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当前共找到 40810 篇文献,本页显示第 681 - 700 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
681 2026-06-17
Single-cell phenotype-associated subpopulation identification via transfer foundation model and statistical ensemble learning
2026-Apr-29, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 提出scPASI方法,整合单细胞与批量信息,识别与表型相关的细胞亚群 结合预训练基础模型与残差变分自编码器,以及LASSO和稀疏组LASSO回归,将细胞分为四种不同表型关联程度的亚群 NA 建立单细胞转录组与表型之间的关联,识别疾病相关的细胞亚群 肿瘤状态、基因突变及临床预后等表型相关的细胞亚群 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序 预训练基础模型、残差变分自编码器、LASSO、稀疏组LASSO 单细胞转录组数据、批量转录组数据 多个不同数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
682 2026-06-17
Single-cell transcriptomics reveals ADRB1 as a key immune checkpoint regulating T cell exhaustion in lung cancer and its prognostic value in lung cancer
2026-Apr-29, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了ADRB1作为肺癌中调控T细胞耗竭的关键免疫检查点及其预后价值 首次将ADRB1描述为一种参与肺癌T细胞耗竭的新型免疫检查点,并基于ADRB1+ T细胞特征进行预后建模 需要进行功能研究和临床试验来验证和讨论这一提出的概念 探索ADRB1在肺癌中作为免疫检查点调控T细胞耗竭的作用及其预后价值 肺腺癌和肺鳞癌患者的肿瘤及邻近非肿瘤组织中的T细胞 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
683 2026-06-17
Integrated Genomic and Single-Cell Analysis Identifies Notch1 as a Metastasis Suppressor in Nasopharyngeal Carcinoma Targeted by the AKT/Smad3 Axis
2026-Apr-29, Biological procedures online IF:3.7Q1
研究论文 本研究系统探究Notch1作为鼻咽癌转移抑制因子的功能及其通过AKT/Smad3轴调控的分子机制 首次通过整合基因组与单细胞分析发现Notch1在鼻咽癌中通过AKT/Smad3轴抑制EMT和转移,并基于Notch1相关基因实现患者分子分型 样本量有限且主要依赖TCGA和GEO数据库,缺乏大规模临床队列验证 阐明Notch1在鼻咽癌侵袭和转移中的功能及分子机制 鼻咽癌组织样本、细胞系及裸鼠模型 机器学习 鼻咽癌 免疫组化, 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀 共识聚类 图像, 文本, 测序数据 鼻咽癌组织微阵列(具体数量未说明)、多个细胞系及裸鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
684 2026-06-17
Machine learning predictions surpass individual mRNAs as a proxy of single-cell protein expression
2026-Apr-22, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 测试九种机器学习方法预测单细胞蛋白表达,并与单独使用mRNA进行比较 系统比较多种机器学习方法在单细胞蛋白表达预测中的性能,发现基于全转录组的推断能预测mRNA缺失的蛋白表达 模型泛化能力有限,需要高度相似的训练数据,限制了当前应用范围 评估机器学习方法预测单细胞蛋白表达的能力,并比较其与直接使用mRNA的准确性 单细胞RNA测序数据及对应的表面蛋白表达数据 机器学习 不适用 单细胞RNA测序 九种机器学习方法(包含多种类型) 基因表达数据 不适用 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
685 2026-06-17
Clonal biases dictate availability of colonic cancer driver mutations for transformation
2026-Apr-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过靶向测序分析正常结肠腺体中的癌症驱动突变,揭示不同基因突变在组织中的克隆行为及其转化风险差异 首次在组织学正常的结肠腺体中系统比较五种结直肠癌驱动基因(APC、KRAS、TP53、FBXW7和CTNNB1)的突变频率、克隆动态及转化风险,并揭示FBXW7 R465C突变倾向于固定而KRAS G12突变强力促进扩增的差异机制 未明确说明局限性 探究人结肠中不同原癌事件在频率、行为及后续转化风险方面的差异 来自56名患者的76,800个正常结肠腺体 数字病理学 结直肠癌 靶向测序, 空间转录组学 NA 测序数据, 空间转录组数据 56名患者的76,800个正常结肠腺体 NA 靶向测序, 空间转录组学 NA NA
686 2026-06-17
Spatial transcriptomics of en bloc transurethral resection of bladder tumor specimens defines an invasive-front gene expression signature
2026-Apr-14, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 使用空间转录组学分析膀胱肿瘤整块经尿道切除标本,识别出侵袭前沿的基因表达特征 首次利用空间转录组学技术对整块经尿道膀胱肿瘤切除标本进行分析,在保留三维肿瘤结构的前提下,识别出与非肌层浸润性膀胱癌侵袭相关的前沿基因表达特征,并发现该15基因特征与预后相关 样本量较小(共7例),且仅针对高风险非肌层浸润性膀胱癌,结果需在更大队列中验证 阐明非肌层浸润性膀胱癌向肌层浸润性膀胱癌进展的侵袭机制,并识别预后标志物 7例高级别非肌层浸润性膀胱癌的整块经尿道切除标本 数字病理学 膀胱癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据,批量RNA-seq数据 7例膀胱肿瘤整块经尿道切除标本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台,用于分析整块经尿道切除标本
687 2026-06-17
Prognostic Implications of Programmed Cell Death Ligand 1 Expression, Cluster of Differentiation 8-Positive T-Cell Infiltration, and Related Immunophenotypes in Invasive Mucinous Adenocarcinoma of the Lung: A Multicenter Study
2026-Apr, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 本研究系统评估了肺浸润性黏液腺癌中PD-L1表达和CD8阳性T细胞浸润,并建立了新的免疫表型分类 首次在最大样本队列中深入分析了IMA的免疫微环境,并提出四类免疫表型分类系统,具有预后和预测潜力 未明确提及具体局限性,但单细胞RNA-seq分析样本量较小(20例接受免疫检查点抑制剂治疗的患者) 探索肺浸润性黏液腺癌的免疫微环境及其对免疫治疗的潜在反应 肺浸润性黏液腺癌患者的肿瘤组织样本 数字病理学 肺癌 PD-L1免疫组化, CD8免疫组化, 单细胞RNA测序 NA 图像, 转录组数据 312例纯IMA患者,其中20例接受免疫检查点抑制剂治疗 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
688 2026-06-17
Spatial Transcriptomics of Human Decidua Identifies Molecular Signatures in Recurrent Pregnancy Loss
2026-Mar-27, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 通过空间转录组学分析人类蜕膜,揭示复发性妊娠丢失中的分子特征 首次对健康供体和复发性妊娠丢失患者的早期妊娠蜕膜进行空间转录组分析,鉴定了两个不同的空间区域(植入区和腺体分泌区),并发现FOSL2是协调蜕膜自然杀伤细胞(dNK1)空间转化的关键调控因子 未提及具体局限性 阐明人类蜕膜中免疫耐受的复杂空间和调控结构,为复发性妊娠丢失中的免疫耐受失调提供新见解 人类早期妊娠蜕膜组织,包括健康供体和复发性妊娠丢失患者 数字病理学 复发性妊娠丢失 空间转录组学 NA 空间转录组数据,单细胞染色质可及性数据,转录因子占用数据 健康供体和复发性妊娠丢失患者的早期妊娠蜕膜样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
689 2026-06-17
Spatial transcriptomics uncovers hybrid, proinflammatory, and profibrotic cellular niches in pulmonary granuloma of patients with chronic sarcoidosis
2026-Feb-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 利用空间转录组学揭示慢性结节病患者肺部肉芽肿中混合型、促炎和促纤维化的细胞微环境 首次在慢性结节病肺部肉芽肿中利用空间转录组学技术详细描述细胞微环境的组成和功能,特别是中央巨噬细胞微环境同时具有促炎和促纤维化特性 样本量较小(9例),缺乏功能实验验证,需要进一步研究肉芽肿微环境的动态变化 利用空间转录组学揭示慢性结节病患者肺部肉芽肿内的细胞微环境 9例慢性结节病患者的肺部外植体(含肉芽肿) 空间转录组学、数字病理学 结节病 空间转录组学、免疫组织荧光染色、RNA原位杂交 NA 空间基因表达数据、图像 9例患者样本,涵盖30,587个基因表达点和173个肉芽肿 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
690 2026-06-17
Reactive oligodendrocytes promote glioblastoma progression through CCL5/CCR5-mediated glioma stem cell maintenance
2026-01-21, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 利用单细胞和空间转录组学技术,揭示反应性少突胶质细胞通过CCL5/CCR5信号轴维持胶质瘤干细胞,促进胶质母细胞瘤进展 首次发现胶质母细胞瘤细胞通过fractalkine信号将少突胶质细胞招募至肿瘤边缘,并诱导其进入类似脱髓鞘炎症和创伤损伤的IFN诱导反应状态,且CCL5/CCR5轴作为可药物靶点 未明确提及具体局限性,但可能包括依赖小鼠模型的局限性以及临床转化仍需进一步验证 研究少突胶质细胞在胶质母细胞瘤微环境中的功能作用及其对肿瘤进展的影响 原发性及复发性胶质母细胞瘤肿瘤组织、少突胶质细胞、胶质瘤干细胞 机器学习 胶质母细胞瘤 单细胞转录组测序、空间转录组测序、免疫组化、细胞因子分析、迁移实验 NA 基因表达数据、图像 原发性及复发性胶质母细胞瘤肿瘤样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞测序平台用于单细胞转录组,10x Visium用于空间转录组
691 2026-06-17
Genetically supported mediators linking peripheral metabolism to cerebral ischemia: a multi-omics characterization of HMGCR, TLR4, and MMP9 in angina pectoris and stroke
2026-Jan-09, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
研究论文 利用多组学整合分析,鉴定出HMGCR、TLR4和MMP9作为连接心绞痛与缺血性卒中的遗传中介因子 首次通过多组学框架(孟德尔随机化、转录组学、单细胞RNA-seq)揭示外周代谢-炎症通路介导心绞痛向缺血性卒中转化的分子机制 未提及具体局限性 探究心绞痛与缺血性卒中之间的因果中介因子及外周-中枢信号传导机制 心绞痛和缺血性卒中患者的外周血及脑组织样本 多组学整合分析 心血管疾病,脑血管疾病 孟德尔随机化(BWMR)、转录组学分析、Boruta特征选择、分子对接、CIBERSORT、单细胞RNA-seq 多层感知器分类器(MLPC) 基因组数据、转录组数据(bulk RNA-seq和scRNA-seq) 大样本GWAS数据(n=628,000) NA 单细胞RNA-seq NA CIBERSORT用于免疫细胞浸润分析,scRNA-seq用于免疫细胞亚群分析
692 2026-06-17
BST2 expression at astrocyte borders promotes microglial recruitment via the C3/C3aR signaling
2026-01-07, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞测序和空间转录组学技术,发现星形胶质细胞边缘表达的BST2通过C3/C3aR信号促进小胶质细胞招募,在脑损伤后形成病变边界并调节神经功能 首次鉴定出星形胶质细胞边缘表达的BST2蛋白通过PKCβII磷酸化增强C3表达,进而调控星形胶质细胞-小胶质细胞相互作用,为脑卒中后早期脑损伤提供潜在治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,BST2在人类脑损伤中的具体作用机制及临床转化潜力尚需进一步验证 阐明星形胶质细胞边界特征及其与小胶质细胞的相互作用机制,探索BST2作为脑卒中治疗靶点的可能性 脑损伤后边界星形胶质细胞、小胶质细胞以及它们之间的相互作用 机器学习 脑血管疾病 单细胞测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间基因表达数据 小鼠模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3‘测序和10x Visium空间转录组学
693 2026-06-17
Customized Design and Preparation of Bionic Drug Delivery System Leveraging Single-Cell RNA Sequencing for Precisely Targeted Therapy
2026-01, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
研究论文 本文报道了一种基于单细胞RNA测序定制的仿生药物递送系统,用于急性肾损伤的精准靶向治疗 首次利用单细胞RNA测序识别病理进展关键细胞亚型(PTIs)并筛选特异性细胞粘附分子(VCAM1和ICAM1)作为靶向递送介体,据此定制设计和制备了仿生药物递送系统BRNCs@AMMOs 未提及具体局限性,但可能包括体内分布和长期安全性需进一步评估 开发一种单细胞RNA测序引导的仿生药物递送系统,用于急性肾损伤的靶向治疗 急性肾损伤的关键细胞亚型(PTIs)及相应的靶向递送介体(VCAM1和ICAM1) 数字病理学 急性肾损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及样本数量,但涉及体外和体内实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
694 2026-06-17
Notch signaling is a driver of glandular stem cell activity and regenerative migration after damage
2026-01, The EMBO journal
研究论文 通过多组学整合方法揭示Notch信号在小鼠唾液腺类器官模型中调控干细胞活性及辐射损伤后再生迁移的作用 首次采用整合单细胞RNA测序、批量ATAC和RNA测序的多组学方法,结合体外类器官模型与体内组织验证,系统解析了Notch信号在腺体干细胞自我更新和辐射诱导迁移中的保守调控机制 研究主要基于小鼠模型,虽然扩展到人和鼠的多种腺体类器官,但人体内验证数据有限,且未深入探讨Notch信号下游的具体分子通路细节 探究腺体器官中稀有静止干细胞的调控机制,特别是Notch信号在辐射损伤后干细胞自我更新和迁移中的作用 小鼠唾液腺类器官、辐射损伤小鼠唾液腺组织、小鼠及患者来源的唾液腺、乳腺和甲状腺类器官 数字病理学 放射性损伤相关疾病 单细胞RNA测序, 批量ATAC测序, 批量RNA测序 NA 基因表达数据, 染色质可及性数据 小鼠唾液腺类器官多时间点样本及辐射损伤后样本,小鼠唾液腺组织样本,以及人和鼠的唾液腺、乳腺和甲状腺类器官样本 NA 单细胞RNA测序, 批量ATAC测序, 批量RNA测序 NA NA
695 2026-06-17
Cyst-independent oocyte phagocytosis builds the female reproductive reserve in mice
2026-01, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 开发高分辨率四维卵巢成像系统,发现小鼠卵母细胞通过独立于囊肿的吞噬作用构建生殖储备 发现卵母细胞以独立细胞形式而非囊肿结构进行选择,并通过吞噬牺牲卵母细胞碎片来富集细胞质和支持存活 实验仅在模型小鼠中进行,未在人类或其他哺乳动物中验证 揭示哺乳动物卵巢发育中卵母细胞命运决定的机制 小鼠卵母细胞 自然语言处理 NA NA NA 图像, 基因表达数据 小鼠卵巢样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
696 2026-06-17
A low-level Cdkn1c/p57kip2 expression in spinal progenitors drives the transition from proliferative to neurogenic modes of division
2026-01, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究利用鸡胚神经管的单细胞RNA测序数据,鉴定出细胞周期调节因子Cdkn1c作为从增殖性分裂转向神经源性分裂模式的关键驱动因子,其低表达水平在神经祖细胞中启动这一转变 首次揭示Cdkn1c/p57kip2的低表达水平而非高表达水平驱动神经祖细胞从增殖性向神经源性分裂模式转变,并提出其在不同表达阶段具有双重功能 主要基于鸡胚模型,未在哺乳动物或人类系统中验证,且低表达调控机制的分子细节尚不完整 探究脊椎动物神经发生过程中从对称增殖性分裂向不对称神经源性分裂转变的分子调控机制 鸡胚神经管中的神经祖细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 鸡胚神经管细胞(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
697 2026-06-17
Transcript profiling and gene regulation of the human pre-implantation embryo: parental effects and impact of ARTs
2026-01-01, Human reproduction update IF:14.8Q1
综述 探讨人植入前胚胎转录组受亲本特征、辅助生殖技术(ART)条件和胚胎因素影响的综述 首次系统综述了影响人植入前胚胎转录组的多重因素,包括亲本特征、ART干预和胚胎内在因素,并利用单细胞RNA测序数据比对各细胞谱系特异性表达变化 关于多囊卵巢综合征、子宫内膜异位症、卵巢储备功能减退、精子异常、不明原因不孕及ART技术影响的证据仍然有限 探究亲本特征、ART条件和胚胎内因如何影响人植入前胚胎转录组,并识别不同因素中共有的失调分子通路 人植入前胚胎(尤其囊胚阶段)的转录组数据 自然语言处理 不孕症 单细胞RNA测序 NA 文本(综述信息)、基因表达数据 NA(综述,包含多篇研究数据) NA 单细胞RNA-seq NA NA
698 2026-06-17
Conserved Ductular Reaction Mechanisms in Biliary Atresia and Primary Sclerosing Cholangitis Derived From Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
综述 基于单细胞和空间转录组学研究胆道闭锁与原发性硬化性胆管炎中保守的导管反应机制 揭示了两种胆道疾病中导管反应共享的上皮、间充质和先天免疫机制,而适应性免疫机制存在差异 未来需要涵盖早期和晚期疾病样本,特别是非肝硬化PSC;单细胞空间转录组技术可提高配体-受体相互作用预测的置信度 阐明胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎中导管反应的保守机制以识别通用治疗靶点 胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎患者的肝脏组织样本 机器学习 胆道疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
699 2026-06-17
Integrative Single-Cell Transcriptomics and Network Pharmacology Analysis of Xiao Qing Long Tang in Pediatric Cough-Variant Asthma
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 通过整合单细胞转录组学和网络药理学分析,探究小青龙汤在小儿咳嗽变异性哮喘中的作用机制 首次利用单细胞RNA测序技术构建儿童哮喘气道上皮细胞的单细胞图谱,并结合网络药理学分析中药复方小青龙汤的多靶点作用机制 NA 揭示儿童咳嗽变异性哮喘的细胞异质性和分子机制,并探索小青龙汤的潜在治疗靶点 儿童哮喘患者的气道上皮组织 自然语言处理, 机器学习 哮喘 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) Monocle算法 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics 单细胞RNA测序平台
700 2026-06-17
A Cross-Tissue Multiomics Analysis Reveals the Protective Role of TGFBR3 in Postmenopausal Osteoporosis
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 通过跨组织多组学分析揭示TGFBR3在绝经后骨质疏松中的保护作用 首次整合人类跨组织转录组谱发现TGFBR3作为绝经后骨质疏松的新型保护性调控因子,并结合遗传流行病学、单细胞转录组学及动物模型进行多层次机制验证 未提及具体局限性 发现绝经后骨质疏松的保守遗传调控因子并表征其生物学功能 绝经后骨质疏松患者的外周血单核细胞、骨髓及骨组织转录组数据,以及卵巢切除小鼠模型 机器学习 骨质疏松 RNA测序, 孟德尔随机化, 单细胞转录组学 机器学习算法组合(108种) 转录组数据 人类样本:外周血单核细胞、骨髓、骨组织;小鼠模型:卵巢切除骨质疏松模型 NA NA NA NA
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