单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28588 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-06-01 |
Bioinformatics identification of shared signaling pathways and core targets linking Benzo[a]pyrene exposure to HCC progression
2025-06, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2025.154129
PMID:40174762
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探索苯并[a]芘(BaP)在肝癌进展中的潜在分子机制 | 首次通过综合数据库分析和分子对接技术，识别了BaP与肝癌相关的核心靶点及其作用通路 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索环境污染物BaP在肝癌进展中的分子机制 | 苯并[a]芘(BaP)与肝癌的关联机制 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析、分子对接 | NA | 基因组数据、蛋白质互作数据 | 从多个数据库获取的数据，具体样本量未明确说明 |
| 682 | 2025-06-01 |
NOTCH1 Mutation and Survival Analysis of Tislelizumab in Advanced or Metastatic Esophageal Squamous Cell Carcinoma: A Biomarker Analysis From the Randomized, Phase III, RATIONALE-302 Trial
2025-Jun, Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology
IF:42.1Q1
DOI:10.1200/JCO-24-01818
PMID:40179324
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research paper | 该研究通过基因组分析和转录组测序，发现NOTCH1突变可作为预测食管鳞状细胞癌患者使用tislelizumab治疗长期生存的潜在生物标志物 | 首次将NOTCH1突变与tislelizumab治疗的生存益处相关联，并通过单细胞RNA测序揭示了Notch1缺陷如何增强肿瘤微环境的免疫激活 | 研究样本来自特定的临床试验（RATIONALE-302），可能限制了结果的普遍适用性 | 探索和验证能够预测食管鳞状细胞癌患者对PD-1靶向治疗反应的生物标志物 | 晚期或转移性食管鳞状细胞癌患者 | digital pathology | esophageal squamous cell carcinoma | 基因组分析、转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | genomic and transcriptomic data | RATIONALE-302研究中的样本 |
| 683 | 2025-06-01 |
Alterations in genomic features and the tumour immune microenvironment predict immunotherapy outcomes in advanced biliary tract cancer patients
2025-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03011-7
PMID:40211026
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研究论文 | 本研究构建了一个多维策略，用于预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后 | 通过整合基因组特征、肿瘤免疫微环境和单细胞转录组数据，开发了一个新的预测模型（EM-CXCL10），其预测性能优于传统的肿瘤突变负荷（TMB）和突变评分 | 样本量较小（60例患者），且仅部分患者接受了基因测序和细胞因子检测 | 预测晚期胆道癌患者对免疫治疗的反应 | 晚期胆道癌患者 | 肿瘤免疫学 | 胆道癌 | 520基因面板测序、多重循环细胞因子检测、单细胞转录组测序 | LASSO算法、Cox回归模型 | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | 60例晚期胆道癌患者（30例基因测序，50例细胞因子检测） |
| 684 | 2025-06-01 |
Alternative splicing in autism spectrum disorder: Recent insights from mechanisms to therapy
2025-Jun, Asian journal of psychiatry
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.ajp.2025.104501
PMID:40273800
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review | 本文综述了自闭症谱系障碍(ASD)中可变剪接(AS)的最新研究进展，从机制到治疗 | 强调了异常剪接事件及其调节因子在ASD发病机制中的作用，并探讨了新兴技术在AS研究中的应用 | NA | 理解ASD中异常剪接的机制及其功能后果，以揭示该疾病的分子基础并促进治疗策略的开发 | 自闭症谱系障碍(ASD)中的可变剪接(AS)机制 | 自然语言处理 | 自闭症谱系障碍 | 长读长测序、单细胞测序、空间转录组学和CRISPR-Cas系统 | NA | RNA数据 | NA |
| 685 | 2025-06-01 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal unique subpopulations of infiltrating macrophages and dendritic cells following AKI
2025-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00059.2025
PMID:40331777
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了急性肾损伤后浸润的巨噬细胞和树突状细胞的独特亚群 | 结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术，首次全面描述了急性肾损伤后肾脏浸润巨噬细胞和树突状细胞的时空及转录特征 | 研究仅关注了缺血再灌注损伤模型，未涉及其他类型的肾损伤 | 阐明急性肾损伤后肾脏浸润免疫细胞的动态变化特征 | 肾脏浸润巨噬细胞(KIMs)和肾脏树突状细胞(KDCs) | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | scRNAseq, 空间转录组学, CITE测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA |
| 686 | 2025-06-01 |
Identification and regulation of EMT cells in vivo by laser stimulation
2025-Jun, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0268350
PMID:40438388
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research paper | 本研究通过激光刺激方法探究PLCG2在上皮-间质转化(EMT)细胞中的作用及其调控机制 | 首次使用飞秒激光扫描光刺激方法激活细胞内钙信号并诱导PLCG2上调，揭示了PLCG2在EMT调控中的直接作用 | PLCG2抑制剂对转移性细胞无显著影响，其作用机制仍需进一步研究 | 探究PLCG2在上皮-间质转化(EMT)和肿瘤发展中的调控作用 | 前列腺癌PC3细胞及皮下肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 前列腺癌 | 飞秒激光扫描光刺激、单细胞RNA测序 | 皮下肿瘤模型 | 基因表达数据 | NA |
| 687 | 2025-06-01 |
Unravelling heart failure cellular signalling heterogeneity with spatial transcriptomics
2025-May-30, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf311
PMID:40444774
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 688 | 2025-06-01 |
DiSC: a Statistical Tool for Fast Differential Expression Analysis of Individual-level Single-cell RNA-seq Data
2025-May-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf327
PMID:40444783
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研究论文 | 介绍了一种名为DiSC的统计工具，用于快速分析个体水平单细胞RNA测序数据的差异表达 | DiSC通过提取多个分布特征并联合测试它们与感兴趣变量的关联，使用灵活的置换测试框架控制假发现率，具有高统计功效和计算效率 | 虽然DiSC是为scRNA-seq数据开发的，但其稳健的测试框架也可应用于其他类型的单细胞数据 | 开发一种高效且统计功效强大的方法，用于分析个体水平单细胞RNA测序数据的差异表达 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | COVID-19, 阿尔茨海默病 | scRNA-seq, 流式细胞术 | 统计模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 689 | 2025-06-01 |
An Arabidopsis single-nucleus atlas decodes leaf senescence and nutrient allocation
2025-May-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.024
PMID:40220755
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research paper | 该研究通过单核RNA测序技术构建了拟南芥的单核转录组图谱，揭示了叶片衰老和养分分配的细胞类型特异性协调机制 | 首次构建了拟南芥跨20个组织的百万级单核转录组图谱，开发了单细胞分辨率叶片衰老量化指标，系统性解析了碳氮分配模式 | 研究主要基于拟南芥模型，结论在其它植物中的普适性有待验证 | 解析植物叶片衰老和养分分配的细胞类型特异性调控机制 | 拟南芥20个组织的1,000,000+细胞核 | 植物分子生物学 | NA | scRNA-seq（单细胞RNA测序）, 加权基因共表达网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过100万个细胞核，覆盖20个组织多个发育阶段 |
| 690 | 2025-06-01 |
Targeting SPP1+ macrophages via the SPP1-CD44 axis reveals a key mechanism of immune suppression and tumor progression in ovarian cancer
2025-May-29, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114906
PMID:40446696
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研究论文 | 该研究通过整合分析卵巢癌单细胞测序数据，揭示了SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴驱动免疫抑制和T细胞耗竭的关键机制 | 首次发现SPP1+巨噬细胞亚群通过SPP1-CD44轴促进T细胞耗竭，并证实阻断该轴可恢复CD8 T细胞功能，同时鉴定尼洛替尼作为潜在SPP1抑制剂 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，需要更多体内实验验证临床转化潜力 | 探究卵巢癌肿瘤微环境中TAMs介导免疫抑制的分子机制 | 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 单细胞测序数据 | 6个HGSOC单细胞测序数据集 |
| 691 | 2025-06-01 |
Unraveling the mechanisms of irAEs in endometrial cancer immunotherapy: insights from FAERS and scRNA-seq data
2025-May-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02723-3
PMID:40436981
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研究论文 | 本研究整合FAERS数据库和单细胞转录组数据，探讨子宫内膜癌免疫治疗中PD-1抑制剂相关不良事件的潜在机制 | 首次整合FAERS数据库与单细胞转录组数据，揭示PD-1抑制剂可能通过CXCR4和CXCR6通路的代偿性激活导致免疫相关不良事件 | 需要进一步的临床研究和机制研究验证这些发现 | 优化子宫内膜癌免疫治疗策略并减轻不良事件 | 子宫内膜癌患者及免疫检查点抑制剂相关不良事件 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | scRNA-seq, FAERS数据库分析 | Weibull建模 | 单细胞转录组数据, 药物不良事件报告数据 | FAERS数据库中2,202例免疫检查点抑制剂相关报告及单细胞分析数据 |
| 692 | 2025-06-01 |
Deciphering the cellular and molecular landscape of cervical cancer progression through single-cell and spatial transcriptomics
2025-May-28, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00948-z
PMID:40437003
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，全面描述了宫颈癌发展过程中肿瘤微环境的细胞和分子特征 | 首次整合scRNA-seq和stRNA-seq技术，揭示了SPP1+巨噬细胞在宫颈癌进展中的关键作用及其通过SPP1-CD44信号轴与免疫细胞的相互作用 | 样本量可能有限，且未涉及治疗干预后的动态变化 | 解析宫颈癌从HPV感染到恶性肿瘤进展过程中的细胞和分子机制 | 正常宫颈组织、HPV感染的正常宫颈组织、高级别鳞状上皮内病变(HSIL)和浸润性宫颈癌样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | scRNA-seq, stRNA-seq | NA | 转录组数据 | 包含正常、HPV感染、HSIL和浸润性癌的多阶段样本(具体数量未明确说明) |
| 693 | 2025-06-01 |
Natural killer cells adopt an activated and decidual-like phenotype after autologous hematopoietic stem cell transplantation in children with cancer
2025-May-28, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-00911-w
PMID:40437214
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研究论文 | 研究儿童癌症患者自体造血干细胞移植后自然杀伤细胞的活化和蜕膜样表型变化 | 首次描述了儿童患者自体造血干细胞移植后自然杀伤细胞出现的短暂蜕膜样表型及其与细胞因子和临床结果的关系 | 样本量较小（13名儿童患者），且使用了成人健康供体的数据进行对比 | 了解自体造血干细胞移植后免疫系统重建过程中自然杀伤细胞的动态功能 | 儿童癌症患者（3-11岁）和成人健康供体（25-62岁）的自然杀伤细胞 | 免疫学 | 癌症 | 多参数流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据、RNA测序数据、血浆细胞因子数据 | 13名儿童患者（男8，女5）和8名成人健康供体（男5，女3） |
| 694 | 2025-06-01 |
ITIH4 attenuates acute lung injury by Fe-containing particulate matter in mice via Hippo pathway in type II alveolar epithelial cells
2025-May-28, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03256-z
PMID:40437524
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research paper | 本研究探讨了重组ITIH4（rITIH4）对暴露于含铁颗粒物（PM）的小鼠急性肺损伤的保护作用及其通过Hippo通路的机制 | 首次揭示了ITIH4通过调节AECII中的Hippo通路减轻含铁颗粒物引起的急性肺损伤 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探究ITIH4对含铁颗粒物引起的急性肺损伤的保护作用及机制 | C57BL/6JNarl和B6.Sftpc-CreERT2;Ai14(RCL-tdT)-D小鼠 | 呼吸病学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序、电感耦合等离子体质谱（ICP-MS） | 小鼠急性肺损伤模型 | 基因表达数据、蛋白质水平数据、细胞计数数据 | 未明确说明具体数量的小鼠样本 |
| 695 | 2025-06-01 |
AAV-mediated silencing of Sox4 leads to long-term amelioration of liver phenotypes in mouse models of Alagille syndrome
2025-May-28, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.04.033
PMID:40446945
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research paper | 该研究通过AAV介导的Sox4沉默，在小鼠模型中长期改善Alagille综合征的肝脏表型 | 首次证明AAV介导的Sox4沉默可作为Alagille综合征肝病的潜在治疗方法 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 寻找增强胆道发育的治疗靶点，以解决Alagille综合征等胆管缺乏疾病的未满足需求 | Alagille综合征小鼠模型及人类肝脏组织 | 基因治疗 | Alagille综合征 | AAV8载体介导的基因沉默、scRNA-Seq、RNAscope | 小鼠模型 | 基因表达数据、组织学数据 | 小鼠模型及人类肝脏组织样本 |
| 696 | 2025-06-01 |
Tolerance and heteroresistance to echinocandins in Candida auris: conceptual issues, clinical implications, and outstanding questions
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00161-25
PMID:40237528
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research paper | 本文探讨了耳念珠菌对棘白菌素的耐受性和异质性耐药性，及其对治疗的挑战和临床意义 | 提出了耳念珠菌对棘白菌素的耐受性和异质性耐药性的概念，并探讨了这些现象对治疗和临床结果的影响 | 这些机制的临床意义尚不明确，且缺乏与治疗失败相关的数据 | 理解耳念珠菌对棘白菌素的耐受性和异质性耐药性的机制及其影响，开发检测方法和缓解策略 | 耳念珠菌 | 微生物学 | 真菌感染 | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 697 | 2025-06-01 |
Chaperonin containing TCP1 subunit 5 as a novel pan-cancer prognostic biomarker for tumor stemness and immunotherapy response: insights from multi-omics data, integrated machine learning, and experimental validation
2025-May-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04071-7
PMID:40423850
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研究论文 | 本研究通过多组学数据和机器学习方法，揭示了CCT5在泛癌中的预后价值和免疫治疗反应预测作用 | 首次全面评估CCT5在33种癌症类型中的表达模式，并开发了基于CCT5的免疫治疗反应预测模型CCT5.Sig | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分相对有限 | 探究CCT5在泛癌进展中的作用及其作为免疫治疗反应预测标志物的潜力 | 33种癌症类型的肿瘤组织和1394例接受免疫检查点阻断治疗的患者样本 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 多组学分析（包括bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学）和机器学习 | 机器学习模型（具体算法未明确说明） | 多组学数据（转录组、单细胞转录组、空间转录组） | 33种癌症类型的肿瘤组织和1394例免疫治疗患者样本 |
| 698 | 2025-06-01 |
Comparative analysis of the syncytiotrophoblast in placenta tissue and trophoblast organoids using snRNA sequencing
2025-May-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.101170
PMID:40424181
|
研究论文 | 通过单核和单细胞RNA测序比较分析胎盘组织和滋养层类器官中的合体滋养层细胞 | 首次使用单核RNA测序技术捕获合体滋养层细胞群体，并揭示了三种核亚型，同时鉴定了类器官培养条件下合体滋养层细胞的不同表达模式 | 研究未涉及RYBP敲除对胎盘发育其他方面的影响 | 探究合体滋养层细胞的分化和核异质性 | 胎盘组织和滋养层类器官中的合体滋养层细胞 | 单细胞组学 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量，涉及早孕期、足月胎盘组织及两种培养条件下的滋养层类器官 |
| 699 | 2025-06-01 |
Single cell RNA sequencing reveals the role of local renin-angiotensin system in regulating ovarian physiological cycle and promoting PCOS
2025-May-27, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02531-8
PMID:40425574
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了卵巢局部肾素-血管紧张素系统（RAS）在调节卵巢生理周期及促进多囊卵巢综合征（PCOS）中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了卵巢局部RAS在发情周期中的动态变化，并提供了AngII与IRS1/PI3K/AKT通路交互作用导致胰岛素抵抗（IR）可能是PCOS潜在机制的初步证据 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究卵巢局部RAS在生理周期调节及PCOS发病机制中的作用 | 小鼠卵巢细胞 | 单细胞组学 | 多囊卵巢综合征（PCOS） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | PCOS小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量，但涉及小鼠卵巢多个细胞簇 |
| 700 | 2025-06-01 |
Deep exploration of logical models of cell differentiation in human preimplantation embryos
2025-May-27, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00537-7
PMID:40425601
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研究论文 | 该研究开发了一个名为SCIBORG的计算工具包，通过整合单细胞转录组数据和先验知识网络，推断基因调控的布尔网络，以探索人类胚胎植入前细胞分化的逻辑模型 | 开发了SCIBORG工具包，利用逻辑编程处理单细胞数据的高维搜索空间，并学习两个不同发育阶段的布尔网络家族，揭示了滋养外胚层成熟的关键基因 | 缺乏某些生物系统的可行扰动数据，限制了动态模型的验证或生成 | 探索人类胚胎植入前细胞分化的逻辑模型，特别是滋养外胚层的成熟过程 | 人类胚胎滋养外胚层（TE）及其成熟过程 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | 布尔网络（BN） | 单细胞转录组数据 | NA |