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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6981 | 2025-10-06 |
Cardelino: computational integration of somatic clonal substructure and single-cell transcriptomes
2020-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0766-3
PMID:32203388
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研究论文 | 开发了一种计算整合方法,将体细胞克隆亚结构与单细胞转录组数据相结合 | 首次提出能够整合不完美的克隆树推断和稀疏变异等位基因表达数据的方法,实现单细胞水平克隆起源的表型特征分析 | 方法依赖于体细胞变异检测的准确性,在变异稀疏情况下性能可能受限 | 开发计算工具来表征不同克隆之间的表型变异 | 人类皮肤成纤维细胞系和癌症数据集 | 计算生物学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 外显子组测序 | 概率模型 | 基因表达数据, DNA序列数据 | 32个人类皮肤成纤维细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 外显子组测序 | NA | NA |
6982 | 2025-10-06 |
Dissecting the early steps of MLL induced leukaemogenic transformation using a mouse model of AML
2020-03-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15220-0
PMID:32179751
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研究论文 | 利用小鼠AML模型研究MLL诱导白血病转化的早期阶段 | 开发了基于明确克隆关系的MLL-r模型,能够捕获MLL-ENL表达的早期细胞和分子后果 | 人类患者和常规小鼠模型通常无法获取白血病转化的早期阶段 | 解析MLL诱导白血病转化的早期步骤 | 小鼠多能造血祖细胞 | 单细胞组学 | 白血病 | scRNA-seq, ATAC-seq, CRISPR-Cas9筛选 | 小鼠AML模型 | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
6983 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals a heterogeneous response to Glucocorticoids in breast cancer cells
2020-03-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-0837-0
PMID:32170217
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示乳腺癌细胞对糖皮质激素反应的异质性 | 首次在单细胞水平揭示糖皮质激素反应的细胞间异质性,发现超过100个批量RNAseq未能检测到的GR调控基因 | 仅使用单一乳腺癌细胞系进行研究,未涉及体内环境或临床样本 | 研究糖皮质激素在单细胞水平的转录反应异质性 | 人类乳腺癌细胞系 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6984 | 2025-10-06 |
Interferon lambda promotes immune dysregulation and tissue inflammation in TLR7-induced lupus
2020-03-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1916897117
PMID:32094169
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研究论文 | 本研究揭示了III型干扰素λ在TLR7诱导的狼疮模型中促进免疫失调和组织炎症的非冗余作用 | 首次确定了IFN-λ在自身免疫疾病狼疮中的关键作用,发现其通过激活角质形成细胞和系膜细胞诱导免疫细胞招募,而不影响自身抗体产生 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自外周血单细胞分析 | 探究III型干扰素在系统性红斑狼疮发病机制中的作用 | TLR7诱导的狼疮小鼠模型、小鼠脾脏细胞、人类外周血细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6985 | 2025-10-06 |
Functional Heterogeneity within the Developing Zebrafish Epicardium
2020-03-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.01.023
PMID:32084358
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼心脏发育过程中心外膜的细胞异质性和功能多样性 | 首次在斑马鱼发育心脏中发现三个具有特定遗传程序和空间分布的心外膜亚群,并揭示了它们在细胞粘附、迁移和趋化作用中的特定功能 | 研究仅限于斑马鱼发育阶段,尚未在哺乳动物或人类模型中验证 | 探究心外膜细胞异质性及其在心脏发育中的功能多样性 | 发育中的斑马鱼心脏心外膜细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6986 | 2025-10-06 |
Identification of region-specific astrocyte subtypes at single cell resolution
2020-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14198-8
PMID:32139688
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了成年小鼠前脑区域中五种转录组学上不同的星形胶质细胞亚型 | 首次在单细胞分辨率下系统识别了大脑区域特异性星形胶质细胞亚型,并揭示了其独特的空间分布模式 | 研究仅针对成年小鼠的皮层和海马区域,未涵盖其他脑区或发育阶段 | 探究前脑区域星形胶质细胞分子多样性的真实程度 | 成年小鼠大脑皮层和海马区域的星形胶质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠大脑皮层和海马区域星形胶质细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6987 | 2025-10-06 |
Re-evaluation of human BDCA-2+ DC during acute sterile skin inflammation
2020-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20190811
PMID:31845972
