单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7061 - 7080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7061 | 2025-10-06 |
A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors
2019-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1373-2
PMID:31292543
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类肝脏细胞图谱，揭示肝脏细胞异质性和上皮祖细胞 | 首次在人类肝脏中发现内皮细胞、库普弗细胞和肝细胞的未知亚型，并鉴定出具有双向分化潜能的TROP2祖细胞群 | 样本量相对有限（9名供体），仅包含正常肝组织 | 解析人类肝脏细胞组成和异质性 | 人类正常肝脏组织细胞 | 单细胞生物学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9名人类供体的约10,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7062 | 2025-10-06 |
Single cell analysis of human foetal liver captures the transcriptional profile of hepatobiliary hybrid progenitors
2019-07-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-11266-x
PMID:31350390
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术发现并表征了人类胎儿肝脏中的肝胆混合祖细胞群体 | 首次在人类胎儿肝脏中鉴定出具有独特转录特征的肝胆混合祖细胞群体 | 研究主要基于转录组分析，功能验证相对有限 | 探索人类肝脏胚胎发育过程中实质组织的细胞起源 | 人类胎儿肝脏细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，FACS分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胎儿和成人肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7063 | 2025-10-06 |
Deep evolutionary origin of limb and fin regeneration
2019-07-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1900475116
PMID:31270239
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研究论文 | 本研究通过鳍再生实验和比较RNA测序分析，揭示了有颌脊椎动物成对附肢再生能力的共同进化起源 | 首次在多鳍鱼、匙吻鲟和雀鳝等非硬骨鱼类中证实了鳍内骨骼截肢后的再生能力，并通过比较转录组分析揭示了蝾螈与鱼类共享的再生特异性遗传程序 | 研究样本仅涵盖部分代表性物种，未能涵盖所有有颌脊椎动物类群 | 探究有颌脊椎动物成对附肢再生能力的进化起源 | 多鳍鱼、匙吻鲟、雀鳝、蓝曼龙、白纹丽鱼、奥斯卡鱼、金鱼等鱼类以及墨西哥钝口螈 | 进化发育生物学 | NA | RNA测序(RNA-seq)，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7个鱼类物种和1个两栖类物种 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7064 | 2025-10-06 |
In silico error correction improves cfDNA mutation calling
2019-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty1004
PMID:30520956
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研究论文 | 开发了一种用于短读长测序数据的PCR错误校正算法，可提高cfDNA突变检测的准确性 | 利用PCR扩增产生的冗余信息来识别和校正测序错误，无需额外的实验步骤或校准DNA数据集 | 主要针对PCR扩增过程中产生的错误，可能无法校正其他类型的测序错误 | 提高循环游离DNA测序中突变检测的准确性和灵敏度 | 循环游离DNA和循环肿瘤DNA | 生物信息学 | 癌症 | 短读长测序，PCR扩增 | NA | DNA测序数据 | NA | NA | 循环游离DNA测序，单细胞测序 | NA | NA |
| 7065 | 2025-10-06 |
Comprehensive evaluation of transcriptome-based cell-type quantification methods for immuno-oncology
2019-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz363
PMID:31510660
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研究论文 | 系统评估基于转录组的免疫肿瘤学细胞类型定量计算方法 | 开发了系统性的基准测试方法，首次对七种计算工具在九种免疫和基质细胞类型上的性能进行了全面评估 | 研究主要基于模拟数据和有限的数据集，真实世界应用的普适性仍需进一步验证 | 评估从批量RNA测序数据中估算肿瘤微环境中免疫细胞组成的计算方法 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞 | 生物信息学 | 肿瘤免疫 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 细胞类型反卷积算法 | RNA测序数据 | 约11000个单细胞，约1800个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7066 | 2025-10-06 |
Application of single-cell RNA sequencing methodologies in understanding haematopoiesis and immunology
2019-07-03, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20180072
PMID:31186287
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综述 | 总结单细胞RNA测序技术在血液学和免疫学领域的最新应用研究 | 通过单细胞RNA测序技术发现新的免疫细胞类型，并揭示造血过程是连续而非分步的过程，挑战了经典的造血谱系树模型 | NA | 理解造血过程和免疫反应机制 | 血液和免疫系统的细胞组成 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7067 | 2025-10-06 |
An optimised tissue disaggregation and data processing pipeline for characterising fibroblast phenotypes using single-cell RNA sequencing
2019-07-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-45842-4
PMID:31270426
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研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序分析成纤维细胞表型的优化组织解离和数据处理流程 | 优化了从人肺组织中分离成纤维细胞的方法，改进了数据处理以提高聚类质量，并评估了体外培养条件对基质细胞基因表达的影响 | 研究主要聚焦于肺组织，方法在其他组织类型中的适用性有待验证 | 开发优化的组织解离和数据处理流程，以更好地表征成纤维细胞表型 | 人肺组织中的成纤维细胞和基质细胞 | 单细胞测序分析 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7068 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analyses of Cell Fate Transitions during Human Cardiac Reprogramming
2019-07-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.05.020
PMID:31230860
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人类心脏重编程过程中的细胞命运转变 | 开发了包含数据标准化方法、多种轨迹预测算法和细胞命运指数计算的分析流程，揭示了hiCM重编程特异性特征和关键决策点 | NA | 研究人类心脏重编程过程中的细胞命运决定机制 | 人类心脏细胞重编程过程 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7069 | 2025-10-06 |
Subclonal cooperation drives metastasis by modulating local and systemic immune microenvironments
2019-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-019-0346-x
PMID:31263265
|
研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌中表达IL11和FIGF的次要亚克隆通过调节局部和全身免疫微环境促进转移的机制 | 发现次要亚克隆通过非细胞自主方式驱动转移，鉴定IL11通过骨髓来源间充质基质细胞诱导促肿瘤中性粒细胞的新机制 | 研究主要聚焦乳腺癌，机制在其他癌种中的普适性有待验证 | 探究肿瘤异质性中次要亚克隆促进转移的分子机制 | 乳腺癌细胞亚克隆、中性粒细胞、骨髓来源间充质基质细胞 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7070 | 2025-10-06 |
Defining inflammatory cell states in rheumatoid arthritis joint synovial tissues by integrating single-cell transcriptomics and mass cytometry
2019-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0378-1
PMID:31061532
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和质谱流式技术定义类风湿关节炎关节滑膜组织中的炎症细胞状态 | 首次整合单细胞RNA测序、质谱流式、批量RNA测序和流式细胞术多种技术系统分析RA滑膜组织细胞组成 | 样本量相对有限（51例），仅比较了RA和OA两种疾病状态 | 鉴定驱动类风湿关节炎关节炎症的关键细胞群体 | 类风湿关节炎和骨关节炎患者的滑膜组织中的T细胞、B细胞、单核细胞和成纤维细胞 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 质谱流式, 批量RNA测序, 流式细胞术 | 典型相关分析 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 批量转录组数据 | 51例滑膜组织样本（来自RA和OA患者） | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7071 | 2025-10-06 |
Spatially constrained tumour growth affects the patterns of clonal selection and neutral drift in cancer genomic data
2019-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1007243
PMID:31356595
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研究论文 | 通过空间随机细胞自动机模型研究肿瘤空间生长对基因组测序数据中克隆选择和中性漂变模式的影响 | 首次量化空间肿瘤采样对突变检测模式的影响，并提出整合空间效应的统计推断框架 | 测量癌症进化时仍需考虑众多混杂因素，仍具挑战性 | 研究空间约束对肿瘤进化动力学测量的影响 | 肿瘤生长模型和多重区域测序数据 | 计算生物学 | 癌症 | 下一代测序，多重区域测序，单细胞测序 | 空间随机细胞自动机模型 | 基因组测序数据 | NA | NA | 下一代测序，单细胞测序 | NA | NA |
| 7072 | 2025-10-06 |
A cellular census of human lungs identifies novel cell states in health and in asthma
2019-07, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0468-5
PMID:31209336
|
研究论文 | 通过单细胞转录组技术绘制健康与哮喘患者肺部的细胞图谱，发现新的细胞状态 | 识别了位置依赖的气道上皮细胞状态、新型组织驻留记忆T细胞亚群、哮喘患者的新型黏液纤毛细胞状态以及致病性效应2型辅助T细胞 | NA | 绘制人类肺部细胞图谱并比较健康与哮喘状态的细胞差异 | 健康肺部和哮喘患者肺部的上呼吸道、下呼吸道及肺实质细胞 | 单细胞生物学 | 哮喘 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7073 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals TOX as a key regulator of CD8+ T cell persistence in chronic infection
2019-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0403-4
PMID:31209400
|
研究论文 | 通过单细胞RNA-seq技术揭示TOX是慢性感染中CD8+ T细胞持久性的关键调控因子 | 发现TOX转录因子在祖细胞样CD8 T细胞中的独特调控作用，及其与表观遗传特征的关联 | 研究主要关注病毒感染的T细胞反应，未涉及其他疾病模型 | 探索慢性感染中CD8+ T细胞持久性的分子机制 | CD8+ T细胞在急性和慢性病毒感染中的反应 | 单细胞生物学 | 慢性病毒感染 | 单细胞RNA-seq, 表观遗传分析 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7074 | 2025-10-06 |
Computational analysis of single-cell transcriptomics data elucidates the stabilization of Oct4 expression in the E3.25 mouse preimplantation embryo
2019-06-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-45438-y
PMID:31222057
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研究论文 | 通过计算分析单细胞转录组数据揭示小鼠植入前胚胎中Oct4表达稳定的机制 | 发现基于至少四个内细胞接触的非自主机制激活Oct4，并鉴定出E3.25-HNC阶段的新型早期多能状态 | 研究主要基于计算分析，需要进一步实验验证 | 阐明小鼠植入前胚胎中Oct4表达稳定的分子机制 | E3.25时期32-64细胞阶段的小鼠胚胎内细胞团细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞微阵列转录组学, 单细胞RNA测序 | 分层最优k均值聚类 | 单细胞转录组数据 | 超过600个微阵列数据，包含早期和晚期32细胞ICM细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列转录组学 | NA | NA |
| 7075 | 2025-10-06 |
Agouti-Related Protein 2 Is a New Player in the Teleost Stress Response System
2019-06-17, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2019.05.021
PMID:31178320
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研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼中AgRP2蛋白在应激反应系统中的新功能 | 首次发现AgRP2作为神经内分泌因子调节应激轴并减少皮质醇分泌 | AgRP2在松果体细胞中的具体功能机制仍需进一步研究 | 探究斑马鱼中两种agrp基因的功能差异 | 斑马鱼幼虫和松果体agrp2表达细胞 | 神经内分泌学 | NA | 单细胞测序,基因敲除,神经元消融 | NA | 基因表达数据,解剖数据 | 斑马鱼幼虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7076 | 2025-10-06 |
Lgr5+ stem and progenitor cells reside at the apex of a heterogeneous embryonic hepatoblast pool
2019-06-12, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.174557
PMID:31142540
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠胚胎肝母细胞的功能异质性，并鉴定出Lgr5作为双潜能肝脏祖细胞的标志物 | 首次发现E9.5-E10.0肝母细胞中存在功能异质性，并鉴定出表达Lgr5的双潜能肝脏祖细胞亚群 | 研究仅针对小鼠胚胎发育特定时期，人类相关性尚需验证 | 探究胚胎肝母细胞的异质性和干细胞特性 | 小鼠胚胎肝母细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，谱系追踪，类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎E9.5-E10.0时期肝母细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7077 | 2025-10-06 |
Neocortical Projection Neurons Instruct Inhibitory Interneuron Circuit Development in a Lineage-Dependent Manner
2019-06-05, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.03.036
PMID:31027966
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研究论文 | 本研究揭示新皮质投射神经元通过谱系依赖方式指导抑制性中间神经元环路发育的机制 | 首次证明IT型投射神经元通过非细胞自主方式调控CGE来源抑制性中间神经元的电路整合 | 研究仅聚焦于Satb2敲除模型，未涵盖其他转录因子或神经环路 | 探究新皮质投射神经元与抑制性中间神经元之间的发育调控机制 | 小鼠新皮质投射神经元和抑制性中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，基因敲除 | NA | 基因表达数据，神经解剖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7078 | 2025-10-06 |
Adventitial Cell Atlas of wt (Wild Type) and ApoE (Apolipoprotein E)-Deficient Mice Defined by Single-Cell RNA Sequencing
2019-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.119.312399
PMID:30943771
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建野生型和ApoE缺陷小鼠血管外膜的细胞图谱，揭示早期动脉粥样硬化中细胞异质性和细胞间通讯 | 首次通过单细胞RNA测序系统描绘动脉粥样硬化早期血管外膜的细胞组成和细胞间相互作用 | 研究仅针对早期动脉粥样硬化阶段，样本来源于小鼠模型 | 解析血管外膜在动脉粥样硬化早期阶段的细胞组成和功能变化 | 12周龄C57BL/6J野生型和ApoE缺陷小鼠的主动脉外膜 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 野生型和ApoE缺陷小鼠主动脉外膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7079 | 2025-10-06 |
Preparation of Cells from Embryonic Organs for Single-Cell RNA Sequencing
2019-06, Current protocols in cell biology
DOI:10.1002/cpcb.86
PMID:30957983
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研究论文 | 介绍从胚胎器官制备用于单细胞RNA测序的细胞的方法 | 提出使用低温嗜冷蛋白酶在低温下进行解离的冷解离技术，以及优化细胞活性和保留的过滤和洗涤方法 | 未提供具体实验数据验证方法效果 | 优化单细胞RNA测序的细胞制备流程 | 胚胎器官细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7080 | 2025-10-06 |
Wnt Signaling Separates the Progenitor and Endocrine Compartments during Pancreas Development
2019-05-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.083
PMID:31116975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胰腺发育过程中内分泌细胞与前体细胞通过Wnt信号通路分离的机制 | 发现体外分化过程中内分泌细胞与前体细胞存在于通过不同遗传通路激活的独立区室，并证实WNT通路抑制对胰岛形成的关键作用 | 研究主要基于体外hESCs分化模型，体内验证仍需进一步深入 | 探索胰腺发育过程中细胞自主反应机制，提高体外β细胞分化效率 | 人类胚胎干细胞(hESCs)及其分化过程中的细胞群体 | 发育生物学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 分化球状簇中的hESCs单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |