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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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7001 | 2025-10-06 |
Using single-cell technologies to map the human immune system - implications for nephrology
2020-02, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-019-0227-3
PMID:31831877
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综述 | 探讨单细胞技术如何推动人类免疫系统图谱绘制及其在肾脏病学中的应用前景 | 系统阐述单细胞技术对肾脏免疫景观研究的革命性影响,提出临床转化应用路径 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于技术前景的理论分析 | 探索单细胞技术在肾脏免疫系统研究和肾脏疾病诊疗中的应用价值 | 肾脏组织、血液、次级淋巴器官中的免疫细胞及上皮/内皮细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
7002 | 2025-10-06 |
Pro-efferocytic nanoparticles are specifically taken up by lesional macrophages and prevent atherosclerosis
2020-02, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-019-0619-3
PMID:31988506
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研究论文 | 开发了一种基于单壁碳纳米管的巨噬细胞特异性纳米疗法,用于预防动脉粥样硬化 | 利用单壁碳纳米管作为'特洛伊木马'纳米颗粒,特异性靶向病变巨噬细胞并重新激活胞葬作用 | 研究仅在易患动脉粥样硬化的载脂蛋白E缺陷小鼠模型中进行,尚未在人体验证 | 开发安全有效的纳米疗法来预防和治疗动脉粥样硬化心血管疾病 | 易患动脉粥样硬化的载脂蛋白E缺陷小鼠和病变巨噬细胞 | 纳米医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7003 | 2025-10-06 |
Chromatin mapping and single-cell immune profiling define the temporal dynamics of ibrutinib response in CLL
2020-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14081-6
PMID:31996669
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研究论文 | 通过染色质图谱和单细胞免疫分析定义伊布替尼在慢性淋巴细胞白血病中应答的时间动态 | 结合免疫表型分析、单细胞转录组分析和染色质图谱,首次系统描绘了伊布替尼治疗过程中CLL细胞的调控动态程序 | 研究样本量有限,患者间存在异质性 | 阐明伊布替尼治疗慢性淋巴细胞白血病的分子调控机制 | 慢性淋巴细胞白血病患者 | 单细胞分析 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组分析,染色质图谱,免疫表型分析 | NA | 单细胞转录组数据,染色质数据,免疫表型数据 | 接受伊布替尼治疗的CLL患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq,染色质图谱 | NA | NA |
7004 | 2025-10-06 |
Loss of Kat2a enhances transcriptional noise and depletes acute myeloid leukemia stem-like cells
2020-01-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.51754
PMID:31985402
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研究论文 | 本研究通过染色质分析和单细胞转录组学揭示Kat2a缺失通过增强转录噪音消耗急性髓系白血病干细胞样细胞 | 首次发现Kat2a通过调控转录爆发频率控制转录变异性,从而维持白血病干细胞样细胞的自我更新能力 | 研究基于条件性基因敲除小鼠模型,人类AML中的直接适用性需进一步验证 | 探究Kat2a在急性髓系白血病干细胞维持中的作用机制 | 条件性Kat2a敲除小鼠模型中的白血病干细胞样细胞 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 染色质分析, 单细胞转录组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7005 | 2025-10-06 |
An optimized protocol for retina single-cell RNA sequencing
2020, Molecular vision
IF:1.8Q3
PMID:33088174
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研究论文 | 开发了一种优化的视网膜单细胞RNA测序方案,改进了样本制备和数据分析流程 | 改良了视网膜样本的温和解离方法,减少了细胞死亡并保持细胞形态,同时改进了计算分析流程 | 比较了新鲜与冷冻视网膜样本的优缺点,但未明确说明具体适用范围 | 优化视网膜单细胞RNA测序的样本制备和数据分析方法 | 小鼠视网膜组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7006 | 2025-10-06 |
Combined single-cell and spatial transcriptomics reveal the molecular, cellular and spatial bone marrow niche organization
2020-01, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-019-0439-6
PMID:31871321
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研究论文 | 结合单细胞和空间转录组学系统绘制骨髓微环境的分子、细胞和空间组成图谱 | 首次结合单细胞和空间转录组技术揭示骨髓微环境的三维空间组织,开发了可从单细胞转录组数据推断空间定位的RNA-Magnet算法 | NA | 解析骨髓微环境的细胞和空间组织结构 | 骨髓驻留细胞类型,特别是Cxcl12富集网状细胞亚群 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | RNA-Magnet算法 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
7007 | 2025-10-06 |
The Application of Single-Cell RNA Sequencing in Vaccinology
2020, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2020/8624963
PMID:32802896
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综述 | 本文探讨单细胞RNA测序技术在疫苗学中的应用潜力 | 系统阐述单细胞RNA测序在传染病疫苗开发中的创新应用价值 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述 | 探索单细胞RNA测序技术在疫苗研发领域的应用前景 | 疫苗免疫反应和传染病(包括COVID-19) | 系统免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7008 | 2025-10-06 |
Patterns, Profiles, and Parsimony: Dissecting Transcriptional Signatures From Minimal Single-Cell RNA-Seq Output With SALSA
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.511286
PMID:33193599
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研究论文 | 介绍SALSA工作流程,可从超稀疏单细胞RNA测序数据中推断稳健表达谱 | 结合测量可靠性指标与潜在变量提取,使用矩阵聚焦方法识别必需基因,基于最小特征基因集进行细胞聚类 | 未明确说明算法在更复杂组织或疾病模型中的适用性 | 开发能够从稀疏单细胞RNA测序数据中提取稳健转录特征的计算方法 | 人类外周血单核细胞和小鼠视网膜细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 潜在语义分析 | 单细胞基因表达数据 | 2,700个人类外周血单细胞和64,000个小鼠视网膜细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Genomics PBMC 3K, DropSeq | 10X Genomics PBMC 3K数据集和DropSeq平台 |
7009 | 2025-10-06 |
Nuclear MYH9-induced CTNNB1 transcription, targeted by staurosporin, promotes gastric cancer cell anoikis resistance and metastasis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.46001
PMID:32685004
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研究论文 | 本研究揭示核MYH9通过促进CTNNB1转录增强胃癌细胞失巢凋亡抵抗和转移能力 | 首次发现MYH9在胃癌细胞核内定位并通过四个核定位信号调控CTNNB1转录的机制 | 动物模型主要使用裸鼠和转基因小鼠,临床转化需进一步验证 | 探究胃癌腹膜转移的分子机制及潜在治疗策略 | 胃癌细胞系、裸鼠模型、转基因小鼠模型、人类胃癌组织样本 | 癌症生物学 | 胃癌 | 2-DIGE, MALDI-TOF/TOF MS, 单细胞转录组测序, 免疫荧光, 免疫透射电镜, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因检测 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 影像数据 | 未明确样本数量,包含正常胃黏膜、原发胃癌和腹膜转移组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7010 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Sequencing From Mouse Incisor Reveals Dental Epithelial Cell-Type Specific Genes
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00841
PMID:32984333
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研究论文 | 通过小鼠切牙单细胞RNA测序揭示牙釉质上皮细胞类型特异性基因 | 首次通过单细胞RNA测鉴定了牙釉质上皮细胞的新型标记基因,揭示了分泌期成釉细胞亚型分化轨迹 | 仅使用出生后7天小鼠切牙样本,未验证其他发育阶段或牙齿类型 | 阐明牙釉质上皮细胞类型的异质性 | 小鼠切牙牙釉质上皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类,伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 6,260个单细胞(出生后7天小鼠切牙) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7011 | 2025-10-06 |
Characterizing Adult Cochlear Supporting Cell Transcriptional Diversity Using Single-Cell RNA-Seq: Validation in the Adult Mouse and Translational Implications for the Adult Human Cochlea
2020, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2020.00013
PMID:32116546
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序首次表征了成年小鼠耳蜗支持细胞的转录组多样性,并验证其在成年人类耳蜗中的相关性 | 首次对成年耳蜗支持细胞进行单细胞转录组表征,揭示了其与围产期支持细胞的转录差异 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 为听力恢复治疗提供成年耳蜗支持细胞的转录组基准 | 成年小鼠耳蜗支持细胞和成年人类耳蜗组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序,荧光免疫组化,原位杂交,qPCR | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | FACS纯化的成年小鼠耳蜗支持细胞(GFP表达) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7012 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of human adipose tissue identifies depot and disease specific cell types
2020-01, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-019-0152-6
PMID:32066997
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类不同脂肪库的基质血管组分,识别与代谢疾病相关的特异性细胞类型 | 首次在人类肥胖个体中系统比较内脏和皮下脂肪组织的单细胞转录组差异,发现与2型糖尿病相关的脂肪祖细胞亚型和表达金属硫蛋白的功能失调CD8+ T细胞 | 研究样本仅来自肥胖个体,未包含正常体重对照群体 | 解析人类脂肪组织分布与代谢疾病风险的细胞学基础 | 肥胖个体的内脏和皮下脂肪组织样本 | 单细胞组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 肥胖个体的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7013 | 2025-10-06 |
New Developments in Transcriptomic Analysis of Synovial Tissue
2020, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2020.00021
PMID:32083090
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综述 | 本文综述了滑膜组织转录组学分析技术的最新进展及其在类风湿关节炎研究中的应用 | 系统总结了从微阵列到单细胞测序再到空间转录组学的技术演进,特别强调了单细胞测序在揭示滑膜成纤维细胞亚群多样性方面的突破性贡献 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述和技术展望 | 探讨转录组学技术在滑膜组织研究中的发展历程和应用前景 | 滑膜组织,特别是类风湿关节炎患者的关节组织 | 转录组学 | 类风湿关节炎 | 微阵列,bulk RNA测序,单细胞测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序 | NA | NA |
7014 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics from human pancreatic islets: sample preparation matters
2020, Biology methods & protocols
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/biomethods/bpz019
PMID:31984226
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研究论文 | 比较不同样本制备方案对人类胰岛单细胞转录组测序结果的影响 | 首次系统评估不同样本处理策略(包括固定和冷冻保存)对新鲜人类胰岛单细胞RNA测序数据的影响 | 研究仅基于两名供体的胰岛样本,样本量较小 | 评估样本制备方案对单细胞转录组测序结果的影响 | 人类胰岛组织 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2名人类供体的胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7015 | 2025-10-06 |
scRNA-seq assessment of the human lung, spleen, and esophagus tissue stability after cold preservation
2019-12-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1906-x
PMID:31892341
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研究论文 | 评估冷保存对人体肺、脾和食管组织稳定性的单细胞RNA测序研究 | 首次系统评估多种人体器官在冷保存条件下单细胞RNA测序数据的稳定性,为样本收集提供时间窗口指导 | 仅评估了三种器官组织,样本量相对有限(≥5名供体),未涵盖所有人体组织类型 | 研究冷保存时间对单细胞RNA测序数据质量的影响,优化样本处理流程 | 健康人体肺组织、脾组织和食管组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | 单细胞转录组数据,基因组序列数据 | ≥5名供体的肺、脾和食管组织,共240,000个高质量单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7016 | 2025-10-06 |
Discrimination of Dormant and Active Hematopoietic Stem Cells by G0 Marker Reveals Dormancy Regulation by Cytoplasmic Calcium
2019-12-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.11.061
PMID:31851939
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研究论文 | 本研究通过建立G0标记小鼠系区分休眠和活跃的造血干细胞,并揭示细胞质钙浓度对干细胞休眠的调控机制 | 开发了能够可视化静息细胞的G0标记小鼠系,首次在传统静息造血干细胞群中识别出活跃与休眠亚群,发现细胞质钙浓度调控干细胞休眠的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类造血干细胞中的适用性需要进一步验证 | 探究休眠与活跃造血干细胞的区分标志及其调控机制 | 小鼠造血干细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序,高通量小分子筛选 | NA | 基因表达数据,细胞成像数据 | 小鼠造血干细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7017 | 2025-10-06 |
IL-33 Signaling Alters Regulatory T Cell Diversity in Support of Tumor Development
2019-12-03, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.10.120
PMID:31801068
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示IL-33信号通过调控调节性T细胞多样性促进肿瘤发展的机制 | 首次纵向追踪肺腺癌模型中调节性T细胞的动态变化,发现ST2受体在晚期疾病中主导效应表型形成 | 研究基于基因工程小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究调节性T细胞在肿瘤发展过程中的动态变化及其免疫抑制机制 | 肺腺癌基因工程小鼠模型中的调节性T细胞 | 免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7018 | 2025-10-06 |
Characterizing smoking-induced transcriptional heterogeneity in the human bronchial epithelium at single-cell resolution
2019-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaw3413
PMID:31844660
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析吸烟对人类支气管上皮细胞转录异质性的影响 | 首次在单细胞分辨率下识别出吸烟者支气管上皮中表达支气管癌前病变标志物的新型杯状细胞周围亚群 | 样本量较小(仅12名参与者),未包含戒烟者群体 | 表征吸烟诱导的人类支气管上皮转录异质性 | 人类支气管上皮细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督分析 | 单细胞转录组数据 | 12名参与者(6名从不吸烟者,6名当前吸烟者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
7019 | 2025-10-06 |
Data generation and network reconstruction strategies for single cell transcriptomic profiles of CRISPR-mediated gene perturbations
2020-06, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
DOI:10.1016/j.bbagrm.2019.194441
PMID:31756390
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综述 | 讨论单细胞RNA测序与CRISPR/Cas9技术结合进行大规模基因扰动研究的数据生成和网络重建策略 | 系统分析单细胞CRISPR扰动数据特有的技术挑战,并介绍网络重建新方法如嵌套效应模型 | 主要关注方法学讨论,缺乏实际数据验证 | 开发单细胞转录组基因扰动数据的生成和分析方法,以重建细胞网络模型 | 单细胞转录组CRISPR扰动数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9 | 共表达网络, 贝叶斯网络, 嵌套效应模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7020 | 2025-10-06 |
Expression profiling of single cells and patient cohorts identifies multiple immunosuppressive pathways and an altered NK cell phenotype in glioblastoma
2020-04, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1111/cei.13403
PMID:31784984
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研究论文 | 本研究通过单细胞和患者队列分析揭示了胶质母细胞瘤中多种免疫抑制途径及NK细胞表型改变 | 首次结合单细胞转录组和患者队列数据系统揭示胶质母细胞瘤中NK细胞功能抑制机制及多种免疫逃避途径 | 研究主要基于体外实验和转录组数据分析,需要进一步体内功能验证 | 阐明胶质母细胞瘤免疫抑制机制及NK细胞在肿瘤微环境中的功能状态 | 胶质母细胞瘤患者样本、神经胶质瘤干细胞、正常神经前体细胞、NK细胞 | 单细胞测序 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序, 基因表达谱分析, 蛋白质表达分析, NK细胞功能检测 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 患者队列数据 | 患者队列样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | NA |