单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 7021 - 7040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7021 | 2024-10-20 |
The molecular anatomy of cashmere goat hair follicle during cytodifferentiation stage
2024-Oct-15, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10820-2
PMID:39407092
|
研究论文 | 研究了绒山羊毛囊在细胞分化阶段的分子结构及其对纤维质量的影响 | 揭示了绒山羊毛囊内层细胞分化过程中的复杂过程和转录动态，识别了九种细胞群体和关键结构，并发现了三种主要内层谱系及其在特化和信号传导中的作用 | NA | 深入理解绒山羊次级毛囊发育及其对纤维质量的影响，为育种策略提供信息 | 绒山羊的次级毛囊及其在细胞分化阶段的分子结构 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7022 | 2024-10-17 |
Multimodal Identification of Molecular Factors Linked to Severe Diabetic Foot Ulcers Using Artificial Intelligence
2024-Oct-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910686
PMID:39409014
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研究论文 | 利用多模态方法和人工智能技术识别与严重糖尿病足溃疡相关的分子因素 | 本研究通过整合电子健康记录和单细胞转录组学数据，识别出与糖尿病足溃疡严重程度相关的细胞类型特异性和分子因素，并考虑了关键的人口统计学差异 | NA | 识别与严重糖尿病足溃疡相关的分子因素 | 糖尿病足溃疡的分子因素 | 机器学习 | 糖尿病 | RNA测序 | NA | 文本 | 数千名患者 |
| 7023 | 2024-10-20 |
FICTURE: scalable segmentation-free analysis of submicron-resolution spatial transcriptomics
2024-Oct, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02415-2
PMID:39266749
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FICTURE的可扩展的无分割空间转录组分析方法 | FICTURE是一种无分割的空间因子分解方法，能够处理带有数十亿亚微米分辨率空间坐标的转录组数据，并且比现有方法效率高几个数量级 | NA | 开发一种能够处理高分辨率空间转录组数据的可扩展分析方法 | 亚微米分辨率的空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间因子分解 | 多层Dirichlet模型 | 空间转录组数据 | 数十亿亚微米分辨率空间坐标的数据 |
| 7024 | 2024-09-15 |
Analyzing submicron spatial transcriptomics data at their original resolution
2024-Oct, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02416-1
PMID:39271936
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7025 | 2024-10-20 |
Gene signatures for cancer research: A 25-year retrospective and future avenues
2024-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012512
PMID:39413055
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评论 | 本文回顾了过去25年基因签名在癌症研究中的应用，并探讨了未来的发展方向 | 提出了多组学数据整合、机器学习技术、开放科学实践和协作努力等未来发展方向 | 基因签名在不同队列中的重叠和一致性有限，且由于每个患者的转录组独特性，存在可重复性问题 | 探讨基因签名在疾病转录组研究中的可靠性，并提出标准化实践和先进方法 | 基因签名在癌症研究中的应用及其未来发展 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 7026 | 2024-10-20 |
Unveiling the Enigmatic Role of SLC35F3 in Lung Adenocarcinoma
2024-Oct, The clinical respiratory journal
DOI:10.1111/crj.70023
PMID:39414367
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研究论文 | 研究探讨了SLC35F3在肺腺癌中的作用及其临床相关性 | 首次系统分析了SLC35F3在肺腺癌中的表达模式及其与免疫浸润、肿瘤突变负荷和药物敏感性的关系 | 研究主要基于TCGA数据库和细胞系实验，缺乏临床样本的直接验证 | 揭示SLC35F3在肺腺癌中的作用及其潜在的临床应用 | SLC35F3在不同癌症类型中的表达及其在肺腺癌中的临床相关性 | 数字病理学 | 肺癌 | qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 包括来自TCGA数据库的肺腺癌患者数据和细胞系样本 |
| 7027 | 2024-10-20 |
Single-cell transcriptome analysis reveals evolving tumour microenvironment induced by immunochemotherapy in nasopharyngeal carcinoma
2024-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70061
PMID:39415331
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了免疫化疗诱导的鼻咽癌肿瘤微环境的变化 | 首次在单细胞水平上探讨了免疫化疗对鼻咽癌肿瘤微环境的影响，揭示了不同治疗反应的分子机制 | 样本量较小，仅包括18个bulk和11个单细胞RNA测序样本 | 探讨免疫化疗对鼻咽癌肿瘤微环境的影响及其机制 | 高风险转移性局部晚期鼻咽癌患者治疗前后的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 18个bulk样本和11个单细胞RNA测序样本 |
| 7028 | 2024-10-20 |
Bioinformatic-Experimental Screening Uncovers Multiple Targets for Increase of MHC-I Expression through Activating the Interferon Response in Breast Cancer
2024-Sep-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910546
PMID:39408874
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验筛选，识别出多个可以增加乳腺癌中MHC-I表达的基因靶点 | 首次通过综合分析MHC-I评分、基因表达相关性、生存预测和Cibersort肿瘤浸润淋巴细胞评分，识别出144个与MHC-I表达和TILs负相关的基因，并通过实验验证了其中多个基因的有效性 | 研究主要集中在乳腺癌细胞系和患者样本，结果的普适性需要进一步验证 | 识别并验证可以增加乳腺癌中MHC-I表达的基因靶点 | 乳腺癌细胞中的MHC-I表达和肿瘤浸润淋巴细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 乳腺癌患者样本 |
| 7029 | 2024-10-20 |
Cerebrospinal Fluid and Peripheral Blood Lymphomonocyte Single-Cell Transcriptomics in a Subject with Multiple Sclerosis Acutely Infected with HIV
2024-Sep-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910459
PMID:39408789
|
研究论文 | 研究了多发性硬化症（MS）急性感染HIV患者的脑脊液和外周血淋巴单核细胞的单细胞转录组特征 | 首次在多发性硬化症和HIV感染的临床样本中使用单细胞转录组技术，揭示了神经退行性基因表达的特征 | 无法区分多发性硬化症和HIV感染的具体原因 | 探讨多发性硬化症急性感染HIV患者的脑脊液和外周血淋巴单核细胞的单细胞转录组特征 | 多发性硬化症急性感染HIV患者的脑脊液和外周血淋巴单核细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 脑脊液中1446个单细胞转录组，外周血单核细胞中4647个单细胞转录组 |
| 7030 | 2024-10-20 |
Characterization of Endothelial Cell Subclusters in Localized Scleroderma Skin with Single-Cell RNA Sequencing Identifies NOTCH Signaling Pathway
2024-Sep-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910473
PMID:39408800
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了局限性硬皮病皮肤中的内皮细胞亚群，并识别出NOTCH信号通路 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细研究局限性硬皮病皮肤中的内皮细胞亚群，并识别出与疾病进展相关的信号通路 | 研究样本仅包括27名局限性硬皮病患者和17名健康对照，样本量有限 | 探讨局限性硬皮病皮肤中内皮细胞的分子机制 | 局限性硬皮病患者的皮肤内皮细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 27名局限性硬皮病患者和17名健康对照的皮肤细胞 |
| 7031 | 2024-10-20 |
Unravelling the Complexity of HNSCC Using Single-Cell Transcriptomics
2024-Sep-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16193265
PMID:39409886
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNAseq）在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）研究中的应用 | scRNAseq技术能够详细描述肿瘤微环境（TME）中的细胞水平特征，为HNSCC的病因、诊断、预后和治疗提供了新的见解 | NA | 评估scRNAseq在解决HNSCC管理挑战中的效用 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）及其肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 7032 | 2024-10-20 |
SELF-Former: multi-scale gene filtration transformer for single-cell spatial reconstruction
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae523
PMID:39413798
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Transformer的框架SELF-Former，用于单细胞空间重构任务 | 引入了基因过滤模块，显著提升了空间重构任务的准确性 | NA | 解决单细胞RNA测序数据到空间转录组数据的空间重构问题 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | Transformer | Transformer | 基因表达数据 | 四个基准数据集 |
| 7033 | 2024-10-20 |
Isotype-aware inference of B cell clonal lineage trees from single-cell sequencing data
2024-Sep-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100637
PMID:39208795
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TRIBAL的算法，用于从单细胞RNA测序数据中推断B细胞克隆系谱树，考虑了体细胞超突变和类别转换重组 | TRIBAL算法能够同时考虑体细胞超突变和类别转换重组，相较于现有方法，能够更全面和准确地重建B细胞系谱树 | NA | 开发一种新的算法，用于从单细胞RNA测序数据中推断B细胞克隆系谱树，考虑体细胞超突变和类别转换重组 | B细胞克隆系谱树的推断 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7034 | 2024-10-20 |
An isoform-resolution transcriptomic atlas of colorectal cancer from long-read single-cell sequencing
2024-Sep-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100641
PMID:39216476
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研究论文 | 本研究通过整合短读和长读单细胞RNA测序数据，构建了结直肠癌的isoform分辨率转录组图谱 | 首次整合短读和长读单细胞RNA测序数据，揭示了结直肠癌中394个失调的转录结构，并开发了一种算法来识别可能用于癌症疫苗开发的复发性新抗原 | NA | 揭示结直肠癌中的转录异质性和潜在的治疗靶点 | 结直肠癌样本中的肿瘤上皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 7035 | 2024-10-20 |
Cardiac and perivascular myofibroblasts, matrifibrocytes, and immune fibrocytes in hypertension; commonalities and differences with other cardiovascular diseases
2024-May-07, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae044
PMID:38395029
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研究论文 | 本文探讨了高血压中不同类型纤维化的分子机制及其在心血管病理生理学中的潜在作用 | 本文提出了新的纤维母细胞亚群（如matrifibrocytes和immune fibrocytes）在心血管纤维化中的作用，并探讨了其潜在的治疗应用 | 本文主要基于实验证据和单细胞RNA测序研究，缺乏临床验证 | 研究高血压和其他心血管疾病中纤维化的分子机制及其潜在治疗策略 | 高血压、压力超负荷、心肌梗死、动脉粥样硬化、主动脉瘤和肾硬化等心血管疾病中的纤维母细胞亚群 | 心血管疾病 | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7036 | 2024-10-20 |
SSR1 and CKAP4 as potential biomarkers for intervertebral disc degeneration based on integrated bioinformatics analysis
2024-Mar, JOR spine
IF:3.4Q1
DOI:10.1002/jsp2.1309
PMID:38222802
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，鉴定了SSR1和CKAP4作为椎间盘退变潜在的生物标志物，并在体外进行了验证 | 本研究首次通过综合生物信息学方法鉴定了SSR1和CKAP4作为椎间盘退变的潜在生物标志物，并在体外实验中验证了其诊断价值 | 本研究的样本量较小，且仅限于人类椎间盘组织，未来需要更大规模和多样本的验证 | 鉴定椎间盘退变的潜在生物标志物并验证其诊断价值 | 椎间盘退变相关的关键基因和潜在生物标志物 | 生物信息学 | 脊柱疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、MCODE、LASSO算法、ROC曲线、免疫浸润分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 30个人类椎间盘样本 |
| 7037 | 2024-10-20 |
Single-cell sequencing reveals increased LAMB3-positive basal keratinocytes and ZNF90-positive fibroblasts in autologous cultured epithelium
2024-01-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05747-5
PMID:38200141
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研究论文 | 研究在无血清和无饲养层条件下培养的自体表皮移植的安全性和有效性，并与传统条件进行比较 | 发现无血清和无饲养层培养的表皮中LAMB3阳性基底角质形成细胞和ZNF90阳性成纤维细胞数量增加，这些细胞在色素再生中起关键作用 | 研究仅限于稳定期的白癜风患者，未涉及其他疾病或更广泛的患者群体 | 探讨无血清和无饲养层条件下自体表皮移植的安全性和有效性 | 自体表皮移植在无血清和无饲养层条件下的细胞组成和功能 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 稳定期白癜风患者 |
| 7038 | 2024-10-20 |
Profiling the heterogeneity of colorectal cancer consensus molecular subtypes using spatial transcriptomics
2024-Jan-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00488-4
PMID:38200223
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，解析了结直肠癌共识分子亚型的空间细胞和分子组成 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了结直肠癌共识分子亚型的空间异质性和肿瘤微环境中的细胞通讯事件 | NA | 进一步阐明结直肠癌的组成和结构，以推进个性化治疗 | 结直肠癌共识分子亚型的空间异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7039 | 2024-10-20 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals tumor cell heterogeneity and immune microenvironment features of pituitary neuroendocrine tumors
2024-01-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01267-3
PMID:38167466
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析了垂体神经内分泌肿瘤的细胞异质性和免疫微环境特征 | 揭示了垂体神经内分泌肿瘤的内在细胞异质性和肿瘤微环境特征，发现了一种新的具有侵袭性特征的皮质激素瘤亚型 | NA | 研究垂体神经内分泌肿瘤的细胞特征和免疫微环境 | 垂体神经内分泌肿瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4个正常样本和24个垂体神经内分泌肿瘤样本 |
| 7040 | 2024-10-20 |
ZNF689 deficiency promotes intratumor heterogeneity and immunotherapy resistance in triple-negative breast cancer
2024-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00909-w
PMID:38168642
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研究论文 | 研究探讨了ZNF689缺乏如何促进三阴性乳腺癌中的肿瘤内异质性和免疫治疗抵抗 | 首次揭示了ZNF689缺乏通过激活LINE-1逆转录转座子加剧基因组不稳定性，从而促进肿瘤内异质性和免疫治疗抵抗 | NA | 探讨三阴性乳腺癌中肿瘤内异质性与免疫治疗抵抗的关系及其关键决定因素 | 三阴性乳腺癌患者的多组学数据和免疫治疗数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间分辨转录组学、流式细胞术 | NA | 多组学数据 | 260例来自本中心的患者、134例来自TCGA的患者和109例接受免疫治疗的患者 |