单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 27504 篇文献,本页显示第 6841 - 6860 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
6841 2024-10-30
Integration of ubiquitination-related genes in predictive signatures for prognosis and immunotherapy response in sarcoma
2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 研究分析了泛素化相关基因在肉瘤中的表达模式、预后意义及其机制,并构建了预测模型 首次系统分析了泛素化相关基因在肉瘤中的表达模式及其预后意义,并构建了预测模型 研究主要基于公共数据库和临床样本,缺乏大规模前瞻性临床试验验证 探讨泛素化相关基因在肉瘤中的表达模式及其预后意义,并构建预测模型 泛素化相关基因在肉瘤中的表达及其预后意义 数字病理学 肉瘤 RT-qPCR LASSO-Cox回归 基因表达数据 TCGA-SARC数据库中的样本及GEO数据库和临床组织样本
6842 2024-10-30
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-Nov-02, Endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 本研究开发并表征了两种内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌体外模型,以识别可能的治疗脆弱性 本研究首次开发了两种长期雌激素剥夺的细胞系,并结合全基因组测序和单细胞RNA测序,揭示了HER2+/ER+乳腺癌内分泌治疗耐药的分子机制和代谢重塑 本研究仅限于体外模型,尚未在临床环境中验证其发现 识别HER2+/ER+乳腺癌内分泌治疗耐药的潜在治疗靶点 HER2+/ER+乳腺癌细胞系及其内分泌治疗耐药变异体 数字病理学 乳腺癌 全基因组测序、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、转录组数据 两种HER2+/ER+乳腺癌细胞系及其长期雌激素剥夺变异体
6843 2024-10-30
A hybrid machine learning and regression method for cell type deconvolution of spatial barcoding-based transcriptomic data
2023-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种混合机器学习和回归方法SDePER,用于空间条形码转录组数据的细胞类型反卷积 SDePER方法通过机器学习去除ST和scRNA-seq数据之间的系统差异(平台效应),并考虑了细胞类型的稀疏性和空间相关性 NA 开发一种新的方法来提高空间条形码转录组数据的细胞类型反卷积的准确性和鲁棒性 空间条形码转录组数据和单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 混合机器学习和回归模型 转录组数据 四个真实数据集和模拟数据
6844 2024-10-30
Systems biological assessment of the temporal dynamics of immunity to a viral infection in the first weeks and months of life
2023-Jan-31, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本文通过多组学方法,对婴儿和幼儿在生命早期几周和几个月内对SARS-CoV-2感染的免疫动态进行了纵向分析 首次提供了生命早期几周和几个月内对病毒感染的免疫动态的快照 NA 研究婴儿和幼儿在生命早期对SARS-CoV-2感染的免疫动态 婴儿和幼儿对SARS-CoV-2感染的先天性和适应性免疫反应 NA NA 多组学分析 NA 血液样本 感染前、感染期间和感染后收集的血液样本
6845 2024-10-30
Targeting Immune-Fibroblast Crosstalk in Myocardial Infarction and Cardiac Fibrosis
2023-Jan-26, Research square
研究论文 研究心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞之间的相互作用 首次揭示了人类心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞之间的分子机制,并展示了通过靶向炎症治疗组织纤维化的潜力 研究主要基于小鼠模型和人类心脏样本,可能存在种属差异 探讨心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞的相互作用机制 心肌梗死和心脏纤维化中的免疫细胞与成纤维细胞 NA 心血管疾病 单细胞基因表达分析、表位映射、染色质可及性分析 NA 基因表达数据 38名急性心肌梗死和慢性心力衰竭患者的心脏样本
6846 2024-10-30
Derivation of extra-embryonic and intra-embryonic macrophage lineages from human pluripotent stem cells
2022-04-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 本文研究了从人类多能干细胞中衍生出的胚外和胚内巨噬细胞谱系 开发了一种系统,能够生成类似于组织驻留或单核细胞来源的巨噬细胞的纯培养物,并揭示了这些巨噬细胞在形态学、转录和功能上的差异 NA 研究组织驻留巨噬细胞的发育和功能,并探索其在组织工程和再生医学中的应用潜力 人类多能干细胞衍生的胚外和胚内巨噬细胞 细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
6847 2024-10-29
Comprehensive integration of single-cell RNA and transcriptome RNA sequencing to establish a pyroptosis-related signature for improving prognostic prediction of gastric cancer
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据,建立了一个与细胞焦亡相关的特征,以提高胃癌患者的预后预测 首次整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据,建立了一个与细胞焦亡相关的特征,用于预测胃癌患者的生存时间和治疗反应 需要进一步验证该特征在不同人群和不同治疗方案中的适用性 探索细胞焦亡相关基因作为胃癌患者的预后生物标志物和治疗指标的价值 胃癌患者的细胞焦亡相关基因表达和分布 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 LASSO分析 RNA GSE183904数据集和TCGA数据库中的胃癌转录组数据
6848 2024-10-29
Bulk and single-cell RNA-seq analyses reveal canonical RNA editing associated with microglia homeostasis and its role in sepsis-associated encephalopathy
2024-Nov-12, Neuroscience IF:2.9Q2
研究论文 研究分析了大量和小鼠脑组织及小胶质细胞样本的单细胞RNA测序数据,探讨了与小胶质细胞稳态相关的经典RNA编辑及其在脓毒症相关脑病中的作用 首次揭示了小胶质细胞稳态与RNA编辑在脓毒症相关脑病中的关系,并提供了新的见解 研究主要基于小鼠模型,结果的临床相关性需要进一步验证 探讨小胶质细胞稳态与RNA编辑在脓毒症相关脑病中的关系 小鼠脑组织及小胶质细胞样本 数字病理学 脓毒症相关脑病 RNA测序 NA RNA 107个脑组织和小胶质细胞样本
6849 2024-10-29
Neuron-glia crosstalk and inflammatory mediators in migraine pathophysiology
2024-Nov-12, Neuroscience IF:2.9Q2
综述 本文综述了偏头痛病理生理学中神经炎症机制的细胞和分子层面 介绍了PBR28-靶向成像和单细胞测序等新技术在理解偏头痛神经炎症机制中的应用 NA 探讨偏头痛的神经炎症机制及其在个性化治疗中的应用 偏头痛的神经炎症机制,包括细胞和分子层面的研究 NA 偏头痛 单细胞测序 NA NA NA
6850 2024-10-29
Blocking the HIF-1α/glycolysis axis inhibits allergic airway inflammation by reducing ILC2 metabolism and function
2024-Oct-27, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 研究HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的作用 首次揭示了HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的关键作用 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步在人体中验证 探讨HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的作用 小鼠和人类的ILC2细胞 NA 哮喘 糖酵解抑制剂和HIF-1α抑制剂 NA 转录组数据、代谢数据和染色质免疫沉淀分析 小鼠和人类样本
6851 2024-10-29
Integrative analysis of bulk and single-cell transcriptomic data reveals novel insights into lipid metabolism and prognostic factors in hepatocellular carcinoma
2024-Oct-25, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究整合了大量和单细胞转录组数据,揭示了肝细胞癌中脂质代谢相关基因的状态及其作为预后因子的潜力 首次整合大量和单细胞转录组数据,识别出与脂质代谢相关的基因,并开发了机器学习模型用于预测肝细胞癌的预后 研究依赖于公共数据库中的数据,可能存在数据质量和代表性的限制 探讨肝细胞癌中脂质代谢相关基因的状态及其作为预后因子的潜力 肝细胞癌患者的脂质代谢相关基因及预后因子 数字病理学 肝癌 单细胞测序 机器学习模型 转录组数据 大量和单细胞转录组数据来自公共数据库
6852 2024-10-29
Microglia regulate GABAergic neurogenesis in prenatal human brain through IGF1
2024-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究揭示了微胶质细胞通过IGF1调节人类胎儿大脑中GABA能神经元的生成 首次揭示了微胶质细胞通过IGF1促进神经前体细胞增殖和GABA能神经元发育的新机制 NA 探讨人类胎儿大脑中GABA能神经元生成的发育机制 人类胎儿大脑中的GABA能神经元和微胶质细胞 神经科学 NA 单细胞转录组学、生物信息学和组织学分析 NA 转录组数据 使用新开发的神经免疫hMGE类器官模型进行实验
6853 2024-10-29
The First Comprehensive Description of the Platelet Single Cell Transcriptome
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 首次全面描述了血小板单细胞转录组 首次使用单细胞RNA测序技术分析血小板转录组,揭示了血小板基因表达的异质性 现有的细胞识别算法可能导致血小板被错误分类为其他血细胞类型 扩展对血小板功能的理解,超越其在凝血中的传统角色 血小板单细胞转录组 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 7名健康供体的血小板样本
6854 2024-10-29
In vivo CRISPRi screen identified lncRNA portfolio crucial for cutaneous squamous cell carcinoma tumor growth
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过体内CRISPRi筛选,识别出对皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长至关重要的lncRNA组合 首次通过单细胞测序数据和CRISPR干扰筛选,识别出在皮肤鳞状细胞癌中起关键作用的lncRNA组合 研究主要集中在体外和异种移植模型中,未来需要进一步验证这些lncRNA在人体内的作用 揭示皮肤鳞状细胞癌发展中的非编码RNA的作用 皮肤鳞状细胞癌中的lncRNA 数字病理学 皮肤癌 CRISPR干扰筛选 NA 单细胞测序数据 来自正常和皮肤鳞状细胞癌的人类皮肤组织样本
6855 2024-10-29
The mTOR Pathway: A Common Link Between Alzheimer's Disease and Down Syndrome
2024-Oct-17, Journal of clinical medicine IF:3.0Q1
研究论文 本文探讨了mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合症之间的共同联系 本文首次利用基因组学、空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学等新技术,分析mTOR通路与唐氏综合症相关阿尔茨海默病的关系 本文尚未完全揭示唐氏综合症相关阿尔茨海默病病理进展的机制 研究mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合症中的作用 mTOR通路及其上游调控因子在唐氏综合症相关阿尔茨海默病中的作用 NA 阿尔茨海默病 基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 NA NA NA
6856 2024-10-29
Single-Cell Antigen Receptor Sequencing in Pigs with Influenza
2024-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了适用于猪的单细胞抗原受体测序方法,结合scRNAseq和TCR/BCR序列分析,研究了猪在流感感染后的肺部免疫反应 首次在猪中结合scRNAseq和TCR/BCR序列分析,研究了流感感染后的肺部免疫反应 仅限于猪模型,未在其他物种中验证 研究猪在流感感染后的肺部适应性免疫系统 猪的肺部T细胞和B细胞受体 数字病理学 流感 单细胞RNA测序(scRNAseq),10x Genomics VDJ测序 NA RNA 来自表达和缺乏特定基因的猪的冷冻肺细胞,以及FACS分选的T细胞
6857 2024-10-29
Single-cell and spatial detection of senescent cells using DeepScence
2024-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种基于深度神经网络的方法DeepScence,用于在单细胞和空间转录组数据中识别衰老细胞 DeepScence基于我们精心挑选的衰老相关基因集CoreScence,能够准确识别单细胞和空间转录组数据中的衰老细胞,显著优于现有方法 NA 开发一种能够准确识别衰老细胞的方法,以研究其空间和分子特征 衰老细胞 机器学习 NA 深度神经网络 深度神经网络 单细胞和空间转录组数据 NA
6858 2024-10-29
Obesity-Associated Changes in Immune Cell Dynamics During Alphavirus Infection Revealed by Single Cell Transcriptomic Analysis
2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过单细胞转录组分析揭示了肥胖与阿尔法病毒感染期间免疫细胞动态变化的关系 首次探讨了肥胖对阿尔法病毒感染期间免疫细胞功能的影响,并发现了肥胖小鼠中缺失的一种独特巨噬细胞亚群 研究仅限于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类 探讨肥胖对阿尔法病毒感染期间免疫细胞功能的影响 肥胖和正常体重小鼠在阿尔法病毒感染期间的免疫细胞动态变化 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 肥胖和正常体重小鼠样本
6859 2024-10-29
Integrative Omics Strategies for Understanding and Combating Brown Planthopper Virulence in Rice Production: A Review
2024-Oct-12, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了利用整合组学策略理解并对抗褐飞虱对水稻生产的危害 整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据,深入理解褐飞虱的生物学特性,并探讨了通过操纵宿主-微生物相互作用来增强植物保护的新机会 尚未全面开展利用下一代组学技术对褐飞虱的遗传相互作用和种群动态进行全面研究 总结近期利用组学数据对抗褐飞虱的进展和新视角,以开发更可持续的害虫管理策略 褐飞虱及其与水稻的相互作用 NA NA 基因组测序、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞RNA测序、元基因组学 NA 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 NA
6860 2024-10-29
Single-Cell Transcriptomics Reveals Cellular Heterogeneity and Drivers in Serrated Pathway-Driven Colorectal Cancer Progression
2024-Oct-11, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了锯齿状病变在结直肠癌进展中的细胞异质性和驱动因素 首次通过单细胞RNA测序揭示了锯齿状病变在结直肠癌进展中的细胞异质性和驱动因素 研究样本量有限,可能影响结果的普适性 阐明锯齿状病变在结直肠癌进展中的机制 正常结肠组织和锯齿状病变组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA RNA 三份正常结肠组织和十五份锯齿状病变组织
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