单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 6981 - 7000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6981 | 2024-10-20 |
A distal lung organoid model to study interstitial lung disease, viral infection and human lung development
2023-07, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-023-00827-6
PMID:37165073
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研究论文 | 本文描述了一种将人类多能干细胞定向分化为远端肺类器官的策略 | 该方法能够重现肺发育过程，并生成具有分支形态、几乎无非肺内胚层谱系、含有间质且能重现间质性肺疾病的类器官 | NA | 研究间质性肺疾病、病毒感染和人类肺发育 | 人类多能干细胞定向分化为远端肺类器官 | 干细胞研究 | 间质性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 类器官生成时间约40天，可维持超过180天 |
| 6982 | 2024-10-20 |
Perivascular cells induce microglial phagocytic states and synaptic engulfment via SPP1 in mouse models of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01257-z
PMID:36747024
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研究论文 | 研究探讨了在阿尔茨海默病模型中，周围血管细胞通过SPP1诱导小胶质细胞吞噬状态和突触吞噬的作用 | 首次揭示了SPP1在周围血管细胞与小胶质细胞间对话中的功能，调节小胶质细胞介导的突触吞噬 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨阿尔茨海默病中突触丢失的机制 | 小胶质细胞、周围血管细胞、突触 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 6983 | 2024-10-20 |
A guidebook of spatial transcriptomic technologies, data resources and analysis approaches
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.01.016
PMID:38213887
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review | 本文详细介绍了空间转录组技术的开发、数据资源和分析方法 | 本文整合了大量空间转录组数据，并介绍了多种计算方法来分析空间转录组数据，为研究人员提供了全面的指导 | NA | 帮助研究人员选择最适合其目标的空间转录组技术，并整合数据以促进数据的可访问性和可用性 | 空间转录组技术、数据资源和分析方法 | 基因组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 6984 | 2024-10-20 |
Role of mitochondria-bound HK2 in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1103231
PMID:37529037
|
研究论文 | 研究线粒体结合的HK2在类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞中的作用 | 首次提出线粒体结合的HK2是类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞表型的关键调控因子 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探讨线粒体结合的HK2在类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞中的作用及其潜在治疗策略 | 类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 6985 | 2024-10-20 |
Single cell RNA-sequencing profiling to improve the translation between human IBD and in vivo models
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1291990
PMID:38179052
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在炎症性肠病（IBD）及其体内模型中的应用，探讨了如何通过scRNA-seq提高临床转化 | 首次广泛应用scRNA-seq技术于IBD的临床前模型，揭示了免疫系统、基质细胞和上皮细胞之间的复杂相互作用 | NA | 探讨如何通过单细胞RNA测序提高炎症性肠病临床前模型的临床转化率 | 炎症性肠病（IBD）及其体内模型 | 基因组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6986 | 2024-10-20 |
Correlated gene modules uncovered by high-precision single-cell transcriptomics
2022-12-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2206938119
PMID:36508663
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研究论文 | 本文介绍了一种高精度单细胞转录组学方法，用于揭示基因表达的相关模块 | 提出了一种新的方法MALBAC-DT，通过测量单细胞中稳态基因表达波动的相关性，更准确地捕获相关基因模块 | NA | 通过高精度单细胞转录组学方法揭示基因表达的相关模块，提升对基因组功能的理解 | 单细胞基因表达相关性及其在功能和调控关系中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 同质细胞群体中的多个单细胞样本 |
| 6987 | 2024-10-19 |
The astrocyte-enriched gene deathstar plays a crucial role in the development, locomotion, and lifespan of D. melanogaster
2024-Dec, Fly
IF:2.4Q3
DOI:10.1080/19336934.2024.2368336
PMID:38884422
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研究论文 | 研究探讨了基因deathstar在果蝇发育、运动和寿命中的关键作用 | 通过单细胞RNA测序技术，首次发现并验证了基因deathstar在星形胶质细胞中的特异性表达及其对果蝇发育和生理功能的影响 | 研究主要集中在雄性果蝇上，对雌性果蝇的影响未进行深入探讨 | 揭示星形胶质细胞特异性基因在果蝇发育和生理功能中的作用 | 果蝇的星形胶质细胞及其特异性基因deathstar | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及果蝇的视觉叶和脑部的多个发育阶段 |
| 6988 | 2024-10-19 |
Revolutionizing prognostic predictions in colorectal cancer: Macrophage‑driven transcriptional insights from single‑cell RNA sequencing and gene co‑expression network analysis
2024-Dec, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2024.14721
PMID:39411205
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和基因共表达网络分析，揭示了结直肠癌中巨噬细胞驱动的转录组特征，并构建了一个新的预后模型 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和基因共表达网络分析，识别了与巨噬细胞相关的预后生物标志物，并构建了一个新的预后模型 | 研究结果需要进一步的前瞻性研究验证 | 提高结直肠癌免疫治疗的预后预测准确性 | 结直肠癌中的巨噬细胞及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解算法 | 基因表达数据 | 23个样本 |
| 6989 | 2024-10-19 |
Gamma-aminobutyric acid-mediated neuro-immune interactions in glioblastoma: Implications for prognosis and immunotherapy response
2024-Nov-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123067
PMID:39322177
|
研究论文 | 研究探讨了伽马氨基丁酸（GABA）在胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 引入了GABA相关评分模型（GABAAS），提供了新的预后指标，并揭示了GABA相关基因（如NDRG2和TIMP1）在免疫调节中的关键作用 | NA | 研究GABA在胶质母细胞瘤肿瘤免疫微环境中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤免疫微环境中的GABA及其相关基因 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、非负矩阵分解（NMF）、免疫组化（IHC）、免疫荧光（IF）、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6990 | 2024-10-19 |
High-Dimensional Overdispersed Generalized Factor Model With Application to Single-Cell Sequencing Data Analysis
2024-Nov-10, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.10213
PMID:39237124
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研究论文 | 本文提出了一种高维过度分散广义因子模型（OverGFM），用于处理高维非线性因子分析中的过度分散混合型数据 | 引入了一个额外的误差项来捕捉因子无法解释的过度分散，并提出了一种新的变分EM算法来解决计算挑战 | NA | 解决高维非线性因子模型在处理过度分散混合型数据时的不足 | 高维过度分散混合型数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 广义因子模型 | 混合型数据 | NA |
| 6991 | 2024-10-19 |
Integrated analysis of single-cell transcriptome and structural biology approach reveals the dynamics changes of NP subtypes and roles of Menaquinone in attenuating intervertebral disc degeneration
2024-Nov, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2023.2275172
PMID:37902557
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和结构生物学方法，揭示了椎间盘退变过程中NP亚型的动态变化及甲萘醌在缓解椎间盘退变中的作用 | 首次报道了甲萘醌在缓解退变性NP细胞中的重要作用，并结合scRNA-seq、bulk-RNA seq和HTVS技术系统解析了IDD过程中NP亚型的纵向变化 | NA | 研究椎间盘退变（IDD）过程中NP细胞的异质性及其动态变化，并探索潜在的治疗药物 | 椎间盘退变过程中的NP细胞亚型及甲萘醌的作用 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞测序分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、差异表达分析、高通量筛选（HTVS）、分子动力学模拟 | NA | 转录组数据 | 5种NP亚群 |
| 6992 | 2024-10-19 |
The opposite aging effect to single cell transcriptome profile among cell subsets
2024-Nov, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-024-10138-2
PMID:39261411
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研究论文 | 本研究探讨了不同细胞亚群中单细胞转录组谱的相反衰老效应 | 首次报告了衰老在不同细胞亚群中对基因表达的相反效应，并强调了在干预衰老相关基因时考虑细胞亚群的重要性 | NA | 研究衰老对不同细胞亚群基因表达的影响 | 小鼠的单细胞RNA测序数据 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Tabula Muris Senis数据集，包含大量小鼠的单细胞RNA测序数据 |
| 6993 | 2024-09-27 |
Spatial transcriptomics of acute kidney injury
2024-Nov, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-024-00899-x
PMID:39322738
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6994 | 2024-10-19 |
MAPbrain: a multi-omics atlas of the primate brain
2024-Oct-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae911
PMID:39420633
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研究论文 | 介绍了MAPbrain，一个整合了灵长类大脑多组学数据的图谱平台 | MAPbrain整合并标准化了实验室和公开的多组学数据，提供了一个独特的、强大的、交互式的平台，用于全面探索大脑发育 | NA | 理解基因如何影响大脑发育，解码人类认知功能的形成和神经疾病的潜在机制 | 灵长类大脑的多组学数据 | 生物信息学 | NA | 多组学技术 | NA | 转录组学、表观基因组学和空间转录组学数据 | 2100万大脑细胞，来自38个关键脑区和436个子区域，涵盖胚胎和成年阶段，164个时间点 |
| 6995 | 2024-10-19 |
scTWAS Atlas: an integrative knowledgebase of single-cell transcriptome-wide association studies
2024-Oct-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae931
PMID:39420631
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研究论文 | 介绍了scTWAS Atlas，一个整合单细胞转录组全关联研究的全面数据库 | 提出了scTWAS Atlas，整合了文献整理和数据分析，提供了交互式知识图谱和跨细胞类型分析功能 | NA | 解决传统TWAS结果中细胞类型异质性的解释难题，并提供一个整合scTWAS数据的平台 | 单细胞转录组全关联研究的数据和基因-性状关联 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组全关联研究 | NA | 基因表达数据 | 2,765,211个关联，涵盖34个性状，30种细胞类型，9种细胞条件和16,470个基因 |
| 6996 | 2024-10-19 |
Ccl5+ Macrophages drive pro-inflammatory responses and neutrophil recruitment in sepsis-associated acute kidney injury
2024-Oct-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113339
PMID:39418726
|
研究论文 | 研究探讨了Ccl5+巨噬细胞在脓毒症相关急性肾损伤中的促炎反应和嗜中性粒细胞招募的作用 | 首次揭示了Ccl5+巨噬细胞在脓毒症中的促炎作用及其通过CCL5-CCR1配体受体对招募嗜中性粒细胞的影响 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 深入了解脓毒症相关急性肾损伤的分子机制 | Ccl5+巨噬细胞在脓毒症中的作用 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 小鼠模型 |
| 6997 | 2024-10-19 |
Putting proteins in context
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.009
PMID:39418999
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研究论文 | 本文介绍了一种通过几何深度学习方法生成蛋白质上下文表示的新技术 | 引入了PINNACLE方法，通过结合蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组学分析，生成蛋白质的上下文表示 | NA | 解决现有蛋白质表示方法缺乏生物学和环境上下文的问题 | 蛋白质的细胞类型特异性功能和相互作用 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | NA | 蛋白质相互作用数据和单细胞转录组学数据 | NA |
| 6998 | 2024-10-19 |
Cancer-Associated Fibroblasts Expressing Sulfatase 1 Facilitate VEGFA-Dependent Microenvironmental Remodeling to Support Colorectal Cancer
2024-Oct-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3987
PMID:39250301
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研究论文 | 研究揭示了表达硫酸酯酶1（SULF1）的癌症相关成纤维细胞（CAF）在结直肠癌中的促肿瘤作用 | 首次发现SULF1+ CAF通过增强VEGFA的释放促进结直肠癌的微环境重塑和肿瘤进展 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要进一步的人体临床验证 | 探讨癌症相关成纤维细胞在结直肠癌中的分子机制及其治疗潜力 | 结直肠癌患者和表达SULF1的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及结直肠癌患者的单细胞测序数据和小鼠模型 |
| 6999 | 2024-10-19 |
YAP1 Status Defines Two Intrinsic Subtypes of LCNEC with Distinct Molecular Features and Therapeutic Vulnerabilities
2024-Oct-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0361
PMID:39150543
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研究论文 | 研究探讨了YAP1状态在大细胞神经内分泌癌（LCNEC）中的作用，定义了两种内在亚型，并分析了其分子特征和治疗脆弱性 | 首次通过YAP1状态区分LCNEC的两种亚型，并揭示了其独特的分子特征和治疗策略 | NA | 研究LCNEC的生物学特性，并探索基于YAP1状态的个性化治疗策略 | 大细胞神经内分泌癌（LCNEC）及其亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组化（IHC）和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自LCNEC患者的核心针活检样本和临床前模型 |
| 7000 | 2024-10-19 |
TGF-β-mediated crosstalk between TIGIT+ Tregs and CD226+CD8+ T cells in the progression and remission of type 1 diabetes
2024-Oct-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53264-8
PMID:39406740
|
研究论文 | 研究探讨了TGF-β介导的TIGIT+ Tregs与CD226+CD8+ T细胞在1型糖尿病进展和缓解中的相互作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了不同1型糖尿病阶段免疫细胞的动态变化，并发现TIGITCCR7 Tregs和CD226CCR7CD8细胞毒性T细胞在疾病进展和缓解中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体临床验证 | 探讨1型糖尿病进展和缓解过程中免疫细胞的相互作用及其潜在的治疗靶点 | TIGIT+ Tregs和CD226+CD8+ T细胞 | 免疫学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA | 涉及不同1型糖尿病阶段的多个患者样本 |