单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-10-05 |
Nonalcoholic Fatty Liver Disease Exacerbates the Advancement of Renal Fibrosis by Modulating Renal CCR2+PIRB+ Macrophages Through the ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP Axis
2025-Sep-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509351
PMID:40995682
|
研究论文 | 本研究揭示了非酒精性脂肪肝病通过ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP轴调控肾脏CCR2+PIRB+巨噬细胞加剧肾纤维化的机制 | 首次发现NAFLD通过肝脏分泌的ANGPTL8激活肾脏特异性CCR2+PIRB+巨噬细胞，通过破坏亚油酸代谢促进肾纤维化的肝-肾轴信号通路 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探讨NAFLD在肾纤维化进展中的具体作用和分子机制 | 小鼠模型、原代肾巨噬细胞、共培养模型 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学, 流式细胞术, 免疫荧光 | 动物模型, 细胞培养模型 | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 流式数据, 图像数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 682 | 2025-10-05 |
Single-Cell Immune Profiling Reveals Neutrophils Promote Myasthenia Gravis Exacerbation Through BAFF Secretion
2025-Sep-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509260
PMID:40995750
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示中性粒细胞通过分泌BAFF促进重症肌无力恶化的机制 | 首次发现中性粒细胞-BAFF-浆细胞轴在重症肌无力急性加重中的作用机制 | 样本量有限，需要更大规模临床验证 | 探究中性粒细胞在重症肌无力急性加重中的具体作用机制 | 重症肌无力患者骨髓和外周血样本、实验性自身免疫性重症肌无力小鼠模型 | 单细胞生物学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据 | 重症肌无力患者和EAMG小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 683 | 2025-10-05 |
RNA Sequencing at Single Vesicle Resolution via 3D Printed Embedded Droplet Arrays
2025-Sep-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c09959
PMID:40938793
|
研究论文 | 开发了一种通过3D打印嵌入式液滴阵列实现单细胞外囊泡RNA测序的平台 | 利用3D打印技术创建嵌入式液滴阵列，首次实现单细胞外囊泡水平的多聚腺苷酸RNA测序 | NA | 解决细胞外囊泡RNA载物的异质性问题 | 单个细胞外囊泡 | 单细胞测序技术 | NA | RNA测序, 3D打印, PCR | NA | RNA测序数据 | 3689个独特条形码对应的细胞外囊泡 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D打印嵌入式液滴阵列 | 基于有机凝胶支持介质的3D打印液滴阵列平台 |
| 684 | 2025-10-05 |
Next-generation translational genomics for developing future crops
2025-Sep-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01704-z
PMID:40987990
|
综述 | 本文探讨现代转化基因组学在作物育种中的最新进展与创新策略 | 从单一基因组转向泛基因组分析，从批量转录组转向单细胞转录组技术，结合人工智能实现高通量表型分析 | NA | 通过整合基因组学、转录组学和表型数据加速作物改良 | 作物育种与遗传改良 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、高通量基因分型、表型分析 | AI和机器学习模型 | 基因组数据、转录组数据、表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 685 | 2025-10-05 |
TYK2 Promotes Immunosurveillance of Colorectal Cancer Liver Metastasis
2025-Sep-24, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4224
PMID:40991399
|
研究论文 | 本研究通过小鼠结直肠癌类器官移植模型发现TYK2通过树突状细胞依赖的机制控制结直肠癌肝转移的免疫监视 | 首次揭示TYK2通过树突状细胞MHC-I介导的抗原交叉呈递机制调控结直肠癌肝转移免疫监视 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探索结直肠癌肝转移免疫监视的调控机制 | 结直肠癌肝转移小鼠模型和免疫细胞亚群 | 癌症免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，类器官移植模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 686 | 2025-10-05 |
Spatial profiling of human pancreatic ductal adenocarcinoma reveals molecular alterations associated with venous invasion
2025-Sep-24, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ady7524
PMID:40991729
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析揭示胰腺导管腺癌静脉侵犯的分子特征 | 首次系统描绘PDAC静脉侵犯的空间分子图谱，发现静脉侵犯区域表现出与更好预后相关的分子特征 | 样本量相对有限（8例患者95个样本），需在更大队列中验证 | 探究胰腺导管腺癌静脉侵犯的分子特征及其临床意义 | 人类胰腺导管腺癌组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, RNA-seq | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 公共RNA-seq数据 | 95个PDAC组织样本（来自8例初治患者），独立验证队列19例患者 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 687 | 2025-10-05 |
Transforming histologic assessment: artificial intelligence in cancer diagnosis and personalized treatment
2025-Sep-24, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03206-y
PMID:40993310
|
综述 | 本文综述了人工智能在组织学评估中的变革作用，特别是在癌症诊断和个性化治疗中的应用 | AI从诊断辅助工具发展为临床决策的组成部分，通过深度学习技术复制和增强病理学家决策，并整合组织学、基因组和临床数据 | AI预测验证存在挑战，特别是在预后应用方面，资源有限环境中的可及性仍需解决 | 探索人工智能在组织病理学评估中的临床应用和发展前景 | 组织学图像、基因组数据和临床数据的整合分析 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习、空间转录组学、多模态方法 | 深度学习模型 | 全切片图像(WSIs)、基因组数据、临床数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 688 | 2025-10-05 |
HEBP2-governed glutamine competition between tumor and macrophages dictates immunotherapy efficacy in triple-negative breast cancer
2025-Sep-23, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.08.009
PMID:40992373
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了HEBP2调控的肿瘤细胞与巨噬细胞间谷氨酰胺竞争决定三阴性乳腺癌免疫治疗疗效的机制 | 首次发现HEBP2/GSTP1轴调控的肿瘤-巨噬细胞代谢检查点，开创了单细胞水平免疫代谢评估免疫治疗脆弱性的新范式 | 样本量相对有限（scRNA-seq队列N=27，空间转录组学队列N=88），需要在更大队列中验证 | 阐明三阴性乳腺癌免疫治疗疗效受限的代谢机制 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤微环境中的肿瘤细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据，空间基因表达数据 | scRNA-seq队列27例患者，空间转录组学队列88例患者 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 689 | 2025-10-05 |
Engineered vasculature induces functional maturation of pluripotent stem cell-derived islet organoids
2025-Sep-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.024
PMID:40412386
|
研究论文 | 本研究通过工程化血管系统成功诱导人多能干细胞来源的胰岛类器官实现功能成熟 | 首次构建了包含血管系统的三维胰岛类器官模型，揭示了血管通过形成胰岛样基底膜和BMP信号通路促进β细胞功能成熟的机制 | 研究中使用的血管系统模型仍需进一步优化以更精确模拟体内生理环境 | 开发具有血管系统的功能性胰岛类器官用于糖尿病研究和治疗 | 人多能干细胞来源的胰岛细胞、人原代内皮细胞和成纤维细胞 | 组织工程 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、微流体技术、三维细胞培养 | NA | 基因表达数据、钙离子成像数据、胰岛素分泌数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 690 | 2025-10-05 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2025-Sep-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96713
PMID:40982369
|
研究论文 | 本研究利用深度迁移学习工具DEGAS识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 | 首次应用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据中，识别出特定的疾病相关β细胞亚群 | 研究样本量有限，未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集 | 优先识别与疾病相关的β细胞亚群以更好理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗相关基因 | 人类胰腺胰岛β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫染色 | 深度迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据，批量表达数据，图像数据 | 来自健康和2型糖尿病捐赠者的人类胰腺切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 691 | 2025-10-05 |
Novel radiation-derived gene blueprint stratifying patients with breast cancer
2025-Sep-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03549-1
PMID:40983794
|
研究论文 | 开发基于辐射相关基因的乳腺癌预后风险模型 | 首次利用辐射相关基因构建乳腺癌预后预测模型，并揭示其与免疫浸润和免疫治疗反应的关系 | 需要更多独立队列验证模型的临床适用性 | 开发乳腺癌预后预测生物标志物和个性化治疗策略 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多组学分析 | 随机森林, LASSO Cox回归, stepAIC | 基因表达数据 | TCGA-BRCA队列和METABRIC数据集患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 692 | 2025-10-05 |
SIGEL: a context-aware genomic representation learning framework for spatial genomics analysis
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03748-7
PMID:40983914
|
研究论文 | 提出一种用于空间基因组学分析的情境感知基因组表示学习框架SIGEL | 开发了能够从空间转录组数据中利用空间基因组情境生成基因表示的创新框架 | NA | 解决空间转录组学中生成空间感知基因表示方法的局限性 | 空间转录组数据中的基因表示 | 空间基因组学 | NA | 空间转录组学 | 表示学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 693 | 2025-10-05 |
KEGNI: knowledge graph enhanced framework for gene regulatory network inference
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03780-7
PMID:40983951
|
研究论文 | 提出一种知识图谱增强的基因调控网络推断框架KEGNI，利用图自编码器从单细胞RNA测序数据中推断细胞类型特异性基因调控网络 | 首次将知识图谱与图自编码器相结合，通过知识引导增强基因调控网络推断的准确性 | NA | 开发更准确的细胞类型特异性基因调控网络推断方法 | 基因调控网络和驱动基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 图自编码器 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 694 | 2025-10-05 |
The Single Cell Landscape of the Human Vein After Arteriovenous Fistula Creation and Implications for Maturation Failure
2025-Sep-22, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.024
PMID:40992573
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类静脉在动静脉瘘建立后的细胞景观，阐明了瘘管成熟失败的机制 | 首次构建了人类静脉在动静脉瘘建立前后的单细胞转录组图谱，发现了成熟失败瘘管中持续的炎症反应和异常修复反应特征 | 样本量相对有限（20例单细胞测序患者），且为观察性研究 | 探究动静脉瘘成熟的生物学机制，特别是成熟失败的分子基础 | 接受血液透析患者的静脉组织和动静脉瘘样本 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学图像 | 23例患者（组织学分析），20例患者（单细胞测序，共70,281个细胞） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 695 | 2025-10-05 |
Single-cell and bulk transcriptomic analyses reveal ITGA5-driven epithelial-mesenchymal transition and metabolic adaptation in thyroid cancer
2025-Sep-21, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152678
PMID:40992268
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示ITGA5驱动的上皮-间质转化和代谢适应在甲状腺癌中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据系统分析ITGA5在甲状腺癌中的功能机制，发现其通过调控上皮-间质转化和肿瘤微环境重塑促进癌症进展 | 研究主要基于细胞系实验，缺乏体内动物模型验证；临床样本分析依赖于公共数据库 | 探究ITGA5在甲状腺癌进展中的分子机制和功能作用 | 甲状腺癌组织样本、BCPAP和8505C甲状腺癌细胞系 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, 功能富集分析, 细胞功能实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA甲状腺癌数据集, 两种甲状腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 696 | 2025-10-05 |
Natural killer cells and IFN-γ protect against liver injury during HAV infection in mice
2025-Sep-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01395-25
PMID:40970716
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示自然杀伤细胞和IFN-γ在甲型肝炎病毒感染早期对肝脏的保护作用 | 首次在免疫活性小鼠模型中证明NK细胞通过产生IFN-γ直接抑制HAV复制并保护肝脏，而非引起病理损伤 | 研究使用基因修饰小鼠模型，结果在人类中的直接适用性需要进一步验证 | 阐明NK细胞在甲型肝炎病毒感染早期的免疫保护机制 | 肝细胞特异性I型干扰素受体敲除小鼠和全局敲除小鼠 | 免疫学 | 病毒性肝炎 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术，细胞耗竭实验 | 动物模型 | 基因表达数据，血清生化指标，组织病理学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 697 | 2025-10-05 |
YWHAG mediated epithelial-mesenchymal transition facilitates tumor progression and metastatic spread in non-small cell lung cancer
2025-Sep-15, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112139
PMID:40962000
|
研究论文 | 本研究揭示YWHAG通过LRRK2/PI3K/AKT轴促进非小细胞肺癌的上皮-间质转化和转移进程 | 首次阐明YWHAG在非小细胞肺癌中通过调控LRRK2/PI3K/AKT信号轴驱动上皮-间质转化的分子机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证相对有限 | 阐明YWHAG在非小细胞肺癌进展中的功能和机制作用 | 非小细胞肺癌细胞系(NCI-H292, A549)、TCGA泛癌数据集、单细胞RNA测序数据、肺癌特异性YWHAG敲除小鼠模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 过表达, 免疫共沉淀, 免疫荧光, 通路活性分析, 生物发光成像 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | TCGA泛癌数据集(29种癌症类型)、2个NSCLC单细胞RNA测序数据集(GSE117570 & GSE148071)、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 698 | 2025-10-05 |
Engineering Spatial and Molecular Features from Cellular Niches to Inform Predictions of Inflammatory Bowel Disease
2025-Sep-12, ArXiv
PMID:40964085
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用空间转录组学构建可解释机器学习模型来区分炎症性肠病亚型的新计算框架 | 首次将空间转录组学与可解释机器学习相结合，从细胞生态位中系统提取空间和分子特征用于IBD分类 | 样本量相对有限，需要更大规模验证 | 开发基于空间转录组学的IBD亚型分类和诊断方法 | 健康对照、溃疡性结肠炎和克罗恩病患者的结肠黏膜组织 | 空间转录组学 | 炎症性肠病 | 空间转录组学，非负矩阵分解，多层感知器 | MLP | 空间转录组数据 | 健康对照、UC和CD患者的结肠黏膜样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 699 | 2025-10-05 |
NNMT inhibition in cancer-associated fibroblasts restores antitumour immunity
2025-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09303-5
PMID:40702186
|
研究论文 | 本研究通过抑制癌症相关成纤维细胞中的NNMT酶活性，恢复抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示NNMT通过诱导H3K27me3低甲基化驱动CAF分泌补体，招募免疫抑制性MDSC的机制，并开发了特异性NNMT抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果需进一步验证 | 探索NNMT在肿瘤微环境免疫抑制中的作用及治疗潜力 | 高级别浆液性卵巢癌、乳腺癌和结肠癌模型 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、高通量筛选 | 基因敲除小鼠模型、同系肿瘤模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | 多个小鼠癌症模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 700 | 2025-10-05 |
Genome-wide association study identifies FUT2 rs601338 polymorphism linking intra-pancreatic fat deposition to chronic pancreatitis
2025-Sep, Pancreatology : official journal of the International Association of Pancreatology (IAP) ... [et al.]
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.pan.2025.07.407
PMID:40744837
|
研究论文 | 通过全基因组关联研究揭示FUT2基因rs601338多态性通过影响胰腺脂肪沉积与慢性胰腺炎风险的关联机制 | 首次通过大规模GWAS发现胰腺脂肪沉积的遗传基础，结合单细胞转录组学确认FUT2基因在胰腺外分泌部的特异性表达 | 研究人群主要为欧洲裔，样本代表性有限；未深入探讨FUT2影响胰腺脂肪沉积的具体分子机制 | 探索胰腺脂肪沉积的遗传基础及其对胰腺疾病风险的影响 | 20,040名欧洲裔个体（排除急/慢性胰腺炎和胰腺癌患者） | 基因组学 | 慢性胰腺炎 | 全基因组关联研究(GWAS), 共定位分析, 转录组关联研究(TWAS), 单细胞转录组学 | 回归模型, 交互作用分析 | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 20,040人 | UK Biobank | 基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |