单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 7081 - 7100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7081 | 2024-10-19 |
Sex-specific proximal tubular cell differentiation pathways identified by single-nucleus RNA sequencing
2024-10-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73102-7
PMID:39402239
|
研究论文 | 通过单核RNA测序技术，研究了小鼠肾脏近端小管细胞在不同年龄段的性别特异性分化途径 | 首次揭示了近端小管细胞在晚期时间点的性别特异性表达谱，并使用轨迹和RNA速度分析技术描绘了这些细胞的分化途径 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量相对较小 | 探讨肾脏近端小管细胞在不同年龄段的性别特异性分化途径 | 小鼠肾脏近端小管细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 68,775个细胞核，来自16只小鼠 |
| 7082 | 2024-10-19 |
CTPAD: an interactive web application for comprehensive transcriptomic profiling in allergic diseases
2024-Oct-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05459-2
PMID:39402558
|
研究论文 | 开发了一个名为CTPAD的交互式网络应用程序，用于过敏性疾病的全基因组表达谱分析和可视化 | CTPAD整合了公共数据库和多种算法，提供了丰富的转录组可视化功能，并支持自定义选项和高分辨率图像下载 | NA | 提供一个全面的网络工具，用于过敏性疾病的多种分析 | 人类和小鼠与过敏性疾病相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 过敏性疾病 | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠样本 |
| 7083 | 2024-10-19 |
Pan-cancer analysis of Sp1 with a focus on immunomodulatory roles in gastric cancer
2024-Oct-14, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03521-z
PMID:39402565
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研究论文 | 本文通过生物信息学工具和公共数据集，全面分析了Sp1在不同癌症中的表达及其在胃癌中的免疫调节作用 | 首次进行了全面的泛癌分析，探讨了Sp1在肿瘤发生中的多方面作用，并验证了其在胃癌患者免疫治疗中的预后和预测价值 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨Sp1在不同癌症中的表达及其在胃癌中的免疫调节作用，评估其在胃癌患者免疫治疗中的预后和预测价值 | Sp1在正常组织、肿瘤和免疫细胞中的表达及其与免疫细胞浸润、肿瘤突变负荷和免疫检查点信号的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | 生物信息学分析、免疫组化、多重免疫荧光 | Cox回归模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 免疫治疗患者队列 |
| 7084 | 2024-10-19 |
Identification of the metabolic protein ATP5MF as a potential therapeutic target of TNBC
2024-Oct-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05692-9
PMID:39402579
|
研究论文 | 本文研究了三阴性乳腺癌（TNBC）中代谢蛋白ATP5MF作为潜在治疗靶点的可能性 | 首次将ATP5MF确定为非BRCA1/2突变型TNBC的潜在治疗靶点 | 研究仅限于体外和动物模型实验，尚未进行临床试验 | 开发针对非BRCA1/2突变型TNBC的新治疗策略 | 三阴性乳腺癌细胞和相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | 基因表达数据 | 包括两个TNBC细胞系（MDA-MB-231和BT-549）和裸鼠肿瘤异种移植模型 |
| 7085 | 2024-10-19 |
BNIP3+ fibroblasts associated with hypoxia and inflammation predict prognosis and immunotherapy response in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Oct-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05674-x
PMID:39402590
|
研究论文 | 研究探讨了BNIP3+纤维母细胞亚型在胰腺导管腺癌中的作用及其与预后和免疫治疗反应的关系 | 首次揭示了BNIP3+纤维母细胞亚型与低氧和炎症反应的关联，并发现其与胰腺导管腺癌患者的预后和免疫治疗反应密切相关 | 研究样本量较小，且仅基于单细胞测序数据，可能影响结果的普适性 | 探索胰腺导管腺癌中癌症相关纤维母细胞的新靶点，以改善治疗策略 | 胰腺导管腺癌患者的癌症相关纤维母细胞及其与预后和免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 35例胰腺导管腺癌患者的单细胞测序数据 |
| 7086 | 2024-10-19 |
scCTS: identifying the cell type-specific marker genes from population-level single-cell RNA-seq
2024-Oct-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03410-8
PMID:39402623
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scCTS的统计模型，用于从群体水平的单细胞RNA测序数据中识别细胞类型特异性标记基因 | 开发了一种新的统计模型scCTS，能够更有效地从群体水平的单细胞RNA测序数据中识别细胞类型特异性基因 | 未提及 | 旨在改进从群体水平单细胞RNA测序数据中识别细胞类型特异性标记基因的方法 | 群体水平的单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性标记基因 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | 多个供体的单细胞RNA测序数据 |
| 7087 | 2024-10-17 |
Transcriptional landscape of sweetpotato root tip development at the single-cell level
2024-Oct-12, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-024-05574-8
PMID:39394068
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术揭示了甘薯根尖分生组织的细胞异质性 | 首次利用单细胞转录组测序技术分析甘薯根尖组织的细胞类型和发育轨迹 | NA | 研究甘薯根尖分生组织的细胞类型和发育调控机制 | 甘薯根尖分生组织的单细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 12,172个单细胞和27,355个基因 |
| 7088 | 2024-10-19 |
Deletion of platelet-derived growth factor receptor β suppresses tumorigenesis in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis (MASH) mice with diabetes
2024-10-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-75713-6
PMID:39394459
|
研究论文 | 研究了血小板衍生生长因子受体β（PDGFRβ）在糖尿病相关代谢功能障碍性脂肪性肝炎（MASH）小鼠模型中的表达及其对肿瘤发生的影响 | 首次探讨了PDGFRβ在糖尿病MASH小鼠模型中的作用，并发现其缺失可抑制肿瘤发生 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证结果 | 探讨PDGFRβ在糖尿病MASH中的作用及其对肿瘤发生的影响 | 糖尿病MASH小鼠模型中的PDGFRβ表达及其对肿瘤发生的影响 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型（KO和FL） |
| 7089 | 2024-10-19 |
Dual spatial host-bacterial gene expression in Mycobacterium abscessus respiratory infections
2024-Oct-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06929-5
PMID:39384974
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研究论文 | 本文展示了定制细菌探针在甲醛固定石蜡包埋（FFPE）组织中识别宿主-病原体相互作用的能力 | 本文首次通过探针空间转录组技术，在FFPE组织中同时检测宿主和细菌的基因表达 | 研究仅在慢性感染的鼠肺组织中进行，结果的普适性有待验证 | 探索宿主和病原体在空间转录组信息上的共定位，以深化对微生物致病机制的理解 | 慢性感染了脓肿分枝杆菌的鼠肺组织 | NA | NA | 探针空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | 鼠肺组织样本 |
| 7090 | 2024-10-19 |
Hyperbaric oxygen therapy enhances osteointegration of reimplanted cranial flap by regulating osteogenesis-angiogenesis coupling
2024-Oct, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.25875
PMID:38751166
|
研究论文 | 研究高压氧治疗对颅骨瓣再植后骨整合的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示高压氧治疗对颅骨瓣再植后骨形成和血管形成的具体细胞类型和信号通路的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在临床上验证 | 探讨高压氧治疗在颅骨瓣再植后骨整合中的作用 | 颅骨瓣再植后的骨形成和血管形成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 7091 | 2024-10-19 |
Neutrophils Recruited by NKX2-1 Suppression via Activation of CXCLs/CXCR2 Axis Promote Lung Adenocarcinoma Progression
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400370
PMID:39113226
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研究论文 | 研究探讨了NKX2-1通过激活CXCLs/CXCR2轴招募中性粒细胞促进肺腺癌进展的机制 | 揭示了NKX2-1在调控肿瘤免疫微环境中通过抑制CXCLs/CXCR2依赖机制影响中性粒细胞浸润的新机制 | NA | 研究NKX2-1在肺腺癌进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 肺腺癌细胞、中性粒细胞及CXCLs/CXCR2信号通路 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、Visium原位捕获分析、qRT-PCR、ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7092 | 2024-10-19 |
Endothelial Cell-Derived Extracellular Vesicles Promote Aberrant Neutrophil Trafficking and Subsequent Remote Lung Injury
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400647
PMID:39119837
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研究论文 | 研究揭示了内皮细胞衍生的外泌体在促进中性粒细胞异常迁移和随后的远端肺损伤中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析揭示了内皮细胞释放的外泌体在促进中性粒细胞反向跨内皮迁移中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本，缺乏人体内直接干预实验 | 探讨脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中中性粒细胞异常迁移的分子机制 | 中性粒细胞、内皮细胞及其衍生的外泌体 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 小鼠模型和脓毒症相关ARDS患者的血液样本 |
| 7093 | 2024-10-19 |
Identification of a Novel ECM Remodeling Macrophage Subset in AKI to CKD Transition by Integrative Spatial and Single-Cell Analysis
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309752
PMID:39119903
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，研究了AKI到CKD过渡期间巨噬细胞的时空异质性 | 发现了与肾纤维化相关的新的巨噬细胞亚群，即细胞外基质重塑相关巨噬细胞（EAMs） | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床适用性需要进一步验证 | 探讨AKI到CKD过渡期间巨噬细胞的异质性和动态特征 | AKI到CKD过渡期间的小鼠巨噬细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠AKI-to-CKD模型中的多个时间点样本 |
| 7094 | 2024-10-19 |
Characterization of Ucp1-iCre knockin mice reveals the recombination activity in male germ cells
2024-Oct-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00128.2024
PMID:39230395
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研究论文 | 本文研究了Ucp1-iCre敲入小鼠的Cre重组活性，特别是在雄性生殖细胞中的表现 | 通过靶向插入IRES-Cre盒，生成了Ucp1-iCre小鼠，减少了Cre在非脂肪组织中的异位活性 | Ucp1-iCre小鼠在某些组织中仍表现出有限的Cre活性，需要谨慎进行小鼠交配和基因分型 | 验证Ucp1-iCre敲入小鼠在脂肪组织中的特异性基因操作能力 | Ucp1-iCre敲入小鼠及其在脂肪组织和生殖细胞中的Cre重组活性 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及Ucp1-iCre小鼠和Rosa-tdTomato报告小鼠的杂交后代 |
| 7095 | 2024-10-19 |
vSPACE: exploring virtual spatial representation of articular chondrocytes at the single-cell level
2024-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae568
PMID:39363499
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研究论文 | vSPACE是一个基于网络的应用程序，通过模拟空间转录组技术，以虚拟方式展示人类关节软骨细胞的单细胞RNA测序数据的空间表达模式 | vSPACE通过虚拟二维图展示人类关节软骨细胞的基因表达模式，揭示了科学家可以理解的沿区域轴的推断空间分布模式 | NA | 探索关节软骨细胞在单细胞水平上的虚拟空间表达模式 | 人类关节软骨细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7096 | 2024-10-19 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq data reveals cell differentiation-related subtypes and a scoring system in bladder cancer
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70111
PMID:39400959
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，揭示了膀胱癌中与细胞分化相关的分子亚型及其预后意义 | 首次探索了与细胞分化相关基因（CDR）相关的分子亚型及其预后影响，并开发了CDR评分系统 | NA | 揭示膀胱癌中与细胞分化相关的分子亚型及其预后意义 | 膀胱癌患者及其分子亚型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | Lasso回归和Cox回归 | 单细胞RNA测序数据 | 两个GEO单细胞数据集 |
| 7097 | 2024-10-19 |
Clustering scRNA-seq data with the cross-view collaborative information fusion strategy
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae511
PMID:39402696
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研究论文 | 本文介绍了一种基于信息瓶颈（IB）和跨视图融合策略的新型单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据聚类算法scCFIB | scCFIB算法通过信息瓶颈处理高维稀疏数据，并采用跨视图融合策略实现稳健的细胞聚类 | NA | 开发一种高效的scRNA-seq数据聚类方法 | scRNA-seq数据中的细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 信息瓶颈（IB） | 基因表达数据 | 多种scRNA-seq数据集 |
| 7098 | 2024-10-19 |
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2024-Aug-14, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0145PS
PMID:39141563
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综述 | 本文探讨了单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的新兴作用 | 利用单细胞转录组学技术，研究人员能够解析肺部复杂的细胞生态系统，识别出在肺动脉高压发病机制中起关键作用的细胞类型，如内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 | 需要提高单细胞转录组学的分辨率以捕捉更精细的细胞变化，克服处理人类组织样本的物流障碍，并整合多种组学方法以全面理解肺动脉高压的分子基础 | 深入探讨单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用，揭示其对理解这一复杂疾病的贡献 | 肺动脉高压的细胞生态系统及其在疾病发病机制中的作用 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组学（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 7099 | 2024-10-19 |
The role of HPV11 E7 in modulating STING-dependent interferon β response in recurrent respiratory papillomatosis
2024-May-14, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01925-23
PMID:38624230
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研究论文 | 研究HPV11 E7在复发性呼吸道乳头状瘤病中调节STING依赖性干扰素β反应的作用 | 首次揭示了HPV11 E7通过抑制STING蛋白的磷酸化来逃避宿主的抗病毒反应，并展示了激活的巨噬细胞在抗病毒免疫中的潜在作用 | 研究主要集中在细胞模型和单细胞RNA测序分析上，缺乏临床试验数据支持 | 探讨HPV在复发性呼吸道乳头状瘤病中逃避宿主先天免疫反应的机制 | 复发性呼吸道乳头状瘤病样本中的免疫细胞状态和HPV感染的细胞模型 | NA | 复发性呼吸道乳头状瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个复发性呼吸道乳头状瘤病样本 |
| 7100 | 2024-10-19 |
Human Motor Neurons Elicit Pathological Hallmarks of ALS and Reveal Potential Biomarkers of the Disease in Response to Prolonged IFNγ Exposure
2024-Apr-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1787-23.2024
PMID:38413232
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研究论文 | 研究探讨了人类运动神经元在长时间IFNγ暴露下表现出ALS病理特征，并揭示了潜在的ALS生物标志物 | 首次展示了长时间IFNγ暴露下人类运动神经元中TDP-43的严重细胞质聚集，并发现PD-L1表达增加可能与ALS发展有关 | 研究主要集中在体外实验，缺乏体内验证；样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨IFNγ暴露对人类运动神经元的影响，揭示ALS病理机制和潜在治疗靶点 | 人类诱导多能干细胞衍生的脊髓运动神经元 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |