单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7021 - 7040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7021 | 2025-10-06 |
Commensal microbiota drive the functional diversification of colon macrophages
2020-03, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-019-0228-3
PMID:31772323
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肠道菌群对结肠巨噬细胞功能多样化的驱动作用 | 首次在分子水平揭示肠道菌群通过调控转录程序驱动结肠巨噬细胞发育轨迹和功能分化 | 研究仅使用C57BL/6小鼠模型，未验证其他物种或人类样本 | 探究肠道菌群对结肠髓系细胞发育和功能分化的影响 | 无特定病原体(SPF)和无菌(GF) C57BL/6小鼠的结肠髓系细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络推断 | 单细胞转录组数据 | SPF和GF C57BL/6小鼠结肠髓系细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7022 | 2025-10-06 |
Transcriptional dynamics of pluripotent stem cell-derived endothelial cell differentiation revealed by single-cell RNA sequencing
2020-03-01, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehz351
PMID:31242503
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示多能干细胞分化为内皮细胞的转录动态过程 | 首次使用单细胞RNA测序技术绘制人多能干细胞向内皮细胞定向分化的转录景观和细胞动态过程，发现了新的转录特征 | 研究仅使用人类胚胎干细胞系，未涵盖其他类型的多能干细胞 | 解析多能干细胞向内皮细胞分化的分子机制和转录动态 | 人类胚胎干细胞及其分化的内皮细胞产物 | 单细胞组学 | 缺血性血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 105,727个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7023 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics: A High-Resolution Avenue for Plant Functional Genomics
2020-02, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2019.10.008
PMID:31780334
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在植物功能基因组学中的应用与潜力 | 首次系统阐述单细胞RNA测序技术在植物复杂组织中研究调控过程的新能力，无需依赖报告基因系即可分析任何植物组织 | 面临复杂数据集处理和分析的挑战 | 探索单细胞转录组学在植物功能基因组学研究中的应用 | 植物组织和单细胞 | 植物基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7024 | 2025-10-06 |
The genetic architecture of Parkinson's disease
2020-02, The Lancet. Neurology
DOI:10.1016/S1474-4422(19)30287-X
PMID:31521533
|
综述 | 本文综述了帕金森病的遗传结构研究现状与挑战 | 系统总结了90个已鉴定的独立风险相关变异，并指出新兴技术将推动该领域发展 | 大多数遗传研究基于欧洲血统患者，对其他人群的遗传学了解有限 | 解析帕金森病的遗传结构及其对疾病风险、发病和进展的影响 | 帕金森病相关遗传变异（罕见和常见变异） | 遗传学 | 帕金森病 | 全基因组关联研究、单细胞RNA测序、机器学习、高通量筛选 | NA | 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7025 | 2025-10-06 |
Probabilistic cell typing enables fine mapping of closely related cell types in situ
2020-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0631-4
PMID:31740815
|
研究论文 | 提出一种名为pciSeq的概率细胞分型方法，通过原位测序技术实现紧密相关细胞类型的精细空间定位 | 结合单细胞RNA测序分类结果，利用多重原位RNA检测技术实现细胞类型的概率识别和空间定位 | 方法依赖于先前的scRNA-seq分类结果，需要已有充分的基础研究数据支持 | 开发能够精确定位紧密相关细胞类型空间组织的新方法 | 小鼠海马CA1区抑制性神经元和等皮质锥体细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位测序 | 概率模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | pciSeq（概率细胞分型原位测序） |
| 7026 | 2025-10-06 |
Transcriptomic, epigenetic, and functional analyses implicate neutrophil diversity in the pathogenesis of systemic lupus erythematosus
2019-12-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1908576116
PMID:31754025
|
研究论文 | 本研究通过转录组学、表观遗传学和功能分析揭示了系统性红斑狼疮中中性粒细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 | 首次系统性地识别了狼疮低密度粒细胞的两个亚群（中间成熟和未成熟中性粒细胞），并揭示了它们在染色质可及性、转录因子基序和功能特征上的差异 | 研究样本量未明确说明，且主要关注中性粒细胞亚群，可能未完全涵盖其他免疫细胞在疾病中的作用 | 阐明系统性红斑狼疮中中性粒细胞异质性及其在疾病发病机制中的具体作用 | 系统性红斑狼疮患者的低密度粒细胞、自体正常密度中性粒细胞和健康对照中性粒细胞 | 生物医学研究 | 系统性红斑狼疮 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 7027 | 2025-10-06 |
Ontogenic Changes in Hematopoietic Hierarchy Determine Pediatric Specificity and Disease Phenotype in Fusion Oncogene-Driven Myeloid Leukemia
2019-12, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1463
PMID:31662298
|
研究论文 | 本研究揭示了融合癌基因驱动的儿童急性髓系白血病中造血层次结构的个体发育变化决定了疾病表型和儿科特异性 | 首次证明融合癌基因在不同发育阶段的造血干细胞中具有不同的致白血病潜能，并发现表型由关键转录因子活性的可逆改变维持 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探究融合癌基因驱动髓系白血病中年龄与表型特异性的关联机制 | 胎儿和成年小鼠造血干细胞、白血病细胞 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组分析、染色质可及性分析、可诱导转基因小鼠模型 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7028 | 2025-10-06 |
Next-generation computational tools for interrogating cancer immunity
2019-12, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-019-0166-7
PMID:31515541
|
综述 | 本文综述了用于解析癌症免疫机制的计算工具，讨论了各种方法的优缺点并提供了方法选择指南 | 系统梳理了新兴计算工具在癌症免疫研究中的应用，为多维数据分析提供方法选择指导 | 作为综述文章，未提出新的计算方法，主要基于现有工具进行评述 | 评述用于解析癌症免疫机制的计算工具和方法选择 | 癌症免疫研究中的计算分析工具 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序,质谱流式细胞术,多重空间细胞表型分析 | NA | 多维分子和细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 7029 | 2025-10-06 |
High-Throughput Single-Cell Sequencing with Linear Amplification
2019-11-21, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2019.08.002
PMID:31495564
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合组合索引和线性扩增的高通量单细胞测序方法sci-L3 | 开发了采用3级索引方案的单细胞测序方法，在最小化扩增偏差的同时实现通量的指数级增长 | NA | 开发高通量、高覆盖度的单细胞测序技术 | 小鼠精子和精子前体细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞全基因组测序, 靶向测序, 基因组与转录组共检测 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | >10,000个小鼠精子和精子前体细胞 | NA | 单细胞全基因组测序, 单细胞靶向测序, 单细胞多组学 | sci-L3 | sci-L3-WGS（单细胞全基因组测序）, sci-L3-target-seq（单细胞靶向测序）, sci-L3-RNA/DNA（基因组与转录组共检测） |
| 7030 | 2025-10-06 |
Zebrafish MITF-Low Melanoma Subtype Models Reveal Transcriptional Subclusters and MITF-Independent Residual Disease
2019-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-19-0037
PMID:31582381
|
研究论文 | 利用斑马鱼MITF-low黑色素瘤模型研究MITF低表达状态对黑色素瘤进展的影响及MITF非依赖性残留疾病特征 | 首次建立斑马鱼MITF-low黑色素瘤模型，揭示MITF低表达状态直接导致黑色素瘤进展，并发现MITF非依赖性残留细胞亚群 | 动物模型研究，需要进一步验证在人类临床样本中的适用性 | 研究MITF-low黑色素瘤的生物学意义和进展机制 | 斑马鱼黑色素瘤模型 | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 斑马鱼遗传模型 | 基因表达数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7031 | 2025-10-06 |
Genetic Identification of Vagal Sensory Neurons That Control Feeding
2019-11-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.031
PMID:31730854
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了控制进食的迷走神经感觉神经元，并发现肠道机械感受器在调节摄食行为中起关键作用 | 首次采用靶向特异性单细胞RNA测序方法绘制胃肠道迷走神经细胞类型图谱，并发现肠道机械感受器而非营养激活的粘膜传入神经对摄食行为具有关键调控作用 | 研究主要关注迷走神经感觉神经元，可能未完全涵盖其他神经通路在能量稳态中的作用 | 识别调控食物摄入的关键感觉神经元及其信号机制 | 迷走神经感觉神经元及其对胃肠道的神经支配 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7032 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Uncovers Zonation of Function in the Mesenchyme during Liver Fibrosis
2019-11-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.10.024
PMID:31722201
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了肝纤维化过程中肝星状细胞的功能分区 | 首次发现肝星状细胞在肝小叶中存在空间分区和功能分区，鉴定出中央静脉相关HSCs是主要的致病性胶原产生细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 解析肝纤维化过程中间质细胞的功能异质性和空间分布 | 小鼠肝脏中的肝星状细胞和其他间质细胞 | 单细胞生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康和小鼠肝纤维化模型中的肝间质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7033 | 2025-10-06 |
Human Cortical Organoids Expose a Differential Function of GSK3 on Cortical Neurogenesis
2019-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.09.005
PMID:31607568
|
研究论文 | 本研究利用人类皮质脑类器官探究GSK3抑制对皮质神经发生的纵向影响 | 首次在人类皮质脑类器官模型中揭示GSK3对谷氨酸能谱系和外放射状胶质细胞输出的选择性调控作用 | 研究基于体外类器官模型，与体内真实脑发育环境存在差异 | 阐明GSK3信号在人类皮质发生中的功能相关性 | 人类皮质脑类器官 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | 脑类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7034 | 2025-10-06 |
Glucose-Dependent Insulinotropic Polypeptide Receptor-Expressing Cells in the Hypothalamus Regulate Food Intake
2019-11-05, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2019.07.013
PMID:31447324
|
研究论文 | 本研究通过创建Gipr-Cre基因敲入小鼠，揭示了表达葡萄糖依赖性促胰岛素多肽受体的下丘脑细胞在调节食物摄入中的作用 | 首次创建Gipr-Cre基因敲入小鼠模型，系统鉴定下丘脑中表达GIPR的细胞类型及其在食欲调节中的功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类验证数据有限；未详细探讨GIPR激动剂与拮抗剂在肥胖治疗中的矛盾作用机制 | 阐明GIPR表达细胞在下丘脑中对食物摄入的调节作用及其作为能量平衡调控靶点的潜力 | Gipr-Cre基因敲入小鼠和人类下丘脑组织 | 神经科学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序,RNAscope原位杂交,G-DREADDs化学遗传学技术 | 基因敲入小鼠模型 | 基因表达数据,行为学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 7035 | 2025-10-06 |
Genetic predisposition to mosaic Y chromosome loss in blood
2019-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1765-3
PMID:31748747
|
研究论文 | 本研究通过计算分析方法揭示了男性血液中Y染色体嵌合缺失的遗传易感因素及其与健康关联 | 首次在大规模人群（英国生物银行）中系统识别了156个常染色体遗传决定因子，并通过单细胞RNA测序揭示了LOY细胞的基因表达失调机制 | 主要基于欧洲和日本人群数据，可能不适用于其他种族群体 | 探索Y染色体嵌合缺失的遗传基础及其与癌症和衰老相关疾病的关联机制 | 英国生物银行中的205,011名男性参与者，以及欧洲和日本血统的757,114名男性复制队列 | 遗传学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 计算分析方法 | 基因组数据、转录组数据 | 205,011名男性（主要研究）+ 757,114名男性（复制验证） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7036 | 2025-10-06 |
Building gene regulatory networks from scATAC-seq and scRNA-seq using Linked Self Organizing Maps
2019-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006555
PMID:31682608
|
研究论文 | 提出一种使用自组织映射(SOM)连接scATAC-seq和scRNA-seq数据构建基因调控网络的新方法 | 开发了SOMatic软件包，通过链接函数整合染色质和基因表达自组织映射，克服现有方法对伪时间分析或差异极大细胞类型的依赖 | 未明确说明方法在更广泛细胞类型或生物系统中的适用性限制 | 从单细胞多组学数据构建基因调控网络 | 小鼠前B细胞分化过程 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | 自组织映射(SOM) | 单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7037 | 2025-10-06 |
Locally instructed CXCR4hi neutrophils trigger environment-driven allergic asthma through the release of neutrophil extracellular traps
2019-11, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0496-9
PMID:31591573
|
研究论文 | 本研究揭示了环境因素通过调控中性粒细胞CXCR4表达和中性粒细胞胞外诱捕网释放促进过敏性哮喘的机制 | 首次发现不同环境暴露条件可指令性改变肺中性粒细胞表型，低剂量LPS通过诱导CXCR4高表达中性粒细胞释放NETs促进过敏反应 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探索环境因素与过敏性哮喘发病机制之间的分子联系 | 小鼠肺中性粒细胞和树突状细胞 | 免疫学 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7038 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Gene Signatures Associated with T-cell Persistence Following Adoptive Cell Therapy
2019-Nov, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-19-0299
PMID:31484655
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示与过继性细胞治疗后T细胞持久性相关的基因特征 | 首次在单细胞水平比较了持久性与非持久性T细胞克隆型的基因表达差异 | 单病例研究，样本量有限，结果需要更大规模研究验证 | 识别与过继性细胞治疗成功相关的基因特征 | 转移性结直肠癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1例转移性结直肠癌患者，分析多个T细胞克隆型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7039 | 2025-10-06 |
Dissociation of solid tumor tissues with cold active protease for single-cell RNA-seq minimizes conserved collagenase-associated stress responses
2019-10-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1830-0
PMID:31623682
|
研究论文 | 本研究比较了低温蛋白酶和胶原酶在实体瘤组织解离中对单细胞RNA测序的影响 | 发现胶原酶消化会诱导应激反应基因表达，而低温活性蛋白酶能最小化这种应激反应 | 应激反应具有组织和细胞类型依赖性，可能影响癌症单细胞研究中应激通路表达的解读 | 研究不同组织解离方法对单细胞RNA测序技术变异和生物学变异的影响 | 患者癌组织、患者来源的乳腺癌异种移植模型和癌细胞系 | 单细胞测序 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 155,165个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7040 | 2025-10-06 |
Integrative Transcriptomics Reveals Sexually Dimorphic Control of the Cholinergic/Neurokine Interface in Schizophrenia and Bipolar Disorder
2019-10-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.09.017
PMID:31618642
|
研究论文 | 开发整合转录组学方法揭示精神分裂症和双相情感障碍中胆碱能/神经因子界面的性别二态性调控机制 | 建立整合大规模转录组元分析、单细胞测序和连接组学的多维度分析方法，突破传统仅关注最低p值转录本的局限 | 方法尚未应用于其他神经递质系统和疾病的研究 | 解析精神分裂症和双相情感障碍的性别二态性分子机制 | 患者脑组织、CNS神经元、人源性别特异性细胞系 | 生物信息学 | 精神分裂症, 双相情感障碍 | RNA测序, 单细胞测序, 短RNA测序, 转录组元分析 | NA | 转录组数据, 单细胞数据, 连接组数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |