单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
6861	2024-12-26	Trem2/Tyrobp Signaling Protects Against Aortic Dissection and Rupture by Inhibiting Macrophage Activation in Mice 2025-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321429 PMID:39508103	研究论文	本研究探讨了Trem2/Tyrobp信号通路在小鼠主动脉夹层（AD）发展中的作用，发现其通过抑制巨噬细胞激活来保护主动脉免受夹层和破裂	首次揭示了Trem2/Tyrobp信号通路在主动脉夹层中的保护作用，并提出了通过增强该信号通路来预防和治疗主动脉夹层的新策略	研究主要基于小鼠模型，未来需要进一步研究Trem2/Tyrobp在人类主动脉夹层中的作用	探讨Trem2/Tyrobp信号通路在主动脉夹层发展中的作用及其潜在机制	小鼠主动脉夹层模型	心血管疾病	主动脉夹层	转录组分析、单细胞RNA测序、免疫荧光染色、定量实时聚合酶链反应	Tyrobp敲除小鼠、Trem2敲除小鼠	基因表达数据、RNA测序数据	小鼠模型
6862	2024-12-26	Guided monocyte fate to FRβ/CD163+ S1 macrophage antagonises atopic dermatitis via fibroblastic matrices in mouse hypodermis 2024-Dec-25, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-024-05543-2 PMID:39720957	研究论文	本文通过单细胞转录组学和流式细胞术研究了巨噬细胞在特应性皮炎中的状态变化，揭示了调控单核细胞获得S1身份的机制，并展示了通过外源性层粘连蛋白211促进单核细胞向S1巨噬细胞分化以缓解皮炎的效果	揭示了特应性皮炎中巨噬细胞S1亚型耗竭的机制，并首次展示了通过外源性层粘连蛋白211促进单核细胞向S1巨噬细胞分化以缓解皮炎的新方法	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	研究巨噬细胞在特应性皮炎中的状态变化及其调控机制，探索通过干预巨噬细胞分化缓解皮炎的可能性	小鼠皮肤中的巨噬细胞和单核细胞	免疫学	特应性皮炎	单细胞转录组学、流式细胞术	NA	基因表达数据、细胞表型数据	NA
6863	2024-12-26	Single cell profiling of hematopoietic stem cell transplant recipients reveals TGF-β1 and IL-2 confer immunoregulatory functions to NK cells 2024-Dec-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111416 PMID:39720529	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了在造血干细胞移植受者中，TGF-β1和IL-2如何赋予NK细胞免疫调节功能	首次定义了在造血干细胞移植后，CD56NK细胞群体与急性移植物抗宿主病（GVHD）保护之间的关联，并阐明了IL-2和TGF-β1联合作用在促进NK细胞调节表型中的角色	诱导的调节性NK细胞表型不稳定，暴露于不同细胞因子后会失去分泌TGF-β1的能力	研究造血干细胞移植后NK细胞的免疫调节功能	造血干细胞移植受者的NK细胞	免疫学	移植物抗宿主病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	造血干细胞移植受者的NK细胞样本
6864	2024-12-26	Myeloperoxidase and Thyrotropin-Releasing Hormone Within Leukaemia Stem Cells Increased Chemosensitivity in Acute Myeloid Leukaemia 2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70306 PMID:39720891	研究论文	本研究探讨了白血病干细胞（LSCs）中的髓过氧化物酶（MPO）和促甲状腺激素释放激素（TRH）在急性髓性白血病（AML）化疗敏感性中的作用	首次在LSCs中识别出MPO和TRH作为AML化疗敏感性的潜在生物标志物，并发现其与患者无复发生存率和总生存率的显著相关性	样本量较小（20名患者），且仅涉及接受'7+3'诱导治疗的患者，可能限制结果的普遍性	识别LSCs中能预测AML化疗敏感性的生物标志物	急性髓性白血病（AML）患者	生物医学研究	白血病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	20名新诊断的AML患者
6865	2024-12-26	Single-Cell RNA-Seq Reveals Injuries in Aortic Dissection and Identifies PDGF Signalling Pathway as a Potential Therapeutic Target 2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70293 PMID:39720896	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了主动脉夹层中的细胞异质性及相关损伤，并识别出PDGF信号通路作为潜在的治疗靶点	首次应用单细胞RNA测序技术全面解析主动脉夹层的细胞异质性，并发现PDGF信号通路在疾病中的关键作用	样本量较小，且未进行长期随访以验证治疗靶点的临床效果	揭示主动脉夹层的细胞异质性及分子机制，探索潜在治疗靶点	主动脉夹层患者及非主动脉夹层供体的主动脉细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	主动脉夹层患者及非主动脉夹层供体的主动脉细胞
6866	2024-12-26	Single-cell profiling uncovers synovial fibroblast subpopulations associated with chondrocyte injury in osteoarthritis 2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2024.1479909 PMID:39720254	研究论文	本研究通过单细胞测序分析揭示了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞损伤之间的相互作用和关联	首次通过单细胞测序技术详细分析了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞之间的相互作用，并识别了具有修复和保护作用的CILP+成纤维细胞以及可能加剧软骨损伤的POSTN+成纤维细胞	研究主要基于单细胞测序数据，缺乏体内实验验证，且样本量未明确说明	阐明骨关节炎中滑膜细胞与软骨细胞之间的相互作用和关联，以深化对骨关节炎发病机制的理解	骨关节炎患者的滑膜细胞和软骨细胞	单细胞测序	骨关节炎	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	NA
6867	2024-12-25	The role of the haematopoietic stem cell niche in development and ageing 2025-Jan, Nature reviews. Molecular cell biology DOI:10.1038/s41580-024-00770-8 PMID:39256623	综述	本文综述了造血干细胞（HSC）及其前体细胞（HSPC）在发育和衰老过程中与骨髓微环境（niche）的相互作用	本文通过单细胞转录组学和显微镜技术，揭示了HSC在发育过程中与不同niche的相互作用，并探讨了这些相互作用在衰老过程中的变化及其对造血疾病的影响	本文主要为综述性质，未提供具体实验数据或模型	探讨HSC与niche在发育和衰老过程中的相互作用，为改善自体HSC疗法和移植提供理论基础	造血干细胞（HSC）及其前体细胞（HSPC）与骨髓微环境（niche）的相互作用	NA	NA	单细胞转录组学、显微镜技术	NA	NA	NA
6868	2024-12-25	Hepatocellular carcinoma hosts cholinergic neural cells and tumoral hepatocytes harboring targetable muscarinic receptors 2025-Jan, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101245 PMID:39717507	研究论文	本文研究了肝细胞癌中胆碱能神经细胞的存在及其对肿瘤肝细胞中可靶向毒蕈碱受体的影响	首次在人类肝细胞癌中发现密集的DCX+、synaptophysin+、NeuN+、VAChT+、TH-、CD31-、CD45-簇，并通过单细胞RNA测序数据独立验证	研究主要基于法国肝脏生物库的数据和TCGA等数据集，可能存在样本多样性不足的问题	探索肝细胞癌中胆碱能神经过程的作用，并评估现有神经药物在肝细胞癌研究中的应用潜力	肝细胞癌中的胆碱能神经细胞和肿瘤肝细胞中的毒蕈碱受体	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	基因组数据	包括来自法国肝脏生物库的肝肿瘤样本、TCGA数据集、其他数据集以及欧洲验证队列
6869	2024-12-25	Interplay between Netrin-1 and Norrin controls arteriovenous zonation of blood-retina barrier integrity 2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2408674121 PMID:39693351	研究论文	研究探讨了Netrin-1和Norrin信号通路在控制视网膜屏障完整性中的相互作用	首次揭示了Netrin-1/Unc5b和Norrin/Lrp5信号通路在视网膜屏障中的区室化基因表达调控机制	研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步验证在人类中的适用性	探讨Netrin-1和Norrin信号通路在视网膜屏障完整性中的作用	视网膜屏障的完整性和基因表达调控	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用出生后视网膜屏障功能性小鼠视网膜内皮细胞进行单细胞RNA测序，识别了超过100个视网膜屏障相关基因
6870	2024-12-25	Pathway metrics accurately stratify T cells to their cells states 2024-Dec-24, BioData mining IF:4.0Q1 DOI:10.1186/s13040-024-00416-7 PMID:39716187	研究论文	本文介绍了一种名为PathSingle的Python工具，用于单细胞数据分析中的通路分析，能够准确分类T细胞的不同状态	PathSingle采用独特的基于图的算法，能够分类不同的细胞状态，如T细胞亚型	NA	开发一种工具，用于从单细胞转录组数据中揭示生物学上有意义的见解	T细胞及其亚型	生物信息学	NA	单细胞转录组分析	基于图的算法	基因表达数据	NA
6871	2024-12-25	Systematic pan-cancer analysis identifies ZBTB11 as a potential pan-cancer biomarker and immunotherapy target in multiple tumor types 2024-Dec-23, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01697-4 PMID:39715911	研究论文	本文系统分析了ZBTB11在多种肿瘤类型中的表达、预后价值、基因突变和DNA启动子甲基化，并探讨了其在肿瘤发生和免疫治疗中的潜在作用	首次系统性地分析了ZBTB11在多种肿瘤类型中的表达和预后价值，并构建了ZBTB11的竞争性lncRNA-miRNA网络，揭示了其在肿瘤生物学行为中的调控作用	研究主要基于数据库和在线工具的分析，缺乏实验验证	探讨ZBTB11在多种肿瘤类型中的生物学意义及其作为潜在生物标志物和免疫治疗靶点的可能性	ZBTB11在不同肿瘤类型中的表达、预后价值、基因突变、DNA甲基化和免疫细胞浸润	数字病理学	多种肿瘤类型	DNA甲基化测序、单细胞测序	NA	基因表达数据、突变数据、甲基化数据	多种肿瘤类型的样本
6872	2024-12-25	Uncovering the molecular networks of ferroptosis in the pathogenesis of type 2 diabetes and its complications: a multi-omics investigation 2024-Dec-23, Molecular medicine (Cambridge, Mass.) DOI:10.1186/s10020-024-01045-w PMID:39716081	研究论文	本研究通过多组学方法揭示铁死亡在2型糖尿病及其并发症发病机制中的分子网络	首次通过多组学分析揭示铁死亡相关基因在2型糖尿病及其并发症中的作用，并验证了影像基因组学在非侵入性诊断中的潜力	研究依赖于现有数据集，可能存在样本偏倚和数据异质性	揭示铁死亡在2型糖尿病及其并发症中的作用，并探索非侵入性诊断的可能性	2型糖尿病及其并发症，包括糖尿病肾病、糖尿病心肌病和非酒精性脂肪肝病	NA	糖尿病	多组学分析、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、蛋白质丰度数据、影像基因组数据	包括发现队列、验证队列和影像基因组队列的多个数据集
6873	2024-12-25	Single-cell transcriptome analysis reveals reciprocal epithelial and endothelial cell evolution in ovarian cancer 2024-Dec-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111417 PMID:39717089	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了卵巢癌中上皮细胞和内皮细胞的相互进化关系	首次揭示了输卵管上皮细胞向卵巢癌上皮细胞的潜在发展趋势，并发现了与肿瘤血管生成相关的内皮细胞亚型	研究仅限于卵巢癌中的上皮细胞和内皮细胞，未涉及其他细胞类型	探讨卵巢癌发展过程中上皮细胞和内皮细胞的相互作用	卵巢癌中的上皮细胞和内皮细胞	数字病理学	卵巢癌	单细胞转录组分析	NA	转录组	87,847个上皮细胞和11,696个内皮细胞
6874	2024-12-25	BDNF augmentation reverses cranial radiation therapy-induced cognitive decline and neurodegenerative consequences 2024-Dec-18, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-024-01906-9 PMID:39696694	研究论文	本文研究了BDNF增强剂逆转颅脑放射治疗引起的认知功能下降和神经退行性后果	本文首次在颅脑放射治疗模型中验证了BDNF增强剂（如利鲁唑）对认知功能下降的逆转作用，并展示了其在神经保护方面的潜力	本文仅在动物模型中进行了研究，尚未在人类中进行验证	探讨BDNF增强剂对颅脑放射治疗引起的认知功能下降和神经退行性后果的影响	颅脑放射治疗后的成年小鼠	神经科学	癌症相关疾病	空间转录组学分析	NA	基因表达数据	颅脑放射治疗后的成年小鼠模型
6875	2024-12-25	Resolving the design principles that control postnatal vascular growth and scaling 2024-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.10.627758 PMID:39713449	研究论文	研究揭示了控制出生后血管生长和缩放的设计原则	发现了主动脉扩张遵循特定的生物学原则，并与脊柱的缩放相关，而不是动物体重；揭示了通过两波动脉细胞增殖来实现扩张的过程，并展示了细胞周期动力学的独特性；证明了内皮细胞的挤出对于稳态主动脉生长和平衡过度增殖的重要性	NA	探讨控制出生后血管生长和缩放的设计原则	主动脉的生长和缩放	NA	NA	单细胞RNA测序	数学模型	NA	NA
6876	2024-12-25	Current transcriptome database and biomarker discovery for immunotherapy by immune checkpoint blockade 2024-Dec-10, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.09.627506 PMID:39713380	综述	本文综述了免疫检查点阻断（ICB）疗法的当前转录组数据库和生物标志物发现，重点讨论了肿瘤基因组、肿瘤微环境和肿瘤-宿主相互作用的生物标志物，并介绍了IOhub平台用于基准分析当前生物标志物	介绍了IOhub平台，该平台整合了36个bulk和10个单细胞转录组数据集，用于生物标志物的基准分析	NA	探讨免疫检查点阻断疗法的生物标志物发现和当前转录组数据库	肿瘤基因组、肿瘤微环境和肿瘤-宿主相互作用的生物标志物	数字病理学	癌症	转录组学	NA	转录组数据	36个bulk和10个单细胞转录组数据集
6877	2024-12-25	Rates of evolution differ between cell types identified by single-cell RNAseq in threespine stickleback 2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.06.627160 PMID:39713298	研究论文	本文结合单细胞RNA测序（scRNAseq）和进化基因组学，研究了不同细胞类型在进化过程中的基因差异性	首次将单细胞RNA测序技术与进化基因组数据结合，揭示了免疫细胞类型的基因进化速度特别快	研究仅限于三刺鱼，结果的普适性有待进一步验证	探讨不同细胞类型在进化过程中的基因差异性	三刺鱼的不同细胞类型及其特征基因的进化速度	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	基因数据	多个三刺鱼种群和物种的基因数据
6878	2024-12-25	Inference and analysis of cell-cell communication of non-myeloid circulating cells in late sepsis based on single-cell RNA-seq 2024-Dec, IET systems biology IF:1.9Q3 DOI:10.1049/syb2.12109 PMID:39578684	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症中非髓系循环细胞间的细胞间通讯	揭示了脓毒症患者中细胞间相互作用的数量和强度增加，并发现了几条显著改变的信号通路，特别是传统树突状细胞和浆细胞样树突状细胞中的通路	NA	深入理解晚期脓毒症中免疫功能障碍的潜在机制	晚期脓毒症中淋巴系来源的白细胞间的细胞间通讯	数字病理学	脓毒症	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	NA
6879	2024-12-25	Identification of CCR7 and CBX6 as key biomarkers in abdominal aortic aneurysm: Insights from multi-omics data and machine learning analysis 2024-Dec, IET systems biology IF:1.9Q3 DOI:10.1049/syb2.12106 PMID:39602349	研究论文	本研究利用多组学数据和机器学习技术，识别了腹主动脉瘤中的关键生物标志物CCR7和CBX6，并揭示了其免疫机制	首次通过多组学数据和机器学习技术识别了腹主动脉瘤中的关键生物标志物CCR7和CBX6，并揭示了它们与免疫细胞浸润的相关性	研究主要基于数据分析，缺乏实验验证	识别腹主动脉瘤的关键生物标志物并揭示其免疫机制	腹主动脉瘤中的关键生物标志物和免疫机制	机器学习	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
6880	2024-12-25	Cell- and tissue-specific glycosylation pathways informed by single-cell transcriptomics 2024-Dec, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1 DOI:10.1093/nargab/lqae169 PMID:39703423	研究论文	本研究通过单细胞转录组学分析了人类组织和细胞类型的糖基化相关基因表达，揭示了细胞和组织特异性糖基化途径	首次在糖科学领域应用单细胞转录组学，揭示了糖基化基因和途径的表达层次结构，并展示了细胞和组织特异性糖基化模式	研究依赖于Tabula Sapiens数据集，可能无法涵盖所有人类细胞类型和组织	探讨单细胞水平上糖基化相关基因的表达模式及其在不同组织和细胞类型中的特异性	人类组织和细胞类型的糖基化相关基因表达	生物学	NA	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	Tabula Sapiens数据集中的人类组织和细胞类型