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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6821 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of human embryos identifies multiple sympathoblast lineages with potential implications for neuroblastoma origin
2021-05, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00818-x
PMID:33833454
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析人类胚胎发育过程,识别出多种交感神经母细胞谱系及其与神经母细胞瘤起源的潜在关联 | 首次发现肾上腺内交感神经母细胞直接来源于神经相关施万细胞前体,而非迁移神经嵴,这一过程在人类发育中持续数周 | 研究仅涵盖受孕后6-14周的人类胚胎发育阶段,样本时间窗口有限 | 探究人类胚胎发育过程中细胞状态进展与儿科疾病起源的关系 | 人类胚胎神经嵴和中胚层来源的谱系,包括肾上腺、肾脏、内皮和造血组织 | 单细胞生物学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组学, 谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类胚胎发育第6-14周的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6822 | 2025-10-06 |
Ventricular, atrial, and outflow tract heart progenitors arise from spatially and molecularly distinct regions of the primitive streak
2021-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001200
PMID:33999917
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠胚胎中心脏祖细胞在原始条纹中的空间和分子预模式 | 发现心脏祖细胞在原始条纹中已按心室、心房和流出道预先分区,比既往认知更早 | 研究局限于小鼠胚胎模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究哺乳动物心脏发育过程中祖细胞的起源和分化机制 | 小鼠胚胎的心脏祖细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪, 活体成像 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | 小鼠胚胎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6823 | 2025-10-06 |
Single-cell multi-omics analysis of the immune response in COVID-19
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01329-2
PMID:33879890
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示COVID-19免疫反应特征 | 首次在COVID-19中整合单细胞转录组、表面蛋白质组和抗原受体分析,发现非经典单核细胞扩增和造血干细胞向巨核细胞分化的倾向 | 横断面研究设计,无法追踪个体随时间变化的免疫反应 | 解析COVID-19发病机制中的协调免疫反应 | 130名不同严重程度COVID-19患者的外周血单个核细胞 | 单细胞多组学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序, 表面蛋白质组分析, T/B细胞抗原受体分析 | NA | 单细胞多组学数据 | 78万个外周血单个核细胞,来自130名患者 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
6824 | 2025-10-06 |
Establishing and maintaining fertility: the importance of cell cycle arrest
2021-05-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.348151.120
PMID:33888561
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综述 | 本文综述了Cip/Kip家族细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂在小鼠性腺发育中的作用,特别关注其对生育能力建立和维持的重要性 | 通过单细胞RNA测序研究揭示了细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂的异质性,发现了细胞周期抑制剂在控制和维持雌性生育能力中的新作用 | NA | 探讨细胞周期停滞在建立和维持生育能力中的重要性 | 小鼠性腺发育过程中的生殖细胞和体细胞 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6825 | 2025-10-06 |
SARS-CoV-2 infection of the oral cavity and saliva
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01296-8
PMID:33767405
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了口腔是SARS-CoV-2感染的重要部位,并证实唾液具有传播病毒的潜在风险 | 首次系统绘制人类口腔小唾液腺和牙龈的单细胞图谱,发现SARS-CoV-2病毒进入因子在口腔上皮细胞中广泛表达,并证实唾液细胞可携带活病毒 | 样本量相对有限(9个样本),主要聚焦于口腔局部感染机制,未深入探讨全身性影响 | 探究SARS-CoV-2在口腔 cavity的感染机制和传播途径 | 人类口腔小唾液腺和牙龈组织,以及感染者唾液样本 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据 | 9个组织样本(13,824个细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6826 | 2025-10-06 |
DNA glycosylase Neil3 regulates vascular smooth muscle cell biology during atherosclerosis development
2021-05, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本研究探讨DNA糖基化酶Neil3通过调控血管平滑肌细胞表型影响动脉粥样硬化发展的机制 | 首次揭示Neil3通过非经典DNA修复功能调控VSMC表型转化,并证实Akt信号通路在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明Neil3在动脉粥样硬化发展中对血管平滑肌细胞生物学行为的调控机制 | Apoe-/-动脉粥样硬化易感小鼠和人类原代主动脉血管平滑肌细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | qPCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序, mRNA测序, 蛋白质组学, BrdU增殖实验, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | Neil3缺陷的Apoe-/-小鼠模型和NEIL3敲除的人原代主动脉VSMCs | NA | 单细胞RNA测序, mRNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
6827 | 2025-10-06 |
Transcriptional characterization of human megakaryocyte polyploidization and lineage commitment
2021-05, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/jth.15271
PMID:33587817
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研究论文 | 首次使用单细胞RNA测序技术表征人类骨髓巨核细胞在不同倍体化水平下的转录组特征及其从造血干细胞的分化过程 | 首次对原代人类骨髓巨核细胞进行单细胞转录组研究,发现两个具有巨核细胞分化倾向的造血干细胞亚群,并揭示了应激性血小板生成中的特异性基因表达特征 | 研究样本量相对有限,且主要关注骨髓巨核细胞,未涉及其他组织来源的巨核细胞 | 研究人类骨髓巨核细胞的谱系承诺、成熟步骤和血小板生成过程 | 人类骨髓巨核细胞和造血干细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类骨髓样本,包括近期心肌梗死患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6828 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling for advancing birth defects research and prevention
2021-04-15, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.1870
PMID:33496083
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在出生缺陷研究和预防中的应用前景 | 利用单细胞分辨率技术解析发育通路,结合计算模型发现关键组织原则 | NA | 推进出生缺陷研究和预防 | 发育过程和致畸作用的细胞分析 | 单细胞基因组学 | 出生缺陷 | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6829 | 2025-10-06 |
Rituximab-resistant splenic memory B cells and newly engaged naive B cells fuel relapses in patients with immune thrombocytopenia
2021-04-14, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abc3961
PMID:33853929
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研究论文 | 本研究揭示了利妥昔单抗耐药性脾脏记忆B细胞和新招募的幼稚B细胞共同导致免疫性血小板减少症患者复发的作用机制 | 首次在人类次级淋巴器官中鉴定出具有独特可逆表型的利妥昔单抗耐药记忆B细胞群体,并阐明其通过持续表达CD19成为现有抗CD19疗法有效靶点的特性 | 研究样本来源于接受脾切除术的特定患者群体,可能限制结果的普适性 | 探究免疫性血小板减少症患者对利妥昔单抗治疗产生耐药性和疾病复发的细胞学基础 | 免疫性血小板减少症患者的脾脏B细胞和浆细胞 | 单细胞组学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序,免疫球蛋白基因谱分析 | NA | 单细胞转录组数据,免疫球蛋白序列数据 | 接受治疗性脾切除术的复发免疫性血小板减少症患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6830 | 2025-10-06 |
ACME dissociation: a versatile cell fixation-dissociation method for single-cell transcriptomics
2021-04-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02302-5
PMID:33827654
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞转录组学的细胞固定-解离方法ACME | 开发了同时实现细胞固定和解离的ACME方法,解决了单细胞测序需要活样本的限制 | NA | 开发适用于单细胞转录组学的细胞固定-解离方法 | 不同物种的细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,基于液滴的单细胞方法,组合条形码单细胞方法 | NA | NA |
6831 | 2025-10-06 |
Application of Single-Cell Approaches to Study Myeloproliferative Neoplasm Biology
2021-04, Hematology/oncology clinics of North America
DOI:10.1016/j.hoc.2021.01.002
PMID:33641869
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综述 | 本文综述了单细胞技术在费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤研究中的应用进展 | 系统总结了新型单细胞技术在MPN研究中的最新应用成果 | NA | 探讨单细胞技术对MPN生物学机制的深入理解 | 费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤(MPNs) | 数字病理学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞基因组学, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 数字病理学 | NA | NA |
6832 | 2025-10-06 |
Fibroblastic reticular cell lineage convergence in Peyer's patches governs intestinal immunity
2021-04, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00894-5
PMID:33707780
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和细胞谱系示踪技术揭示了派尔集合淋巴结中成纤维网状细胞的双重谱系汇聚模式及其在肠道免疫调控中的关键作用 | 首次发现派尔集合淋巴结中血管周围和上皮下两种成纤维网状细胞谱系的协同作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关机制仍需进一步验证 | 探究派尔集合淋巴结中成纤维网状细胞的分化机制及其在肠道免疫中的功能 | 小鼠胚胎派尔集合淋巴结中的成纤维网状细胞 | 单细胞生物学 | 肠道免疫疾病 | 单细胞转录组学, 细胞谱系示踪, 功能获得与缺失实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 细胞命运图谱 | 小鼠胚胎派尔集合淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6833 | 2025-10-06 |
Immune cells lacking Y chromosome show dysregulation of autosomal gene expression
2021-Apr, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-03822-w
PMID:33837451
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研究论文 | 本研究探讨Y染色体缺失对免疫细胞基因表达的影响及其与疾病风险的关联 | 首次发现Y染色体缺失会导致约500个常染色体基因表达失调,并揭示其在不同免疫细胞类型中的特异性效应 | 研究主要集中于白细胞,尚未完全阐明Y染色体缺失影响疾病风险的具体分子机制 | 探究Y染色体嵌合缺失对基因表达的影响及其在疾病发生中的作用 | 人类白细胞(包括NK细胞、CD4+T细胞和粒细胞) | 基因组学 | 阿尔茨海默病,前列腺癌 | DNA分析,RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA,转录组RNA | 来自阿尔茨海默病和前列腺癌患者的白细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
6834 | 2025-10-06 |
Targeted Single-Cell RNA-seq Identifies Minority Cell Types of Kidney Distal Nephron
2021-Apr, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020101407
PMID:33769948
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研究论文 | 本研究通过靶向单细胞RNA测序技术揭示了小鼠肾脏远端肾单位中少数细胞类型的转录组多样性 | 首次结合流式细胞分选富集方案与单细胞RNA测序,系统鉴定了远端肾单位中先前未被充分认识的细胞亚型多样性 | 研究仅针对小鼠模型,未在人类样本中验证;未发现DCT2特异性转录本 | 探索肾脏远端肾单位中少数细胞类型的转录组特征和细胞异质性 | 小鼠肾脏厚壁升支/远曲小管区域的细胞 | 单细胞转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞分选 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 9099个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6835 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing redefines the mesenchymal cell landscape of mouse endometrium
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002123R
PMID:33710643
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序重新定义小鼠子宫内膜间充质细胞图谱 | 首次对成年小鼠子宫内膜间充质细胞进行明确分析,鉴定出五个亚群,为子宫内膜与其他易纤维化组织间充质细胞的比较提供平台 | 研究仅限于小鼠模型,人类子宫内膜的等效细胞群体存在与否尚不明确 | 重新定义子宫内膜间充质细胞组成和特征 | 小鼠子宫内膜间充质细胞 | 单细胞组学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | Pdgfrb-BAC-eGFP转基因报告小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
6836 | 2025-10-06 |
Skin-resident innate lymphoid cells converge on a pathogenic effector state
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03188-w
PMID:33536623
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研究论文 | 本研究揭示了皮肤驻留先天淋巴样细胞在银屑病炎症中向致病性ILC3样状态转化的动态过程 | 发现皮肤ILCs在炎症刺激下通过多种轨迹向致病性ILC3样状态汇聚,而非由预定型ILCs直接响应 | 研究主要基于小鼠模型,人类皮肤ILCs的类似机制需要进一步验证 | 探究皮肤驻留先天淋巴样细胞在银屑病发病机制中的状态转变和功能重塑 | 小鼠皮肤组织中的先天淋巴样细胞 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 体内命运图谱 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
6837 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptional Survey of Ileal-Anal Pouch Immune Cells From Ulcerative Colitis Patients
2021-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.12.030
PMID:33359089
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析溃疡性结肠炎患者回肠肛袋免疫细胞的转录特征 | 首次在单细胞水平揭示回肠肛袋炎症中IL1B/LYZ+髓系细胞和FOXP3/BATF+T细胞的特异性群体 | 原始序列数据因患者隐私保护未公开,样本量相对有限 | 阐明回肠肛袋炎中肠道免疫系统的独特组织方式 | 溃疡性结肠炎患者的肠道组织免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 26例患者(15例有回肠肛袋,11例无回肠肛袋) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6838 | 2025-10-06 |
Dynamic Expression of Imprinted Genes in the Developing and Postnatal Pituitary Gland
2021-03-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12040509
PMID:33808370
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研究论文 | 本研究通过高灵敏度RNA测序和单细胞RNA测序技术,系统描述了垂体发育和功能中印记基因的动态表达模式 | 首次将印记基因作为一类基因系统研究其在垂体形成和功能中的作用,并揭示了妊娠期母体垂体中印记基因的动态调控 | 垂体在发育阶段体积小且成熟期细胞复杂性高,给获取有用转录组数据带来技术困难 | 阐明印记基因在垂体发育和功能中的作用及其与印记障碍的关系 | 哺乳动物垂体腺(包括胚胎期、出生后和妊娠期母体) | 发育生物学 | 印记障碍 | 高灵敏度RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
6839 | 2025-10-06 |
Resolving cellular systems by ultra-sensitive and economical single-cell transcriptome filtering
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102147
PMID:33665566
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Constellation-Seq的超灵敏且经济的单细胞转录组过滤技术 | 通过分子转录组过滤器实现两个数量级的灵敏度提升,同时减少数据稀疏性和测序成本 | NA | 解决单细胞转录组学中低丰度转录本识别受限的问题 | 外周血单个核细胞样本中的稀有树突状细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6840 | 2025-10-06 |
Transcriptional heterogeneity and tightly regulated changes in gene expression during Plasmodium berghei sporozoite development
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2023438118
PMID:33653959
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析疟原虫子孢子发育过程中的基因表达变化 | 首次在单细胞水平揭示疟原虫子孢子发育过程中的转录异质性和严格调控的基因表达变化 | 研究主要关注转录组水平,未直接验证候选基因的功能 | 阐明疟原虫子孢子在蚊子体内发育的分子机制 | 伯氏疟原虫(Plasmodium berghei)子孢子 | 单细胞组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16,038个子孢子 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |