单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 6921 - 6940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6921 | 2024-10-26 |
A subpopulation of lipogenic brown adipocytes drives thermogenic memory
2023-Oct, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00893-w
PMID:37783943
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研究论文 | 本文研究了短暂寒冷暴露后棕色脂肪组织的长期转录和代谢适应机制 | 发现了一种脂质生成棕色脂肪细胞亚群，该亚群在短暂寒冷暴露后驱动热生成记忆，并能改善二次寒冷暴露时的热生成反应 | NA | 探讨短暂环境刺激后长期适应的机制 | 棕色脂肪组织及其在寒冷暴露后的转录和代谢适应 | NA | 肥胖 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 6922 | 2024-10-26 |
Optimized protocol for mouse footpad immune cell isolation for single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-Sep-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102409
PMID:37402171
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的小鼠足垫免疫细胞分离协议，用于单细胞RNA测序和流式细胞术 | 提出了一个高效的小鼠足垫免疫细胞分离方法，保持高细胞活力，适用于单细胞RNA测序 | NA | 开发和优化用于单细胞RNA测序的小鼠足垫免疫细胞分离方法 | 小鼠足垫中的免疫细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠足垫中的免疫细胞 |
| 6923 | 2024-10-26 |
The Dynamic Role of Cardiac Macrophages in Aging and Disease
2022-08, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-022-01714-4
PMID:35595950
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综述 | 本文综述了心脏免疫景观在衰老、血流动力学应激和心肌损伤中的动态变化，重点介绍了心脏免疫细胞类型及其在心肌损伤后重塑细胞景观和促进组织重塑中的作用 | 通过单细胞转录组学和效应机制的阐明，提供了关于多种心脏疾病发病机制的新见解，并可能为治疗提供新的靶点 | NA | 探讨心脏免疫细胞在衰老和疾病中的动态作用及其在心脏病理中的机制 | 心脏巨噬细胞及其在心肌损伤后的功能 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 6924 | 2024-10-26 |
Towards precision medicine in lymphoid malignancies
2022-08, Journal of internal medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1111/joim.13423
PMID:34875132
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综述 | 本文综述了淋巴恶性肿瘤中临床相关的诊断、预后和预测生物标志物，并讨论了综合分子分析的诊断方法如何为精准诊断/医学方法的实施铺平道路 | 讨论了单细胞测序和其他组学技术在解析淋巴恶性肿瘤克隆动态和进化中的应用 | NA | 探讨淋巴恶性肿瘤中的精准医学方法 | B细胞恶性肿瘤中的诊断、预后和预测生物标志物 | 数字病理 | 淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组和表观基因组数据 | NA |
| 6925 | 2024-10-26 |
Combinatorial transcription factor profiles predict mature and functional human islet α and β cells
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151621
PMID:34428183
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了正常人胰岛细胞中转录因子的表达异质性，并基于组合转录因子表达对α和β细胞进行分层 | 首次通过组合转录因子表达预测了高度功能性和成熟的胰岛α和β细胞亚群 | 研究仅限于正常人胰岛细胞，未涉及糖尿病或其他疾病状态 | 定义胰岛细胞中转录因子表达的异质性及其对细胞功能的影响 | 人胰岛α和β细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过40,000个正常人胰岛细胞 |
| 6926 | 2024-10-26 |
Age-determined expression of priming protease TMPRSS2 and localization of SARS-CoV-2 in lung epithelium
2021-01-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI140766
PMID:33180746
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研究论文 | 研究了SARS-CoV-2在肺上皮细胞中的表达及其与年龄相关的TMPRSS2蛋白酶的表达 | 首次揭示了TMPRSS2在不同年龄段小鼠和人类肺组织中的表达变化，并发现TMPRSS2表达与SARS-CoV-2感染细胞的共定位 | 研究主要基于小鼠和人类肺组织的单细胞RNA测序和免疫荧光分析，缺乏更大规模的临床数据支持 | 探讨SARS-CoV-2在肺上皮细胞中的表达及其与年龄相关的TMPRSS2蛋白酶的表达 | SARS-CoV-2在肺上皮细胞中的表达及TMPRSS2蛋白酶的年龄相关性表达 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和免疫荧光 | NA | RNA | 小鼠和人类肺组织样本 |
| 6927 | 2024-10-25 |
Spatial Transcriptomics: A New Frontier in Atherosclerosis Research?
2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321652
PMID:39441914
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6928 | 2024-10-25 |
Immunoglobin attenuates fulminant myocarditis by inhibiting overactivated innate immune response
2024-Oct-23, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.17372
PMID:39442535
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研究论文 | 研究免疫球蛋白通过抑制过度激活的先天免疫反应来减轻暴发性心肌炎的治疗效果 | 首次揭示了免疫球蛋白通过调节心脏免疫稳态，特别是抑制过度激活的先天免疫反应，显著改善暴发性心肌炎小鼠的心脏功能 | 研究仅在A/JGpt小鼠模型中进行，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨免疫调节药物对暴发性心肌炎的治疗效果 | 暴发性心肌炎小鼠模型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | A/JGpt小鼠 |
| 6929 | 2024-10-25 |
Integrated transcriptomics of human blood vessels defines a spatially controlled niche for early mesenchymal progenitor cells
2024-Oct-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.015
PMID:39025061
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研究论文 | 本文通过空间和单细胞转录组学技术，详细研究了人类血管外膜中的间充质前体细胞的表型、潜能和微观解剖分布 | 首次详细描述了人类血管外膜中间充质前体细胞的微观解剖分布和异质性，并识别出一种具有高表面CD201表达的更原始细胞类型 | 研究主要集中在人类和小鼠的血管外膜细胞，未涉及其他物种或组织类型 | 揭示人类血管外膜中间充质前体细胞的微观解剖分布和异质性 | 人类和小鼠的血管外膜中间充质前体细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的血管外膜样本 |
| 6930 | 2024-10-25 |
Decoding the multiple functions of ZBP1 in the mechanism of sepsis-induced acute lung injury
2024-Oct-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07072-x
PMID:39433574
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研究论文 | 研究探讨了ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的多重功能 | 首次定义了ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用，并揭示了其在调节巨噬细胞和肺内皮细胞功能中的重要性 | 研究仅基于ZBP1敲除小鼠模型，未涉及人类样本 | 探讨ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用及其潜在治疗价值 | ZBP1在巨噬细胞和肺内皮细胞中的功能 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | ZBP1敲除小鼠 |
| 6931 | 2024-10-25 |
Enhancing spatial domain detection in spatial transcriptomics with EnSDD
2024-Oct-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07001-y
PMID:39433947
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研究论文 | 本文提出了一种名为EnSDD的方法，通过集成学习整合多种空间域检测方法，以提高空间转录组学中空间域的识别准确性 | EnSDD的创新点在于其动态加权机制，优化了每个基础模型的贡献，并提供了一种无需真实标签数据的性能评估指标 | NA | 提高空间转录组学中空间域的识别准确性，揭示组织异质性和区域化特征 | 空间转录组学数据中的空间域、特定空间变异基因和细胞类型的空间分布 | 空间转录组学 | NA | 集成学习 | 集成学习模型 | 空间转录组数据 | 多种组织结构的空间转录组数据集 |
| 6932 | 2024-10-25 |
Spatial-transcriptomic profiling: a new lens for understanding myelofibrosis pathophysiology
2024-Oct-21, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01877-3
PMID:39434124
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组学在理解骨髓纤维化病理生理学中的应用 | 引入空间转录组学技术，提供了对骨髓和脾脏中基因表达的高分辨率映射，揭示了驱动疾病进展的分子特征和病理微环境 | NA | 通过空间转录组学技术深入理解骨髓纤维化的病理生理学，识别新的治疗靶点和生物标志物 | 骨髓纤维化的病理生理学、临床表型和治疗干预 | 数字病理学 | 血液病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6933 | 2024-10-25 |
Single-cell transcriptomics reveals aberrant skin-resident cell populations and identifies fibroblasts as a determinant in rosacea
2024-Oct-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52946-7
PMID:39384741
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示了玫瑰痤疮患者面部皮肤中异常的驻留细胞群体，并确定成纤维细胞在疾病发展中的关键作用 | 首次生成玫瑰痤疮患者和健康个体的面部皮肤单细胞图谱，发现并验证了成纤维细胞在玫瑰痤疮发展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行大规模验证 | 揭示玫瑰痤疮的细胞和分子机制，并确定关键的致病细胞类型 | 玫瑰痤疮患者和健康个体的面部皮肤细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 女性玫瑰痤疮患者和健康个体的面部皮肤样本 |
| 6934 | 2024-10-25 |
Exploring the impact of ITGB2 on glioma progression and treatment: Insights from non-apoptotic cell death and immunotherapy
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24231
PMID:38488682
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研究论文 | 研究探讨了整合素β2（ITGB2）在胶质瘤进展和治疗中的作用，特别是其在非凋亡细胞死亡和免疫治疗效果中的关键作用 | 首次揭示了ITGB2在非凋亡细胞死亡和免疫治疗反应中的关键作用，并展示了其在预测免疫活动、突变特征和药物反应中的潜力 | 研究主要基于体外模型和数据分析，未来需要进一步的临床验证 | 探讨ITGB2在胶质瘤进展和治疗中的作用，特别是其在非凋亡细胞死亡和免疫治疗效果中的关键作用 | 胶质瘤细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序分析（iTalk和ICELLNET） | NA | 数据集 | 10个不同的胶质瘤数据集 |
| 6935 | 2024-10-25 |
Elucidating the role of FOS in modulating the immune microenvironment through fibroblast and myeloid cell regulation in locoregional recurrent HNSCC
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24262
PMID:38567514
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研究论文 | 本研究探讨了FOS在调节头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）局部复发中的免疫微环境中的作用，特别是其对成纤维细胞和髓系细胞的影响 | 本研究揭示了FOS在HNSCC肿瘤微环境中不同细胞群体中的表达差异，并探讨了其与免疫和缺氧相关通路的关联，为HNSCC的治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 研究FOS在HNSCC局部复发中的免疫微环境调节作用 | FOS在HNSCC肿瘤微环境中对成纤维细胞和髓系细胞的调节作用 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | HNSCC患者组织样本及相邻非癌组织样本 |
| 6936 | 2024-10-25 |
Single-cell and bulk RNA-sequencing reveal SPP1 and CXCL12 as cell-to-cell communication markers to predict prognosis in lung adenocarcinoma
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24297
PMID:38622884
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据，揭示了SPP1和CXCL12作为细胞间通讯标志物，用于预测肺腺癌预后的潜力 | 首次揭示了SPP1和CXCL12在肺腺癌微环境中的细胞间通讯作用，并探讨了它们与免疫细胞的关系 | 研究依赖于公共数据集，可能存在数据质量和样本偏差的问题 | 探讨肺腺癌微环境中的细胞间通讯特征及其与预后的关系 | 肺腺癌肿瘤组织及其邻近的非肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 使用了来自公共数据集的肺腺癌批量RNA测序数据和单细胞RNA测序数据 |
| 6937 | 2024-10-25 |
PTPN7 mediates macrophage-polarization and determines immunotherapy in gliomas: A single-cell sequencing analysis
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24259
PMID:38581214
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研究论文 | 研究探讨了PTPN7在胶质瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 首次系统分析了PTPN7在胶质瘤微环境中的特征及其对免疫治疗的影响 | 研究主要基于单细胞测序和细胞培养实验，缺乏临床验证 | 探讨PTPN7在胶质瘤中的作用及其对免疫治疗的影响 | PTPN7在胶质瘤中的表达、预后价值、基因组特征、免疫特性及对化疗和免疫治疗的预测作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 涉及HMC3和M0细胞与U251和T98G细胞的共培养实验 |
| 6938 | 2024-10-25 |
RNA modification-related EIF4G2 is an immunotherapy determinant in osteosarcoma: A single-cell sequencing analysis
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24261
PMID:38578024
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研究论文 | 本研究探讨了RNA修饰与骨肉瘤免疫治疗之间的关系，并识别出EIF4G2作为关键的免疫治疗决定因素 | 首次建立了RNA修饰与骨肉瘤免疫治疗之间的联系，并识别出EIF4G2作为潜在的治疗靶点 | NA | 探索骨肉瘤中RNA修饰与免疫治疗之间的关系，以识别新的治疗靶点 | 骨肉瘤中的RNA修饰和免疫治疗 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | 随机森林 | RNA修饰相关特征 | NA |
| 6939 | 2024-10-25 |
Using single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing data to reveal a correlation between smoking and neutrophil activation in esophageal carcinoma patients
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24312
PMID:38700434
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据揭示吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关联 | 首次揭示了吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关联，并探讨了中性粒细胞在肿瘤微环境中的促癌作用 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探讨吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关系 | 食管癌患者的中性粒细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 公共数据库中的数据，具体样本数量未提及 |
| 6940 | 2024-10-25 |
LineageVAE: reconstructing historical cell states and transcriptomes toward unobserved progenitors
2024-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae520
PMID:39172488
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研究论文 | 本文介绍了一种名为LineageVAE的新型计算方法，利用深度学习技术重建不可观测的细胞状态和转录组 | 开发了LineageVAE，一种基于深度生成模型的计算方法，能够将具有相同谱系条码的scRNA-seq观测数据转换为潜在细胞状态空间中的序列轨迹，从而重建不可观测的细胞状态转变、历史转录组和调控动力学 | 由于实验性质，观测数据稀疏，早期状态的细胞并非后期观测细胞的直接祖先 | 克服单细胞RNA测序在动态过程中测量基因表达变化的限制，重建不可观测的细胞状态和转录组 | 细胞状态转变、历史转录组和调控动力学 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | VAE | 基因表达数据 | 涉及造血和重编程成纤维细胞数据集 |