单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6881 - 6900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6881 | 2025-10-06 |
Role of Vascular Smooth Muscle Cell Plasticity and Interactions in Vessel Wall Inflammation
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.599415
PMID:33324416
|
综述 | 本文探讨血管平滑肌细胞可塑性及其在血管壁炎症中的相互作用机制 | 整合新型技术方法揭示VSMC表现型转化的多样性及其在炎症过程中的非专业吞噬功能 | NA | 阐明动脉粥样硬化疾病中血管平滑肌细胞的生物学作用 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | NA | 心血管疾病 | 杂交邻近连接分析, CreER-loxP系统细胞命运追踪, 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6882 | 2025-10-06 |
Molecular Genetics of Kappa Opioids in Pain and Itch Sensations
2022, Handbook of experimental pharmacology
DOI:10.1007/164_2020_397
PMID:33145633
|
综述 | 本文综述了κ阿片受体及其内源性激动剂强啡肽在调节瘙痒和疼痛感觉中的分子遗传学机制 | 整合了单细胞测序数据重新分析显示这些分子的表达谱，并基于解剖结构系统梳理了κ阿片系统在不同部位的作用 | 仅考虑强啡肽与KOR的相互作用，未深入探讨高剂量下其他肽类对KOR的潜在刺激作用 | 探讨κ阿片受体系统在疼痛和瘙痒感觉调节中的分子遗传机制 | κ阿片受体及其内源性激动剂强啡肽，以及受其影响的细胞和神经回路 | 神经科学 | 疼痛和瘙痒相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6883 | 2025-10-06 |
Loss of function of the mitochondrial peptidase PITRM1 induces proteotoxic stress and Alzheimer's disease-like pathology in human cerebral organoids
2021-10, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0807-4
PMID:32632204
|
研究论文 | 本研究通过PITRM1基因敲除的人源诱导多能干细胞衍生的脑类器官，揭示了线粒体肽酶功能缺失导致蛋白质毒性应激和阿尔茨海默病样病理的机制 | 首次在人类脑类器官模型中证明PITRM1缺陷通过激活线粒体未折叠蛋白反应和线粒体清除机制，自发诱导阿尔茨海默病病理特征 | 研究主要基于体外类器官模型，未在完整生物体中进行验证 | 探究线粒体前序列加工缺陷的致病机制及其与神经退行性疾病的关系 | PITRM1敲除的人源诱导多能干细胞衍生的皮质神经元和脑类器官 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术 | 脑类器官模型 | 基因表达数据，蛋白质检测数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6884 | 2025-10-06 |
A review of computational strategies for denoising and imputation of single-cell transcriptomic data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa222
PMID:33003202
|
综述 | 对单细胞转录组数据去噪和插补的计算方法进行全面分析比较 | 首次对19种单细胞转录组数据去噪和插补方法进行系统性定量评估，涵盖多种实验场景和性能指标 | 未提供定量基准测试标准，仅对现有方法进行比较分析 | 评估单细胞转录组数据去噪和插补计算方法的性能 | 19种单细胞转录组数据去噪和插补计算方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 模拟数据集和真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6885 | 2025-10-06 |
Single-cell molecular profiling provides a high-resolution map of basophil and mast cell development
2021-06, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.14633
PMID:33078414
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分子分析绘制了嗜碱性粒细胞和肥大细胞发育的高分辨率图谱 | 首次在单细胞水平揭示了嗜碱性粒细胞和肥大细胞的分化轨迹，发现了一个先前未表征的腹膜嗜碱性粒细胞-肥大细胞双能祖细胞群 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 绘制嗜碱性粒细胞和肥大细胞的发育分化路径 | 小鼠骨髓和腹膜细胞 | 单细胞生物学 | 过敏性疾病 | 多色流式细胞术,单细胞RNA测序,细胞命运测定 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 小鼠骨髓和腹膜细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高覆盖度单细胞RNA测序分析 |
| 6886 | 2025-10-06 |
Deconvolution of monocyte responses in inflammatory bowel disease reveals an IL-1 cytokine network that regulates IL-23 in genetic and acquired IL-10 resistance
2021-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-321731
PMID:33037057
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了炎症性肠病中单核细胞IL-23表达的调控机制，发现IL-1和IL-10信号通路是关键调节因子 | 首次在遗传性和获得性IL-10抵抗背景下系统解析单核细胞IL-23表达调控网络，并区分稳态与疾病相关的IL-23产生特征 | 研究主要聚焦单核细胞，其他免疫细胞类型的贡献可能未完全阐明 | 阐明炎症性肠病中单核细胞IL-23表达的调控机制及其在疾病分型和治疗反应预测中的作用 | 健康个体和炎症性肠病患者的单核吞噬细胞及外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因网络相关性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 患者活检样本 | 健康个体和IBD患者的单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6887 | 2025-10-06 |
Neuronal activity increases translocator protein (TSPO) levels
2021-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0745-1
PMID:32398717
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术，揭示了神经元活动可增加成年中枢神经系统中转位蛋白(TSPO)的表达水平 | 首次证明神经元活动可直接调控TSPO表达，挑战了TSPO仅作为神经炎症生物标志物的传统认知 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证；未探讨TSPO功能改变的具体分子机制 | 探究神经元活动是否影响成年中枢神经系统中TSPO的表达水平 | 成年C57BL6/N小鼠的海马体和大脑皮层区域 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 共聚焦激光扫描显微镜 | NA | 基因表达数据, 蛋白质成像数据 | 12周龄C57BL6/N小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6888 | 2025-10-06 |
ILoReg: a tool for high-resolution cell population identification from single-cell RNA-seq data
2021-05-23, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa919
PMID:33151294
|
研究论文 | 介绍了一个用于从单细胞RNA-seq数据中高分辨率识别细胞群体的R工具包ILoReg | 提出了一种新的概率特征提取方法，通过迭代聚类投影(ICP)算法结合逻辑回归和聚类相似性比较，能够识别转录组差异细微的细胞亚群 | NA | 开发一种改进的单细胞RNA-seq数据分析方法，提高细胞群体识别的分辨率 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归, 聚类算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6889 | 2025-10-06 |
Ileal Transcriptomic Analysis in Paediatric Crohn's Disease Reveals IL17- and NOD-signalling Expression Signatures in Treatment-naïve Patients and Identifies Epithelial Cells Driving Differentially Expressed Genes
2021-May-04, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaa236
PMID:33232439
|
研究论文 | 通过回肠转录组分析揭示儿童克罗恩病初治患者的IL17和NOD信号通路表达特征，并识别驱动差异表达基因的上皮细胞 | 首次在儿童克罗恩病初治患者中发现31个基因特征，识别表达抗菌基因转录本的特殊上皮细胞亚群驱动IL17和NOD信号通路上调 | 样本量有限（共70例），部分相关性分析p值未达到显著水平（如复发时间相关性p=0.07） | 确定儿童克罗恩病中激活的信号通路和驱动细胞类型 | 儿童克罗恩病患者和对照组的回肠组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | RNA测序, 单细胞测序, 加权基因共表达网络分析 | WGCNA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 27例初治克罗恩病, 26例确诊克罗恩病, 17例对照 | NA | 单细胞RNA测序, 靶向自身免疫RNA测序 | NA | NA |
| 6890 | 2025-10-06 |
Cellular heterogeneity and microenvironmental control of skin cancer
2021-05, Journal of internal medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1111/joim.13177
PMID:32976658
|
综述 | 探讨皮肤组织中细胞异质性及微环境对携带致癌突变细胞的调控机制 | 整合体内功能研究与单细胞转录组分析，揭示表皮干细胞及其微环境在癌症预防与促进中的双重作用 | NA | 阐明微环境如何调控携带突变细胞的恶性进展机制 | 皮肤组织中的表皮干细胞、成纤维细胞和免疫细胞亚群 | 单细胞生物学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6891 | 2025-10-06 |
The epigenetic basis of cellular heterogeneity
2021-04, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-020-00300-0
PMID:33244170
|
综述 | 探讨表观遗传机制在细胞异质性形成中的基础作用 | 系统阐述单细胞表观基因组分析技术如何揭示染色质状态对基因表达异质性的贡献机制 | NA | 研究表观遗传特征与细胞异质性之间的关联机制 | 染色质可及性、核小体定位、组蛋白尾修饰和增强子-启动子相互作用等表观遗传特征 | 表观遗传学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞表观基因组分析 | NA | NA |
| 6892 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell type- and artery type-specific vascular remodelling in male spontaneously hypertensive rats
2021-03-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa164
PMID:32589721
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示雄性自发性高血压大鼠血管重塑的细胞类型和动脉类型特异性特征 | 首次在高血压动物模型中系统描绘了抵抗性和传导性动脉的细胞图谱，并以无偏倚方式揭示了动脉类型和细胞类型特异性的基因表达失调 | 研究仅使用雄性自发性高血压大鼠，未涉及雌性模型或人类样本 | 系统表征高血压相关的血管重塑机制 | 自发性高血压大鼠的肠系膜动脉和主动脉 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过20,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6893 | 2025-10-06 |
Congenital heart disease risk loci identified by genome-wide association study in European patients
2021-01-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI141837
PMID:33201861
|
研究论文 | 通过欧洲患者全基因组关联研究识别先天性心脏病的风险基因位点 | 首次在欧洲人群中通过大规模GWAS识别出与先天性心脏病相关的多个新风险基因位点，并进行了功能验证 | 研究仅限于欧洲白人群体，样本多样性不足 | 识别先天性心脏病的遗传风险因素并进行功能分析 | 4034名白人先天性心脏病患者和8486名健康对照 | 基因组学 | 先天性心脏病 | GWAS, 单细胞RNA测序, 干细胞分化 | NA | 基因组数据, 基因表达数据 | 4034例患者和8486例对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 6894 | 2025-10-06 |
Glycolytic metabolism of pathogenic T cells enables early detection of GVHD by 13C-MRI
2021-01-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020005770
PMID:32785680
|
研究论文 | 本研究通过13C-MRI代谢成像技术无创检测GVHD早期病理变化 | 首次利用超极化13C-丙酮酸磁共振成像技术检测GVHD早期T细胞糖酵解代谢活性变化 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本数据仅为初步结果 | 开发GVHD早期无创诊断方法 | 同种异体造血干细胞移植后的GVHD病理过程 | 医学影像 | 移植物抗宿主病 | 13C-MRI，单细胞测序，转录组分析，代谢活性分析 | NA | 影像数据，转录组数据，代谢数据 | 慢性GVHD小鼠模型及AHSCT患者初步样本 | NA | 单细胞RNA测序，代谢成像 | NA | NA |
| 6895 | 2025-10-06 |
Decoding myofibroblast origins in human kidney fibrosis
2021-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2941-1
PMID:33176333
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示人类肾脏纤维化中肌成纤维细胞的起源和异质性 | 首次在人类肾脏纤维化中高分辨率绘制所有基质产生细胞图谱，鉴定周细胞和成纤维细胞亚群为肌成纤维细胞主要来源 | 研究同时使用小鼠模型数据，人类样本可能存在种属差异 | 解析人类肾脏纤维化中瘢痕形成细胞的起源和分化机制 | 健康与纤维化人类肾脏的近端和非近端小管细胞 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 空间转录组学, 遗传命运追踪 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 空间基因表达数据 | 健康与纤维化人类肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6896 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hematopoietic Cells
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0810-4_9
PMID:33165847
|
研究论文 | 本文介绍了两种最常用的造血细胞单细胞RNA测序方法：Smart-Seq2和10× Genomics的详细实验方案 | 系统比较了板式与液滴式两种单细胞RNA测序平台在造血细胞研究中的应用 | 未涉及具体实验数据的分析结果 | 为造血细胞的单细胞转录组研究提供实验方法指导 | 造血细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics液滴式单细胞RNA测序平台 |
| 6897 | 2025-10-06 |
Intravenous nanoparticle vaccination generates stem-like TCF1+ neoantigen-specific CD8+ T cells
2021-01, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-00810-3
PMID:33139915
|
研究论文 | 本研究探讨了静脉注射纳米颗粒疫苗如何通过调节疫苗参数优化抗肿瘤免疫反应 | 发现静脉注射纳米颗粒疫苗能特异性生成干细胞样TCF1+新抗原特异性CD8+ T细胞，优于皮下免疫 | 研究仅在治疗模型中验证，尚未进行临床试验 | 优化癌症疫苗参数以增强抗肿瘤免疫反应 | 新抗原特异性CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6898 | 2025-10-06 |
Cell type prioritization in single-cell data
2021-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0605-1
PMID:32690972
|
研究论文 | 提出一种名为Augur的方法，用于在单细胞数据中优先识别对生物扰动最敏感的细胞类型 | 采用机器学习框架量化扰动与未扰动细胞在高维空间中的可分离性，相比基于差异基因表达的现有方法表现更优 | NA | 开发优先识别对生物扰动最敏感细胞类型的方法 | 单细胞数据中的细胞类型 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序、染色质可及性分析、成像转录组学 | 机器学习框架 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 6899 | 2025-10-06 |
The quiescent fraction of chronic myeloid leukemic stem cells depends on BMPR1B, Stat3 and BMP4-niche signals to persist in patients in remission
2021-01-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2019.232793
PMID:32001529
|
研究论文 | 本研究揭示慢性髓系白血病干细胞通过BMPR1B、Stat3和BMP4信号在治疗缓解期维持静息状态的分子机制 | 首次发现BMPR1B+白血病干细胞通过粘附基质细胞获得治疗诱导的静息状态，并证实同时靶向BMPR1B和Jak2/Stat3通路可有效清除残留白血病干细胞 | 研究基于新型持续存在白血病干细胞模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究BMP信号在慢性髓系白血病缓解期残留干细胞持续存在中的作用机制 | 慢性髓系白血病患者的CD34+CD38-白血病干细胞和骨髓基质细胞 | 单细胞生物学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6900 | 2025-10-06 |
Spatio-temporal regulation of gene expression defines subpopulations of epidermal stem cells
2020-12-18, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20200740
PMID:33170265
|
综述 | 探讨表皮干细胞亚群中基因表达的时空调控机制及其在再生医学中的意义 | 通过单细胞转录组学揭示表皮干细胞的高度异质性，并利用伪时间推断、RNA速率和细胞熵分析发现表皮干细胞的可塑性特征 | 未明确说明研究样本的具体数量或实验验证的局限性 | 阐明表皮干细胞的异质性特征及其在再生医学中的潜在应用 | 表皮干细胞及其在角质形成细胞中的亚群 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学，伪时间推断，RNA速率分析，细胞熵计算 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |