单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 6921 - 6940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6921 | 2024-10-21 |
Single-cell mRNA sequencing of giant panda (Ailuropoda melanoleuca) seminoma reveals the cellular and molecular characteristics of tumour cells
2024-01, Veterinary medicine and science
IF:1.8Q2
DOI:10.1002/vms3.1348
PMID:38227708
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研究论文 | 研究使用单细胞mRNA测序技术分析大熊猫睾丸精原细胞瘤的细胞和分子特征 | 首次利用单细胞RNA测序技术分析大熊猫睾丸肿瘤的细胞状态和分子机制 | 样本量较小，仅基于一只大熊猫的睾丸肿瘤 | 探讨大熊猫睾丸精原细胞瘤的细胞和分子特征 | 大熊猫睾丸精原细胞瘤的细胞和分子机制 | 数字病理学 | 其他疾病 | 单细胞mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一只大熊猫的睾丸肿瘤样本 |
| 6922 | 2024-10-21 |
EAAT3 impedes oligodendrocyte remyelination in chronic cerebral hypoperfusion-induced white matter injury
2024-01, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14487
PMID:37803915
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研究论文 | 研究EAAT3在慢性脑低灌注引起的白质损伤中对少突胶质细胞再髓鞘化的影响 | 首次证明慢性脑低灌注中异常高水平的少突胶质细胞EAAT3会损害少突胶质前体细胞的再髓鞘化作用，从而阻碍白质修复和功能恢复 | NA | 探讨EAAT3在慢性脑低灌注引起的白质损伤中的作用及其对少突胶质细胞再髓鞘化的影响 | 少突胶质细胞、少突胶质前体细胞、脑白质 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、Western blot | NA | RNA序列、蛋白质表达 | 使用小鼠模型进行研究，包括脑损伤模型和脑低灌注模型 |
| 6923 | 2024-10-21 |
A relay velocity model infers cell-dependent RNA velocity
2024-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01728-5
PMID:37012448
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研究论文 | 本文介绍了一种名为cellDancer的可扩展深度神经网络，用于从单细胞RNA测序数据中推断细胞依赖的RNA速度 | cellDancer通过局部推断每个细胞的速度，并将其邻近细胞的速度传递，从而提供单细胞分辨率的RNA速度动力学推断 | NA | 克服现有RNA速度模型在多阶段或多谱系细胞状态转换实验中的局限性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞状态转换 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | RNA测序数据 | NA |
| 6924 | 2024-10-21 |
Anoikis-related CTNND1 is associated with immuno-suppressive tumor microenvironment and predicts unfavorable immunotherapeutic outcome in non-small cell lung cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.89542
PMID:38169514
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研究论文 | 研究探讨了与细胞凋亡相关的基因CTNND1在非小细胞肺癌中的表达及其与肿瘤微环境和免疫治疗结果的关系 | 首次揭示了CTNND1作为预测非小细胞肺癌免疫治疗反应的新型生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步的临床验证 | 探索细胞凋亡相关基因与非小细胞肺癌肿瘤微环境和免疫治疗结果的关系 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 多个公共数据库和内部队列的非小细胞肺癌样本 |
| 6925 | 2024-10-21 |
Establishment of a tumor-associated fibroblast associated gene score based on scRNA-seq to predict prognosis in patients with triple-negative breast cancer
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311801
PMID:39418248
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，建立了与肿瘤相关成纤维细胞相关的基因评分，用于预测三阴性乳腺癌患者的预后 | 首次基于单细胞RNA测序数据，建立了与肿瘤相关成纤维细胞相关的基因评分，并验证了其与三阴性乳腺癌患者预后的相关性 | 研究仅基于特定数据集，结果的普适性有待进一步验证 | 研究肿瘤微环境中肿瘤相关成纤维细胞的异质性，并建立基因评分以预测三阴性乳腺癌患者的预后 | 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的肿瘤相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于GSE118389和GSE103091数据集，涉及多个三阴性乳腺癌患者的样本 |
| 6926 | 2024-10-21 |
Mapping inherited genetic variation with opposite effects on autoimmune disease and cancer identifies candidate drug targets associated with the anti-tumor immune response
2023-Dec-28, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.12.23.23300491
PMID:38234717
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研究论文 | 本文通过系统搜索具有相反效应的遗传变异，识别出与抗肿瘤免疫反应相关的潜在药物靶点 | 本文首次通过大规模的基因组关联研究，结合跨疾病的元分析，识别出与癌症和自身免疫疾病相反效应的遗传变异，并将其映射到潜在的免疫治疗靶点 | 本文主要依赖于基因组关联研究和元分析，未进行体内或体外实验验证 | 通过遗传证据识别潜在的癌症免疫治疗靶点 | 乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌、子宫内膜癌以及七种自身免疫/自身炎症疾病 | 生物信息学 | 癌症 | 全基因组关联研究 (GWAS) | NA | 基因组数据 | 240,540 例癌症病例和 317,000 例对照，以及 112,631 例自身免疫/自身炎症疾病病例和 895,386 例对照 |
| 6927 | 2024-10-21 |
CellBiAge: Improved single-cell age classification using data binarization
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113500
PMID:38032797
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研究论文 | 本文开发了一种名为CellBiAge的机器学习管道，用于通过单细胞转录组学对小鼠脑细胞的年龄进行分类 | 通过基因表达值的二值化显著提高了不同模型、技术和脑区的测试性能，并识别了潜在的与年龄相关的基因 | NA | 开发一种准确的方法来预测特定细胞类型的年龄，以理解衰老的异质性和评估 rejuvenation 策略 | 小鼠脑细胞的年龄分类 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 6928 | 2024-10-21 |
INVADEseq to identify cell-adherent or invasive bacteria and the associated host transcriptome at single-cell-level resolution
2023-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-023-00888-7
PMID:37789194
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为INVADEseq的新方法，用于在单细胞水平分辨率下识别细胞粘附或侵袭性细菌及其相关宿主转录组 | INVADEseq方法通过引入针对细菌16S rRNA基因的引物，克服了传统scRNAseq技术无法捕获细菌RNA的局限性 | NA | 开发一种能够在单细胞水平上同时分析宿主和细菌转录组的新技术 | 人类肿瘤细胞系和患者肿瘤样本中的细菌及其相关宿主转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 人类肿瘤细胞系和患者肿瘤样本 |
| 6929 | 2024-10-21 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify a macrophage population associated with skeletal muscle fibrosis
2023-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.18.537253
PMID:37131694
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组学和空间转录组学技术，识别与骨骼肌纤维化相关的巨噬细胞群体 | 发现了六个新的巨噬细胞集群，这些集群与传统的M1或M2巨噬细胞激活定义不符，并揭示了spp1在肌营养不良中调节基质祖细胞和巨噬细胞相互作用的关键作用 | 研究主要集中在小鼠模型和人类肌肉活检样本上，可能无法完全代表所有肌肉退行性疾病的情况 | 探讨巨噬细胞在肌肉退行性疾病中的作用，特别是其在肌肉纤维化中的作用 | 骨骼肌中的巨噬细胞及其在肌肉退行性疾病中的分子特征 | 数字病理学 | 肌肉退行性疾病 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和人类肌肉活检样本 |
| 6930 | 2024-10-21 |
Virus infection pattern imprinted and diversified the differentiation of T-cell memory in transcription and function
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1334597
PMID:38264657
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研究论文 | 研究比较了由不同病毒（CMV、EBV和SARS-CoV-2）诱导的记忆T细胞的转录组和功能差异 | 发现CD28和CTLA4可作为评估T细胞抗病毒能力的连续指标，并提出REL是CMV特异性T细胞产生细胞因子的主要调控因子 | NA | 理解不同病毒特异性记忆T细胞的差异，为开发新的抗病毒治疗策略提供基础 | 由CMV、EBV和SARS-CoV-2诱导的记忆T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 由CMV、EBV和SARS-CoV-2诱导的记忆T细胞样本 |
| 6931 | 2024-10-21 |
ATF5 promotes malignant T cell survival through the PI3K/AKT/mTOR pathway in cutaneous T cell lymphoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1282996
PMID:38223508
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研究论文 | 研究探讨了转录因子ATF5在皮肤T细胞淋巴瘤中的作用及其通过PI3K/AKT/mTOR通路促进恶性T细胞生存的机制 | 首次揭示了ATF5在皮肤T细胞淋巴瘤中的肿瘤特异性高表达及其促进肿瘤生存的机制 | 研究仅限于两个CTCL细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 识别皮肤T细胞淋巴瘤中肿瘤特异性的转录因子 | 皮肤T细胞淋巴瘤中的恶性T细胞 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 两个CTCL细胞系Myla和H9 |
| 6932 | 2024-10-21 |
Comprehensive analysis of senescence-associated genes in sepsis based on bulk and single-cell sequencing data
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1322221
PMID:38259686
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞测序数据分析了与脓毒症相关的衰老相关基因，并开发了一种基于关键基因的脓毒症诊断模型 | 本文首次通过综合分析批量和单细胞测序数据，揭示了衰老相关基因与脓毒症之间的关联，并开发了一种高可靠性的诊断模型 | 本文仅使用了两个RNA表达数据集，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨衰老相关基因与脓毒症之间的关系，并开发一种新的脓毒症诊断模型 | 衰老相关基因、脓毒症患者、健康对照组 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | 无监督聚类分析、加权基因共表达网络分析 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 两个RNA表达数据集（GSE28750和GSE57065），具体样本量未详细说明 |
| 6933 | 2024-10-21 |
Single-cell sequencing reveals an important role of SPP1 and microglial activation in age-related macular degeneration
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1322451
PMID:38259505
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研究论文 | 研究衰老相关细胞因子在年龄相关性黄斑变性中的作用 | 揭示了SPP1和微胶质细胞激活在年龄相关性黄斑变性中的重要作用，并提出SPP1可能成为潜在的治疗靶点 | 需要更多的体外和体内研究来验证结果和治疗效果 | 探讨衰老相关细胞因子在年龄相关性黄斑变性病理生理中的作用 | 人类视网膜神经节细胞和年龄相关性黄斑变性患者 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 118例人类黄斑神经视网膜样本 |
| 6934 | 2024-10-21 |
Application progress of single-cell sequencing technology in mesenchymal stem cells research
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1336482
PMID:38264356
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在间充质干细胞研究中的应用进展 | 单细胞测序技术揭示了间充质干细胞在基因表达异质性、分化过程中的动态转录变化以及调控因子在关键过程中的作用 | NA | 探讨单细胞测序技术在间充质干细胞研究中的应用 | 间充质干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6935 | 2024-10-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals characteristics of myeloid cells in post-acute sequelae of SARS-CoV-2 patients with persistent respiratory symptoms
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1268510
PMID:38259488
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研究论文 | 研究了COVID-19后遗症患者中持续呼吸症状的髓系细胞特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了COVID-19后遗症患者中髓系细胞的转录组特征 | 样本量较小，仅包括3名患者和1名对照组 | 探讨COVID-19后遗症患者中持续呼吸症状的免疫反应和细胞特征 | COVID-19后遗症患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3名COVID-19后遗症患者和1名对照组 |
| 6936 | 2024-10-21 |
nPCA: a linear dimensionality reduction method using a multilayer perceptron
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1290447
PMID:38259616
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研究论文 | 提出了一种使用多层感知器的线性降维方法nPCA，旨在保留原始数据的线性投影并生成更好的降维结果 | nPCA方法结合了深度学习和线性投影，能够在降维过程中保留更多原始数据的信息，是对传统PCA方法的改进 | 文章未详细讨论nPCA方法在处理大规模数据时的性能和计算效率 | 开发一种新的线性降维方法，能够在保留线性投影的同时生成更好的降维结果 | nPCA算法在10个公共数据集和6个单细胞RNA测序数据集上的性能 | 机器学习 | NA | 多层感知器 | 多层感知器 | 数据集 | 10个公共数据集和6个单细胞RNA测序数据集 |
| 6937 | 2024-10-21 |
Revelations in Thymic Epithelial Cell Biology and Heterogeneity from Single-Cell RNA Sequencing and Lineage Tracing Methodologies
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2740-2_2
PMID:36374449
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研究论文 | 本文总结了通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术在胸腺上皮细胞生物学和异质性方面的发现 | 揭示了胸腺上皮细胞的异质性，包括新发现的mTEC亚群、mTEC基因表达的多样性以及从胚胎到成年阶段的TEC变化 | 需要实验方法如谱系追踪和重聚胸腺器官培养来验证scRNA-Seq数据的假说 | 探讨胸腺上皮细胞的生物学特性和异质性 | 胸腺上皮细胞（TECs）及其亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | 多个胸腺上皮细胞样本 |
| 6938 | 2024-10-21 |
Developmental dynamics of two bipotent thymic epithelial progenitor types
2022-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04752-8
PMID:35614226
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研究论文 | 研究了胸腺上皮祖细胞的发育动态，识别出两种主要的祖细胞群体 | 结合单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9细胞条形码系统，首次揭示了胸腺上皮祖细胞的发育动态和身份 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨胸腺上皮祖细胞的发育动态及其在胸腺微环境中的作用 | 胸腺上皮祖细胞及其在胸腺微环境中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), CRISPR-Cas9 | NA | RNA | 年轻和老年成年小鼠 |
| 6939 | 2024-10-21 |
Single-Cell Analyses Identify Brain Mural Cells Expressing CD19 as Potential Off-Tumor Targets for CAR-T Immunotherapies
2020-10-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.08.022
PMID:32961131
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研究论文 | 研究报告了脑壁细胞表达CD19，可能成为CAR-T免疫疗法的非肿瘤靶点 | 首次发现脑壁细胞表达CD19，为CD19导向疗法的神经毒性提供了靶向机制解释 | 小鼠模型中脑壁细胞的CD19表达水平较低，限制了神经毒性的临床前动物模型 | 探讨CD19导向免疫疗法的神经毒性机制及潜在靶点 | 脑壁细胞及其CD19表达 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和鼠类脑组织样本 |
| 6940 | 2024-10-20 |
Schisandrin C inhibits AKT1-regulated cell proliferation in A549 cells
2024-Dec-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113110
PMID:39260306
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研究论文 | 研究了五味子素C对A549细胞增殖的影响及其机制 | 首次探讨了五味子素C通过抑制AKT1信号通路来抑制A549细胞增殖的机制 | 仅在体外细胞实验和部分临床样本中验证了效果，缺乏大规模临床试验数据 | 探讨五味子素C对肺癌的影响及其作用机制 | A549细胞和肺癌患者组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | A549细胞和肺癌患者组织样本 |