Tumor Microenvironment
2023-08, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0012
PMID:37546701
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研究论文 | 通过综合分析多个单细胞RNA测序数据集，研究了IL21与抗PD-1联合治疗在肿瘤微环境中通过协调重编程免疫细胞网络的协同机制 | 揭示了IL21在肿瘤微环境中通过增强CD4 T细胞的辅助功能，促进CD8 T细胞介导的免疫反应，并与抗PD-1阻断剂协同驱动肿瘤抗原特异性CD8 T细胞的克隆扩增和功能状态分化 | NA | 探讨IL21与抗PD-1联合治疗在肿瘤微环境中的协同机制 | 肿瘤微环境中的免疫细胞网络 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 7119 | 2024-10-19 |
Integrative in situ mapping of single-cell transcriptional states and tissue histopathology in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01251-x
PMID:36732642
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STARmap PLUS的方法，结合高分辨率空间转录组学和蛋白质检测，用于在小鼠阿尔茨海默病模型中进行单细胞转录状态和组织病理学的整合原位映射 | 本文创新性地将高分辨率空间转录组学与蛋白质检测结合，提供了疾病进展的综合细胞图谱 | NA | 揭示阿尔茨海默病在小鼠模型中的时空动态变化，理解疾病机制和进展 | 小鼠阿尔茨海默病模型的大脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 8个月和13个月龄的小鼠阿尔茨海默病模型大脑组织样本 |
| 7120 | 2024-10-19 |
Application of single-cell RNA sequencing methods to develop B cell targeted treatments for autoimmunity
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1103690
PMID:37520578
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研究论文 | 本文探讨了利用单细胞RNA测序方法开发针对自身免疫病的B细胞靶向治疗 | 本文提出利用单细胞RNA测序技术识别自身免疫病中的致病性自身反应性B细胞，以开发更精确的靶向治疗 | NA | 开发针对自身免疫病的B细胞靶向治疗 | 自身反应性B细胞 | 数字病理学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |