单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27271 篇文献，本页显示第 6801 - 6820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6801 | 2024-10-24 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604718
PMID:39091743
|
研究论文 | 研究了多能心脏咽部祖细胞在细胞周期驱动下获得多谱系能力的过程 | 首次揭示了转录组成熟过程与细胞周期进展之间的耦合关系，并提出了“行为能力”的概念 | 研究仅限于tunicate Ciona，可能不适用于其他物种 | 探讨多能心脏咽部祖细胞如何通过细胞周期进展获得多谱系能力 | 多能心脏咽部祖细胞及其在细胞周期不同阶段的转录组动态 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及tunicate Ciona的多能心脏咽部祖细胞 |
| 6802 | 2024-10-24 |
The role of polycystic kidney disease-like homologs in planarian nervous system regeneration and function
2024-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.17.603829
PMID:39091889
|
研究论文 | 研究了多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 首次全面分析了涡虫基因组中所有相关基因的表达和功能，并开发了用于机械感觉刺激获取和分析的自动化设置 | 对数十种神经亚型的功能了解仍然不足 | 探讨多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 涡虫的神经系统再生和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及无性和雌雄同体两种涡虫品系 |
| 6803 | 2024-10-24 |
Transcriptional, developmental, and functional parallels of lymphatic and venous smooth muscle
2024-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.18.604042
PMID:39091770
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪和成像技术，探讨了淋巴肌肉细胞（LMCs）和静脉平滑肌细胞（SMCs）的转录组和发育基础 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了LMCs和静脉SMCs的转录组相似性，并发现它们可能源自相关的间充质祖细胞 | 研究仅限于小鼠后肢的淋巴和静脉血管，未涵盖其他物种或组织 | 探讨淋巴肌肉细胞和静脉平滑肌细胞的转录组和发育基础，以理解其独特的收缩特性 | 淋巴肌肉细胞（LMCs）和静脉平滑肌细胞（SMCs） | 生物医学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 小鼠后肢的LMCs和SMCs样本 |
| 6804 | 2024-10-24 |
Immune disease dialogue of chemokine-based cell communications as revealed by single-cell RNA sequencing meta-analysis
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.17.603936
PMID:39071425
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序元分析揭示了基于趋化因子的细胞间通信在免疫疾病中的对话 | 本文通过元分析揭示了不同免疫疾病和组织中细胞间通信的复杂模式，为精准医学提供了新的见解 | 本文依赖于公开的单细胞RNA测序数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 揭示免疫疾病中细胞间通信的疾病特异性模式，为开发靶向治疗提供理论基础 | 多种免疫疾病（如特应性皮炎、银屑病、慢性阻塞性肺病、特发性肺纤维化、溃疡性结肠炎、IgA肾病和狼疮性肾炎）及其相关组织 | 数字病理学 | 免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种免疫疾病和组织的单细胞RNA测序数据 |
| 6805 | 2024-10-24 |
SmartImpute: A Targeted Imputation Framework for Single-cell Transcriptome Data
2024-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.15.603649
PMID:39071378
|
研究论文 | 提出了一种名为SmartImpute的计算框架，用于单细胞转录组数据的靶向插补 | SmartImpute通过聚焦于预定义的标记基因，提高了插补过程的生物学相关性和计算效率，同时减少了模型误设的风险 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题，提高细胞类型注释和聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失基因表达值 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 生成对抗插补网络 | 基因表达数据 | 头颈部鳞状细胞癌和人类骨髓的单细胞RNA测序数据 |
| 6806 | 2024-10-24 |
A Single Trophoblast Layer Acts as the Gatekeeper at the Endothelial-Hematopoietic Crossroad in the Placenta
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603303
PMID:39071312
|
研究论文 | 研究探讨了胎盘中滋养层巨细胞在调节血管内皮与造血细胞过渡中的作用 | 通过单细胞RNA测序和受体-配体对分析，揭示了滋养层巨细胞分泌的旁分泌因子在维持胎盘造血-血管生成平衡中的新机制 | 研究基于特定敲除小鼠模型，结果可能不适用于所有物种 | 阐明胎盘中滋养层巨细胞在调节造血微环境中的分子机制 | 胎盘中的滋养层巨细胞及其分泌的旁分泌因子 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 特定敲除小鼠模型的胎盘样本 |
| 6807 | 2024-10-24 |
CD38+ Alveolar macrophages mediate early control of M. tuberculosis proliferation in the lung
2024-Jul-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3934768/v1
PMID:39070650
|
研究论文 | 研究探讨了CD38+肺泡巨噬细胞在早期控制结核分枝杆菌（M. tuberculosis）肺部增殖中的作用 | 首次揭示了CD38+肺泡巨噬细胞在结核分枝杆菌感染早期的重要控制作用，并通过多模态单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析了巨噬细胞亚群的功能和表观遗传特征 | 研究主要集中在实验室条件下，未来需要在临床环境中验证这些发现 | 探讨肺泡巨噬细胞在结核病早期控制中的作用，并揭示潜在的疫苗和免疫治疗策略 | CD38+肺泡巨噬细胞及其在结核分枝杆菌感染中的动态变化 | 免疫学 | 结核病 | 多模态单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 多个感染时间点的肺泡巨噬细胞样本 |
| 6808 | 2024-10-24 |
Eed controls craniofacial osteoblast differentiation and mesenchymal proliferation from the neural crest
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.13.584903
PMID:38558995
|
研究论文 | 研究了Polycomb抑制复合物2（PRC2）的核心亚基Eed在神经嵴诱导后对颅面成骨细胞分化和间充质增殖的影响 | 通过整合小鼠遗传学和单细胞RNA测序，揭示了Eed在神经嵴细胞诱导后对颅面发育的关键作用 | 对PRC2活性在神经嵴诱导后的胚胎、细胞和分子后果的理解尚不完全 | 探讨PRC2在神经嵴诱导后对颅面发育的影响及其分子机制 | Eed在颅面成骨细胞分化和间充质增殖中的作用 | 发育生物学 | 先天性畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠遗传学模型和单细胞RNA测序数据 |
| 6809 | 2024-10-24 |
Endogenous FGFs drive ERK-dependent cell fate patterning in 2D human gastruloids
2024-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.08.602611
PMID:39026750
|
研究论文 | 研究内源性FGF在2D人类胚胎体中驱动ERK依赖的细胞命运模式的作用 | 发现了FGF依赖的ERK信号在2D胚胎体中的新作用，揭示了FGF4和FGF17通过基底定位的FGFR1诱导原始条纹样细胞的机制 | NA | 探讨FGF在人类胚胎发育中的作用及其机制 | 2D人类胚胎体中的FGF依赖的ERK活性模式 | NA | NA | 原位杂交和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6810 | 2024-10-24 |
Cell Simulation as Cell Segmentation
2024-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591218
PMID:38712065
|
研究论文 | 本文采用从头细胞模拟方法来快速推断形态上合理的细胞边界，以提高单细胞空间转录组学数据的细胞分割精度 | 本文创新性地将从头细胞模拟方法应用于细胞分割，显著提高了分割精度和计算效率 | NA | 提高单细胞空间转录组学数据的细胞分割精度 | 单细胞空间转录组学数据中的细胞分割 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 从头细胞模拟 | NA | 转录组数据 | 来自肾细胞癌患者样本的数据 |
| 6811 | 2024-10-24 |
GeneSurfer Enables Transcriptome-wide Exploration and Functional Annotation of Gene Co-expression Modules in 3D Spatial Transcriptomics Data
2024-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.05.602230
PMID:39005368
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为GeneSurfer的交互式界面，用于探索3D空间转录组数据中的局部基因共表达模式 | GeneSurfer提供了一种新的方法来探索大规模数据集中局部基因共表达模式，并支持实时基因本体论术语注释 | NA | 开发一种工具来探索和注释3D空间转录组数据中的基因共表达模块 | 3D空间转录组数据中的基因共表达模式 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了Allen Brain Cell Atlas中的空间转录组和单细胞RNA测序数据 |
| 6812 | 2024-10-24 |
Spatial transcriptomics reveals influence of microenvironment on intrinsic fates in melanoma therapy resistance
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601416
PMID:39005406
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学和单细胞RNA测序揭示了黑色素瘤治疗抵抗中内在命运与微环境的相互影响 | 本文首次揭示了不同遗传背景下黑色素瘤细胞抵抗命运的共享内在抵抗程序，并展示了这些抵抗程序与肿瘤微环境的密切关联 | 本文主要基于空间转录组学和单细胞RNA测序数据，未涉及其他类型的实验验证 | 研究黑色素瘤治疗抵抗中细胞内在命运与微环境因素的相互作用 | 黑色素瘤细胞及其抵抗命运 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 转录组数据 | 多个细胞系和患者样本 |
| 6813 | 2024-10-24 |
Genomic and single-cell characterization of patient-derived tumor organoid models of head and neck squamous cell carcinoma
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601068
PMID:39005427
|
研究论文 | 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤类器官模型，探讨了肿瘤异质性和治疗反应的分子机制 | 首次在头颈部鳞状细胞癌中建立了患者来源的肿瘤类器官模型，并揭示了与顺铂耐药相关的分子亚型和异质性程序 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 提高对头颈部鳞状细胞癌生物学特性的理解，并为个性化治疗提供新的靶点 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤类器官模型 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 31名头颈部鳞状细胞癌患者 |
| 6814 | 2024-10-24 |
Global trends of single cell sequence associated in cancer from 2011 to 2024: A bibliometric analysis
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32847
PMID:38975217
|
meta-analysis | 本文通过文献计量分析探讨了2011年至2024年间与癌症相关的单细胞测序研究的趋势和前沿 | 本文首次通过文献计量分析方法，系统地总结了单细胞测序在癌症研究中的应用趋势和前沿 | 本文主要依赖于文献计量分析，未涉及具体的实验数据或技术细节 | 探索基于单细胞测序的癌症分子和临床病理特征，揭示肿瘤间异质性，并为癌症的早期诊断、治疗和预后分析提供新思路 | 2011年至2024年间发表的与癌症相关的单细胞测序研究 | digital pathology | NA | 单细胞测序 | NA | 文本 | 6189篇文章 |
| 6815 | 2024-10-24 |
Positionally distinct interferon stimulated dermal immune acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet's syndrome
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.24.600500
PMID:38979312
|
研究论文 | 研究探讨了Sweet's综合征中位置特异性的干扰素刺激的真皮免疫作用成纤维细胞促进中性粒细胞招募的机制 | 首次揭示了Sweet's综合征皮肤样本中显著的干扰素特征，并发现这种特征在其他中性粒细胞性皮肤病中减少 | 研究主要基于单核和批量转录组学分析，缺乏对活体组织的直接观察 | 探讨Sweet's综合征中中性粒细胞浸润的机制 | Sweet's综合征患者的皮肤样本和培养的初级人真皮成纤维细胞 | NA | Sweet's综合征 | 单核和批量转录组学、单分子分辨率空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括Sweet's综合征患者的皮肤样本和培养的初级人真皮成纤维细胞 |
| 6816 | 2024-10-24 |
Medulloblastoma Spatial Transcriptomics Reveals Tumor Microenvironment Heterogeneity with High-Density Progenitor Cell Regions Correlating with High-Risk Disease
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.25.600684
PMID:38979174
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析了十六例儿童髓母细胞瘤样本，揭示了肿瘤微环境的异质性及其与高风险疾病的关系 | 首次在空间背景下分析髓母细胞瘤的肿瘤微环境，揭示了高密度静止祖细胞区域与高风险疾病特征的相关性 | 样本量相对较小，且仅限于儿童髓母细胞瘤 | 探讨髓母细胞瘤肿瘤微环境的异质性及其与疾病进展和治疗反应的关系 | 十六例儿童髓母细胞瘤样本及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 神经系统肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 十六例儿童髓母细胞瘤样本，包括两对诊断-复发匹配样本 |
| 6817 | 2024-10-24 |
Target-Oriented Reference Construction for supervised cell-type identification in scRNA-seq
2024-Jun-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4559348/v1
PMID:38978578
|
研究论文 | 本文提出了一种名为TORC的目标导向参考构建方法，用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | TORC方法解决了现有监督细胞类型识别工具中参考数据选择和构建的缺失问题，通过减少参考数据与目标数据之间的分布差异和细胞类型组成差异，提高了细胞类型识别的准确性 | NA | 开发一种新的方法来构建高质量的参考数据，以提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6818 | 2024-10-24 |
B cell-mediated antigen presentation promotes adverse cardiac remodeling in chronic heart failure
2024-Jun-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4536350/v1
PMID:38978561
|
研究论文 | 研究探讨了B细胞通过MHC II介导的抗原呈递在慢性心力衰竭中促进不良心脏重塑的作用 | 揭示了B细胞通过MHC II介导的抗原呈递在慢性心力衰竭中的新机制，并提出MHC II介导的信号通路作为治疗慢性心力衰竭的新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和人类心肌梗死患者的循环B细胞分析，可能需要进一步的人类临床研究来验证其普遍性 | 探讨特定免疫细胞在慢性心力衰竭中的作用机制，特别是B细胞通过MHC II介导的抗原呈递的作用 | 小鼠和人类心肌梗死患者的B细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类心肌梗死患者的B细胞样本 |
| 6819 | 2024-10-24 |
Identify Regulatory eQTLs by Multiome Sequencing in Prostate Single Cells
2024-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.19.599704
PMID:38948854
|
研究论文 | 本文通过多组学单细胞测序技术，研究前列腺癌细胞中调控eQTL及其靶基因的关联 | 首次应用多组学单细胞测序技术在前列腺癌细胞中识别调控eQTL及其靶基因 | 数据稀疏性问题仍然存在，尽管通过靶向测序有所改善 | 验证多组学单细胞测序技术在前列腺癌风险位点识别调控元件及其靶基因的可行性 | 前列腺癌细胞中的调控eQTL及其靶基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 多组学测序 | NA | 单细胞数据 | 65,501个高质量单细胞来自8种前列腺细胞系 |
| 6820 | 2024-10-24 |
A prognostic matrix gene expression signature defines functional glioblastoma phenotypes and niches
2024-Jun-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4541464/v1
PMID:38947019
|
研究论文 | 通过计算基因组学和蛋白质组学方法，分析了胶质母细胞瘤（GBM）中细胞外基质蛋白（CMP）表达的功能和临床相关性 | 识别了一个17基因的CMP表达特征，称为Matrisome 17（M17）特征，该特征进一步细化了CMP基因的预后价值，并可能预测PD1阻断的反应 | NA | 研究胶质母细胞瘤中细胞外基质蛋白的表达及其对患者生存和治疗反应的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）中的细胞外基质蛋白（CMP）表达 | 生物信息学 | 脑肿瘤 | 计算基因组学和蛋白质组学 | NA | 基因表达数据 | NA |