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当前共找到 40432 篇文献，本页显示第 6941 - 6960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6941 | 2026-03-03 |
Modulator of TMB-associated immune infiltration (MOTIF) predicts immunotherapy response and guides combination therapy
2024-03-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.01.025
PMID:38320897
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研究论文 | 开发了一种名为MOTIF的新工具，用于预测肿瘤突变负荷相关的免疫浸润，并指导免疫检查点抑制剂的治疗反应和联合疗法 | 首次提出MOTIF工具，通过整合多癌种的大规模RNA-seq数据，识别能决定CD8 T细胞浸润程度的基因，并揭示其在癌症-免疫循环中的完整性缺陷 | 研究主要基于回顾性数据，需要前瞻性临床试验进一步验证MOTIF的预测准确性 | 预测免疫检查点抑制剂的治疗反应并指导联合疗法 | 肿瘤样本和免疫细胞浸润 | 生物信息学 | 多种实体瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 9311个肿瘤样本（来自30种癌症类型）和84个人类单细胞RNA-seq数据集（来自32种实体瘤） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6942 | 2026-03-03 |
A Comprehensive Survey of Statistical Approaches for Differential Expression Analysis in Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12121947
PMID:34946896
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综述 | 本文全面综述了单细胞RNA测序研究中差异表达分析的统计方法，并对19种广泛使用的方法在11个真实数据集上进行了性能评估 | 首次系统分类和评估了从批量RNA-seq借鉴的方法及专为scRNA-seq设计的方法，通过多标准分析推荐了最佳工具 | 评估基于特定数据集和性能指标，可能无法完全覆盖所有实验条件或新兴方法 | 为单细胞RNA测序数据中的差异表达分析提供方法选择指南和性能评估 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达分析方法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6943 | 2026-03-03 |
Single-cell connectomic analysis of adult mammalian lungs
2019-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaw3851
PMID:31840053
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠、大鼠、猪和人类肺组织，以揭示成年哺乳动物肺中保守的细胞间相互作用模式，并构建了肺泡细胞群间信号传导的系统级图谱 | 首次在跨物种（小鼠、大鼠、猪、人类）水平上，利用单细胞RNA测序系统描绘了成年哺乳动物肺中保守的细胞间通讯网络，并发现肺泡I型细胞在组织稳态调控中起主要作用 | 研究主要关注成年健康肺组织的稳态机制，对疾病状态下的细胞互作变化及具体分子通路的实验验证尚待深入 | 揭示哺乳动物肺组织稳态的细胞间相互作用机制，为慢性肺病研究和肺组织再生医学提供基础 | 成年哺乳动物（小鼠、大鼠、猪、人类）的肺组织 | 单细胞组学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 跨四个物种（小鼠、大鼠、猪、人类）的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6944 | 2026-03-02 |
Single-cell and spatial transcriptome profiling identifies cellular heterogeneity and immunosuppressive tumor microenvironment in inflammatory breast cancer
2026-Mar, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.061
PMID:40460936
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示了炎性乳腺癌的细胞异质性和免疫抑制性肿瘤微环境，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次在单细胞和空间水平上全面分析炎性乳腺癌的免疫细胞组成和信号通路，发现CXCL13表达降低与免疫抑制相关，并筛选出天然产物作为免疫调节剂 | 研究样本量有限，且主要基于转录组数据，功能验证和临床转化需要进一步研究 | 分析炎性乳腺癌的病理和分子基础，以开发精准医疗策略 | 炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，荧光染色，空间分析，肿瘤-免疫细胞共培养，体内研究 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据，基因表达数据 | 未明确指定样本数量，但涉及炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | NanoString | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler用于空间分析 |
| 6945 | 2026-03-02 |
Cytoskeletal-related genes function as checkpoints for the maintenance of VSMC contractile phenotype and prevent pathological remodeling in arterial diseases
2026-Mar, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.065
PMID:40516911
|
研究论文 | 本研究构建了动脉疾病中血管平滑肌细胞表型转换的跨物种整合模型，识别了细胞骨架相关基因作为维持收缩表型的关键检查点，并验证其在病理重塑中的作用 | 通过单细胞RNA-seq数据分析，首次识别Fblim1、Tns1和Synpo2等细胞骨架相关基因作为VSMC表型转换的检查点，揭示了它们在防止病理重塑中的关键作用 | 研究主要基于公共数据集和动物模型，人类样本验证有限，且机制细节需进一步探索 | 构建VSMC表型转换的整合模型，识别调控基因并验证其在动脉疾病病理重塑中的功能 | 血管平滑肌细胞（VSMC）、动脉疾病（包括动脉粥样硬化和主动脉瘤） | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 公共单细胞RNA-seq数据集、实验动物动脉瘤样本、PDGF-BB处理的VSMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6946 | 2026-03-02 |
Spatial Single-cell Transcriptome Atlas of Mouse Thymus Reveals the T Lymphocyte Dynamics During Development
2026-Mar-01, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag020
PMID:41764407
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研究论文 | 本研究通过空间单细胞转录组图谱揭示了小鼠胸腺在发育过程中的T淋巴细胞动态变化 | 首次构建了小鼠胸腺在四个发育阶段的空间单细胞转录组图谱，揭示了胸腺细胞组成和转录谱的动态重塑，特别是DP-T细胞亚群的空间分布和DC-DP-2相互作用的MHC-II通路富集 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本；样本量相对有限（四个时间点）；空间分析分辨率可能受技术限制 | 解析胸腺微环境中淋巴细胞发育的分子动力学和空间组织 | 小鼠胸腺组织在3、9、15和33周四个发育阶段的免疫细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 空间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 四个发育阶段（3、9、15、33周）的小鼠胸腺样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6947 | 2026-03-02 |
Atherosclerotic Fibrous Plaques in Women Present ECM Remodeling Linked to TGF-β
2026-Feb-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327624
PMID:41641539
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研究论文 | 本研究揭示了女性与男性在晚期动脉粥样硬化纤维斑块中具有不同的临床和分子特征，特别是女性纤维斑块以平滑肌细胞驱动的细胞外基质重塑和TGF-β反应为特征 | 首次系统性地结合组织学、临床特征及多组学数据（蛋白质、bulk RNA、单细胞RNA、DNA甲基化），揭示了性别差异在动脉粥样硬化纤维斑块分子机制中的作用，并利用空间转录组学定位了基因表达模式，实验验证了TGF-β/SMAD3通路在女性偏向性机制中的关键作用 | 研究样本来源于颈动脉内膜切除术患者，可能无法完全代表其他血管床的斑块特性；研究为观察性设计，因果关系需进一步实验验证 | 探究男性和女性在组织学确定的纤维斑块中的分子驱动因素差异，以理解斑块侵蚀的分子机制并为动脉粥样硬化治疗提供潜在靶点 | 人类晚期动脉粥样硬化斑块（来自颈动脉内膜切除术患者） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, DNA甲基化测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | RNA-seq数据, 甲基化数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 | 1889个动脉粥样硬化斑块（1309例男性，580例女性） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6948 | 2026-03-02 |
A beneficial environment promotes immune resilience through epigenetic regulation
2026-Feb-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady7317
PMID:41758935
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研究论文 | 本研究探讨了农场粉尘暴露如何通过表观遗传重编程增强免疫韧性，从而减轻过敏性肺部炎症 | 首次揭示了有益环境暴露通过PPARγ信号通路维持的组蛋白去乙酰化酶活性，对单核细胞来源的巨噬细胞进行表观遗传重编程的机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证有限；长期效应和临床转化潜力需进一步研究 | 探究有益环境暴露对免疫系统的影响机制，寻找哮喘预防新策略 | 小鼠过敏性炎症模型、骨髓来源巨噬细胞、人类细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq | NA | NA |
| 6949 | 2026-02-28 |
Correction: CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42146-2
PMID:41748707
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6950 | 2026-03-02 |
BST2 promotes esophageal squamous cell carcinoma progression by mediating the cell-cell interaction between cancer cells and cancer-associated fibroblasts
2026-Feb-26, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.012
PMID:41763536
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研究论文 | 本研究探讨了BST2在食管鳞状细胞癌中通过介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞之间的细胞间相互作用促进癌症进展的机制 | 首次建立了通过直接共培养骨髓间充质干细胞与食管鳞癌细胞生成CAF样细胞的方法，并利用此方法结合单细胞RNA测序数据揭示了BST2在癌细胞与CAFs相互作用中的关键作用 | 研究主要基于体外共培养模型和公共数据库分析，缺乏体内实验验证BST2在肿瘤微环境中的具体作用机制 | 探究BST2在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞相互作用的机制 | 食管鳞状细胞癌细胞、骨髓来源的间充质干细胞、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤生物学 | 食管鳞状细胞癌 | cDNA微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 共培养模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床病理数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了公共单细胞RNA测序数据库和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6951 | 2026-03-02 |
Tertiary lymphoid structures correlate with reduced recurrence risk and enhanced antitumor immunity in esophageal squamous cell carcinoma with pathologic non-complete response to neoadjuvant chemoimmunotherapy
2026-Feb-25, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00748-6
PMID:41736069
|
研究论文 | 本研究探讨了三级淋巴结构（TLS）在食管鳞状细胞癌（ESCC）新辅助化疗免疫治疗后非病理完全缓解（non-pCR）患者中的预后价值和免疫特征 | 首次在non-pCR ESCC患者中系统评估TLS与术后复发风险及抗肿瘤免疫的关系，并利用单细胞测序和多色免疫组化揭示TLS内免疫细胞的空间定位和相互作用模式 | 研究为回顾性分析，样本量有限，且未涉及TLS形成的机制或干预策略 | 评估TLS在non-pCR ESCC中的预后意义和免疫调控作用 | 接受新辅助化疗免疫治疗的局部晚期食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞测序、批量RNA测序、多色免疫组化 | NA | 单细胞数据、批量RNA测序数据、免疫组化图像 | 未明确指定样本数量，但涉及临床病理特征、复发事件和生存结果分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6952 | 2026-03-02 |
An integrative spatial multi-omic workflow for unified analysis of tumor tissue
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101306
PMID:41687601
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研究论文 | 本研究提出了一种名为SMINT的空间多组学整合工作流，用于统一分析IDH突变型弥漫性胶质瘤组织，结合空间转录组学和空间代谢组学数据 | 开发了一个创新的空间多组学整合工作流，能够将空间转录组学和空间代谢组学数据在共同坐标框架下进行细胞分割和配准，并识别出肿瘤浸润边缘的独特细胞邻域 | 仅使用细胞核分割策略时仅包含40%的细胞转录本，且未考虑多核细胞的分割场景 | 开发并验证一个整合空间多组学数据的工作流，以深入理解IDH突变型胶质瘤的肿瘤微环境 | IDH突变型弥漫性胶质瘤组织 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 6953 | 2026-03-02 |
The Proximity of PD-1-CD103+ Tissue-Resident CD8+ T Cells to Tumor Cells Is Correlated with Improved Clinical Outcomes in Patients with Cholangiocarcinoma
2026-Feb-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18040680
PMID:41749934
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研究论文 | 本研究探讨了胆管癌中CD8+组织驻留记忆T细胞的激活表型及其与肿瘤细胞的空间分布如何影响抗肿瘤免疫监视并预测临床结局 | 结合多重免疫组化和单细胞RNA测序，首次量化了PD-1-CD103+ CD8+ T细胞与肿瘤细胞的空间邻近性，并将其确定为改善临床结局的独立预测因子 | NA | 阐明胆管癌免疫微环境中CD8+ T细胞的激活状态和空间定位对预后的影响 | 胆管癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 胆管癌 | 多重免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6954 | 2026-03-02 |
Signatures of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Uncovered by Integrative Multi-Omics Analysis
2026-Feb-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18040687
PMID:41749940
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析揭示了胰腺导管腺癌的分子特征 | 成功将分子特征归因于不同的细胞类型群体，并识别出与肿瘤发生活性和免疫抑制相关的分子特征 | 未明确说明样本选择或数据整合的具体限制 | 更好地表征胰腺导管腺癌的分子特征以改善临床结果 | 胰腺导管腺癌肿瘤组织及配对正常邻近组织 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 140个肿瘤组织、67个配对正常邻近组织、73个肿瘤组织的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6955 | 2026-03-02 |
AZD4635 Targets cAMP/CREB Axis to Salvage PARPi-Induced Immune Evasion and Enhance Antitumor Efficacy in Ovarian Cancer
2026-Feb-19, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics18020257
PMID:41754998
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研究论文 | 本研究探讨了PARP抑制剂与A2A受体拮抗剂联合治疗卵巢癌的机制，通过靶向cAMP/CREB轴克服免疫逃逸并增强抗肿瘤效果 | 首次揭示PARPi耐药卵巢癌细胞中腺苷受体上调导致免疫抑制，并提出联合A2ARa靶向cAMP/CREB轴的新型治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化效果需进一步验证 | 探索PARPi与A2ARa联合治疗在卵巢癌中的抗肿瘤机制及免疫微环境调控 | 卵巢癌细胞和小鼠肿瘤模型 | 癌症免疫治疗 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，涉及小鼠模型和体外细胞实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6956 | 2026-03-02 |
Upregulated ZBP1 Is Associated with B-Cell Dysregulation in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Feb-17, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020451
PMID:41751350
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学分析，揭示了ZBP1在系统性红斑狼疮（SLE）患者B细胞中上调，并与B细胞活化、疾病活动度相关，提示其可能通过调控细胞周期通路参与SLE发病机制 | 首次系统性地将先天免疫感受器ZBP1与SLE中的B细胞功能失调联系起来，并通过单细胞转录组学揭示了其在多个B细胞亚群中的表达模式，同时结合功能实验验证了其对B细胞活化、浆细胞分化和抗体产生的调控作用 | 研究主要基于公共数据集和体外实验，直接因果关系尚未完全确立，缺乏体内模型验证和更深入的机制研究 | 探究ZBP1在系统性红斑狼疮（SLE）B细胞失调中的作用及其与疾病活动的关联 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者的B细胞（包括初始B细胞、记忆B细胞、年龄相关B细胞和浆细胞） | 生物信息学与免疫学 | 系统性红斑狼疮 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因敲低实验 | NA | 转录组数据（批量RNA-seq和单细胞RNA-seq） | 基于多个公共数据集（GSE61635, GSE235658, GSE136035, GSE163497），具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6957 | 2026-03-02 |
Identification and Mechanism Research of Oxidative Stress-Related Biomarkers in Oral Lichen Planus
2026-Feb-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020420
PMID:41751319
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别了与口腔扁平苔藓相关的氧化应激生物标志物，并探索了其潜在机制 | 首次整合多个数据集和单细胞RNA测序技术，系统性地识别了TGFB1、KLF4、TNF、NQO1和MMP9作为口腔扁平苔藓的氧化应激相关生物标志物，并预测了潜在的治疗化合物和RNA修饰位点 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学预测，实验验证仅限于qRT-PCR，缺乏更深入的体内外功能验证 | 识别和表征口腔扁平苔藓中与氧化应激相关的分子标志物及其作用机制 | 口腔扁平苔藓组织样本及相关基因表达数据 | 生物信息学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序，定量实时PCR，分子对接模拟，RNA修饰分析 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 来自GSE38616和GSE211630数据集的数据，涉及467个氧化应激相关基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6958 | 2026-03-02 |
Integrated Weighted Gene Co-Expression Network and Single-Cell RNA Sequencing Analyses Reveal the Prognostic Significance of Hypoxia in Gastric Cancer
2026-Feb-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14020425
PMID:41751324
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研究论文 | 本研究通过整合加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序分析，揭示了缺氧在胃癌中的预后意义及其与免疫抑制肿瘤微环境的关联 | 首次通过整合WGCNA、Cox回归、LASSO回归和单细胞RNA测序分析，构建了一个由四个基因组成的缺氧相关预后特征，并揭示了该特征在癌症相关成纤维细胞中的特异性表达 | 研究样本量有限，单细胞RNA测序分析的样本规模未明确说明，且qPCR验证仅在5对组织样本中进行 | 阐明缺氧在胃癌中的预后意义及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 胃癌患者组织样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，qPCR | WGCNA，Cox回归，LASSO回归 | 基因表达数据 | 5对胃癌及癌旁组织（用于qPCR验证），其他分析样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6959 | 2026-03-02 |
Genomic Landscape and Therapeutic Implications of Metaplastic Breast Carcinoma: Insights from a Nationwide Database Including Diagnostic Mimickers
2026-Feb-12, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19020311
PMID:41754851
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研究论文 | 本研究利用日本全国性数据库分析了化生性乳腺癌的基因组景观，探索了其诊断模糊性和治疗反应的分子基础 | 整合了大规模基因组数据和单细胞RNA测序分析，揭示了化生性乳腺癌中独特的恶性细胞亚群及其与形态多样性的关联 | 治疗关联基于有限队列，需要前瞻性验证以确认临床效用 | 表征化生性乳腺癌的基因组特征并探索其诊断和治疗响应的分子机制 | 化生性乳腺癌患者及其组织学模拟肿瘤（如血管肉瘤和肌上皮癌） | 基因组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，基因组分析 | NA | 基因组数据，临床数据，单细胞转录组数据 | 123例化生性乳腺癌病例，19例血管肉瘤，8例肌上皮癌，以及3274个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6960 | 2026-03-02 |
Decoding Alzheimer's Disease One Cell Class at a Time
2026-Feb-10, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-026-01685-y
PMID:41667797
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学和空间转录组学在阿尔茨海默病细胞分类中的应用，并探讨了整合转录组、结构和功能数据的重要性 | 强调整合转录组学、解剖学、生理学和转化框架来重新定义阿尔茨海默病的遗传、分子和细胞基础 | NA | 总结单细胞和空间转录组学在阿尔茨海默病细胞分类中的发现，并推动更整合的研究方法 | 哺乳动物大脑中的基因定义细胞簇，特别是在阿尔茨海默病状态下的变化 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞基因组学, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |