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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6921 | 2025-10-06 |
Inflammatory Signals Induce AT2 Cell-Derived Damage-Associated Transient Progenitors that Mediate Alveolar Regeneration
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.06.020
PMID:32750316
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术揭示了肺泡再生过程中AT2细胞衍生的损伤相关短暂祖细胞(DATPs)的作用机制 | 首次发现并表征了肺泡再生过程中的新型AT2细胞亚群DATPs,揭示了IL-1β/HIF1α/糖酵解通路在调控干细胞命运中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类肺泡再生的机制可能有所不同 | 阐明肺泡组织再生过程中细胞命运转换的分子机制 | 肺泡谱系细胞,特别是AT2细胞及其衍生的DATP细胞 | 单细胞生物学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序,体内谱系追踪,类器官模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6922 | 2025-10-06 |
Therapy-Induced Evolution of Human Lung Cancer Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2020-09-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.07.017
PMID:32822576
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示靶向治疗诱导的人类肺癌演化过程 | 首次在靶向治疗前后对转移性肺癌进行纵向单细胞RNA测序分析,揭示了治疗诱导的原始细胞状态转变和肿瘤微环境动态变化 | 样本量相对有限(30名患者),仅针对转移性肺癌 | 探究靶向治疗如何影响肺癌细胞和肿瘤微环境的演化 | 转移性肺癌患者治疗前后的肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30名患者的49个临床活检样本,包含超过20,000个癌细胞和肿瘤微环境细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6923 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Vascular Smooth Muscle Cell Phenotype Modulation in Marfan Syndrome Aortic Aneurysm
2020-09, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314670
PMID:32698686
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究马凡综合征主动脉瘤中血管平滑肌细胞的表型调控动态 | 首次在马凡综合征主动脉瘤中鉴定出转录组调控的平滑肌细胞亚群,并揭示其特异性基因特征和TGF-β信号通路的作用机制 | 研究样本主要来自小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明马凡综合征主动脉瘤发展过程中血管平滑肌细胞表型调控的时空动态 | Fbn1C1041G/+马凡综合征模型小鼠和人类马凡综合征患者的主动脉组织 | 单细胞转录组学 | 马凡综合征主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 马凡综合征模型小鼠和人类患者主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6924 | 2025-10-06 |
Adaptable haemodynamic endothelial cells for organogenesis and tumorigenesis
2020-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2712-z
PMID:32908310
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研究论文 | 本研究通过ETV2转录因子重编程成熟内皮细胞,创建了可适应器官发育和肿瘤形成的血管化平台 | 首次通过ETV2瞬时重激活将成熟内皮细胞重置为可塑性血管生成细胞,建立了无需合成半透膜的器官-血管网络模型 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在更复杂的生理环境中验证 | 开发能够模拟生理血管化的平台,用于器官修复和肿瘤靶向研究 | 人类内皮细胞、小鼠模型、人类胰腺胰岛、大鼠肠道和人结肠类器官 | 组织工程 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、表观遗传分析、三维培养 | 器官-血管网络模型 | 基因表达数据、表观遗传数据、影像数据 | 人类内皮细胞、小鼠模型、多种人类器官类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6925 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of colonic CD8+ T cells in ulcerative colitis
2020-09, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-1003-4
PMID:32747828
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序和质谱流式技术构建了健康人群和溃疡性结肠炎患者结肠CD8+ T细胞的综合图谱 | 首次系统揭示结肠CD8+ T细胞的异质性,发现表达IL-26的终末分化功能障碍性CD8+ T细胞具有调节功能 | 研究样本量未明确说明,人类源化小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病 | 阐明健康状态和溃疡性结肠炎中结肠CD8+ T细胞的表型特征和功能机制 | 人类结肠CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组测序, T细胞受体谱分析, 质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
6926 | 2025-10-06 |
The activation trajectory of plasmacytoid dendritic cells in vivo during a viral infection
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0731-4
PMID:32690951
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研究论文 | 通过多技术联用揭示浆细胞样树突状细胞在病毒感染过程中的体内激活轨迹 | 首次证明同一pDC可顺序执行干扰素产生和T细胞激活功能,并发现其受时空精密调控的新机制 | 研究仅限于小鼠巨细胞病毒感染模型,未验证其他病毒或人类系统 | 解析浆细胞样树突状细胞在病毒感染过程中的体内功能分化机制 | 小鼠浆细胞样树突状细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,CD4 T细胞激活试验 | Ifnb1报告基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据,流式数据,显微图像 | 病毒感染动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6927 | 2025-10-06 |
The transcription factor Hhex cooperates with the corepressor Tle3 to promote memory B cell development
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0713-6
PMID:32601467
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9筛选发现转录因子Hhex与共抑制因子Tle3协同调控记忆B细胞分化 | 首次发现Hhex-Tle3复合物在记忆B细胞分化中的关键作用,并揭示其通过调控Bcl-6/Bcl-2通路的新机制 | NA | 探索记忆B细胞分化过程中的关键转录调控因子 | 生发中心B细胞和记忆B细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6928 | 2025-10-06 |
Fgfr3 Is a Positive Regulator of Osteoblast Expansion and Differentiation During Zebrafish Skull Vault Development
2020-09, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4042
PMID:32379366
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研究论文 | 本研究通过构建fgfr3功能缺失斑马鱼模型,揭示了Fgfr3在颅骨发育过程中对成骨细胞扩增和分化的正向调控作用 | 首次构建了fgfr3功能缺失斑马鱼模型,并结合活体成像和单细胞RNA测序技术分析成骨细胞谱系 | 研究仅限于斑马鱼模型,在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究FGFR3在颅骨穹隆发育中的具体作用机制 | 斑马鱼颅骨发育过程中的成骨细胞 | 发育生物学 | 颅骨发育缺陷 | 单细胞RNA测序,活体成像 | 斑马鱼基因敲除模型 | 基因表达数据,影像数据 | fgfr3突变斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6929 | 2025-10-06 |
The Long Journey from Diagnosis to Therapy
2020-08-31, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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自传体评论 | 作者回顾了40年来从孟德尔疾病诊断到单基因疾病治疗的个人科学历程 | 通过个人经历展示了遗传学领域从基础诊断到精准治疗的演变历程 | 基于个人视角,缺乏系统性数据支持 | 回顾人类遗传学发展历程并展望未来方向 | 杜氏肌营养不良症及其他遗传疾病 | 遗传学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞测序,体细胞CRISPR编辑 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6930 | 2025-10-06 |
Ageing compromises mouse thymus function and remodels epithelial cell differentiation
2020-08-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.56221
PMID:32840480
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠衰老过程中胸腺功能衰退的细胞机制,发现前体细胞是衰老的主要靶标 | 首次结合单细胞RNA测序和谱系追踪技术,揭示胸腺上皮前体细胞在衰老过程中的特异性变化机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究衰老过程中胸腺功能衰退的分子和细胞机制 | 小鼠胸腺组织和胸腺上皮细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA-seq, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6931 | 2025-10-06 |
OscoNet: inferring oscillatory gene networks
2020-Aug-21, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03561-y
PMID:32838730
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研究论文 | 提出OscoNet方法,用于从单细胞RNA测序数据中推断振荡基因网络 | 改进了Oscope的优化方案,提供了经过良好校准的非参数假设检验来选择振荡基因 | 仅基于单细胞RNA测序数据,缺乏时间序列信息 | 开发从快照单细胞数据中检测振荡基因网络的稳健方法 | 振荡基因及其网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数假设检验 | 基因表达数据 | 三个真实数据集和合成数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6932 | 2025-10-06 |
Human Lung Conventional Dendritic Cells Orchestrate Lymphoid Neogenesis during Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2020-08-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.201906-1123OC
PMID:32255375
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类肺髓样细胞的异质性,并发现慢性阻塞性肺疾病中常规树突状细胞2型通过OX40L-OX40轴诱导T滤泡辅助样细胞,参与三级淋巴器官形成 | 首次在COPD患者中发现cDC2细胞具有独特的迁移特征,并通过OX40L-OX40信号轴诱导Tfh样细胞,揭示了其在三级淋巴器官形成中的新机制 | 研究样本量有限,主要聚焦晚期COPD患者,机制研究仍需进一步验证 | 探究肺树突状细胞在慢性阻塞性肺疾病中诱导T滤泡辅助细胞及三级淋巴器官形成的机制 | 人类肺组织样本,包括对照组和COPD患者的髓样细胞和T细胞 | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选,成像分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,组织成像数据 | 对照组和GOLD IV期COPD患者肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6933 | 2025-10-06 |
Knowledge-primed neural networks enable biologically interpretable deep learning on single-cell sequencing data
2020-08-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02100-5
PMID:32746932
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研究论文 | 提出了一种基于生物网络的知识引导神经网络方法,在单细胞测序数据上实现可解释的深度学习 | 将深度学习与生物网络结合,使网络节点对应分子实体,边对应调控相互作用,提供了生物学机制解释 | NA | 开发可解释的深度学习方法,在保持预测性能的同时提供生物学机制洞察 | 癌症和免疫细胞的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 知识引导神经网络(KPNN) | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6934 | 2025-10-06 |
Chronic myelomonocytic leukaemia stem cell transcriptomes anticipate disease morphology and outcome
2020-Aug, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2020.102904
PMID:32763828
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析慢性粒单核细胞白血病干细胞转录组特征及其与疾病形态和预后的关系 | 首次在单细胞水平揭示CMML干细胞转录组异质性,发现干细胞转录组特征可预测疾病形态和临床结局 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究慢性粒单核细胞白血病干细胞转录组特征及其临床意义 | 慢性粒单核细胞白血病患者和健康对照的Lin-CD34+CD38-干细胞 | 单细胞转录组学 | 慢性粒单核细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6826个Lin-CD34+CD38-干细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的超高通量10x平台 |
6935 | 2025-10-06 |
Alveolar wars: The rise of in vitro models to understand human lung alveolar maintenance, regeneration, and disease
2020-08, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.19-0433
PMID:32272001
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综述 | 本文综述了体外人类肺泡模型在理解肺泡维持、再生和疾病机制方面的应用与发展 | 系统总结了当前单细胞RNA测序技术在揭示人类肺泡细胞异质性和疾病特异性细胞类型方面的突破,以及多种体外模型(类器官、器官芯片等)在模拟人类肺泡生物学中的创新应用 | 现有体外系统仍存在局限性,如无法完全重现体内环境的复杂性,需要进一步改进以更好地模拟人类肺泡的完整功能 | 开发更接近人类肺部的相关模型,以研究肺泡在稳态、损伤修复和疾病状态下的生物学机制 | 人类肺泡细胞、肺泡类器官、器官芯片系统和离体肺切片 | 生物医学工程 | 肺疾病(特发性肺纤维化、慢性阻塞性肺疾病、支气管肺发育不良) | 单细胞RNA测序,类器官培养,器官芯片技术,离体肺切片 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6936 | 2025-10-06 |
Advances and challenges in epigenomic single-cell sequencing applications
2020-08, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2020.01.013
PMID:32304986
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综述 | 本文探讨表观基因组单细胞测序技术的进展与挑战 | 强调多模态单细胞测序技术在克服数据整合局限性的潜力 | 未提及具体技术实施细节和验证数据 | 分析单细胞测序技术在表观基因组研究中的应用前景 | 多细胞生理和病理生物学过程 | 表观基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
6937 | 2025-10-06 |
Distinct synovial tissue macrophage subsets regulate inflammation and remission in rheumatoid arthritis
2020-08, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0939-8
PMID:32601335
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示类风湿关节炎中不同滑膜组织巨噬细胞亚群在炎症和缓解期的调控作用 | 首次在类风湿关节炎中鉴定出具有独特缓解期转录组特征的两个滑膜组织巨噬细胞亚群(MerTKTREM2和MerTKLYVE1) | 样本量相对有限,需要进一步验证这些发现 | 研究类风湿关节炎药物自由缓解期的免疫调节机制 | 滑膜组织巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组学,流式细胞分选,空间分析,功能分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 32,000个滑膜组织巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6938 | 2025-10-06 |
Heterotypic cell-cell communication regulates glandular stem cell multipotency
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2632-y
PMID:32848220
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研究论文 | 本研究揭示腺上皮中腔细胞通过分泌TNF限制基底干细胞多能性的细胞间通讯机制 | 首次发现腔细胞通过TNF信号通路在生理条件下限制基底干细胞多能性,并鉴定出胚胎发育相关的混合分化程序 | 研究主要基于小鼠模型和类器官,人类组织中的验证尚需进一步研究 | 探究腺上皮干细胞多能性调控的细胞通讯机制 | 乳腺和前列腺腺上皮的基底细胞与腔细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 类器官培养 | NA | 基因表达数据 | 小鼠体内模型和体外类器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
6939 | 2025-10-06 |
Mechanisms of stretch-mediated skin expansion at single-cell resolution
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2555-7
PMID:32728211
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研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率分析揭示了皮肤在拉伸作用下扩张的细胞机制 | 首次在单细胞分辨率下研究体内机械力对表皮细胞行为的影响,结合克隆分析、定量建模和单细胞RNA测序的多学科方法 | 研究主要基于小鼠模型,人类皮肤的响应机制可能有所不同 | 阐明机械拉伸如何调控皮肤表皮细胞行为和组织扩张的分子机制 | 小鼠皮肤表皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质分析, 克隆分析, 定量建模 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6940 | 2025-10-06 |
Single-cell technologies in hepatology: new insights into liver biology and disease pathogenesis
2020-08, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-020-0304-x
PMID:32483353
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综述 | 本文综述单细胞技术在肝病研究中的应用及其对肝脏生物学和疾病发病机制的新见解 | 系统总结单细胞转录组技术在揭示肝脏细胞异质性、代谢分区和疾病发病机制中的创新应用 | NA | 探讨单细胞技术在肝病研究中的应用价值和发展前景 | 肝脏细胞(肝细胞、内皮细胞、肝星状细胞、巨噬细胞、间充质细胞等) | 单细胞组学 | 肝病(肝纤维化、肝癌等) | 单细胞转录组技术、空间转录组学、多组学方法 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |