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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6841 | 2025-10-06 |
Meta-analysis of tumor- and T cell-intrinsic mechanisms of sensitization to checkpoint inhibition
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.002
PMID:33508232
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荟萃分析 | 通过整合多种肿瘤类型的基因组和转录组数据,系统分析肿瘤细胞内在和微环境因素对检查点抑制剂敏感性的影响 | 首次在泛癌种水平验证了克隆肿瘤突变负荷是检查点抑制剂反应的最强预测因子,并发现CCR5和CXCL13作为T细胞内在的敏感性标志物 | 研究样本量相对有限,仅涵盖七种肿瘤类型,部分预测因子未达到泛癌种显著性 | 系统鉴定检查点抑制剂敏感性的肿瘤细胞内在和T细胞内在机制 | 1000多名接受检查点抑制剂治疗的患者,涵盖七种肿瘤类型 | 生物信息学 | 多种癌症 | 全外显子组测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 多变量预测模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 超过1000名患者 | NA | 全外显子组测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6842 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.12.016
PMID:33406409
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析人类肠道发育的时空动态 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学系统描绘人类肠道发育过程,识别了101种细胞状态和关键形态发生程序 | 研究主要关注胎儿期肠道发育,对出生后发育阶段涉及较少 | 解析人类肠道发育的细胞和分子机制 | 人类胎儿肠道组织 | 单细胞生物学, 发育生物学 | 肠道发育异常疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
6843 | 2025-10-06 |
Ubiquitination of MHC Class II by March-I Regulates Dendritic Cell Fitness
2021-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000975
PMID:33318291
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研究论文 | 本研究揭示了MHC II类分子泛素化通过March-I调控树突状细胞功能的新机制 | 首次证明MHC II类分子泛素化缺陷会导致树突状细胞功能缺陷,即使表面pMHC-II水平正常 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类细胞中验证 | 探究MHC II类分子泛素化对树突状细胞功能的调控机制 | 树突状细胞、CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6844 | 2025-10-06 |
Whole-body senescent cell clearance alleviates age-related brain inflammation and cognitive impairment in mice
2021-02, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13296
PMID:33470505
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研究论文 | 本研究通过清除衰老细胞改善老年小鼠大脑炎症和认知功能障碍 | 首次证明全身性清除衰老细胞可改善自然衰老过程中的认知功能,并发现小胶质细胞是衰老细胞清除的关键靶点 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究清除衰老细胞是否能改善年龄相关的认知功能障碍 | 年轻和老年小鼠,特别是海马体中的细胞 | 衰老生物学 | 年龄相关认知障碍 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | INK-ATTAC转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠海马体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6845 | 2025-10-06 |
Assembly and Exploration of a Single Cell Atlas of the Drosophila Larval Ventral Cord. Identification of Rare Cell Types
2021-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.37
PMID:33600085
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研究论文 | 本研究开发了一个用于单细胞RNA测序数据分析的多阶段分析流程,并将其应用于果蝇幼虫腹侧索细胞图谱的构建和探索 | 整合了多个R软件包中的模块,创建了一个灵活、高质量的单细胞RNA-seq数据分析流程,能够识别和描述罕见细胞类型 | 分析流程需要针对特定目标进行定制和调整,存在一定的技术门槛 | 开发单细胞RNA测序数据分析方法并探索果蝇幼虫腹侧索的细胞多样性 | 果蝇幼虫腹侧索细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多阶段分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 多个果蝇幼虫腹侧索数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6846 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Drosophila Larval Ventral Cord
2021-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.38
PMID:33620770
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研究论文 | 本文描述了针对果蝇幼虫腹侧神经索进行单细胞RNA测序分析的优化实验方案 | 开发了一套专门针对果蝇幼虫腹侧神经索的scRNA-seq优化方案,解决了果蝇脑组织细胞尺寸小的技术挑战 | 方案主要针对果蝇幼虫腹侧神经索,可能需要进一步优化才能应用于其他组织 | 建立适用于果蝇神经系统的单细胞RNA测序分析方法 | 果蝇幼虫腹侧神经索 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 3个独立样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6847 | 2025-10-06 |
Heterogeneous disease-propagating stem cells in juvenile myelomonocytic leukemia
2021-02-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20180853
PMID:33416891
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了幼年型粒单核细胞白血病中疾病传播干细胞的异质性特征 | 首次在JMML中鉴定出具有异质性的白血病干细胞群体,发现RAS通路突变是“首次打击”,并识别了新的治疗靶点/生物标志物 | 研究样本量有限,需要进一步验证候选靶点的临床价值 | 阐明幼年型粒单核细胞白血病的细胞层次结构和白血病干细胞特征 | 幼年型粒单核细胞白血病患者的造血干细胞/祖细胞 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 克隆形成实验 | NA | 单细胞基因表达数据 | JMML患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6848 | 2025-10-06 |
Long-term self-renewing stem cells in the adult mouse hippocampus identified by intravital imaging
2021-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00759-4
PMID:33349709
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研究论文 | 通过活体成像技术在成年小鼠海马体中鉴定出具有长期自我更新能力的神经干细胞 | 首次通过活体成像技术直接观察并证实成年海马体中存在具有长期自我更新能力的Gli1靶向神经干细胞群体 | 研究仅限于小鼠模型,人类海马体中是否存在类似干细胞群体尚不清楚 | 探究成年哺乳动物海马体中神经干细胞的长期自我更新能力 | 成年小鼠海马体中的神经干细胞 | 神经科学 | NA | 双光子显微镜, 活体成像, 单细胞RNA测序 | NA | 图像数据, 基因表达数据 | 成年小鼠海马体神经干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6849 | 2025-10-06 |
MicroExonator enables systematic discovery and quantification of microexons across mouse embryonic development
2021-01-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02246-2
PMID:33482885
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研究论文 | 本研究开发了MicroExonator流程,用于系统发现和定量分析小鼠胚胎发育过程中的微外显子 | 开发了首个可重复的从头发现和定量微外显子的新流程,提供了小鼠最全面的微外显子调查,发现了未被注释数据库收录的新微外显子 | 微外显子检测仍受限于标准RNA-seq比对工具的困难,研究主要聚焦于小鼠模型 | 系统研究微外显子在小鼠胚胎发育过程中的表达模式和功能 | 小鼠18个组织的289个RNA-seq数据集,涵盖9个胚胎和出生后发育阶段 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 无监督聚类 | RNA测序数据 | 289个RNA-seq数据集,来自18个小鼠组织 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
6850 | 2025-10-06 |
Persistence of mature dendritic cells, TH2A, and Tc2 cells characterize clinically resolved atopic dermatitis under IL-4Rα blockade
2021-01-22, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abe2749
PMID:33483337
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了特应性皮炎临床缓解后持续存在的特定免疫细胞群 | 首次发现特应性皮炎临床缓解后仍持续存在的成熟树突状细胞、TH2A细胞和Tc2细胞群,这些细胞构成疾病记忆 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 理解人类疾病中组织驻留免疫记忆的机制 | 接受IL-4Rα阻断剂dupilumab短期和长期治疗的特应性皮炎患者 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序,多重蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | 特应性皮炎患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq,多重蛋白质组学 | NA | NA |
6851 | 2025-10-06 |
Differential encoding in prefrontal cortex projection neuron classes across cognitive tasks
2021-01-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.11.046
PMID:33338423
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研究论文 | 本研究探讨小鼠前额叶皮层投射神经元的不同转录组类型如何与轴突投射和多个认知任务中的编码特性相关联 | 首次将单细胞转录组学与系统神经科学方法结合,在分子解剖特征明确的神经元类别中分析认知任务信号的组织方式 | 研究仅限于小鼠前额叶皮层的特定投射神经元类型,可能不适用于其他脑区或物种 | 揭示前额叶皮层不同分子类型投射神经元在认知任务中的编码特性差异 | 小鼠前额叶皮层投射神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学,钙成像 | NA | 基因表达数据,神经活动数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6852 | 2025-10-06 |
OCT4 induces embryonic pluripotency via STAT3 signaling and metabolic mechanisms
2021-01-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2008890118
PMID:33452132
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和定量免疫荧光技术揭示了OCT4通过STAT3信号通路和代谢机制调控胚胎多能性的新机制 | 发现OCT4通过调控JAK/STAT信号通路和代谢途径(特别是糖酵解限速酶和溶酶体通路)来建立和保护胚胎多能性 | 研究仅在小鼠胚胎中进行,尚未在其他物种验证 | 探究OCT4如何在胚胎中建立和保护多能性谱系 | 对照组和OCT4缺失小鼠囊胚内细胞团 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学,定量免疫荧光 | NA | 转录组数据,图像数据 | 两个发育阶段的小鼠囊胚内细胞团 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6853 | 2025-10-06 |
Regulation of Immune Responses by Nonhematopoietic Cells in Asthma
2021-01-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000885
PMID:33397743
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综述 | 本文探讨非造血细胞在哮喘免疫反应调控中的重要作用及其与免疫细胞的相互作用机制 | 揭示了肺上皮细胞等非造血细胞通过表达先天传感器和产生促炎分子在哮喘中的新型免疫调控功能 | NA | 阐明非造血细胞在哮喘发病机制中的免疫调控作用 | 肺组织非造血细胞(主要是上皮细胞)及其与免疫细胞的相互作用 | 免疫学 | 哮喘 | 细胞谱系追踪,单细胞RNA测序,反向遗传学方法 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6854 | 2025-10-06 |
Tuning MPL signaling to influence hematopoietic stem cell differentiation and inhibit essential thrombocythemia progenitors
2021-01-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2017849118
PMID:33384332
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研究论文 | 本研究开发了一种调节TPO-R信号的新型双特异性抗体,用于调控造血干细胞分化和抑制原发性血小板增多症 | 开发了能够通过不同几何构型调控TPO-R信号强度的双特异性抗体,实现了TPO/TPO-R双重功能的解耦 | NA | 研究调节TPO-R信号对造血干细胞分化和原发性血小板增多症的影响 | 造血干细胞和原发性血小板增多症祖细胞 | 单细胞测序 | 原发性血小板增多症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6855 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis of CAR T-cell products reveals subpopulations, stimulation, and exhaustion signatures
2021-01-06, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1866287
PMID:33489472
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示CAR-T细胞产品的亚群组成、激活状态和耗竭特征 | 首次在单细胞水平系统分析CAR-T细胞产品的异质性,发现仅50%的CAR表达细胞在抗原刺激后发生转录变化,并识别出新的T细胞耗竭相关基因 | 样本量较小(仅3名健康供者),需要在更大队列中验证发现 | 深入理解CAR-T细胞的激活机制和异质性特征 | CAR-T细胞产品和外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 恶性肿瘤 | 流式细胞术, 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名健康供者,53,191个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6856 | 2025-10-06 |
The order and logic of CD4 versus CD8 lineage choice and differentiation in mouse thymus
2021-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20306-w
PMID:33397934
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究小鼠胸腺中CD4与CD8谱系选择的顺序和逻辑 | 首次在单细胞水平可视化选择中间体中辅助受体基因活性,揭示信号强度影响辅助受体基因活性时序的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类或其他物种中验证 | 阐明CD4/CD8谱系选择的分子机制和时序逻辑 | 小鼠胸腺细胞选择中间体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量的小鼠胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6857 | 2025-10-06 |
The NF-κB regulator Bcl-3 restricts terminal differentiation and promotes memory cell formation of CD8+ T cells during viral infection
2021-01, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009249
PMID:33508001
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研究论文 | 本研究揭示了Bcl-3在CD8+ T细胞分化过程中的细胞自主性作用,通过调控终末效应细胞与记忆前体效应细胞之间的平衡来影响抗病毒免疫记忆形成 | 首次明确Bcl-3在CD8+ T细胞中的细胞自主性功能,证明其通过调节NF-κB信号通路控制T细胞分化命运 | 研究主要基于淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染模型,在其他病原体感染或疾病背景下的普适性需进一步验证 | 阐明Bcl-3在CD8+ T细胞分化过程中的分子机制及其对免疫记忆形成的影响 | CD8+ T细胞,特别是病毒特异性CD8+ T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,转基因技术 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | Bcl3-/-小鼠和转基因CD8+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6858 | 2025-10-06 |
How Do Uterine Natural Killer and Innate Lymphoid Cells Contribute to Successful Pregnancy?
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.607669
PMID:34234770
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综述 | 总结子宫先天淋巴细胞在妊娠过程中的表型和功能多样性研究进展 | 整合单细胞RNA测序和高维流式/质谱细胞术对子宫先天淋巴细胞群体进行详细表征 | 由于子宫组织在月经周期和妊娠期间快速变化的特性,确定各细胞亚群的具体功能具有固有挑战性 | 探讨子宫自然杀伤细胞和先天淋巴细胞如何促进成功妊娠 | 人类和小鼠的子宫先天淋巴细胞(uILCs) | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq),高维流式细胞术,质谱细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6859 | 2025-10-06 |
The T-box transcription factor Eomesodermin governs haemogenic competence of yolk sac mesodermal progenitors
2021-01, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-00611-8
PMID:33420489
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研究论文 | 本研究揭示T-box转录因子Eomesodermin在调控卵黄囊中胚层祖细胞造血能力中的关键作用 | 首次证明Eomes通过调控增强子可及性决定中胚层祖细胞的造血能力,将Eomes置于早期血液形成转录层级的顶端 | 使用胚胎干细胞模型进行研究,可能与体内真实发育环境存在差异 | 探究卵黄囊中胚层祖细胞向造血命运定向的分子机制 | 胚胎干细胞模型、卵黄囊中胚层祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6860 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Hematopoietic Stem Cells
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1425-9_22
PMID:34057731
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研究论文 | 介绍小鼠骨髓单细胞RNA测序分析的完整实验方案 | 结合Smart-Seq2和mcSCRB-Seq协议优化出板式单细胞分析方法,并整合液滴式高通量方法 | 主要针对小鼠骨髓样本,未涉及其他组织或物种 | 建立造血干细胞单细胞转录组分析的标准实验流程 | 小鼠骨髓造血祖细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |