单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6941 - 6960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6941 | 2025-10-06 |
Alveolar wars: The rise of in vitro models to understand human lung alveolar maintenance, regeneration, and disease
2020-08, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.19-0433
PMID:32272001
|
综述 | 本文综述了体外人类肺泡模型在理解肺泡维持、再生和疾病机制方面的应用与发展 | 系统总结了当前单细胞RNA测序技术在揭示人类肺泡细胞异质性和疾病特异性细胞类型方面的突破，以及多种体外模型（类器官、器官芯片等）在模拟人类肺泡生物学中的创新应用 | 现有体外系统仍存在局限性，如无法完全重现体内环境的复杂性，需要进一步改进以更好地模拟人类肺泡的完整功能 | 开发更接近人类肺部的相关模型，以研究肺泡在稳态、损伤修复和疾病状态下的生物学机制 | 人类肺泡细胞、肺泡类器官、器官芯片系统和离体肺切片 | 生物医学工程 | 肺疾病（特发性肺纤维化、慢性阻塞性肺疾病、支气管肺发育不良） | 单细胞RNA测序，类器官培养，器官芯片技术，离体肺切片 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6942 | 2025-10-06 |
Advances and challenges in epigenomic single-cell sequencing applications
2020-08, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2020.01.013
PMID:32304986
|
综述 | 本文探讨表观基因组单细胞测序技术的进展与挑战 | 强调多模态单细胞测序技术在克服数据整合局限性的潜力 | 未提及具体技术实施细节和验证数据 | 分析单细胞测序技术在表观基因组研究中的应用前景 | 多细胞生理和病理生物学过程 | 表观基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6943 | 2025-10-06 |
Distinct synovial tissue macrophage subsets regulate inflammation and remission in rheumatoid arthritis
2020-08, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0939-8
PMID:32601335
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示类风湿关节炎中不同滑膜组织巨噬细胞亚群在炎症和缓解期的调控作用 | 首次在类风湿关节炎中鉴定出具有独特缓解期转录组特征的两个滑膜组织巨噬细胞亚群(MerTKTREM2和MerTKLYVE1) | 样本量相对有限，需要进一步验证这些发现 | 研究类风湿关节炎药物自由缓解期的免疫调节机制 | 滑膜组织巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组学,流式细胞分选,空间分析,功能分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 32,000个滑膜组织巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6944 | 2025-10-06 |
Heterotypic cell-cell communication regulates glandular stem cell multipotency
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2632-y
PMID:32848220
|
研究论文 | 本研究揭示腺上皮中腔细胞通过分泌TNF限制基底干细胞多能性的细胞间通讯机制 | 首次发现腔细胞通过TNF信号通路在生理条件下限制基底干细胞多能性，并鉴定出胚胎发育相关的混合分化程序 | 研究主要基于小鼠模型和类器官，人类组织中的验证尚需进一步研究 | 探究腺上皮干细胞多能性调控的细胞通讯机制 | 乳腺和前列腺腺上皮的基底细胞与腔细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 类器官培养 | NA | 基因表达数据 | 小鼠体内模型和体外类器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6945 | 2025-10-06 |
Mechanisms of stretch-mediated skin expansion at single-cell resolution
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2555-7
PMID:32728211
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率分析揭示了皮肤在拉伸作用下扩张的细胞机制 | 首次在单细胞分辨率下研究体内机械力对表皮细胞行为的影响，结合克隆分析、定量建模和单细胞RNA测序的多学科方法 | 研究主要基于小鼠模型，人类皮肤的响应机制可能有所不同 | 阐明机械拉伸如何调控皮肤表皮细胞行为和组织扩张的分子机制 | 小鼠皮肤表皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质分析, 克隆分析, 定量建模 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6946 | 2025-10-06 |
Single-cell technologies in hepatology: new insights into liver biology and disease pathogenesis
2020-08, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-020-0304-x
PMID:32483353
|
综述 | 本文综述单细胞技术在肝病研究中的应用及其对肝脏生物学和疾病发病机制的新见解 | 系统总结单细胞转录组技术在揭示肝脏细胞异质性、代谢分区和疾病发病机制中的创新应用 | NA | 探讨单细胞技术在肝病研究中的应用价值和发展前景 | 肝脏细胞（肝细胞、内皮细胞、肝星状细胞、巨噬细胞、间充质细胞等） | 单细胞组学 | 肝病（肝纤维化、肝癌等） | 单细胞转录组技术、空间转录组学、多组学方法 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6947 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics identifies spatially dysregulated expression of GRM3 and USP47 in amyotrophic lateral sclerosis
2020-08, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12597
PMID:31925813
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术识别了肌萎缩侧索硬化症中GRM3和USP47基因的空间表达失调 | 首次在携带C9orf72六核苷酸重复扩展的ALS患者尸检皮质组织中应用空间转录组学技术，并识别出跨sALS、SOD1和C9orf72病例共同失调的GRM3和USP47转录本 | 研究样本量有限，主要基于尸检脑组织，可能受到死后组织变化的影响 | 识别可能导致ALS中不同细胞类型和脑区域差异易感性的失调转录本 | 人类尸检脑组织和脊髓组织，包括C9orf72、散发性ALS和SOD1 ALS病例 | 空间转录组学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 空间转录组学，BaseScope原位杂交技术 | NA | 空间转录组数据，原位杂交数据 | 多个尸检脑区域和脊髓组织样本，包括C9orf72、散发性ALS和SOD1 ALS病例队列 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间分辨率达100微米的空间转录组学技术 |
| 6948 | 2025-10-06 |
Prototypical pacemaker neurons interact with the resident microbiota
2020-07-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1920469117
PMID:32647059
|
研究论文 | 本研究在基础后生动物中鉴定并功能表征了表达ANO/SCN/TRPM离子通道的起搏神经元，揭示了这些神经元通过免疫相关基因与微生物环境相互作用的机制 | 发现原始起搏神经元表达丰富的免疫相关基因，提出了起搏细胞进化起源的新模型——利用先天免疫成分与微生物环境相互作用 | 研究仅针对基础后生动物模型，在更高等生物中的适用性需要进一步验证 | 探究起搏神经元的进化起源及其与微生物的相互作用机制 | 基础后生动物中的起搏神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学，免疫化学，功能实验 | NA | 基因表达数据，免疫染色数据，功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6949 | 2025-10-06 |
Multimodal Analysis of Composition and Spatial Architecture in Human Squamous Cell Carcinoma
2020-07-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.05.039
PMID:32579974
|
研究论文 | 通过多模态分析揭示人类皮肤鳞状细胞癌的细胞组成、空间结构和细胞间通讯网络 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和多重离子束成像技术，发现肿瘤特异性角质形成细胞(TSK)群体及其在纤维血管微环境中的定位 | 研究样本数量有限，主要关注皮肤鳞状细胞癌，结果在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 解析皮肤鳞状细胞癌的细胞组成、空间结构和细胞间相互作用网络 | 人类皮肤鳞状细胞癌组织及匹配的正常皮肤组织 | 空间转录组学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重离子束成像,CRISPR筛选 | NA | 基因表达数据,空间定位数据,成像数据 | 一系列人类cSCC和匹配正常皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重离子束成像 | NA | NA |
| 6950 | 2025-10-06 |
A Single-Cell Transcriptomics CRISPR-Activation Screen Identifies Epigenetic Regulators of the Zygotic Genome Activation Program
2020-07-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.06.004
PMID:32634384
|
研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学和CRISPR激活技术筛选调控合子基因组激活程序的表观遗传因子 | 首次将CRISPR激活筛选与单细胞转录组学结合，在小鼠胚胎干细胞中系统鉴定ZGA调控因子 | 使用胚胎干细胞作为早期胚胎的体外替代模型，可能与真实胚胎环境存在差异 | 鉴定调控合子基因组激活程序的表观遗传调控因子 | 小鼠胚胎干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR激活 | MOFA+ | 单细胞转录组数据 | 约200,000个单细胞转录组，包含230个CRISPRa扰动 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6951 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses identify dysfunctional CD16+ CD8 T cells in smokers
2020-07-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2020.100054
PMID:33163982
|
研究论文 | 通过单细胞分析识别吸烟者中功能失调的CD16+ CD8 T细胞 | 首次在吸烟者中发现并表征了表达CD16的NK样CD8 T细胞亚群，揭示了吸烟与免疫衰老和T细胞衰老的关联 | 研究样本仅来自外周血，未涉及组织特异性免疫反应 | 识别受吸烟影响的免疫细胞并研究吸烟对免疫系统的影响 | 吸烟者和非吸烟者的外周血免疫细胞 | 单细胞生物学 | 慢性疾病 | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术，假时间分析，DNA甲基化分析 | 假时间分析模型，DNA甲基化模型 | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，表观遗传数据 | 吸烟者和非吸烟者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6952 | 2025-10-06 |
Tumors induce de novo steroid biosynthesis in T cells to evade immunity
2020-07-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17339-6
PMID:32680985
|
研究论文 | 本研究揭示肿瘤通过诱导T细胞从头合成类固醇来逃避免疫攻击的新机制 | 首次发现肿瘤能诱导T细胞从头合成类固醇，并证明这是肿瘤免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中得到验证 | 探究肿瘤诱导免疫逃逸的新机制 | T淋巴细胞和肿瘤微环境 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 转基因类固醇生成报告小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6953 | 2025-10-06 |
RNA Identification of PRIME Cells Predicting Rheumatoid Arthritis Flares
2020-07-16, The New England journal of medicine
DOI:10.1056/NEJMoa2004114
PMID:32668112
|
研究论文 | 通过纵向RNA测序识别预测类风湿关节炎发作的PRIME细胞 | 首次发现血液中CD45-CD31-PDPN+ PRIME细胞可作为类风湿关节炎发作的预测标志物 | 样本量有限，仅包含4名主要患者和19名验证患者 | 探索类风湿关节炎发作前的分子机制和预测标志物 | 类风湿关节炎患者血液样本 | 基因组学 | 类风湿关节炎 | RNA测序,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 4名主要患者（364个时间点）+ 3名额外患者（235个时间点）+ 19名验证患者 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6954 | 2025-10-06 |
CD70 expression determines the therapeutic efficacy of expanded human regulatory T cells
2020-07-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-1097-8
PMID:32665635
|
研究论文 | 本研究揭示了CD70表达在扩增的人类调节性T细胞治疗功效中的决定性作用 | 首次发现体外长期刺激后人类Tregs获得稳定CD70表达并伴随功能转变，证明CD70阻断可维持Tregs的调节活性 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探究CD27-CD70受体-配体相互作用在调节性T细胞中的功能作用 | 人类调节性T细胞 | 免疫学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高分辨率靶向单细胞RNA测序 |
| 6955 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Cellular Hierarchies and Impaired Developmental Trajectories in Pediatric Ependymoma
2020-07-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.06.004
PMID:32663469
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童室管膜瘤的细胞层次结构和发育轨迹 | 首次在室管膜瘤中揭示从未分化细胞群到神经胶质命运特化的三个谱系的发育层次结构 | NA | 研究室管膜瘤的肿瘤内异质性和发育起源 | 儿童室管膜瘤肿瘤组织 | 单细胞测序分析 | 室管膜瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6956 | 2025-10-06 |
Human CNS barrier-forming organoids with cerebrospinal fluid production
2020-07-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz5626
PMID:32527923
|
研究论文 | 本研究建立了具有选择性屏障和脑脊液分泌功能的人源脉络丛类器官 | 首次开发出能够形成选择性屏障并分泌脑脊液样液体的人源脉络丛类器官，并发现先前未知的特化上皮亚型 | NA | 建立模拟体内脉络丛功能的人类中枢神经系统屏障类器官模型 | 人源脉络丛类器官 | 类器官技术 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞转录组学，蛋白质组学 | 类器官模型 | 转录组数据，蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，蛋白质组分析 | NA | NA |
| 6957 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of alloreactive CD4+ T cells over time reveals divergent fates during gut graft-versus-host disease
2020-07-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.137990
PMID:32484791
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序研究同种异体反应性CD4+ T细胞在肠道移植物抗宿主病中的分化命运 | 首次在单细胞水平揭示GVHD过程中同种异体反应性CD4+ T细胞分化为静止状态和效应状态的异质性分化路径 | 研究基于小鼠模型，临床相关性需进一步验证 | 探究同种异体造血干细胞移植后肠道GVHD中CD4+ T细胞的分化机制 | 同种异体反应性CD4+ T细胞 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | 计算轨迹推断模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6958 | 2025-10-06 |
Analysis of endothelial-to-haematopoietic transition at the single cell level identifies cell cycle regulation as a driver of differentiation
2020-07-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02058-4
PMID:32611441
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了细胞周期调控在内皮-造血转化过程中的关键驱动作用 | 首次在单细胞水平证明细胞周期再进入是内皮细胞获得造血命运的必要条件，并鉴定CDK4/6和CDK1在此过程中的核心作用 | 使用体外hPSC分化系统模拟EHT过程，可能与体内实际发育环境存在差异 | 探索内皮-造血转化过程的分子机制 | 人多能干细胞分化的内皮细胞和早期造血细胞 | 单细胞生物学 | 造血发育疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6959 | 2025-10-06 |
Deciphering Cell Fate Decision by Integrated Single-Cell Sequencing Analysis
2020-07, Annual review of biomedical data science
IF:7.0Q1
|
综述 | 本文综述了如何通过整合单细胞测序分析来解析细胞命运决定机制 | 整合多种单细胞测序模态和计算工具，在 unprecedented 分辨率下探索细胞命运特化过程 | NA | 理解发育、再生、稳态和疾病过程中细胞命运选择的调控机制 | 多细胞生物中的细胞分化过程 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 多模态测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6960 | 2025-10-06 |
PhISCS-BnB: a fast branch and bound algorithm for the perfect tumor phylogeny reconstruction problem
2020-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa464
PMID:32657358
|
研究论文 | 提出一种快速分支定界算法PhISCS-BnB，用于从单细胞测序数据重建最可能的完美肿瘤系统发育树 | 开发了比现有方法快10-100倍且保证最优解的分支定界算法 | 未明确说明算法在更复杂数据集上的性能表现 | 解决肿瘤系统发育树重建中的计算效率问题 | 肿瘤单细胞测序数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | 分支定界算法 | 基因型矩阵 | 20个克隆系的2367个突变 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |