单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
681	2025-05-09	PINK1 link mitochondria-ER contacts controls deposition of intramuscular fat in pigs 2025-05-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151672 PMID:40138759	研究论文	本研究探讨了PINK1如何通过调节线粒体-内质网相互作用来调控猪肌肉内脂肪（IMF）沉积	首次揭示了PINK1通过调控线粒体-内质网接触点来控制猪肌肉内脂肪沉积的分子机制	研究主要基于猪模型，结果在人类或其他物种中的适用性尚需验证	探究PINK1在调控猪肌肉内脂肪沉积中的作用机制	猪的肌肉内脂肪沉积过程	分子生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	多个猪品种的肌肉组织样本
682	2025-05-09	Hdac1 as an early determinant of intermediate-exhausted CD8+ T cell fate in chronic viral infection 2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2502256122 PMID:40333757	research paper	该研究探讨了组蛋白去乙酰化酶1（Hdac1）在慢性病毒感染中作为中间耗竭CD8+ T细胞命运早期决定因素的作用	揭示了Hdac1在抗原特异性T-int细胞形成中的特异性需求，以及其在调节T-int特征基因和防止过度激活耗竭程序中的双重功能	研究仅关注了Hdac1在慢性病毒感染中的作用，未涉及其他可能的疾病模型或条件	理解慢性病毒感染中CD8+ T细胞耗竭的分子机制	CD8+ T细胞在慢性病毒感染中的不同亚群	免疫学	慢性病毒感染	单细胞转录组学、染色质可及性分析	NA	转录组数据、染色质可及性数据	NA
683	2025-05-09	Interferon-induced activation of dendritic cells and monocytes by yellow fever vaccination correlates with early antibody responses 2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2422236122 PMID:40333758	研究论文	研究黄热病疫苗接种后树突状细胞和单核细胞的干扰素诱导激活与早期抗体反应的关系	首次通过单细胞RNA测序揭示了黄热病疫苗接种后树突状细胞和单核细胞的激活状态及其与早期抗体反应的关联	研究仅关注了疫苗接种后的早期免疫反应，未涉及长期免疫保护机制	阐明黄热病疫苗接种后早期先天免疫事件与快速产生保护性免疫的关系	人类血液中的树突状细胞和单核细胞亚群	免疫学	黄热病	转录组分析、单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	RNA测序数据、流式细胞数据	大量疫苗接种者的血液样本
684	2025-05-09	IFN-γ and donor leukocyte infusions for relapsed myeloblastic malignancies after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation 2025-May-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.190655 PMID:40131369	research paper	该研究探讨了IFN-γ联合供体白细胞输注(DLI)在异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤中的安全性和初步疗效	首次在临床试验中评估IFN-γ联合DLI治疗异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤，并采用单细胞RNA测序技术分析IFN-γ对恶性髓系细胞的体内作用	样本量较小(n=7)，需要更大规模的研究来验证疗效	评估IFN-γ联合DLI治疗异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤的安全性和初步疗效	异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病或骨髓增生异常综合征患者	血液肿瘤学	急性髓系白血病, 骨髓增生异常综合征	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	NA	临床数据, 单细胞转录组数据	7名患者
685	2025-05-09	Klf9 promotes the repair of myocardial infarction by regulating macrophage recruitment and polarization 2025-May-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.187072 PMID:40198141	研究论文	该研究揭示了Klf9通过调节巨噬细胞的招募和极化，促进心肌梗死后修复的机制	首次发现Klf9通过调控IFN-γ/STAT1信号通路影响巨噬细胞表型和功能，从而影响心肌梗死后修复	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	探究Klf9在心肌梗死后巨噬细胞表型和功能调控中的作用	心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞	心血管疾病	心肌梗死	单细胞RNA测序、流式细胞术	Klf9基因敲除小鼠模型	基因表达数据、细胞表型数据	野生型和Klf9敲除小鼠的心肌组织样本
686	2025-05-09	The brain-body circuit mediates acute stress-induced antiinflammatory reflex in bacterial cystitis by suppressing ILC2 activation 2025-May-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.189362 PMID:40100274	research paper	该研究揭示了急性应激通过脑-体回路抑制ILC2细胞激活，从而在细菌性膀胱炎中产生抗炎反射的机制	首次发现急性应激通过PVN脑区神经元激活抑制ILC2细胞的促炎因子表达，阐明了脑-体回路在UTI治疗中的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床验证	探索心理应激与膀胱感染免疫调节的神经机制	小鼠UTI模型中的PVN脑区神经元和ILC2免疫细胞	神经免疫学	尿路感染	单细胞RNA测序	动物模型	基因表达数据	未明确说明小鼠数量
687	2025-05-09	Cerulenin Partially Corrects the Disrupted Developmental Transcriptomic Signature in Huntington's Disease Striatal Medium Spiny Neurons 2025-May-08, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxaf029 PMID:40336225	研究论文	本研究探讨了亨廷顿病(HD)中突变HTT蛋白对纹状体中型多棘神经元(MSNs)发育的影响，并发现Cerulenin部分恢复了HD MSNs的DARPP-32水平和电活动	首次使用HD诱导多能干细胞(iPSC)模型模拟人类胎儿纹状体神经元发育轨迹，并发现Cerulenin对HD MSNs的潜在治疗作用	研究仅使用体外细胞模型，未进行动物或临床试验验证	探究突变HTT蛋白对MSN发育的影响并寻找潜在治疗分子	亨廷顿病(HD)患者的诱导多能干细胞(iPSC)分化的MSNs	神经退行性疾病研究	亨廷顿病	单细胞RNA测序	iPSC分化模型	基因表达数据	未明确说明样本数量，使用HD iPSC和同基因对照
688	2025-05-09	Hepatic stellate cell heterogeneity: Functional aspects and therapeutic implications 2025-May-08, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001386 PMID:40338161	review	本文综述了肝星状细胞（HSCs）在健康和疾病肝脏中的异质性及其在纤维化、肝分区、功能、再生和癌症中的作用	整合单细胞测序、空间转录组学、临床前和临床数据，更新了对HSC异质性在肝脏稳态和疾病中作用的理解	NA	探讨HSC异质性在肝脏稳态和疾病中的作用及其治疗潜力	肝星状细胞（HSCs）及其与肝细胞、内皮细胞、巨噬细胞/单核细胞、T细胞和肿瘤细胞的相互作用	NA	肝病	单细胞测序、空间转录组学	NA	临床前数据、临床数据	NA
689	2025-05-09	Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immune Landscape of Granulomatous Mastitis 2025-May-08, Inflammation IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s10753-025-02310-8 PMID:40338490	研究论文	通过单细胞RNA测序技术揭示肉芽肿性乳腺炎的免疫图谱	首次使用单细胞RNA测序技术对肉芽肿性乳腺炎病变组织与正常乳腺组织进行比较分析，揭示了免疫细胞的浸润情况、免疫紊乱现象以及多种信号通路的异常激活	研究样本量未明确说明，可能影响结果的普遍性	探究肉芽肿性乳腺炎的免疫学特征和潜在发病机制	肉芽肿性乳腺炎病变组织和正常乳腺组织	数字病理学	乳腺炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA序列数据	NA
690	2025-05-09	Splicing regulatory dynamics for precision analysis and treatment of heterogeneous leukemias 2025-May-07, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adr1471 PMID:40333990	research paper	该研究开发了一种名为OncoSplice的无监督计算工作流程，用于全面定义肿瘤分子景观，并在成人和儿童急性髓系白血病（AML）中识别了驱动遗传学的谱系	发现了超过十种先前未报告的AML分子亚型，并发现了一种主导的剪接亚型，该亚型部分模拟了突变剪接	研究主要集中在AML，未涉及其他类型的白血病或癌症	研究剪接调控在白血病中的动态变化，以进行精确分析和治疗	成人和儿童急性髓系白血病（AML）	computational biology	leukemia	long-read single-cell RNA sequencing	unsupervised computational workflow (OncoSplice)	RNA sequencing data	成人和儿童AML队列
691	2025-05-09	Heterogeneous pericoerulear neurons tune arousal and exploratory behaviours 2025-May-07, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08952-w PMID:40335695	research paper	该研究揭示了蓝斑核（LC）及其周围区域中转录、空间和功能多样化的GABA能神经元如何调节全局觉醒水平和相关行为	首次定义了LC及peri-LC区域的分子、细胞和功能多样性，揭示了这些神经元如何通过调节LC的放电模式来控制觉醒和回避行为	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探索LC及其周围神经元如何调节觉醒和回避状态	小鼠蓝斑核（LC）及其周围区域的神经元	神经科学	神经精神疾病	单细胞RNA测序、空间转录组学、病毒追踪	NA	基因表达数据、神经活动数据	NA
692	2025-05-09	Oncogene aberrations drive medulloblastoma progression, not initiation 2025-May-07, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08973-5 PMID:40335697	research paper	该研究利用单细胞技术探究了3/4组髓母细胞瘤中癌基因畸变和拷贝数变异在肿瘤发展和治疗抵抗中的作用	揭示了大规模染色体畸变是肿瘤发生的早期事件，而单基因癌基因事件发生在晚期并通常是亚克隆的，但MYC在疾病进展过程中可以成为克隆性驱动因素	研究仅关注了已知MYC、MYCN和PRDM6改变的3/4组髓母细胞瘤病例	探究3/4组髓母细胞瘤中癌基因畸变和拷贝数变异在肿瘤发展和治疗抵抗中的作用	3/4组髓母细胞瘤	digital pathology	medulloblastoma	single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq), single-nucleus assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing (snATAC-seq), spatial transcriptomics	population genetics model	single-cell omics data, spatial transcriptomics data	一组已知MYC、MYCN和PRDM6改变的3/4组髓母细胞瘤病例
693	2025-05-09	miR142 silencing alleviates retinal inflammation by impairing mitochondrial function and reprogramming metabolism of CD4+ T cells via targeting MTFR1 2025-May-06, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114727 PMID:40334625	研究论文	本研究探讨了miR-142在自身免疫性葡萄膜炎中的作用及其机制，发现miR-142通过靶向MTFR1调控T细胞线粒体功能和代谢重编程	首次揭示了miR-142通过靶向MTFR1调控T细胞线粒体功能和代谢重编程在自身免疫性葡萄膜炎中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	阐明miR-142在葡萄膜炎发病机制中的作用及其分子机制	外周血单核细胞、实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)模型、miR-142敲除小鼠	免疫学	葡萄膜炎	流式细胞术、单细胞测序、Seahorse分析仪、线粒体染色、电子显微镜分析、荧光素酶报告实验、Western-Blot	miR-142敲除小鼠模型	基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据	葡萄膜炎患者外周血单核细胞、EAU模型小鼠
694	2025-05-09	Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Regulatory Functions of Copines Family Genes in Testicular Cancer Progression 2025-May-06, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets DOI:10.2174/0118715303375462250430055914 PMID:40337972	研究论文	本研究基于单细胞数据探讨了Copines家族基因在睾丸癌不同细胞亚群中的表达模式及调控功能	首次在单细胞水平上研究Copines家族基因在睾丸癌中的调控作用	NA	探究Copines家族基因在睾丸癌中的调控机制	睾丸癌细胞亚群	数字病理学	睾丸癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	NA
695	2025-05-09	Fate mapping in mouse demonstrates early secretory differentiation directly from Lgr5+ intestinal stem cells 2025-May-05, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.023 PMID:39793582	research paper	该研究通过结合定量命运映射、数学建模和单细胞RNA测序，揭示了肠道上皮细胞更新的细胞水平机制	提出了基于两个循环群体的隐窝维持模型，并验证了干细胞区室在分泌和吸收谱系命运决定中的作用	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他动物模型中验证	探究肠道上皮细胞更新的细胞水平机制及干细胞和前体细胞的行为如何确保组织维持	小鼠肠道上皮细胞，特别是Lgr5+肠道干细胞和转运扩增(TA)细胞	细胞生物学	NA	定量命运映射、数学建模、单细胞RNA测序	数学建模	单细胞RNA测序数据	三种互补的小鼠模型
696	2025-05-09	Single-cell RNA-seq identifies protracted mouse germline X chromosome reactivation dynamics directed by a PRC2-dependent mechanism 2025-May-05, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.028 PMID:39798575	研究论文	通过单细胞RNA测序和染色质分析，研究了小鼠原始生殖细胞中X染色体再激活的动态过程及其机制	首次在单细胞水平上精确评估了X染色体再激活的动力学，并揭示了PRC2依赖的机制在促进女性减数分裂中的作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他哺乳动物中验证	探究女性原始生殖细胞中X染色体再激活的分子机制及其与生殖细胞性别二态性的关系	小鼠胚胎中的原始生殖细胞（PGCs）和性腺生殖细胞	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质分析	NA	RNA-seq数据、染色质数据	从小鼠胚胎的E9.5到E16.5阶段的生殖细胞
697	2025-05-09	Comparative spatial transcriptomics reveals root dryland adaptation mechanism in rice and HMGB1 as a key regulator 2025-May-05, Molecular plant IF:17.1Q1 DOI:10.1016/j.molp.2025.04.001 PMID:40195115	研究论文	本研究通过比较旱稻和灌溉稻的根系发育，揭示了旱稻适应旱地的分子和发育机制，并发现HMGB1作为关键调控因子促进旱稻根系伸长和增粗，从而增强抗旱性	首次通过空间转录组图谱比较旱稻和灌溉稻的根系发育，发现HMGB1作为关键调控因子促进旱稻根系伸长和增粗	研究仅关注了旱稻和灌溉稻的根系发育，未涉及其他可能的抗旱机制	揭示旱稻适应旱地的分子和发育机制，为培育抗旱水稻提供遗传资源	旱稻和灌溉稻的根系	植物分子生物学	NA	空间转录组学	NA	转录组数据	旱稻和灌溉稻的根系样本
698	2025-05-09	Oligodendroglia vulnerability in the human dorsal striatum in Parkinson's disease 2025-May-05, Acta neuropathologica IF:9.3Q1 DOI:10.1007/s00401-025-02884-5 PMID:40323467	研究论文	该研究通过单核RNA测序和基于图像的空间转录组学技术，揭示了帕金森病中人类背侧纹状体少突胶质细胞的多样性和疾病影响	首次在帕金森病中系统性地描述了少突胶质细胞的亚类及其疾病相关变化，并发现了与疾病相关的四个特定细胞群体	研究样本量相对有限，且仅关注了背侧纹状体区域	阐明帕金森病中少突胶质细胞的多样性及其在疾病中的作用	人类尾状核和壳核(背侧纹状体)中的少突胶质细胞	神经科学	帕金森病	sn-RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学分析	NA	转录组数据, 图像数据	约200,000个少突胶质细胞核
699	2025-05-09	Integrated multiomics and Mendelian randomization identify CHIT1 as a novel sepsis biomarker and therapeutic target 2025-May-05, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-99619-z PMID:40325173	研究论文	本研究通过整合多组学数据和孟德尔随机化方法，发现CHIT1作为脓毒症的新型生物标志物和治疗靶点	首次将CHIT1鉴定为脓毒症的新生物标志物和潜在药物靶点，揭示了其在加剧中性粒细胞过度炎症和免疫抑制中的作用	研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证	寻找能预测脓毒症患者预后的新关键生物标志物并探索其分子机制	脓毒症患者	生物信息学	脓毒症	批量转录组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析	单变量Cox回归模型	基因表达数据	多个GEO数据集(GSE65682等)和eQTLGen Consortium及IEU OpenGWAS项目数据
700	2025-05-09	Modulation of senescent Lepr+ skeletal stem cells via suppression of leptin-induced STAT3‒FGF7 axis activation alleviates abnormal subchondral bone remodeling and osteoarthritis progression 2025-May-05, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-025-04342-1 PMID:40325465	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和体内外实验，揭示了瘦素受体阳性骨骼干细胞（Lepr+ SSCs）在骨关节炎（OA）进展中的衰老机制及其通过STAT3-FGF7轴加剧软骨下骨异常重塑的作用	首次揭示了Lepr+ SSCs通过瘦素-Lepr信号通路激活STAT3-FGF7轴促进OA进展的新机制，为OA治疗提供了新的靶点	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类OA患者中进行验证	探究骨骼干细胞衰老在骨关节炎进展中的作用及其分子机制	小鼠创伤后骨关节炎（PTOA）模型中的Lepr+骨骼干细胞	骨生物学	骨关节炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、microCT、病理分析	小鼠PTOA模型	基因表达数据、影像数据、组织病理数据	未明确说明具体样本数量（小鼠模型）