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研究论文 | 重新评估急性无菌性皮肤炎症中人类BDCA-2+树突状细胞的特征和功能 | 发现了一种新型CD123intBDCA-2+CD1a+树突状细胞亚群在皮肤伤口中快速浸润,并揭示了ASDC细胞在皮肤损伤过程中的存在 | 研究主要关注急性无菌炎症模型,在慢性炎症或其他疾病条件下的适用性需进一步验证 | 重新评估人类皮肤炎症过程中BDCA-2+树突状细胞的组成和功能 | 人类皮肤伤口中的树突状细胞亚群 | 免疫学 | 皮肤炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
6988 | 2025-10-06 |
Dynamics of human monocytes and airway macrophages during healthy aging and after transplant
2020-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20191236
PMID:31917836
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类不同年龄段和肺移植后单核细胞与气道巨噬细胞的动态变化 | 首次系统描绘人类气道巨噬细胞在健康衰老和肺移植后的来源动态变化 | 样本量相对有限,主要基于观察性数据 | 理解人类肺中气道巨噬细胞的个体发育及其在疾病中的作用 | 健康志愿者和肺移植受者的外周血和气道单核细胞/巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖婴儿/儿童期(2-12岁)、成年期(20-50岁)和老年期(>50岁)的健康志愿者,以及性别不匹配的肺移植受者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6989 | 2025-10-06 |
Titrating gene expression using libraries of systematically attenuated CRISPR guide RNAs
2020-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0387-5
PMID:31932729
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研究论文 | 开发了一种使用CRISPR干扰和系统衰减sgRNA文库来精确调控人类基因表达水平的方法 | 利用包含错配的sgRNA系统性地调控基因表达水平,并通过深度学习推导错配sgRNA活性规则 | NA | 建立精确控制基因表达的工具,研究表达水平与表型之间的关系 | 人类基因,特别是约2,400个对细胞生长至关重要的基因 | 基因编辑 | 基因表达失调疾病 | CRISPR干扰,单细胞RNA-seq,深度学习 | 深度学习模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 多个细胞模型的大规模测量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6990 | 2025-10-06 |
Bystander IFN-γ activity promotes widespread and sustained cytokine signaling altering the tumor microenvironment
2020-03, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-0038-2
PMID:32803171
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤反应性T细胞产生的IFN-γ通过扩散和旁观者活性广泛改变肿瘤微环境的机制 | 首次证明IFN-γ可在肿瘤内远距离扩散,并通过旁观者活性介导持续的STAT1信号传导 | 人类数据主要来自单细胞RNA-seq分析,需要进一步实验验证 | 探究IFN-γ在肿瘤微环境中的时空活动模式及其功能影响 | 肿瘤反应性T细胞、肿瘤细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 活体成像、单细胞RNA测序、STAT1易位报告系统 | NA | 成像数据、基因表达数据 | 黑色素瘤患者单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6991 | 2025-10-06 |
Publisher Correction: Single-cell and spatial transcriptomics reveal somitogenesis in gastruloids
2020-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2113-3
PMID:32132714
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更正 | 本文是对原论文的出版更正,可通过论文顶部链接访问 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
6992 | 2025-10-06 |
Functionally distinct subgroups of oligodendrocyte precursor cells integrate neural activity and execute myelin formation
2020-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-019-0581-2
PMID:32066987
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞技术揭示了少突胶质前体细胞存在功能不同的亚群 | 首次证明少突胶质前体细胞存在功能特化的稳定亚群,而非临时状态 | 研究仅基于斑马鱼脊髓模型,未验证其他物种或脑区 | 探究少突胶质前体细胞的异质性本质和功能分化 | 斑马鱼脊髓中的少突胶质前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序, 钙成像, 谱系追踪, 神经活动操控 | NA | 基因表达数据, 成像数据, 生理信号数据 | 斑马鱼脊髓少突胶质前体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6993 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing in hematology
2020-03, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000000613
PMID:31895120
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在血液学研究和血液恶性肿瘤研究中的最新应用与进展 | 重点介绍了通过单细胞分辨率研究髓系恶性肿瘤中干细胞/祖细胞获得的生物学新见解 | NA | 探讨单细胞测序技术在血液学研究和血液恶性肿瘤临床管理中的当前及未来应用 | 造血过程和血液恶性肿瘤,特别是髓系恶性肿瘤中的干细胞/祖细胞 | 单细胞组学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | RNA、DNA、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞DNA测序,单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
6994 | 2025-10-06 |
Understanding the complexity of retina and pluripotent stem cell derived retinal organoids with single cell RNA sequencing: current progress, remaining challenges and future prospective
2020-03, Current eye research
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/02713683.2019.1697453
PMID:31794277
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综述 | 综述单细胞RNA测序技术在视网膜和视网膜类器官研究中的应用进展、挑战与未来展望 | 系统比较视网膜组织与干细胞衍生视网膜类器官的单细胞转录组数据,揭示细胞类型亚群特征和地理差异 | 技术一致性有待提高,尚未完全解析所有视网膜细胞类型的复杂性、功能性和相互作用 | 探讨单细胞测序技术在视网膜研究中的应用价值与发展前景 | 视网膜组织和多能干细胞衍生的视网膜类器官 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6995 | 2025-10-06 |
Bone Marrow Stromal Cells Drive Key Hallmarks of B Cell Malignancies
2020-Feb-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21041466
PMID:32098106
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综述 | 本文综述了骨髓基质细胞与恶性B细胞之间的相互作用及其在B细胞恶性肿瘤发病机制中的作用 | 强调肿瘤细胞与基质细胞相互作用的双向性,提出靶向肿瘤-基质相互作用具有治疗潜力 | NA | 探讨骨髓基质细胞与恶性B细胞之间的相互作用机制及其在B细胞恶性肿瘤中的关键作用 | 骨髓基质细胞和恶性B细胞 | NA | B细胞恶性肿瘤 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6996 | 2025-10-06 |
A cell atlas of human thymic development defines T cell repertoire formation
2020-02-21, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aay3224
PMID:32079746
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类胸腺生命周期细胞图谱,揭示T细胞发育轨迹和T细胞受体重组动力学 | 首次创建人类胸腺生命周期单细胞图谱,识别新型CD8αα T细胞群、胸腺成纤维细胞亚型和活化树突状细胞状态,揭示TCR重组的基因组位置偏好性 | NA | 解析人类胸腺T细胞发育过程和T细胞受体形成机制 | 人类胸腺组织样本 | 单细胞组学 | 免疫系统发育 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖整个生命周期的人类胸腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6997 | 2025-10-06 |
Adult Human Glioblastomas Harbor Radial Glia-like Cells
2020-02-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.01.007
PMID:32004492
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研究论文 | 本研究在成人胶质母细胞瘤中发现存在放射状胶质细胞样细胞亚群 | 首次在成人胶质母细胞瘤中发现具有典型放射状胶质细胞形态和标志物的细胞亚群,并揭示其与正常人类胎儿放射状胶质细胞的转录组相似性 | 研究主要基于单细胞RNA测序分析,需要进一步功能验证这些细胞在肿瘤发生中的具体作用 | 探索成人胶质母细胞瘤中是否存在放射状胶质细胞样细胞及其在肿瘤中的作用 | 成人胶质母细胞瘤组织样本 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6998 | 2025-10-06 |
The Repertoire of Serous Ovarian Cancer Non-genetic Heterogeneity Revealed by Single-Cell Sequencing of Normal Fallopian Tube Epithelial Cells
2020-02-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.01.003
PMID:32049047
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研究论文 | 通过正常输卵管上皮细胞的单细胞测序揭示浆液性卵巢癌的非遗传异质性 | 首次利用正常输卵管上皮细胞的分子特征来准确测量浆液性卵巢癌的非遗传异质性 | 样本主要来自非卵巢癌患者,可能影响细胞亚型特征的普适性 | 量化浆液性卵巢癌的非遗传异质性并评估其预后价值 | 正常输卵管上皮细胞和浆液性卵巢癌肿瘤组织 | 单细胞测序 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约6,000个正常输卵管上皮细胞和约1,700个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6999 | 2025-10-06 |
Eleven grand challenges in single-cell data science
2020-02-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-1926-6
PMID:32033589
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综述 | 本文概述了单细胞数据科学领域面临的十一项重大挑战 | 首次系统性地提出单细胞数据科学领域的核心挑战,为未来研究指明方向 | 未提供具体解决方案,主要聚焦于问题识别和框架构建 | 推动单细胞数据科学领域的发展,界定关键研究问题 | 单细胞测序技术产生的海量数据及其分析方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞测序数据 | 数千至数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
7000 | 2025-10-06 |
Targeted therapy guided by single-cell transcriptomic analysis in drug-induced hypersensitivity syndrome: a case report
2020-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0733-7
PMID:31959990
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病例报告 | 通过单细胞转录组分析指导药物超敏综合征的靶向治疗 | 首次应用单细胞RNA测序技术解析难治性药物超敏综合征的病理机制,并基于发现指导靶向治疗 | 仅基于单一病例报告,需要更大样本量验证 | 探索难治性药物超敏综合征的病理机制和靶向治疗策略 | 一名难治性药物超敏综合征患者的皮肤和血液样本 | 单细胞组学 | 药物超敏综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |