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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6841 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Human Developmental Hematopoiesis
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.11.015
PMID:33352111
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序分析人类发育期造血过程 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq技术分析人类发育期造血过程,识别了三个高增殖性寡能祖细胞群并揭示了表观遗传先于转录的启动现象 | 研究样本仅限于胎儿肝脏和骨髓,样本量相对有限 | 阐明人类发育期造血调控机制 | 人类胎儿肝脏和骨髓中的免疫表型血细胞 | 单细胞多组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞基因表达数据, 染色质可及性数据 | 超过8,000个人类免疫表型血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
6842 | 2025-10-06 |
Evaluation of Ranzoni et al.: Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Human Developmental Hematopoiesis
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.020
PMID:33667351
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评论 | 本文是对Ranzoni等人关于人类发育造血过程中单细胞RNA测序和ATAC测序整合分析研究的同行评审过程示例 | NA | NA | 展示科学研究中的同行评审过程 | 人类发育造血研究论文的评审过程 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
6843 | 2025-10-06 |
Population-scale single-cell RNA-seq profiling across dopaminergic neuron differentiation
2021-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00801-6
PMID:33664506
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研究论文 | 通过大规模单细胞RNA测序研究215个人类iPSC系分化为多巴胺能神经元过程中的遗传变异功能 | 开发高效多重策略在三个分化时间点对超过100万个细胞进行单细胞RNA测序,发现46%的eQTL未在GTEx数据库中出现 | 研究仅限于中脑神经命运分化过程,未涵盖其他细胞类型或发育阶段 | 研究常见遗传变异在原发性人类组织和发育过程中的功能 | 215个人类诱导多能干细胞系及其分化的多巴胺能神经元 | 单细胞基因组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | eQTL分析 | 单细胞转录组数据 | 215个iPSC系,超过100万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6844 | 2025-10-06 |
Identification of resistance pathways and therapeutic targets in relapsed multiple myeloma patients through single-cell sequencing
2021-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01232-w
PMID:33619369
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研究论文 | 通过单细胞测序技术识别复发性多发性骨髓瘤患者的耐药通路和治疗靶点 | 首次将纵向单细胞RNA测序与前瞻性临床试验相结合,揭示了包括低氧耐受、蛋白质折叠和线粒体呼吸在内的新型耐药分子通路,并发现PPIA作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限(41例患者),为单臂临床试验设计缺乏对照组 | 研究多发性骨髓瘤耐药机制并识别新的治疗靶点 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者(41例)、健康受试者(11例)和新诊断MM患者(15例) | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据 | 41例耐药/早期复发患者、11例健康对照、15例新诊断患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6845 | 2025-10-06 |
Cholangiocyte organoids can repair bile ducts after transplantation in the human liver
2021-02-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz6964
PMID:33602855
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研究论文 | 本研究证明胆管细胞类器官可在移植后修复人类肝脏中的胆管 | 首次将胆管细胞类器官应用于人类肝脏修复,并证明其移植后能恢复体内转录特征 | 研究在离体常温灌注模型中进行,尚未进行体内临床试验 | 探索类器官技术在再生医学中修复人类胆管的可行性 | 人类胆管细胞和胆管类器官 | 再生医学 | 胆管病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6846 | 2025-10-06 |
Common clonal origin of conventional T cells and induced regulatory T cells in breast cancer patients
2021-02-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21297-y
PMID:33602930
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研究论文 | 本研究通过T细胞受体和单细胞转录组测序分析乳腺癌患者中调节性T细胞的克隆起源 | 首次揭示人类乳腺癌中调节性T细胞可能主要来源于抗原经验性常规T细胞通过肿瘤内激活转化为诱导性调节性T细胞 | 研究仅限于乳腺癌患者,机制细节仍需进一步验证 | 探究人类癌症中调节性T细胞库形成的机制 | 乳腺癌患者的调节性CD4 T细胞和常规T细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | T细胞受体测序, 单细胞转录组测序 | 轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据 | 乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6847 | 2025-10-06 |
Meta-analysis of tumor- and T cell-intrinsic mechanisms of sensitization to checkpoint inhibition
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.002
PMID:33508232
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荟萃分析 | 通过整合多种肿瘤类型的基因组和转录组数据,系统分析肿瘤细胞内在和微环境因素对检查点抑制剂敏感性的影响 | 首次在泛癌种水平验证了克隆肿瘤突变负荷是检查点抑制剂反应的最强预测因子,并发现CCR5和CXCL13作为T细胞内在的敏感性标志物 | 研究样本量相对有限,仅涵盖七种肿瘤类型,部分预测因子未达到泛癌种显著性 | 系统鉴定检查点抑制剂敏感性的肿瘤细胞内在和T细胞内在机制 | 1000多名接受检查点抑制剂治疗的患者,涵盖七种肿瘤类型 | 生物信息学 | 多种癌症 | 全外显子组测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 多变量预测模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 超过1000名患者 | NA | 全外显子组测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6848 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.12.016
PMID:33406409
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析人类肠道发育的时空动态 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学系统描绘人类肠道发育过程,识别了101种细胞状态和关键形态发生程序 | 研究主要关注胎儿期肠道发育,对出生后发育阶段涉及较少 | 解析人类肠道发育的细胞和分子机制 | 人类胎儿肠道组织 | 单细胞生物学, 发育生物学 | 肠道发育异常疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
6849 | 2025-10-06 |
Ubiquitination of MHC Class II by March-I Regulates Dendritic Cell Fitness
2021-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000975
PMID:33318291
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研究论文 | 本研究揭示了MHC II类分子泛素化通过March-I调控树突状细胞功能的新机制 | 首次证明MHC II类分子泛素化缺陷会导致树突状细胞功能缺陷,即使表面pMHC-II水平正常 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类细胞中验证 | 探究MHC II类分子泛素化对树突状细胞功能的调控机制 | 树突状细胞、CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6850 | 2025-10-06 |
Whole-body senescent cell clearance alleviates age-related brain inflammation and cognitive impairment in mice
2021-02, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13296
PMID:33470505
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研究论文 | 本研究通过清除衰老细胞改善老年小鼠大脑炎症和认知功能障碍 | 首次证明全身性清除衰老细胞可改善自然衰老过程中的认知功能,并发现小胶质细胞是衰老细胞清除的关键靶点 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究清除衰老细胞是否能改善年龄相关的认知功能障碍 | 年轻和老年小鼠,特别是海马体中的细胞 | 衰老生物学 | 年龄相关认知障碍 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | INK-ATTAC转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠海马体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6851 | 2025-10-06 |
Assembly and Exploration of a Single Cell Atlas of the Drosophila Larval Ventral Cord. Identification of Rare Cell Types
2021-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.37
PMID:33600085
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研究论文 | 本研究开发了一个用于单细胞RNA测序数据分析的多阶段分析流程,并将其应用于果蝇幼虫腹侧索细胞图谱的构建和探索 | 整合了多个R软件包中的模块,创建了一个灵活、高质量的单细胞RNA-seq数据分析流程,能够识别和描述罕见细胞类型 | 分析流程需要针对特定目标进行定制和调整,存在一定的技术门槛 | 开发单细胞RNA测序数据分析方法并探索果蝇幼虫腹侧索的细胞多样性 | 果蝇幼虫腹侧索细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多阶段分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 多个果蝇幼虫腹侧索数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6852 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Drosophila Larval Ventral Cord
2021-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.38
PMID:33620770
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研究论文 | 本文描述了针对果蝇幼虫腹侧神经索进行单细胞RNA测序分析的优化实验方案 | 开发了一套专门针对果蝇幼虫腹侧神经索的scRNA-seq优化方案,解决了果蝇脑组织细胞尺寸小的技术挑战 | 方案主要针对果蝇幼虫腹侧神经索,可能需要进一步优化才能应用于其他组织 | 建立适用于果蝇神经系统的单细胞RNA测序分析方法 | 果蝇幼虫腹侧神经索 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 3个独立样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6853 | 2025-10-06 |
Heterogeneous disease-propagating stem cells in juvenile myelomonocytic leukemia
2021-02-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20180853
PMID:33416891
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了幼年型粒单核细胞白血病中疾病传播干细胞的异质性特征 | 首次在JMML中鉴定出具有异质性的白血病干细胞群体,发现RAS通路突变是“首次打击”,并识别了新的治疗靶点/生物标志物 | 研究样本量有限,需要进一步验证候选靶点的临床价值 | 阐明幼年型粒单核细胞白血病的细胞层次结构和白血病干细胞特征 | 幼年型粒单核细胞白血病患者的造血干细胞/祖细胞 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 克隆形成实验 | NA | 单细胞基因表达数据 | JMML患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6854 | 2025-10-06 |
Long-term self-renewing stem cells in the adult mouse hippocampus identified by intravital imaging
2021-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00759-4
PMID:33349709
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研究论文 | 通过活体成像技术在成年小鼠海马体中鉴定出具有长期自我更新能力的神经干细胞 | 首次通过活体成像技术直接观察并证实成年海马体中存在具有长期自我更新能力的Gli1靶向神经干细胞群体 | 研究仅限于小鼠模型,人类海马体中是否存在类似干细胞群体尚不清楚 | 探究成年哺乳动物海马体中神经干细胞的长期自我更新能力 | 成年小鼠海马体中的神经干细胞 | 神经科学 | NA | 双光子显微镜, 活体成像, 单细胞RNA测序 | NA | 图像数据, 基因表达数据 | 成年小鼠海马体神经干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6855 | 2025-10-06 |
MicroExonator enables systematic discovery and quantification of microexons across mouse embryonic development
2021-01-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02246-2
PMID:33482885
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研究论文 | 本研究开发了MicroExonator流程,用于系统发现和定量分析小鼠胚胎发育过程中的微外显子 | 开发了首个可重复的从头发现和定量微外显子的新流程,提供了小鼠最全面的微外显子调查,发现了未被注释数据库收录的新微外显子 | 微外显子检测仍受限于标准RNA-seq比对工具的困难,研究主要聚焦于小鼠模型 | 系统研究微外显子在小鼠胚胎发育过程中的表达模式和功能 | 小鼠18个组织的289个RNA-seq数据集,涵盖9个胚胎和出生后发育阶段 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 无监督聚类 | RNA测序数据 | 289个RNA-seq数据集,来自18个小鼠组织 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
6856 | 2025-10-06 |
Persistence of mature dendritic cells, TH2A, and Tc2 cells characterize clinically resolved atopic dermatitis under IL-4Rα blockade
2021-01-22, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abe2749
PMID:33483337
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了特应性皮炎临床缓解后持续存在的特定免疫细胞群 | 首次发现特应性皮炎临床缓解后仍持续存在的成熟树突状细胞、TH2A细胞和Tc2细胞群,这些细胞构成疾病记忆 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 理解人类疾病中组织驻留免疫记忆的机制 | 接受IL-4Rα阻断剂dupilumab短期和长期治疗的特应性皮炎患者 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序,多重蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | 特应性皮炎患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq,多重蛋白质组学 | NA | NA |
6857 | 2025-10-06 |
Differential encoding in prefrontal cortex projection neuron classes across cognitive tasks
2021-01-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.11.046
PMID:33338423
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研究论文 | 本研究探讨小鼠前额叶皮层投射神经元的不同转录组类型如何与轴突投射和多个认知任务中的编码特性相关联 | 首次将单细胞转录组学与系统神经科学方法结合,在分子解剖特征明确的神经元类别中分析认知任务信号的组织方式 | 研究仅限于小鼠前额叶皮层的特定投射神经元类型,可能不适用于其他脑区或物种 | 揭示前额叶皮层不同分子类型投射神经元在认知任务中的编码特性差异 | 小鼠前额叶皮层投射神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学,钙成像 | NA | 基因表达数据,神经活动数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6858 | 2025-10-06 |
OCT4 induces embryonic pluripotency via STAT3 signaling and metabolic mechanisms
2021-01-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2008890118
PMID:33452132
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和定量免疫荧光技术揭示了OCT4通过STAT3信号通路和代谢机制调控胚胎多能性的新机制 | 发现OCT4通过调控JAK/STAT信号通路和代谢途径(特别是糖酵解限速酶和溶酶体通路)来建立和保护胚胎多能性 | 研究仅在小鼠胚胎中进行,尚未在其他物种验证 | 探究OCT4如何在胚胎中建立和保护多能性谱系 | 对照组和OCT4缺失小鼠囊胚内细胞团 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学,定量免疫荧光 | NA | 转录组数据,图像数据 | 两个发育阶段的小鼠囊胚内细胞团 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6859 | 2025-10-06 |
Regulation of Immune Responses by Nonhematopoietic Cells in Asthma
2021-01-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000885
PMID:33397743
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综述 | 本文探讨非造血细胞在哮喘免疫反应调控中的重要作用及其与免疫细胞的相互作用机制 | 揭示了肺上皮细胞等非造血细胞通过表达先天传感器和产生促炎分子在哮喘中的新型免疫调控功能 | NA | 阐明非造血细胞在哮喘发病机制中的免疫调控作用 | 肺组织非造血细胞(主要是上皮细胞)及其与免疫细胞的相互作用 | 免疫学 | 哮喘 | 细胞谱系追踪,单细胞RNA测序,反向遗传学方法 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6860 | 2025-10-06 |
Tuning MPL signaling to influence hematopoietic stem cell differentiation and inhibit essential thrombocythemia progenitors
2021-01-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2017849118
PMID:33384332
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研究论文 | 本研究开发了一种调节TPO-R信号的新型双特异性抗体,用于调控造血干细胞分化和抑制原发性血小板增多症 | 开发了能够通过不同几何构型调控TPO-R信号强度的双特异性抗体,实现了TPO/TPO-R双重功能的解耦 | NA | 研究调节TPO-R信号对造血干细胞分化和原发性血小板增多症的影响 | 造血干细胞和原发性血小板增多症祖细胞 | 单细胞测序 | 原发性血小板增多症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |