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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6841 | 2025-10-06 |
Fibroblastic reticular cell lineage convergence in Peyer's patches governs intestinal immunity
2021-04, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00894-5
PMID:33707780
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和细胞谱系示踪技术揭示了派尔集合淋巴结中成纤维网状细胞的双重谱系汇聚模式及其在肠道免疫调控中的关键作用 | 首次发现派尔集合淋巴结中血管周围和上皮下两种成纤维网状细胞谱系的协同作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关机制仍需进一步验证 | 探究派尔集合淋巴结中成纤维网状细胞的分化机制及其在肠道免疫中的功能 | 小鼠胚胎派尔集合淋巴结中的成纤维网状细胞 | 单细胞生物学 | 肠道免疫疾病 | 单细胞转录组学, 细胞谱系示踪, 功能获得与缺失实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 细胞命运图谱 | 小鼠胚胎派尔集合淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6842 | 2025-10-06 |
Immune cells lacking Y chromosome show dysregulation of autosomal gene expression
2021-Apr, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-03822-w
PMID:33837451
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研究论文 | 本研究探讨Y染色体缺失对免疫细胞基因表达的影响及其与疾病风险的关联 | 首次发现Y染色体缺失会导致约500个常染色体基因表达失调,并揭示其在不同免疫细胞类型中的特异性效应 | 研究主要集中于白细胞,尚未完全阐明Y染色体缺失影响疾病风险的具体分子机制 | 探究Y染色体嵌合缺失对基因表达的影响及其在疾病发生中的作用 | 人类白细胞(包括NK细胞、CD4+T细胞和粒细胞) | 基因组学 | 阿尔茨海默病,前列腺癌 | DNA分析,RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA,转录组RNA | 来自阿尔茨海默病和前列腺癌患者的白细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
6843 | 2025-10-06 |
Targeted Single-Cell RNA-seq Identifies Minority Cell Types of Kidney Distal Nephron
2021-Apr, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020101407
PMID:33769948
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研究论文 | 本研究通过靶向单细胞RNA测序技术揭示了小鼠肾脏远端肾单位中少数细胞类型的转录组多样性 | 首次结合流式细胞分选富集方案与单细胞RNA测序,系统鉴定了远端肾单位中先前未被充分认识的细胞亚型多样性 | 研究仅针对小鼠模型,未在人类样本中验证;未发现DCT2特异性转录本 | 探索肾脏远端肾单位中少数细胞类型的转录组特征和细胞异质性 | 小鼠肾脏厚壁升支/远曲小管区域的细胞 | 单细胞转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞分选 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 9099个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6844 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing redefines the mesenchymal cell landscape of mouse endometrium
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002123R
PMID:33710643
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序重新定义小鼠子宫内膜间充质细胞图谱 | 首次对成年小鼠子宫内膜间充质细胞进行明确分析,鉴定出五个亚群,为子宫内膜与其他易纤维化组织间充质细胞的比较提供平台 | 研究仅限于小鼠模型,人类子宫内膜的等效细胞群体存在与否尚不明确 | 重新定义子宫内膜间充质细胞组成和特征 | 小鼠子宫内膜间充质细胞 | 单细胞组学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | Pdgfrb-BAC-eGFP转基因报告小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
6845 | 2025-10-06 |
Skin-resident innate lymphoid cells converge on a pathogenic effector state
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03188-w
PMID:33536623
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研究论文 | 本研究揭示了皮肤驻留先天淋巴样细胞在银屑病炎症中向致病性ILC3样状态转化的动态过程 | 发现皮肤ILCs在炎症刺激下通过多种轨迹向致病性ILC3样状态汇聚,而非由预定型ILCs直接响应 | 研究主要基于小鼠模型,人类皮肤ILCs的类似机制需要进一步验证 | 探究皮肤驻留先天淋巴样细胞在银屑病发病机制中的状态转变和功能重塑 | 小鼠皮肤组织中的先天淋巴样细胞 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 体内命运图谱 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
6846 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptional Survey of Ileal-Anal Pouch Immune Cells From Ulcerative Colitis Patients
2021-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.12.030
PMID:33359089
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析溃疡性结肠炎患者回肠肛袋免疫细胞的转录特征 | 首次在单细胞水平揭示回肠肛袋炎症中IL1B/LYZ+髓系细胞和FOXP3/BATF+T细胞的特异性群体 | 原始序列数据因患者隐私保护未公开,样本量相对有限 | 阐明回肠肛袋炎中肠道免疫系统的独特组织方式 | 溃疡性结肠炎患者的肠道组织免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 26例患者(15例有回肠肛袋,11例无回肠肛袋) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6847 | 2025-10-06 |
Dynamic Expression of Imprinted Genes in the Developing and Postnatal Pituitary Gland
2021-03-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12040509
PMID:33808370
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研究论文 | 本研究通过高灵敏度RNA测序和单细胞RNA测序技术,系统描述了垂体发育和功能中印记基因的动态表达模式 | 首次将印记基因作为一类基因系统研究其在垂体形成和功能中的作用,并揭示了妊娠期母体垂体中印记基因的动态调控 | 垂体在发育阶段体积小且成熟期细胞复杂性高,给获取有用转录组数据带来技术困难 | 阐明印记基因在垂体发育和功能中的作用及其与印记障碍的关系 | 哺乳动物垂体腺(包括胚胎期、出生后和妊娠期母体) | 发育生物学 | 印记障碍 | 高灵敏度RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
6848 | 2025-10-06 |
Resolving cellular systems by ultra-sensitive and economical single-cell transcriptome filtering
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102147
PMID:33665566
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Constellation-Seq的超灵敏且经济的单细胞转录组过滤技术 | 通过分子转录组过滤器实现两个数量级的灵敏度提升,同时减少数据稀疏性和测序成本 | NA | 解决单细胞转录组学中低丰度转录本识别受限的问题 | 外周血单个核细胞样本中的稀有树突状细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6849 | 2025-10-06 |
Transcriptional heterogeneity and tightly regulated changes in gene expression during Plasmodium berghei sporozoite development
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2023438118
PMID:33653959
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析疟原虫子孢子发育过程中的基因表达变化 | 首次在单细胞水平揭示疟原虫子孢子发育过程中的转录异质性和严格调控的基因表达变化 | 研究主要关注转录组水平,未直接验证候选基因的功能 | 阐明疟原虫子孢子在蚊子体内发育的分子机制 | 伯氏疟原虫(Plasmodium berghei)子孢子 | 单细胞组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16,038个子孢子 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6850 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Human Developmental Hematopoiesis
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.11.015
PMID:33352111
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序分析人类发育期造血过程 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq技术分析人类发育期造血过程,识别了三个高增殖性寡能祖细胞群并揭示了表观遗传先于转录的启动现象 | 研究样本仅限于胎儿肝脏和骨髓,样本量相对有限 | 阐明人类发育期造血调控机制 | 人类胎儿肝脏和骨髓中的免疫表型血细胞 | 单细胞多组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞基因表达数据, 染色质可及性数据 | 超过8,000个人类免疫表型血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
6851 | 2025-10-06 |
Evaluation of Ranzoni et al.: Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Human Developmental Hematopoiesis
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.020
PMID:33667351
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评论 | 本文是对Ranzoni等人关于人类发育造血过程中单细胞RNA测序和ATAC测序整合分析研究的同行评审过程示例 | NA | NA | 展示科学研究中的同行评审过程 | 人类发育造血研究论文的评审过程 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
6852 | 2025-10-06 |
Population-scale single-cell RNA-seq profiling across dopaminergic neuron differentiation
2021-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00801-6
PMID:33664506
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研究论文 | 通过大规模单细胞RNA测序研究215个人类iPSC系分化为多巴胺能神经元过程中的遗传变异功能 | 开发高效多重策略在三个分化时间点对超过100万个细胞进行单细胞RNA测序,发现46%的eQTL未在GTEx数据库中出现 | 研究仅限于中脑神经命运分化过程,未涵盖其他细胞类型或发育阶段 | 研究常见遗传变异在原发性人类组织和发育过程中的功能 | 215个人类诱导多能干细胞系及其分化的多巴胺能神经元 | 单细胞基因组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | eQTL分析 | 单细胞转录组数据 | 215个iPSC系,超过100万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6853 | 2025-10-06 |
Identification of resistance pathways and therapeutic targets in relapsed multiple myeloma patients through single-cell sequencing
2021-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01232-w
PMID:33619369
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研究论文 | 通过单细胞测序技术识别复发性多发性骨髓瘤患者的耐药通路和治疗靶点 | 首次将纵向单细胞RNA测序与前瞻性临床试验相结合,揭示了包括低氧耐受、蛋白质折叠和线粒体呼吸在内的新型耐药分子通路,并发现PPIA作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限(41例患者),为单臂临床试验设计缺乏对照组 | 研究多发性骨髓瘤耐药机制并识别新的治疗靶点 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者(41例)、健康受试者(11例)和新诊断MM患者(15例) | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据 | 41例耐药/早期复发患者、11例健康对照、15例新诊断患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6854 | 2025-10-06 |
Cholangiocyte organoids can repair bile ducts after transplantation in the human liver
2021-02-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz6964
PMID:33602855
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研究论文 | 本研究证明胆管细胞类器官可在移植后修复人类肝脏中的胆管 | 首次将胆管细胞类器官应用于人类肝脏修复,并证明其移植后能恢复体内转录特征 | 研究在离体常温灌注模型中进行,尚未进行体内临床试验 | 探索类器官技术在再生医学中修复人类胆管的可行性 | 人类胆管细胞和胆管类器官 | 再生医学 | 胆管病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6855 | 2025-10-06 |
Common clonal origin of conventional T cells and induced regulatory T cells in breast cancer patients
2021-02-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21297-y
PMID:33602930
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研究论文 | 本研究通过T细胞受体和单细胞转录组测序分析乳腺癌患者中调节性T细胞的克隆起源 | 首次揭示人类乳腺癌中调节性T细胞可能主要来源于抗原经验性常规T细胞通过肿瘤内激活转化为诱导性调节性T细胞 | 研究仅限于乳腺癌患者,机制细节仍需进一步验证 | 探究人类癌症中调节性T细胞库形成的机制 | 乳腺癌患者的调节性CD4 T细胞和常规T细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | T细胞受体测序, 单细胞转录组测序 | 轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据 | 乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6856 | 2025-10-06 |
Meta-analysis of tumor- and T cell-intrinsic mechanisms of sensitization to checkpoint inhibition
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.002
PMID:33508232
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荟萃分析 | 通过整合多种肿瘤类型的基因组和转录组数据,系统分析肿瘤细胞内在和微环境因素对检查点抑制剂敏感性的影响 | 首次在泛癌种水平验证了克隆肿瘤突变负荷是检查点抑制剂反应的最强预测因子,并发现CCR5和CXCL13作为T细胞内在的敏感性标志物 | 研究样本量相对有限,仅涵盖七种肿瘤类型,部分预测因子未达到泛癌种显著性 | 系统鉴定检查点抑制剂敏感性的肿瘤细胞内在和T细胞内在机制 | 1000多名接受检查点抑制剂治疗的患者,涵盖七种肿瘤类型 | 生物信息学 | 多种癌症 | 全外显子组测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 多变量预测模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 超过1000名患者 | NA | 全外显子组测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6857 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.12.016
PMID:33406409
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析人类肠道发育的时空动态 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学系统描绘人类肠道发育过程,识别了101种细胞状态和关键形态发生程序 | 研究主要关注胎儿期肠道发育,对出生后发育阶段涉及较少 | 解析人类肠道发育的细胞和分子机制 | 人类胎儿肠道组织 | 单细胞生物学, 发育生物学 | 肠道发育异常疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
6858 | 2025-10-06 |
Ubiquitination of MHC Class II by March-I Regulates Dendritic Cell Fitness
2021-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000975
PMID:33318291
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研究论文 | 本研究揭示了MHC II类分子泛素化通过March-I调控树突状细胞功能的新机制 | 首次证明MHC II类分子泛素化缺陷会导致树突状细胞功能缺陷,即使表面pMHC-II水平正常 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类细胞中验证 | 探究MHC II类分子泛素化对树突状细胞功能的调控机制 | 树突状细胞、CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6859 | 2025-10-06 |
Whole-body senescent cell clearance alleviates age-related brain inflammation and cognitive impairment in mice
2021-02, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13296
PMID:33470505
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研究论文 | 本研究通过清除衰老细胞改善老年小鼠大脑炎症和认知功能障碍 | 首次证明全身性清除衰老细胞可改善自然衰老过程中的认知功能,并发现小胶质细胞是衰老细胞清除的关键靶点 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究清除衰老细胞是否能改善年龄相关的认知功能障碍 | 年轻和老年小鼠,特别是海马体中的细胞 | 衰老生物学 | 年龄相关认知障碍 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | INK-ATTAC转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠海马体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6860 | 2025-10-06 |
Assembly and Exploration of a Single Cell Atlas of the Drosophila Larval Ventral Cord. Identification of Rare Cell Types
2021-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.37
PMID:33600085
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研究论文 | 本研究开发了一个用于单细胞RNA测序数据分析的多阶段分析流程,并将其应用于果蝇幼虫腹侧索细胞图谱的构建和探索 | 整合了多个R软件包中的模块,创建了一个灵活、高质量的单细胞RNA-seq数据分析流程,能够识别和描述罕见细胞类型 | 分析流程需要针对特定目标进行定制和调整,存在一定的技术门槛 | 开发单细胞RNA测序数据分析方法并探索果蝇幼虫腹侧索的细胞多样性 | 果蝇幼虫腹侧索细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多阶段分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 多个果蝇幼虫腹侧索数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |