单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6861 - 6880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6861 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis of CAR T-cell products reveals subpopulations, stimulation, and exhaustion signatures
2021-01-06, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1866287
PMID:33489472
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示CAR-T细胞产品的亚群组成、激活状态和耗竭特征 | 首次在单细胞水平系统分析CAR-T细胞产品的异质性，发现仅50%的CAR表达细胞在抗原刺激后发生转录变化，并识别出新的T细胞耗竭相关基因 | 样本量较小（仅3名健康供者），需要在更大队列中验证发现 | 深入理解CAR-T细胞的激活机制和异质性特征 | CAR-T细胞产品和外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 恶性肿瘤 | 流式细胞术, 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名健康供者，53,191个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6862 | 2025-10-06 |
The order and logic of CD4 versus CD8 lineage choice and differentiation in mouse thymus
2021-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20306-w
PMID:33397934
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究小鼠胸腺中CD4与CD8谱系选择的顺序和逻辑 | 首次在单细胞水平可视化选择中间体中辅助受体基因活性，揭示信号强度影响辅助受体基因活性时序的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 阐明CD4/CD8谱系选择的分子机制和时序逻辑 | 小鼠胸腺细胞选择中间体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量的小鼠胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6863 | 2025-10-06 |
The NF-κB regulator Bcl-3 restricts terminal differentiation and promotes memory cell formation of CD8+ T cells during viral infection
2021-01, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009249
PMID:33508001
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研究论文 | 本研究揭示了Bcl-3在CD8+ T细胞分化过程中的细胞自主性作用，通过调控终末效应细胞与记忆前体效应细胞之间的平衡来影响抗病毒免疫记忆形成 | 首次明确Bcl-3在CD8+ T细胞中的细胞自主性功能，证明其通过调节NF-κB信号通路控制T细胞分化命运 | 研究主要基于淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染模型，在其他病原体感染或疾病背景下的普适性需进一步验证 | 阐明Bcl-3在CD8+ T细胞分化过程中的分子机制及其对免疫记忆形成的影响 | CD8+ T细胞，特别是病毒特异性CD8+ T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，转基因技术 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | Bcl3-/-小鼠和转基因CD8+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6864 | 2025-10-06 |
How Do Uterine Natural Killer and Innate Lymphoid Cells Contribute to Successful Pregnancy?
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.607669
PMID:34234770
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综述 | 总结子宫先天淋巴细胞在妊娠过程中的表型和功能多样性研究进展 | 整合单细胞RNA测序和高维流式/质谱细胞术对子宫先天淋巴细胞群体进行详细表征 | 由于子宫组织在月经周期和妊娠期间快速变化的特性，确定各细胞亚群的具体功能具有固有挑战性 | 探讨子宫自然杀伤细胞和先天淋巴细胞如何促进成功妊娠 | 人类和小鼠的子宫先天淋巴细胞（uILCs） | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），高维流式细胞术，质谱细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6865 | 2025-10-06 |
The T-box transcription factor Eomesodermin governs haemogenic competence of yolk sac mesodermal progenitors
2021-01, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-00611-8
PMID:33420489
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研究论文 | 本研究揭示T-box转录因子Eomesodermin在调控卵黄囊中胚层祖细胞造血能力中的关键作用 | 首次证明Eomes通过调控增强子可及性决定中胚层祖细胞的造血能力，将Eomes置于早期血液形成转录层级的顶端 | 使用胚胎干细胞模型进行研究，可能与体内真实发育环境存在差异 | 探究卵黄囊中胚层祖细胞向造血命运定向的分子机制 | 胚胎干细胞模型、卵黄囊中胚层祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6866 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Hematopoietic Stem Cells
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1425-9_22
PMID:34057731
|
研究论文 | 介绍小鼠骨髓单细胞RNA测序分析的完整实验方案 | 结合Smart-Seq2和mcSCRB-Seq协议优化出板式单细胞分析方法，并整合液滴式高通量方法 | 主要针对小鼠骨髓样本，未涉及其他组织或物种 | 建立造血干细胞单细胞转录组分析的标准实验流程 | 小鼠骨髓造血祖细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 6867 | 2025-10-06 |
Exploiting Single-Cell Tools in Gene and Cell Therapy
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.702636
PMID:34322133
|
综述 | 本文综述了单细胞工具在基因和细胞治疗领域的应用与发展 | 整合单细胞多组学与功能数据，结合空间转录组/蛋白质组学和CRISPR技术推动细胞与基因治疗 | NA | 探讨单细胞技术在基因和细胞治疗中的临床应用 | 单细胞分子特征（基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组） | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学, CRISPR技术, 碱基编辑 | NA | 单细胞分子数据, 功能数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6868 | 2025-10-06 |
Automated methods for cell type annotation on scRNA-seq data
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.01.015
PMID:33613863
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据中自动细胞类型注释的可用工具和基础方法 | 系统总结和比较了基于标记基因数据库、参考表达数据相关性和监督分类标签转移等不同策略的自动化细胞类型注释方法 | NA | 概述单细胞RNA测序数据中自动细胞类型注释的工具和方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督分类 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6869 | 2025-10-06 |
Space-time logic of liver gene expression at sub-lobular scale
2021-01, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-020-00323-1
PMID:33432202
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝脏基因在亚小叶尺度上的时空表达逻辑 | 首次在单细胞水平分析肝脏分区与昼夜节律的相互作用，发现基因表达具有乘性时空效应 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证机制 | 探究肝脏基因在空间分区和时间节律维度上的调控机制 | 小鼠肝脏细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, smFISH | 混合效应模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6870 | 2025-10-06 |
Diversification of molecularly defined myenteric neuron classes revealed by single-cell RNA sequencing
2021-01, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00736-x
PMID:33288908
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠小肠肌间神经丛中12种神经元类群的分子分类体系 | 发现了神经元多样化的新机制——两个神经元类群通过二元神经源性分支产生，其他身份通过有丝分裂后分化形成 | 研究仅限于小鼠小肠肌间神经丛，人类或其他肠道区域的适用性尚待验证 | 建立肠道神经系统神经元的分子分类体系并解析其发育机制 | 小鼠小肠肌间神经丛神经元 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6871 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing of Developing Human Gut Reveals Transcriptional Links to Childhood Crohn's Disease
2020-12-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.11.010
PMID:33290721
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序绘制了人类肠道发育图谱，并揭示了与儿童克罗恩病的转录关联 | 发现了不同于LGR5表达细胞的循环上皮前体细胞，揭示了胎儿转录因子在克罗恩病中的重新激活 | 研究仅涵盖6-10周孕期的肠道发育阶段，样本时间范围有限 | 解析人类肠道发育过程及其与儿童克罗恩病的关联机制 | 发育中的人类肠道组织（6-10周孕期）和儿童克罗恩病患者上皮组织 | 单细胞生物学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 发育期肠道组织（6-10周孕期）和儿童克罗恩病匹配健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6872 | 2025-10-06 |
Generation of a Single-Cell RNAseq Atlas of Murine Salivary Gland Development
2020-Dec-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101838
PMID:33305192
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研究论文 | 构建了小鼠颌下腺发育过程的单细胞RNA测序图谱，揭示了关键发育阶段的细胞异质性 | 首次创建了小鼠唾液腺发育的单细胞转录组图谱，识别了腺泡和导管细胞群的可塑性及与腺泡分化相关的转录因子 | 仅针对小鼠模型进行研究，未涉及人类或其他物种的验证 | 解析器官发育过程中的动态转录景观，为再生治疗提供模板 | 小鼠颌下腺 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6873 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of the first intra-mammalian developmental stage of the human parasite Schistosoma mansoni
2020-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20092-5
PMID:33339816
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了曼氏血吸虫早期哺乳动物内发育阶段的细胞类型图谱 | 首次提供了曼氏血吸虫最早哺乳动物内发育阶段（血吸虫体）的单细胞分辨率转录组图谱 | 仅针对两天龄的血吸虫体进行研究，未覆盖其他发育阶段 | 解析血吸虫在哺乳动物宿主内早期发育的细胞类型组成和转录动态 | 曼氏血吸虫两天龄血吸虫体 | 单细胞生物学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序，原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 两天龄曼氏血吸虫血吸虫体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6874 | 2025-10-06 |
Transfer learning efficiently maps bone marrow cell types from mouse to human using single-cell RNA sequencing
2020-12-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01463-6
PMID:33277618
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研究论文 | 本研究利用迁移学习技术，通过单细胞RNA测序数据实现小鼠与人类骨髓细胞类型的高效跨物种映射 | 首次将迁移学习应用于跨物种单细胞RNA测序数据分析，证明简单逻辑回归模型能达到与复杂神经网络相当的性能 | 某些人类细胞类型难以准确识别，表明物种间存在重要生物学差异 | 开发跨物种骨髓细胞类型映射方法 | 小鼠和人类骨髓细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 多类逻辑回归, 人工神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6875 | 2025-10-06 |
Transcriptomic profiling across the nonalcoholic fatty liver disease spectrum reveals gene signatures for steatohepatitis and fibrosis
2020-12-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aba4448
PMID:33268509
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研究论文 | 通过转录组分析揭示非酒精性脂肪性肝病谱系中脂肪性肝炎和纤维化的基因特征 | 首次在大规模多中心研究中系统识别出25个与纤维化进展相关的差异表达基因特征，并通过单细胞RNA测序数据解析了肝内特定细胞群的贡献 | 研究样本量有限，需要进一步验证这些生物标志物在更广泛人群中的临床应用价值 | 探索非酒精性脂肪性肝病进展至肝硬化的分子机制并识别潜在的循环生物标志物 | 非酒精性脂肪性肝病患者肝组织和血清样本 | 转录组学 | 非酒精性脂肪性肝病 | RNA测序，单细胞RNA测序，SomaScan蛋白分析 | 逻辑回归模型 | 转录组数据，蛋白质组数据 | 发现队列206例患者，验证队列175例患者，300多份血清样本 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6876 | 2025-10-06 |
A Conserved TCRβ Signature Dominates a Highly Polyclonal T-Cell Expansion During the Acute Phase of a Murine Malaria Infection
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.587756
PMID:33329568
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研究论文 | 本研究通过分析小鼠疟疾感染急性期脾脏CD4 T细胞受体库，揭示了在高度多克隆扩增中存在保守的TCRβ特征 | 首次描述了疟疾感染急性期T细胞扩增的克隆性和克隆组成，发现TRBV3基因使用在效应T细胞库中持续占主导地位 | 研究仅限于小鼠模型，尚未确定驱动这种保守反应的宿主或寄生虫因素 | 阐明疟疾感染急性期T细胞受体库的克隆组成和特征 | 小鼠脾脏CD4 αβ T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, RNA-seq分析 | NA | 基因表达数据, T细胞受体序列数据 | 多个重复实验的小鼠脾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA-seq | NA | NA |
| 6877 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Tocilizumab-Treated Peripheral Blood Mononuclear Cells as an in vitro Model of Inflammation
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.610682
PMID:33469465
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析托珠单抗处理的外周血单个核细胞，建立体外炎症模型 | 首次在单细胞水平展示托珠单抗对炎症相关基因和生物学通路的抑制作用 | 样本来源于肾移植受者，可能限制结果在COVID-19中的直接适用性 | 研究托珠单抗在炎症条件下的生物学效应 | 托珠单抗处理前后的刺激外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 体外炎症模型 | 单细胞基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6878 | 2025-10-06 |
BingleSeq: a user-friendly R package for bulk and single-cell RNA-Seq data analysis
2020, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.10469
PMID:33391870
|
研究论文 | 开发了一个用户友好的R软件包BingleSeq，用于批量RNA测序和单细胞RNA测序数据分析 | 提供了同时支持批量RNA测序和单细胞RNA测序分析的灵活工具，集成了三种先进软件包并采用交互式仪表板界面 | 未在摘要中明确说明 | 开发无需编程经验的RNA测序数据分析工具 | RNA测序产生的计数矩阵数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达计数矩阵 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6879 | 2025-10-06 |
Role of Vascular Smooth Muscle Cell Plasticity and Interactions in Vessel Wall Inflammation
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.599415
PMID:33324416
|
综述 | 本文探讨血管平滑肌细胞可塑性及其在血管壁炎症中的相互作用机制 | 整合新型技术方法揭示VSMC表现型转化的多样性及其在炎症过程中的非专业吞噬功能 | NA | 阐明动脉粥样硬化疾病中血管平滑肌细胞的生物学作用 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | NA | 心血管疾病 | 杂交邻近连接分析, CreER-loxP系统细胞命运追踪, 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6880 | 2025-10-06 |
Molecular Genetics of Kappa Opioids in Pain and Itch Sensations
2022, Handbook of experimental pharmacology
DOI:10.1007/164_2020_397
PMID:33145633
|
综述 | 本文综述了κ阿片受体及其内源性激动剂强啡肽在调节瘙痒和疼痛感觉中的分子遗传学机制 | 整合了单细胞测序数据重新分析显示这些分子的表达谱，并基于解剖结构系统梳理了κ阿片系统在不同部位的作用 | 仅考虑强啡肽与KOR的相互作用，未深入探讨高剂量下其他肽类对KOR的潜在刺激作用 | 探讨κ阿片受体系统在疼痛和瘙痒感觉调节中的分子遗传机制 | κ阿片受体及其内源性激动剂强啡肽，以及受其影响的细胞和神经回路 | 神经科学 | 疼痛和瘙痒相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |