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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7101 | 2025-11-30 |
Analysis of the Mechanism Underlying Radiotherapy Resistance Caused by Oligodendroglia Cells in Glioblastoma by Applying the Single-cell RNA Sequencing Technology
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析胶质母细胞瘤中少突胶质细胞导致放疗抵抗的分子机制 | 首次识别出两个具有放疗抵抗特性的少突胶质细胞亚群ODC3和ODC4,并揭示它们通过不同分子通路获得放疗抵抗性 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索胶质母细胞瘤放疗抵抗的分子机制及关键影响因素 | 胶质母细胞瘤组织样本 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Monocle2, AUCell, maftools | 单细胞RNA测序数据,基因突变数据 | 来自GEO和TCGA数据库的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7102 | 2025-11-30 |
Integrated Single-cell RNA-seq and Bulk RNA-seq Identify Diagnostic Biomarkers for Postmenopausal Osteoporosis
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,筛选出绝经后骨质疏松症的诊断生物标志物 | 首次结合单细胞转录组图谱和WGCNA分析骨质疏松症,识别出单核细胞亚型特异性表达的新型生物标志物 | 未提及样本量的具体数字和验证队列的详细信息 | 探索绝经后骨质疏松症的诊断生物标志物,为早期诊断和治疗靶点提供依据 | 绝经后骨质疏松症患者样本 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, 基因集富集分析 | 列线图诊断模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7103 | 2025-11-30 |
Proximity-based proteomics (BioID) uncovers the Rho GTPase interactome in kidney podocytes
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1625950
PMID:41306285
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研究论文 | 本研究通过邻近标记技术绘制了肾足细胞中Rho GTPases的相互作用网络 | 首次在足细胞中系统绘制RhoA、Rac1和Cdc42的相互作用组,发现约50%的相互作用是足细胞特有的,并鉴定出KIAA1522作为新型Cdc42效应子和ARHGEF12作为关键RhoA调节因子 | NA | 揭示肾足细胞中Rho GTPases的信号网络及其在足细胞损伤中的作用机制 | 人类肾足细胞、HEK293细胞、HeLa细胞、斑马鱼模型 | 蛋白质组学 | 肾脏疾病 | 邻近依赖性生物素标记(BioID)、单细胞RNA测序、基因敲除 | NA | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据 | NA | NA | 邻近标记蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7104 | 2025-11-30 |
Targeting Matrix Metalloproteinase-9 to Alleviate T Cell Exhaustion and Improve Sepsis Prognosis
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0996
PMID:41306770
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研究论文 | 本研究通过构建分子互作扰动网络,首次揭示脓毒症免疫异质性的网络生物学基础,并确定单核细胞来源的MMP9是驱动CD4 T细胞功能障碍的关键调节因子 | 首次构建脓毒症免疫异质性的分子互作扰动网络,发现MMP9通过双重机制调控T细胞耗竭,并验证选择性MMP9抑制剂可逆转T细胞功能障碍 | NA | 阐明脓毒症免疫异质性的分子机制并寻找有效治疗靶点 | 人类外周血样本和免疫细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,功能验证 | NA | 转录组数据,蛋白质数据,功能实验数据 | 1,862例人类外周血样本,超过450,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7105 | 2025-11-30 |
Ocular surface health and disease: insight from single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1683167
PMID:41306916
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在眼表组织健康与疾病研究中的原理、应用及局限性 | 首次系统总结scRNA-seq在眼表组织细胞多样性解析和疾病机制研究中的综合应用 | 技术本身存在检测灵敏度限制和细胞捕获偏差,且眼表组织样本获取难度较大 | 探讨单细胞RNA测序技术在眼表组织研究和疾病机制解析中的应用价值 | 眼表组织(角膜、睑板腺、结膜、泪腺)及相关疾病 | 单细胞组学 | 眼表疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7106 | 2025-11-30 |
Multi-omics reveals that NOTCH1 promotes cervical cancer progression and reduces radiosensitivity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1703032
PMID:41306984
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了NOTCH1在促进宫颈癌进展和降低放疗敏感性中的作用机制 | 首次从单细胞水平揭示NOTCH1在宫颈癌恶性细胞中的表达特征及其通过MIF配体-受体通路影响浆细胞分化的新机制 | NA | 阐明NOTCH1在宫颈癌进展和放疗抵抗中的分子机制 | 宫颈癌组织和细胞系 | 生物医学 | 宫颈癌 | 单细胞测序,cDNA微阵列,高通量测序,免疫组织化学 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7107 | 2025-11-30 |
The Role of Vitamin D Metabolism-Related Genes in Recurrent Pregnancy Loss and Their Immune Microenvironmental Changes
2025, Journal of multidisciplinary healthcare
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/JMDH.S541670
PMID:41307047
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析揭示了维生素D代谢相关基因DOCK11和ETV2在复发性流产中的作用机制 | 首次将维生素D代谢基因与复发性流产的免疫微环境变化联系起来,并发现DOCK11和ETV2作为新型生物标志物 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床验证 | 阐明维生素D代谢在复发性流产发生中的潜在机制 | 复发性流产患者的基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 复发性流产 | 转录组测序, RT-qPCR, Western blotting, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习, 孟德尔随机化 | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 7108 | 2025-11-30 |
Desmosome mutations impact the tumor microenvironment to promote melanoma proliferation
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.19.558457
PMID:37786690
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研究论文 | 本研究揭示了桥粒基因突变通过影响肿瘤微环境促进黑色素瘤增殖的新机制 | 首次发现桥粒基因在人类癌症中的高频突变,并阐明其通过改变角质形成细胞的微环境促进黑色素瘤增殖 | 研究主要基于原发黑色素瘤样本,未在转移性黑色素瘤中观察到相同现象 | 探究桥粒基因突变在黑色素瘤发生发展中的作用机制 | 人类黑色素瘤样本、角质形成细胞与黑色素瘤细胞共培养体系 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、蛋白质免疫荧光、基因敲低、细胞共培养 | 细胞共培养模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据、细胞增殖数据 | 未明确样本数量的人类黑色素瘤活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7109 | 2025-11-29 |
Single-Cell Atlas of Aging Human Skin Reveals FOSB-Related Transcriptional Programs and Druggable Targets
2025-Dec, Journal of cosmetic dermatology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jocd.70569
PMID:41293818
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类皮肤衰老图谱,揭示FOSB相关转录程序和可药物靶点 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示人类皮肤衰老的转录调控网络,发现FOSB作为关键衰老相关转录因子 | 样本数量有限,仅比较年轻和老年组,缺乏中间年龄段数据 | 研究人类皮肤衰老的细胞类型特异性转录调控机制和潜在治疗靶点 | 年轻和老年人皮肤细胞 | 单细胞基因组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年人类皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7110 | 2025-11-29 |
Integrated Aerobic Exercise and Multisensory Environment Training for Age-related Cognitive Decline via Hippocampal-prefrontal Neural Circuit Modulation
2025-Nov-28, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05302-9
PMID:41313574
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合有氧运动和多感官环境训练的新型干预方法,通过调节海马-前额叶神经回路改善年龄相关认知衰退 | 首次将有氧运动与多感官环境训练相结合,并揭示了海马-前额叶神经回路在此过程中的关键作用机制 | 研究仅使用老年小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索联合训练改善年龄相关认知衰退的神经机制 | 老年小鼠 | 神经科学 | 老年性疾病 | 神经回路追踪、化学遗传学、单细胞测序 | 动物模型 | 神经活动数据、基因表达数据 | 老年小鼠群体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7111 | 2025-11-29 |
Multiplexed Transcriptomics for Screening Drug Combinations and Defining the Mechanism of Action of HCC Therapeutics at Single-Cell Resolution
2025-Nov-27, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70148
PMID:41308634
|
研究论文 | 本研究利用高通量单核测序平台筛选肝癌治疗药物组合,并通过单细胞转录组学分析揭示HY组合通过诱导铁死亡抑制肿瘤细胞增殖的机制 | 首次将高通量单细胞筛选与机制解析相结合,在单细胞分辨率下系统评估药物组合对肝癌细胞的影响并发现JUN是关键调控因子 | 研究主要聚焦于HY药物组合,其他潜在有效组合可能需要进一步探索 | 筛选抗肝癌药物组合并阐明其作用机制 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单核测序,单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | snHH-seq | 高通量高灵敏度单核测序平台 |
| 7112 | 2025-11-29 |
CRATER tumor niches facilitate CD8+ T cell engagement and correspond with immunotherapy success
2025-Nov-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.09.021
PMID:41109214
|
研究论文 | 本研究通过活体成像和空间转录组学技术鉴定出促进免疫治疗反应的肿瘤微环境结构CRATER | 首次在斑马鱼和人类黑色素瘤中发现CRATER结构,揭示其作为CD8+T细胞与肿瘤细胞相互作用的关键区域 | 研究主要聚焦于黑色素瘤,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索免疫治疗中T细胞与肿瘤细胞相互作用的时空动态机制 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | NA | 图像、空间转录组数据 | 斑马鱼和人类黑色素瘤样本(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7113 | 2025-11-29 |
Gut microbiota L-ornithine promotes resistance to obesity through metabolites mediated immunosuppressive macrophages
2025-Nov-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05882-8
PMID:41291317
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研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物L-鸟氨酸通过调控巨噬细胞功能抵抗肥胖的新机制 | 首次发现L-鸟氨酸通过下游代谢物精胺和亚精胺调控巨噬细胞向免疫抑制表型极化,从而抵抗肥胖 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肠道微生物代谢物在肥胖发病机制中的保护作用 | 小鼠模型和肥胖人群 | 代谢疾病研究 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和肥胖人群样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7114 | 2025-11-29 |
Impact of single-cell cell cycle regulation of intercellular communication on the prognosis of hepatocellular carcinoma in the tumor microenvironment
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01963-x
PMID:41286375
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯对肿瘤进展和患者预后的影响 | 首次在单细胞水平系统分析肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯网络的相互作用及其临床意义 | 样本量相对有限,仅分析了两个单细胞RNA测序数据集 | 探究肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯对患者预后的影响机制 | 肝癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞转录组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NMF聚类,CellChat,Monocle,SCENIC | 单细胞RNA测序数据 | 24,637个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7115 | 2025-11-29 |
Decoding colorectal cancer chemotherapy and immunotherapy resistance: revealing the role of NOL3 using single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01913-7
PMID:41286470
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习揭示了NOL3在结直肠癌化疗和免疫治疗耐药中的关键作用 | 首次系统探索缺氧与18种程序性细胞死亡特征之间的关联,并识别NOL3作为结直肠癌预后关键标志物 | 研究基于回顾性多中心队列,需要进一步的前瞻性验证 | 探索结直肠癌化疗和免疫治疗耐药的分子机制 | 结直肠癌患者和癌细胞系 | 机器学习,数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,机器学习,MTT测定,Western blot | XGBoost,RR,RF | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 4个多中心队列共1294例样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7116 | 2025-11-29 |
Lineage plasticity and signal dysregulation define the cellular trajectory of osteoarthritis progression
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01947-x
PMID:41286526
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索骨关节炎进展过程中细胞谱系的可塑性变化及其与信号通路失调的关系 | 首次系统揭示骨关节炎中PreFC细胞向FC和preHTC细胞转化的轨迹,并鉴定HIF1A和ANGPTL4为关键分子调控因子 | NA | 探索骨关节炎进展的细胞轨迹和分子机制,为精准治疗提供新靶点 | 骨关节炎患者的关节软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,KEGG和GO富集分析,伪时间轨迹分析,体外实验验证 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7117 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics implicate a prognostic function of tertiary lymphoid structures in gastric cancer
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65421-8
PMID:41290589
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析揭示三级淋巴结构在胃癌中的预后功能 | 首次整合单细胞和空间转录组学分析不同空间定位模式的三级淋巴结构,发现iTLS富集肿瘤中特定免疫细胞亚群,并揭示HEV通过VCAM1/ICAM1-CXCL13-ACKR1通路促进TLS形成的新机制 | 样本量相对有限(30例胃癌标本),需要在更大队列中验证发现 | 探究三级淋巴结构在胃癌中的预后功能和免疫治疗预测价值 | 30例按TLS空间定位模式分层的胃癌标本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 30例胃癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 7118 | 2025-11-29 |
Machine learning driven multiomics analysis identifies disulfidptosis associated molecular subtypes in ovarian cancer
2025-Nov-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26157-z
PMID:41290867
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研究论文 | 本研究通过机器学习驱动的多组学分析,在卵巢癌中鉴定出与双硫死亡相关的分子亚型 | 首次将双硫死亡机制纳入卵巢癌分类系统,并构建了10基因预测模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 建立卵巢癌双硫死亡相关分子亚型分类系统 | 卵巢癌患者样本 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞测序,空间转录组学,免疫组化 | CNN+GRU, LASSO回归,随机森林 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 7119 | 2025-11-29 |
Immune cell-resolved transcriptomics provides insights into the basis for variations of fish genetic resistance to viral disease
2025-Nov-25, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02452-z
PMID:41291655
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研究论文 | 通过整合批量组织RNA-seq和单细胞RNA-seq技术,揭示虹鳟鱼对病毒性出血性败血症病毒遗传抗性的免疫细胞特异性转录组基础 | 首次在鱼类中结合批量组织和单细胞分辨率转录组学,解析不同遗传抗性品系免疫细胞对病毒感染的异质性响应 | 研究仅针对两个极端抗性品系,可能无法完全代表自然种群中的遗传多样性 | 探究鱼类对病毒感染的遗传抗性机制 | 虹鳟鱼(抗性和易感性等基因系) | 转录组学 | 病毒性出血性败血症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 两个虹鳟鱼等基因系的前肾组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7120 | 2025-11-29 |
Identification and validation of PANoptosis-related biomarkers in Alzheimer's disease via single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Nov-25, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03335-3
PMID:41291841
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法识别并验证了阿尔茨海默病中与PANoptosis相关的生物标志物 | 首次在阿尔茨海默病中系统研究PANoptosis相关基因,并整合单细胞测序与多种机器学习算法识别生物标志物 | BACH2基因的转录组学发现未能通过qRT-PCR验证,样本来源和数量可能存在限制 | 探索PANoptosis在阿尔茨海默病发病机制中的作用并识别相关生物标志物 | 阿尔茨海默病患者和正常对照的基因表达数据及临床样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,机器学习 | LASSO,支持向量机,随机森林 | 基因表达数据 | 多个数据集(GSE181279,GSE85426,GSE48350)和临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |