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当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 6881 - 6900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6881 | 2025-12-06 |
Spatiotemporal, optogenetic control of gene expression in organoids
2023-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01986-w
PMID:37735569
|
研究论文 | 本研究结合光遗传学和基因扰动技术，在类器官中实现了目标基因表达的可编程时空控制 | 首次将光遗传学与基因扰动技术结合，用于控制类器官中基因表达的时空模式，并通过空间和单细胞转录组分析揭示了SHH信号在神经发育中的新调控机制 | 未明确说明技术适用范围、效率或潜在脱靶效应，且可能仅限于特定类器官模型 | 开发控制类器官中基因表达时空模式的方法，以研究人类发育和疾病建模 | 干细胞衍生的类器官，特别是人类神经发育类器官模型 | 生物医学工程 | NA | 光遗传学、基因扰动技术、空间转录组学、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6882 | 2025-12-05 |
The unfolded protein response in progeria arteries originates from non-endothelial cell types
2026-Feb, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503485
PMID:41326174
|
研究论文 | 本研究探讨了早衰症动脉中未折叠蛋白反应的起源，发现其主要源于非内皮细胞类型 | 揭示了在表达早老素的动脉中，UPR激活具有细胞类型特异性，挑战了先前关于血管平滑肌细胞和成纤维细胞中UPR普遍激活的观点 | 研究基于小鼠模型，可能不完全反映人类HGPS的病理生理学，且未详细探讨非内皮细胞中UPR的具体机制 | 研究早衰症中未折叠蛋白反应是否导致内皮细胞功能障碍 | Hutchinson-Gilford早衰综合征小鼠模型，特别是内皮细胞特异性表达早老素的动脉组织 | 数字病理学 | 早衰症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6883 | 2025-12-05 |
Spatial transcriptomics mapping of immune cell and TGFβ signalling pathway heterogeneity in testicular germ cell tumours
2026-Jan, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70100
PMID:40693358
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，绘制了睾丸生殖细胞肿瘤中免疫细胞和TGFβ信号通路的异质性图谱 | 首次应用空间转录组学分析睾丸生殖细胞肿瘤的组织切片，揭示了肿瘤内部及周围区域的免疫细胞和TGFβ信号通路异质性 | 样本量较小（仅4例患者），且未涉及长期临床结果验证 | 探究睾丸生殖细胞肿瘤的异质性，特别是免疫细胞和TGFβ信号通路在肿瘤发生发展中的作用 | 睾丸生殖细胞肿瘤组织切片，包括非精原细胞瘤和精原细胞瘤样本 | 空间转录组学 | 睾丸生殖细胞肿瘤 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 4例TGCT患者样本，超过90个感兴趣区域 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | NanoString GeoMx空间全转录组工作流程 |
| 6884 | 2025-12-05 |
Altered Inflammatory Signature in a C9ORF72 -ALS iPSC-Derived Motor Neuron and Microglia Coculture Model
2026-Jan, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70084
PMID:40952044
|
研究论文 | 本研究利用携带C9ORF72基因突变的人类诱导多能干细胞（iPSC）来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型，揭示了ALS中炎症反应的改变机制 | 首次在iPSC来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型中，结合单细胞RNA测序技术，系统分析了C9ORF72突变对神经炎症的影响，并发现LPS响应性小胶质细胞亚群的消失 | 研究主要基于体外细胞模型，可能无法完全模拟体内复杂的神经微环境；样本类型和数量有限 | 探究肌萎缩侧索硬化症（ALS）中，C9ORF72基因突变如何通过小胶质细胞介导的神经炎症影响疾病病理 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）来源的运动神经元和小胶质细胞，包括携带C9ORF72六核苷酸重复扩增（HRE）的ALS患者iPSC系和C9ORF72敲除（KO）iPSC系 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），细胞共培养，炎症因子表达与分泌分析 | iPSC来源的细胞共培养模型 | 单细胞转录组数据，细胞表型数据 | 多个iPSC细胞系（包括C9ORF72 HRE和KO系），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6885 | 2025-12-05 |
Plasma proteomics identifies potential drug targets for diabetic polyneuropathy: Evidence from prospective cohorts and genetic analysis
2026-Jan, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70239
PMID:41144938
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研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析，结合前瞻性队列和遗传数据，识别出与糖尿病多发性神经病相关的潜在药物靶点，特别是TNFRSF14，并探讨其临床和细胞机制 | 首次大规模整合临床、遗传和单细胞测序数据，系统性地筛选并验证TNFRSF14作为糖尿病多发性神经病的新型生物标志物和治疗靶点 | 研究依赖于观察性队列和遗传关联分析，因果推断需进一步实验验证；单细胞测序数据可能样本有限，需扩大验证 | 识别糖尿病多发性神经病的潜在药物靶点，以提升治疗效果 | 糖尿病多发性神经病患者及相关蛋白质和遗传因素 | 蛋白质组学 | 糖尿病多发性神经病 | 血浆蛋白质组学、单细胞测序 | NA | 蛋白质组数据、遗传数据、临床数据 | 大规模临床和遗传数据集（具体样本数未在摘要中说明） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6886 | 2025-12-05 |
Spatial Myeloid Landscape of Large Artery Atherosclerotic and Cardioembolic Thrombi Retrieved by Mechanical Thrombectomy
2025-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501658RR
PMID:41329022
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和免疫组化分析，比较了大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性血栓的免疫细胞组成和分子特征 | 首次在急性缺血性卒中的两种主要亚型中，结合空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示了巨噬细胞和中性粒细胞在血栓形成中的特异性免疫血栓模式 | 样本量相对较小（空间转录组学分析仅8例，免疫组化分析35例），且未包括其他卒中病因亚型 | 探究大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性卒中血栓中髓系细胞的分子特征和免疫血栓机制 | 接受血管内血栓切除术的急性缺血性卒中患者的血栓样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 免疫组化图像, 单细胞RNA测序数据 | 42例急性缺血性卒中患者（其中8例LAA，27例CE），空间转录组学分析8例（4例LAA，4例CE），免疫组化分析35例（8例LAA，27例CE） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6887 | 2025-12-05 |
Endothelial ADAR1 Deficit Induces the NOCT-IRF7 Axis in Pulmonary Hypertension
2025-Dec-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326277
PMID:41342206
|
研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的ADAR1缺乏通过上调NOCT表达，激活肺内皮细胞干扰素信号通路，导致细胞凋亡并促进肺动脉高压的发病机制 | 首次发现ADAR1通过RNA编辑调控NOCT基因表达，并建立了ADAR1-NOCT轴在肺动脉高压中的关键作用机制 | 研究主要基于体外细胞和动物模型，人类样本验证相对有限，且具体RNA编辑位点的功能机制需进一步阐明 | 阐明ADAR1依赖性RNA编辑在调控肺内皮细胞病理表型和肺动脉高压发病中的功能和靶点 | 肺内皮细胞、人类和小鼠肺动脉高压模型 | 分子生物学 | 肺动脉高压 | RNA测序、单细胞RNA测序、腺相关病毒表达 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 人类肺动脉高压肺组织、缺氧PH小鼠模型、多种啮齿动物疾病模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6888 | 2025-12-05 |
Identification of CD7 as a novel biomarker of embryonal hepatoblastoma
2025-Dec-04, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-06255-9
PMID:41343061
|
研究论文 | 本研究通过多种生物信息学分析和免疫组化染色，探讨了CD7在肝母细胞瘤中的表达及其作为新型生物标志物的潜力 | 首次将CD7鉴定为胚胎型肝母细胞瘤的新型生物标志物，并揭示其与肿瘤进展和不良临床结局的关联 | 研究主要基于回顾性分析，需要进一步的前瞻性验证和功能实验来确认CD7的生物学作用 | 研究CD7在肝母细胞瘤中的表达及其作为生物标志物的潜力 | 人类肝母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学分析, 免疫组化染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6889 | 2025-12-05 |
ScisTree2 enables large-scale inference of cell lineage trees and genotype calling using efficient local search
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280542.125
PMID:40903391
|
研究论文 | 本文介绍了ScisTree2，一种基于无限位点模型、用于大规模细胞谱系树推断和基因型调用的快速准确方法 | ScisTree2是首个能够处理数万或更多细胞数据集的基于模型的细胞谱系树推断和基因型调用方法，并采用高效局部搜索优化树结构 | NA | 开发一种能够从大规模单细胞数据中准确推断细胞谱系树并进行基因型调用的计算方法 | 单细胞测序数据中的细胞谱系树和基因型 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 无限位点模型 | 单细胞测序数据 | 数万或更多细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6890 | 2025-12-05 |
Label-free selection of marker genes in single-cell and spatial transcriptomics with geneCover
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280539.125
PMID:41224531
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为geneCover的无标签组合方法，用于在单细胞RNA测序和空间转录组学数据中选择最优的标记基因面板 | 提出了一种基于基因-基因相关性的无标签组合方法，能有效识别稀有细胞类型或微妙空间模式的标记基因，并具有出色的可扩展性 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发一种无标签的标记基因选择方法，以捕获单细胞和空间转录组学数据中的细胞和空间异质性 | 单细胞RNA测序和空间转录组学数据中的标记基因面板 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 组合方法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 6891 | 2025-12-05 |
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms with LLOKI
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280803.125
PMID:41233159
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研究论文 | 本文提出了一种名为LLOKI的新型框架，用于整合不同平台的空间转录组学数据，无需共享基因面板 | LLOKI通过最优传输引导的特征传播和基于图的插补技术，解决了跨平台ST数据整合中基因面板差异、数据稀疏性和技术变异性的挑战，并利用scGPT等单细胞基础模型生成统一特征 | 未在摘要中明确说明 | 开发一个能够整合不同平台空间转录组学数据的统一框架，以促进对组织结构和细胞相互作用的深入理解 | 小鼠脑组织样本和卵巢癌数据集 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | scGPT（单细胞基础模型），基于图的插补模型 | 空间转录组学数据，单细胞RNA测序数据 | 来自五种不同技术的小鼠脑样本，以及五个卵巢癌数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6892 | 2025-12-05 |
Joint imputation and deconvolution of gene expression across spatial transcriptomics platforms
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280555.125
PMID:41249066
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SIID的算法，用于整合不同空间转录组学平台的数据，以进行基因表达的插补和解卷积 | SIID算法通过联合非负因子分解模型，结合空间对齐，能够同时处理基因表达缺失和细胞类型特异性表达推断，在模拟和真实数据中均表现出优于现有工具的性能 | NA | 整合不同空间转录组学技术的数据，以克服单个技术的局限性，实现基因表达的准确插补和解卷积 | 空间转录组学数据，特别是来自10x Genomics Visium和Xenium平台的人类乳腺癌和结肠癌组织切片 | 空间转录组学 | 乳腺癌，结肠癌 | 空间转录组学 | 联合非负因子分解模型 | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium平台测量多细胞大小点的全转录组，10x Xenium平台在亚细胞分辨率下测量数百个基因 |
| 6893 | 2025-12-05 |
Optimal marker genes for c-separated cell types with SepSolve
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280637.125
PMID:41067889
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SepSolve的新方法，用于在单细胞RNA-seq研究中识别细胞类型，通过优化选择标记基因以实现细胞类型的c-分离 | 引入c-分离概念，并设计线性规划模型，在考虑细胞类型内表达变异的同时避免处理所有细胞对，从而高效计算最优标记基因集 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发一种高效且稳定的标记基因选择方法，以准确区分单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型及其标记基因 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq | 线性规划 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6894 | 2025-12-05 |
IL-8-Induced Tumor Self-Rampart Spatially Confines Oncolytic Virotherapy in Glioblastoma
2025-Dec-03, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf276
PMID:41339296
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤通过IL-8诱导的肿瘤自我壁垒（TSR）来空间限制溶瘤病毒疗法的机制，并提出了克服该耐药性的策略 | 首次发现并命名了肿瘤自我壁垒（TSR）这一空间防御结构，揭示了IL-8驱动的旁分泌信号在限制溶瘤病毒传播中的关键作用，并提出了IL-8作为药效学生物标志物和治疗靶点的双重功能 | 研究主要基于PDX模型和有限的患者样本，临床转化效果需进一步大规模试验验证 | 探究胶质母细胞瘤中限制溶瘤病毒持续复制和传播的分子与空间机制，并开发改善疗效的组合策略 | 胶质母细胞瘤、溶瘤腺病毒YSCH-01、患者来源异种移植（PDX）模型、肿瘤细胞 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学、全基因组CRISPR激活筛选、组织学分析 | NA | 空间转录组数据、组织图像数据 | PDX模型和患者肿瘤样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6895 | 2025-12-05 |
Standardized metrics for assessment and reproducibility of imaging-based spatial transcriptomics datasets
2025-Dec-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02811-9
PMID:41339526
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研究论文 | 本研究通过生成Spatial Touchstone数据集，评估了Xenium和CosMx平台在成像空间转录组学中的性能，并提出了标准化操作流程和开源软件SpatialQM，以促进数据评估和可重复性 | 首次为成像空间转录组学技术建立了标准化评估指标和操作流程，并开发了开源软件SpatialQM，支持跨平台数据比较和细胞注释插补 | 研究仅基于Xenium和CosMx两个平台，可能未涵盖所有成像空间转录组学技术；样本类型和数量有限，可能影响通用性 | 评估成像空间转录组学技术的可重复性和性能，并建立标准化指标以促进数据整合和分析 | 六种组织类型的空间转录组学数据，包括公共和新生成的Spatial Touchstone数据集 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组学，原位杂交技术 | NA | 空间转录组学数据，图像数据 | 254个空间剖面，涵盖六种组织类型 | 10x Genomics, NanoString | 成像空间转录组学 | Xenium, CosMx | Xenium和CosMx平台，用于成像空间转录组学分析 |
| 6896 | 2025-12-05 |
Delta-like ligand 4 mediated myeloid-derived suppressor cell metabolic reprogramming promotes neoadjuvant therapy resistance in titin-inactivated triple-negative breast cancer
2025-Dec-02, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00372-6
PMID:41326912
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研究论文 | 本研究揭示了Titin失活通过DLL4-MCT4轴调控髓源性抑制细胞代谢重编程，促进三阴性乳腺癌新辅助治疗耐药的机制 | 首次定义了“Titin失活”状态，并发现其通过DLL4增强MDSCs的糖酵解功能，驱动肿瘤免疫逃逸和治疗抵抗 | 研究主要基于临床样本和动物模型，尚未在更大规模人群中验证，且机制细节需进一步探索 | 探究Titin失活如何调控免疫逃逸并影响三阴性乳腺癌的治疗抵抗 | 三阴性乳腺癌患者样本、基因编辑的TNBC细胞系、原位MCT4基因修饰小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 全外显子组测序、单细胞转录组测序、空间转录组测序、CRISPR-Cas9基因编辑、糖酵解相关分子实验 | 基因修饰小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及TNBC患者临床样本和多种细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、全外显子组测序 | NA | NA |
| 6897 | 2025-12-05 |
Marsupial single-cell transcriptomics identifies temporal diversity in mammalian developmental programs
2025-Dec-01, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.037
PMID:40712578
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析有袋类动物负鼠的发育过程，揭示了哺乳动物发育程序中的时间多样性 | 首次将有袋类动物纳入单细胞转录组学研究，识别了异时性组织并发现前部结构转录程序启动更早、进展更快 | 研究仅聚焦于有袋类动物负鼠，可能无法完全代表所有哺乳动物发育模式 | 探究哺乳动物发育程序中的时间多样性，特别关注有袋类动物的异时性现象 | 有袋类动物负鼠（Monodelphis domestica）的原肠胚形成和早期器官发生过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及负鼠发育多个阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6898 | 2025-12-05 |
The extracellular-matrix-remodeling capability exposes therapeutic vulnerability in a subset of renal cell carcinomas with tumor thrombi
2025-Dec-01, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.010
PMID:40774251
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研究论文 | 本研究通过多中心、多组学数据分析，识别了肾细胞癌伴癌栓的两种亚型，并揭示了预后不良亚型中由上皮LOX表达驱动的细胞外基质重塑及其在构建肿瘤免疫屏障中的作用 | 首次在肾细胞癌伴癌栓中识别出两种临床相关亚型，并发现预后不良亚型中上皮LOX驱动的细胞外基质重塑是关键的肿瘤免疫屏障形成机制，为LOX抑制联合免疫治疗提供了新策略 | 研究基于回顾性多中心数据，需要前瞻性临床试验验证LOX抑制剂的治疗效果 | 探究肾细胞癌伴癌栓的肿瘤微环境特征、分子亚型及其对治疗抵抗的影响，寻找新的治疗靶点 | 164例肾细胞癌伴癌栓患者 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学，多组学数据分析，多重免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，多组学数据，临床数据 | 164例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6899 | 2025-12-05 |
Combinatorial BMP4 and activin direct the choice between alternate routes to endoderm in a stem cell model of human gastrulation
2025-Dec-01, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.08.009
PMID:40930099
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学、活细胞成像和数学模型，探索了激活素和骨形态发生蛋白4（BMP4）如何协同或拮抗地引导人类原肠胚形成过程中的命运决定，揭示了内胚层通过直接和间接两条路径产生的机制 | 揭示了BMP4在诱导中胚层基因的同时促进多能性退出的双重作用，并首次在人类干细胞模型中阐明了信号组合不仅决定细胞最终命运，还影响其发育路径的选择，表明谱系汇聚增强了命运决定的稳健性 | 研究基于干细胞模型，可能与体内实际发育过程存在差异；未全面探索其他可能参与的信号通路 | 探究组合信号（激活素和BMP4）如何引导人类原肠胚形成过程中的细胞命运决定 | 人类干细胞模型中的细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、活细胞成像、数学建模 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6900 | 2025-12-05 |
Endothelial protective effects of ferulic acid in preeclampsia treatment
2025-Dec-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00495.2025
PMID:41165539
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研究论文 | 本研究探讨了阿魏酸通过靶向STAT3/VEGF信号轴改善子痫前期小鼠模型的内皮功能和炎症反应 | 首次在子痫前期模型中系统验证阿魏酸通过调控STAT3/VEGF信号通路改善内皮功能障碍的保护作用 | 研究基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证；机制研究主要聚焦STAT3/VEGF轴，可能存在其他通路参与 | 评估阿魏酸作为子痫前期治疗策略的疗效和机制 | L-NAME诱导的子痫前期小鼠模型 | NA | 子痫前期 | 单细胞RNA测序，分子检测 | NA | 基因表达数据，生理指标数据 | 未明确说明样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |