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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2026-05-15 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Intrahepatic Cholangiocarcinoma: Insights into Origins, Heterogeneity, Lymphangiogenesis, and Peritoneal Metastasis
2025-03, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.07.009
PMID:39117110
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综述 | 系统总结了肝内胆管癌中癌症相关成纤维细胞的起源、异质性、淋巴管生成和腹膜转移机制 | 整合了最新的细胞谱系追踪、单细胞RNA测序和生物标志物分析成果,揭示了CAFs的多亚型复杂性及其潜在的抑癌与促转移双重作用 | 未涉及CAFs在免疫治疗中的具体作用机制及临床转化策略的详细讨论 | 评估肝内胆管癌中CAFs的起源、表型和功能复杂性,并阐明其在淋巴管生成和腹膜转移中的作用 | 肝内胆管癌中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序,细胞谱系追踪 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 682 | 2026-05-15 |
Transcriptional regulatory network analysis identifies GRN as a key regulator bridging chemotherapy and immunotherapy response in small cell lung cancer
2025-02-05, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-025-01667-5
PMID:39910394
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研究论文 | 通过构建转录调控网络,确定GRN为连接小细胞肺癌化疗和免疫治疗反应的关键调节因子 | 首次揭示GRN作为小细胞肺癌化疗和免疫治疗反应之间的桥梁调控因子,并提出基于GRN表达水平的患者分层策略 | 未明确提及局限性,但缺乏对GRN调控机制的深入验证,且样本量信息未在摘要中提供 | 探究小细胞肺癌对EP化疗和免疫治疗产生耐药的分子机制,并识别潜在的生物标志物 | 小细胞肺癌细胞系和肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 683 | 2026-05-15 |
Single-cell landscape of dynamic changes in CD8+ T cells, CD4+ T cells and exhausted T cells in hepatocellular carcinoma
2025-02-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88377-7
PMID:39900964
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研究论文 | 利用单细胞测序数据研究肝细胞癌中CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和耗竭T细胞的动态变化景观及T细胞相关基因的预后价值 | 通过hdWGCNA算法识别与CD4 T细胞、CD8 T细胞和耗竭T细胞相关的基因模块,并利用AUCell算法揭示耗竭T细胞中信号通路活性的变化,构建基于七基因的预后模型 | 未提及具体的局限性,但样本量仅为12例肝细胞癌单细胞测序病例 | 探究T细胞相关基因在肝细胞癌预后中的价值 | 肝细胞癌患者的CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和耗竭T细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、hdWGCNA、AUCell、免疫组化、实时PCR | NA | 单细胞转录组数据 | 12例肝细胞癌单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 684 | 2026-05-15 |
Exploring biomarkers and molecular mechanisms of Type 2 diabetes mellitus promotes colorectal cancer progression based on transcriptomics
2025-02-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88520-4
PMID:39901036
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研究论文 | 基于转录组学探索2型糖尿病促进结直肠癌进展的生物标志物和分子机制 | 首次通过转录组学分析揭示O-连接糖基化在T2DM促进CRC进展中的关键作用,并构建了T2DM-CRC共病的诊断模型,鉴定COX11为潜在的免疫相关分子标志物 | NA | 探索2型糖尿病促进结直肠癌进展的潜在生物标志物和分子机制 | 结直肠癌患者肿瘤组织,伴或不伴2型糖尿病 | NA | 2型糖尿病,结直肠癌 | 转录组学,单细胞转录组分析,分子对接 | 逻辑回归,Lasso正则化 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 685 | 2026-05-15 |
Tertiary Lymphoid Structure in Dental Pulp: The Role in Combating Bacterial Infections
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406684
PMID:39465672
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色揭示了人类牙髓中三级淋巴结构(TLS)在对抗细菌感染中的作用 | 首次在牙髓中发现三级淋巴结构,并鉴定出CCL3可能为TLS形成的关键驱动因子 | TLS在免疫反应中的具体角色及其形成调控分子仍不完全确定 | 研究牙髓中三级淋巴结构在抗细菌感染免疫反应中的形成和功能 | 健康和发炎的人类牙髓组织以及小鼠牙髓炎模型 | 数字病理学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类牙髓组织(健康与发炎)和小鼠牙髓炎模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于人类牙髓样本的单细胞分析 |
| 686 | 2026-05-15 |
Targeting SLITRK4 Restrains Proliferation and Liver Metastasis in Colorectal Cancer via Regulating PI3K/AKT/NFκB Pathway and Tumor-Associated Macrophage
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400367
PMID:39499724
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研究论文 | 该研究通过分析结直肠癌患者原发癌旁组织、肿瘤和肝转移灶的转录组,发现SLITRK4是肝转移中上调最显著的基因,并通过体外和体内实验证实其促进肿瘤发生、侵袭、迁移和血管生成,抑制SLITRK4可抑制肿瘤生长和肝转移,机制涉及PI3K/AKT/NFκB通路激活及肿瘤相关巨噬细胞浸润和极化 | 首次发现SLITRK4在结直肠癌肝转移中高表达并通过调控PI3K/AKT/NFκB通路和肿瘤相关巨噬细胞促进转移,并利用脂质聚合物杂化纳米颗粒递送siRNA实现靶向治疗 | 未提及具体局限性 | 探索结直肠癌肝转移的新型驱动因子SLITRK4的功能及潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者原发癌旁组织、肿瘤组织和肝转移组织,以及体外细胞模型和体内小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 人类患者组织样本(原发癌旁、肿瘤和肝转移)和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 687 | 2026-05-15 |
Identifying Multiomic Signatures of X-Linked Retinoschisis-Derived Retinal Organoids and Mice Harboring Patient-Specific Mutation Using Spatiotemporal Single-Cell Transcriptomics
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405818
PMID:39503290
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研究论文 | 本研究采用多组学方法,结合单细胞RNA测序和时空转录组学,识别由患者特异性突变引起的X连锁视网膜劈裂症衍生视网膜类器官和小鼠的多组学特征 | 首次利用多模态方法(高吞吐量单细胞RNA测序和时空转录组学)在两种XLRS样模型(基因工程小鼠和患者衍生视网膜类器官)中全面解析疾病特异性转录组特征,并发现慢性内质网应激/eIF2信号通路作为保守疾病通路,为治疗提供新靶点 | 未明确说明研究局限性 | 阐明X连锁视网膜劈裂症(XLRS)的转录组特征和病理机制,探索潜在治疗靶点 | 携带患者特异性p.R209C突变的基因工程Rs1小鼠和患者衍生视网膜类器官 | 数字病理学 | X连锁视网膜劈裂症 | 单细胞RNA测序, 时空转录组学, 蛋白质组学, Western印迹 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 基因工程Rs1小鼠和患者衍生视网膜类器官(具体数量未提供) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学 |
| 688 | 2026-05-15 |
PD-1+CD8+ T Cell-Mediated Hepatocyte Pyroptosis Promotes Progression of Murine Autoimmune Liver Disease
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407284
PMID:39494472
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和体外实验,揭示了PD-1+CD8+ T细胞通过颗粒酶B和穿孔素-1诱导肝细胞焦亡,促进自身免疫性肝病进展的机制 | 首次发现PD-1+CD8+ T细胞亚群在自身免疫性肝病中通过GSDMD介导的焦亡途径发挥致病作用,并证明CAR-T细胞清除该细胞群可缓解疾病 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类疾病的转化需要进一步验证;焦亡通路的详细分子机制尚未完全阐明 | 阐明自身免疫性肝病中效应通路的特异性机制,寻找潜在治疗靶点 | dnTGFβRII Aire小鼠模型中的肝脏自身反应性CD8 T细胞及肝细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性肝病 | NGS, 单细胞测序, 体外分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 689 | 2026-05-15 |
Landscape of the Peripheral Immune Response Induced by Intraoperative Radiotherapy Combined with Surgery in Early Breast Cancer Patients
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308174
PMID:39494578
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序,分析早期乳腺癌患者术中放疗联合手术后的外周免疫反应 | 首次全面分析术中放疗联合手术诱导的外周免疫反应,揭示了CD8Teff_GZMK细胞毒性增加、MIF信号通路变化及T细胞克隆扩增等新发现 | 研究样本量较小,且仅关注早期乳腺癌患者,缺乏长期随访数据 | 探究术中放疗联合手术对早期乳腺癌患者外周免疫细胞的影响 | 早期乳腺癌患者的外周血单个核细胞 | 自然语言处理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 流式细胞术, 共培养实验 | NA | 基因表达数据 | 早期乳腺癌患者的外周血样本,具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 |
| 690 | 2026-05-15 |
CosGeneGate selects multi-functional and credible biomarkers for single-cell analysis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae626
PMID:39592241
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研究论文 | 提出CosGeneGate模型,用于单细胞分析中选择多功能且可信的生物标志物 | 结合细胞类型分类准确性和标志基因特异性表达模式的优点,选择非冗余且具有细胞类型特异性表达模式的标志基因 | 未明确说明局限性 | 开发更有效的标志基因选择方法,以改善单细胞测序分析中的细胞类型区分 | 人类主要细胞类型和组织 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | CosGeneGate | 基因表达数据 | 使用公开数据集和新测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 691 | 2026-05-15 |
The Impact of Low Protein Diet on the Molecular and Cellular Development of the Fetal Kidney
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.04.569988
PMID:38106143
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研究论文 | 利用先进成像和单细胞RNA测序技术,探究低蛋白饮食对胎儿肾脏分子和细胞发育的影响 | 首次结合断层成像、共聚焦成像和单细胞RNA测序,全面揭示母体低蛋白饮食导致肾单位数量减少的细胞和分子机制 | 研究中提到低蛋白饮食对代谢、细胞周期、表观遗传调控和信号传导具有多效性影响,但未明确这些变化的因果关系或长期后果 | 阐明母体低蛋白饮食如何通过改变细胞和分子过程影响胎儿肾脏发育中的肾单位形成 | 小鼠胚胎肾脏样本(E14.5和P0阶段) | 机器学习,数字病理学 | 慢性肾脏病,高血压 | 单细胞RNA测序,光学投影断层成像,共聚焦成像 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠胚胎肾脏样本(E14.5和P0阶段),具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 692 | 2026-05-15 |
Autoimmune uveitis attenuated in diabetic mice through imbalance of Th1/Th17 differentiation via suppression of AP-1 signaling pathway in Th cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1347018
PMID:38887289
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研究论文 | 本研究利用小鼠模型探讨糖尿病对自身免疫性葡萄膜炎发展的影响及其免疫机制 | 首次揭示糖尿病通过抑制Th细胞中的AP-1信号通路,导致Th1/Th17分化失衡,从而减轻自身免疫性葡萄膜炎 | 研究基于小鼠模型,未在人体中验证;具体分子机制尚需进一步探索 | 探究糖尿病状态对器官特异性自身免疫性疾病(如葡萄膜炎)的影响 | 野生型C57BL/6小鼠和自发糖尿病Ins2Akita小鼠 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎,糖尿病 | 单细胞RNA测序,免疫组化,流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型,具体数量未明确,涉及WT和Akita两组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 693 | 2026-05-15 |
Genome-wide mapping of cancer dependency genes and genetic modifiers of chemotherapy in high-risk hepatoblastoma
2023-07-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39717-6
PMID:37414763
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研究论文 | 通过改进的MYC驱动肝母细胞瘤小鼠模型结合CRISPR-Cas9筛选,绘制了癌症依赖基因图谱并鉴定化疗遗传修饰因子 | 首次在肝母细胞瘤中整合单细胞转录组、空间转录组及CRISPR全基因组筛选,发现与高风险人类疾病相关的可药物化靶点(如CDK7、CDK9、PRMT1、PRMT5)及化疗增敏调控因子PRKDC | 未提及具体局限性(标题与摘要未提供) | 构建肝母细胞瘤的遗传模型并系统鉴定治疗靶点及化疗反应修饰因子 | 高风险的胚胎型肝母细胞瘤 | 机器学习 | 肝母细胞瘤 | CRISPR-Cas9筛选,单细胞RNA测序,空间转录组学,转录组测序 | NA | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 小鼠模型及衍生细胞系(具体数量未提) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium |
| 694 | 2026-05-15 |
The current state and future of T-cell exhaustion research
2023, Oxford open immunology
DOI:10.1093/oxfimm/iqad006
PMID:37554723
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综述 | 本文回顾了T细胞耗竭的研究现状,讨论了其分子定义不一致的问题,并提出了通过系统遗传学方法(如单细胞RNA-seq和CRISPR筛选)达成共识的进展,同时强调了体外生成耗竭T细胞的研究重要性 | 提出了用一组基于代谢、表观遗传、转录和激活的表型标志物(称为M.E.T.A)来统一定义T细胞耗竭,旨在解决不同研究语境下耗竭定义不一致的问题 | 由于在体内环境中进行操作困难,理解耗竭如何发生仍具挑战性 | 探讨T细胞耗竭的当前知识、研究方法及未来方向,推动统一定义和标准化分析 | T细胞,特别是耗竭T细胞 | 机器学习 | 慢性病毒感染,癌症 | 单细胞RNA-seq,CRISPR筛选 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 695 | 2026-05-15 |
Molecular and anatomical characterization of parabrachial neurons and their axonal projections
2022-11-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81868
PMID:36317965
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研究论文 | 对臂旁核神经元及其轴突投射进行分子和解剖学特征描述 | 通过单细胞RNA测序鉴定出臂旁核及其邻近区域的21个神经元亚群,并利用多重原位杂交和21种Cre驱动小鼠品系提供了详细的分子身份、空间位置和投射模式 | 未明确讨论研究局限性 | 揭示臂旁核神经元亚群的分子特征、空间分布和轴突投射模式 | 臂旁核及其邻近区域的神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,多重原位杂交 | NA | 基因表达数据,图像 | 21种Cre驱动小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 696 | 2026-05-12 |
Single-cell transcriptomics reveals EpCAM regulates the development and morphology of intestinal epithelium via controlling the EGFR pathway
2026-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2026.102072
PMID:42110227
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 697 | 2026-05-12 |
Multi-omics Mendelian randomization combined with single-cell and spatial transcriptomics: Multidimensional validation of drug targets for osteoarthritis
2026-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101864
PMID:42110225
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 698 | 2026-05-12 |
The applications of single-cell and spatial transcriptomics in neuroscience and brain disorders
2026-Jul, Neuroscience and biobehavioral reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.neubiorev.2026.106721
PMID:42069165
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学在神经科学和脑疾病中的应用进展 | 系统总结了空间转录组学平台的最新进展,并探讨了其在神经科学中的关键应用,包括脑细胞类型识别、结构-功能关系以及神经精神疾病的基因表达模式 | 未详细讨论空间转录组学在临床转化中的具体挑战,如成本和技术复杂性 | 总结空间转录组学平台及其在神经科学和脑疾病研究中的应用,并为未来研究提供基础 | 脑细胞类型、神经发育过程、阿尔茨海默病和抑郁症等精神及神经退行性疾病 | 数字病理学 | 神经退行性疾病, 精神疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 699 | 2026-05-12 |
Pulsed photobiomodulation reprograms the tumor immune microenvironment to restore local T cell-mediated antitumor immunity
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115788
PMID:42109854
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研究论文 | 研究980纳米脉冲光生物调节(PBM)通过重编程肿瘤免疫微环境,恢复局部T细胞介导的抗肿瘤免疫 | 首次发现脉冲光生物调节可直接逆转CD8 T细胞耗竭并增强其细胞毒性功能,且免疫调节效应局限于照射部位,不依赖调节性T细胞 | 对色素性B16黑色素瘤无效,可能由于黑色素介导的光吸收;仅在早期肿瘤模型中验证,长期效果和联合治疗潜力需进一步研究 | 开发精准调控肿瘤免疫微环境的局部光免疫调节策略 | 同基因LLC和MC38肿瘤模型小鼠 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 未明确具体数量,涉及小鼠肿瘤模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 700 | 2026-05-12 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and intercellular communication of endothelial cells and Schwann cells during keloid formation
2026-Jun, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2026.107973
PMID:41864161
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示瘢痕疙瘩形成过程中内皮细胞和雪旺细胞的异质性与细胞间通讯 | 首次发现瘢痕疙瘩中内皮细胞亚群具有皮肤恶性肿瘤内皮细胞的转录特征并表现出强迁移潜力,并鉴定PLPP3为该亚群内皮管形成的关键调控因子 | 样本量较小(仅6个样本),未进行功能验证实验,依赖公开数据集 | 探究瘢痕疙瘩形成过程中细胞异质性和细胞间信号调控机制 | 瘢痕疙瘩组织和正常瘢痕组织 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6个样本(3个瘢痕疙瘩组织,3个正常瘢痕组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |