单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28258 篇文献，本页显示第 6881 - 6900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6881 | 2024-12-05 |
SenMayo transcriptomic senescence panel highlights glial cells in the ageing mouse and human retina
2024-Nov-30, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-024-00187-9
PMID:39616175
|
研究论文 | 研究使用SenMayo转录组衰老面板分析了不同年龄小鼠和人类视网膜中的衰老细胞，特别是胶质细胞 | 首次将SenMayo基因面板应用于视网膜衰老细胞的鉴定，并比较了不同年龄小鼠和人类视网膜胶质细胞的转录组特征 | 研究主要集中在视网膜胶质细胞，未涵盖其他类型的细胞 | 鉴定中枢神经系统和视网膜中的衰老细胞，并分析其转录组特征 | 不同年龄小鼠和人类的视网膜胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 不同年龄的小鼠和人类视网膜样本 |
| 6882 | 2024-12-05 |
Single-cell transcriptomics reveals over-activated reactive oxygen species pathway in hepatocytes in the development of hepatocellular carcinoma
2024-11-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81481-0
PMID:39616235
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肝细胞中活性氧通路在肝细胞癌发展中的过度激活 | 首次揭示了肝细胞癌中活性氧通路的异常激活及其与能量代谢相关通路的正相关性，并发现了与预后不良相关的GPX4+肝细胞亚群 | 研究基于GSE189175数据集，样本量有限，未来需要更大规模的研究验证 | 探讨活性氧通路在肝细胞癌发展中的作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织及其邻近组织中的肝细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于GSE189175数据集，具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 6883 | 2024-12-05 |
Identification of the key targets for sepsis-associated acute kidney injury by RNA sequencing combined with bioinformatics methods
2024-Nov-30, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00673-5
PMID:39616313
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序结合生物信息学方法，识别脓毒症相关急性肾损伤的关键靶点 | 首次通过RNA测序和生物信息学分析，确定了CD74和IL32作为脓毒症相关急性肾损伤的早期诊断和预后评估的生物标志物 | 研究样本量较小，且仅限于脓毒症患者，结果的普适性有待进一步验证 | 提供脓毒症相关肾损伤的早期识别和预后研究的可靠靶点 | 脓毒症患者的肾损伤相关基因 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序 | NA | RNA | 10名健康个体和22名脓毒症患者的外周血样本 |
| 6884 | 2024-12-05 |
CD22 blockade exacerbates neuroinflammation in Neuromyelitis optica spectrum disorder
2024-Nov-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03305-2
PMID:39616380
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研究论文 | 研究CD22在视神经脊髓炎谱系障碍（NMOSD）中对神经炎症和中枢神经系统损伤的影响 | 揭示了CD22作为调控微胶质细胞和Gr-1+髓系细胞在NMOSD中负面效应的关键分子开关的新角色 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨CD22在NMOSD中的作用及其对微胶质细胞活性和神经炎症的影响 | CD22在NMOSD中的表达、功能及其对微胶质细胞和髓系细胞的影响 | 神经科学 | 神经疾病 | 单细胞测序、流式细胞术 | NA | 细胞 | 人类样本每组5个，小鼠样本每组8个 |
| 6885 | 2024-12-05 |
[Hepatic T cell subtypes and functional analysis among alveolar echinococcosis patients using single-cell RNA sequencing]
2024-Nov-08, Zhongguo xue xi chong bing fang zhi za zhi = Chinese journal of schistosomiasis control
DOI:10.16250/j.32.1915.2024172
PMID:39623989
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研究论文 | 研究了泡型包虫病患者肝脏免疫微环境中T细胞亚型及其功能 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析泡型包虫病患者肝脏中T细胞亚型及其功能 | 样本量较小，仅包括四名患者 | 探讨泡型包虫病患者肝脏免疫微环境中T细胞亚型及其功能 | 泡型包虫病患者的肝脏T细胞亚型及其功能 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 四名泡型包虫病患者，共采集八份肝脏样本 |
| 6886 | 2024-12-05 |
FSCN1 is a Potential Therapeutic Target for Atherosclerosis Revealed by Single-Cell and Bulk RNA Sequencing
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S480528
PMID:39618922
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序数据，研究了动脉粥样硬化中的细胞表型、细胞间通讯和潜在治疗靶点 | 发现FSCN1在动脉粥样硬化中的高表达，并验证了其在细胞凋亡和迁移中的作用，提示其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨动脉粥样硬化中的细胞表型、细胞间通讯和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化中的细胞类型、FSCN1的表达及其在疾病发展中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、ELISA | NA | RNA测序数据 | 包括Apoeko小鼠和颈动脉内膜切除术患者的数据 |
| 6887 | 2024-12-05 |
Corrigendum: Unraveling the ecological landscape of mast cells in esophageal cancer through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522632
PMID:39620211
|
correction | 对先前发表的文章进行更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6888 | 2024-12-05 |
Cellular and molecular characterization of peripheral glia in the lung and other organs
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0310303
PMID:39621665
|
研究论文 | 系统分析了肺部及其他器官中外周胶质细胞的细胞和分子特征 | 利用单细胞RNA测序技术，首次全面描述了小鼠肺部Sox10+胶质细胞系的解剖、细胞和分子特征，并扩展到灵长类和其他器官 | 研究主要集中在小鼠、鼠狐猴和人类，其他物种的数据有限 | 揭示外周胶质细胞在肺部及其他器官中的分子差异和定位 | 小鼠、鼠狐猴和人类的外周胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约700个外周胶质细胞样本，来自小鼠、鼠狐猴和人类 |
| 6889 | 2024-12-02 |
Low level exposure to BDE-47 facilitates the development of prostate cancer through TOP2A/LDHA/lactylation positive feedback circuit
2024-Dec-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2024.120094
PMID:39362459
|
研究论文 | 研究低剂量BDE-47暴露通过TOP2A/LDHA/乳酸化正反馈回路促进前列腺癌发展的机制 | 首次探讨了BDE-47暴露与前列腺癌发展之间的关系，并揭示了TOP2A/LDHA/乳酸化正反馈回路在其中的作用 | NA | 探讨BDE-47暴露对前列腺癌进展的影响及其分子机制 | BDE-47暴露、前列腺癌细胞、TOP2A、LDHA、乳酸化 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接模拟 | NA | 基因表达数据 | 体外实验使用PC3和LNCaP细胞系，体内实验使用小鼠模型 |
| 6890 | 2024-12-02 |
CD4+CD8αlow T Cell Clonal Expansion Dependent on Costimulation in Patients With Rheumatoid Arthritis
2024-Dec, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42960
PMID:39054665
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研究论文 | 研究了类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其对T细胞靶向治疗的反应 | 首次探讨了类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其与疾病活动的关系，并评估了靶向治疗的效果 | 样本量较小，研究对象仅包括类风湿性关节炎和银屑病关节炎患者，未涵盖其他自身免疫性疾病 | 探讨类风湿性关节炎患者中CD4+CD8αlow T细胞的克隆扩增及其对T细胞靶向治疗的反应 | 类风湿性关节炎患者和健康对照者的CD4+CD8αlow T细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA和T细胞受体序列 | 类风湿性关节炎患者3例，健康对照2例；类风湿性关节炎患者53例，银屑病关节炎患者52例，健康对照50例 |
| 6891 | 2024-12-02 |
IL-1β mediated fibroblast-neutrophil crosstalk promotes inflammatory environment in skin lesions of SLE
2024-Dec, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110396
PMID:39522851
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研究论文 | 研究了系统性红斑狼疮（SLE）皮肤病变中纤维母细胞与中性粒细胞之间的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SLE病变中CXCL1纤维母细胞的独特亚群，并阐明了其与中性粒细胞的相互作用机制 | NA | 探讨SLE皮肤病变中纤维母细胞与中性粒细胞的相互作用及其在炎症环境中的作用 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者皮肤病变中的纤维母细胞和中性粒细胞 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 6892 | 2024-12-02 |
Mutation-Driven Immune Microenvironments in Non-Small Cell Lung Cancer: Unrevealing Patterns through Cluster Analysis
2024-Dec, Yonsei medical journal
IF:2.6Q1
DOI:10.3349/ymj.2024.0062
PMID:39609084
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了非小细胞肺癌中不同突变类型的肿瘤微环境 | 揭示了非小细胞肺癌中不同突变类型与肿瘤微环境的密切关联，为个性化癌症诊断和治疗提供了新见解 | 研究样本仅来自21名患者，可能影响结果的普适性 | 全面分析非小细胞肺癌中主要突变类型的肿瘤微环境异质性 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | RNA-seq数据 | 64369个肿瘤组织细胞，来自21名非小细胞肺癌患者 |
| 6893 | 2024-12-02 |
Spatial transcriptomics in focal cortical dysplasia type IIb
2024-Nov-30, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01897-7
PMID:39614299
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研究论文 | 研究了FCD IIb患者新鲜冷冻脑样本中DNs和BCs区域的转录组变化 | 首次使用空间转录组学技术研究FCD IIb患者脑样本中DNs和BCs区域的转录变化，并揭示了mTOR信号通路、自噬和泛素-蛋白酶体系统在癫痫发作中的潜在作用 | 样本量较小，仅包括三名患者 | 探讨FCD IIb患者脑样本中DNs和BCs区域的转录组变化及其在癫痫发作中的作用 | FCD IIb患者脑样本中的DNs和BCs区域 | 数字病理学 | 癫痫 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 三名FCD IIb患者的新鲜冷冻脑样本 |
| 6894 | 2024-12-02 |
CMTM7 shapes the chronic inflammatory and immunosuppressive tumor microenvironment in hepatocellular carcinoma as an M2 macrophage biomarker
2024-Nov-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-75538-3
PMID:39609464
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研究论文 | 研究探讨了CMTM7蛋白在肝细胞癌中的作用及其对慢性炎症和免疫抑制肿瘤微环境的影响 | 首次揭示了CMTM7作为M2巨噬细胞的分子标记物，并提出了其作为肝细胞癌患者免疫检查点的潜在应用 | 研究主要基于组织微阵列、测序数据和分析工具，缺乏体内实验验证 | 探讨CMTM7在肝细胞癌中的作用及其对患者预后的影响 | CMTM7蛋白、肝细胞癌、M2巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、多重荧光染色 | NA | 组织微阵列、测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 6895 | 2024-12-02 |
New direction: identification of immunoinflammatory subtypes and potential therapeutic targets for cholangiocarcinoma
2024-Nov-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01628-3
PMID:39612077
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研究论文 | 本研究旨在识别胆管癌的免疫炎症亚型并探索潜在的治疗靶点 | 首次识别出胆管癌的两种免疫亚型（CS1和CS2），并揭示了它们在肿瘤微环境中的不同特征和代谢调控机制 | 研究主要基于数据库中的转录组和单细胞测序数据，缺乏体内实验验证 | 识别胆管癌的免疫亚型并探讨其在巨噬细胞功能代谢调控中的作用 | 胆管癌的免疫亚型及其在肿瘤微环境中的特征 | 数字病理学 | 胆管癌 | 转录组分析、单细胞测序 | NA | 转录组数据、单细胞数据 | 多个数据库中的样本 |
| 6896 | 2024-12-02 |
CardioAtlas: deciphering the single-cell transcriptome landscape in cardiovascular tissues and diseases
2024-Nov-28, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00696-5
PMID:39609860
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研究论文 | 构建了一个名为CardioAtlas的资源，提供了心血管组织和疾病中单细胞转录组数据的全面分析结果 | 首次构建了一个全面且精心制作的心血管系统和疾病参考图谱，详细描述了大量人类和小鼠中先前未被识别的细胞群体 | NA | 揭示心血管组织和疾病中的单细胞转录组景观 | 心血管系统和疾病中的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 27个人类数据集中的1,929,000个细胞和39个小鼠数据集中的1,088,000个细胞 |
| 6897 | 2024-12-02 |
Genetic and therapeutic heterogeneity shape the baseline and longitudinal immune ecosystem of ovarian clear cell carcinoma
2024-Nov-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010069
PMID:39608974
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研究论文 | 研究卵巢透明细胞癌的免疫生态系统及其在基因和治疗压力下的动态变化 | 揭示了ARID1A突变与卵巢透明细胞癌基线免疫激活的关联，并探讨了VEGF抑制剂在重塑肿瘤基质和增强免疫治疗效果中的作用 | 研究样本量有限，且主要集中在特定基因突变和治疗策略上，可能无法全面反映所有卵巢透明细胞癌的免疫生态系统 | 探讨卵巢透明细胞癌的免疫反应异质性及其潜在的联合治疗策略 | 卵巢透明细胞癌患者的肿瘤样本和血清肿瘤标志物 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞mRNA测序、TCR测序、免疫组化、空间转录组学、RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 13名卵巢透明细胞癌患者的肿瘤样本和31份石蜡包埋样本 |
| 6898 | 2024-12-02 |
Germ cell progression through zebrafish spermatogenesis declines with age
2024-Nov-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204319
PMID:39470160
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研究论文 | 研究了斑马鱼随着年龄增长精子发生过程中的细胞和分子变化 | 首次使用单细胞RNA测序生成斑马鱼衰老睾丸的发育图谱，揭示了精子发生随年龄下降的分子机制 | 研究仅限于斑马鱼，可能不适用于其他物种 | 探讨斑马鱼精子发生随年龄下降的分子和细胞机制 | 斑马鱼睾丸中的生殖细胞和免疫细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个年龄段的斑马鱼睾丸样本 |
| 6899 | 2024-12-02 |
Early autonomous patterning of the anteroposterior axis in gastruloids
2024-Nov-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202171
PMID:39552366
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研究论文 | 研究了在小鼠胚胎干细胞（ESCs）形成的gastruloids中，前后轴（AP轴）自主模式的早期动态 | 通过单细胞RNA测序，识别了支持AP极化的T+和T-群体的关键细胞状态转变和分子特征 | 对细胞命运的空间限制和伴随的转录变化的理解仍然有限 | 探讨小鼠gastruloids中AP轴建立的动态过程，特别是在外部Wnt刺激之前 | 小鼠胚胎干细胞形成的gastruloids | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多个小鼠gastruloids样本 |
| 6900 | 2024-12-02 |
Transcriptome Assembly at Single-Cell Resolution with Beaver
2024-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621958
PMID:39574665
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Beaver的单细胞分辨率转录组装工具，用于短读长单细胞RNA测序数据 | Beaver通过实现转录片段图和高效的动态规划算法，结合随机森林模型，显著提高了单细胞转录组装的精度和准确性 | NA | 开发一种能够在单细胞分辨率下准确重建全长转录本的工具 | 单细胞RNA测序数据中的转录组装 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 随机森林模型 | 转录组数据 | 实验使用了真实和模拟的Smart-seq3 scRNA-seq数据 |