单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 6781 - 6800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6781 | 2024-10-24 |
Hyperedge Representations with Hypergraph Wavelets: Applications to Spatial Transcriptomics
2024-Sep-14, ArXiv
PMID:39314512
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研究论文 | 本文介绍了超图扩散小波及其在空间转录组学中的应用 | 引入了超图扩散小波，并展示了其在捕捉复杂交互中的优势 | NA | 探索超图在空间转录组学中的应用 | 超图扩散小波在阿尔茨海默病相关细胞微环境中的表示 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | NA | NA | 转录组数据 | NA |
| 6782 | 2024-10-24 |
Inferring cell differentiation maps from lineage tracing data
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.611835
PMID:39314473
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研究论文 | 本文介绍了一种基于潜能概念的细胞分化图谱数学框架，并开发了一种算法，用于从单细胞谱系追踪数据中推断出最优的细胞分化图谱 | 本文提出的算法能够更准确地推断细胞分化图谱，并在模拟数据和真实数据中表现优于现有方法 | NA | 推断细胞分化图谱 | 单细胞谱系追踪数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | NA |
| 6783 | 2024-10-24 |
Novel Role of Endothelial CD45 in Regulating Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atherosclerosis
2024-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.03.610974
PMID:39282400
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研究论文 | 研究探讨了内皮细胞中CD45在调节动脉粥样硬化中的内皮间质转化（EndoMT）的作用 | 首次揭示了内皮细胞中CD45缺失通过增加KLF2表达抑制TGFβ信号传导和EndoMT标记物表达，从而保护动脉粥样硬化 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探讨内皮细胞中CD45在动脉粥样硬化中的作用及其分子机制 | 内皮细胞、动脉粥样硬化小鼠模型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 内皮细胞特异性CD45缺失小鼠（EC-iCD45KO）和ApoE-/-小鼠模型 |
| 6784 | 2024-10-24 |
The Cardioprotective Role of Neutrophil-Specific STING in Myocardial Ischemia/Reperfusion Injury
2024-Sep-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.06.611551
PMID:39314411
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研究论文 | 研究中性粒细胞特异性STING在心肌缺血/再灌注损伤中的心脏保护作用 | 首次探讨了中性粒细胞中富含I型干扰素信号的亚群及其在心肌缺血/再灌注损伤中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床相关性需要进一步验证 | 研究中性粒细胞在心肌缺血/再灌注损伤中的异质性及其对心脏损伤的影响 | 中性粒细胞及其STING信号在心肌缺血/再灌注损伤中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞数据 | 小鼠模型 |
| 6785 | 2024-10-24 |
Lipid-siRNA conjugate accesses perivascular transport and achieves durable knockdown throughout the central nervous system
2024-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.09.598079
PMID:38915549
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研究论文 | 本文描述了一种白蛋白结合脂质-siRNA偶联物，通过脑脊液途径运输，实现中枢神经系统广泛分布的持久基因敲低 | 开发了一种新的白蛋白结合脂质-siRNA偶联物，能够在中枢神经系统中实现长达五个月的持久基因敲低，且无明显毒性 | NA | 研究一种新的siRNA递送系统，以实现中枢神经系统中持久且广泛的基因抑制 | 白蛋白结合脂质-siRNA偶联物在中枢神经系统中的运输和基因敲低效果 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 6786 | 2024-10-24 |
Construction of thyroid cancer classification and iodine metabolism related diagnostic model using thyroid differentiation score and bioinformation
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039464
PMID:39252309
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研究论文 | 构建了一个与甲状腺癌亚型碘代谢相关的诊断模型，利用甲状腺分化评分和生物信息 | 通过GSVA获取与甲状腺分化评分相关的基因，构建了一个具有准确预测能力的诊断模型 | NA | 提高不同亚型甲状腺癌患者的诊断和治疗准确性 | 甲状腺癌亚型及其碘代谢 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 104个交叉基因，5个关键基因 |
| 6787 | 2024-10-24 |
A conserved cell-type gradient across the human mediodorsal and paraventricular thalamus
2024-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.03.611112
PMID:39282422
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研究论文 | 研究了人类内侧背核和室旁核的细胞类型梯度，并探讨了其与认知和精神疾病的关系 | 通过单核和空间转录组学技术，发现了人类内侧背核中保守的兴奋性神经元梯度，并揭示了其与精神疾病遗传风险的关联 | 研究主要集中在人类和鼠类的内侧背核，未涵盖其他物种或脑区 | 探讨人类内侧背核和室旁核的细胞组成及其与认知和精神疾病的关系 | 人类和鼠类的内侧背核和室旁核的细胞类型 | 神经科学 | 精神疾病 | 单核和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类和鼠类的内侧背核和室旁核样本 |
| 6788 | 2024-10-24 |
Biological sex affects functional variation across the human genome
2024-Sep-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.09.03.24313025
PMID:39281750
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研究论文 | 研究探讨了生物性别对人类基因组功能变异的影响 | 开发了一种两步回归方法来识别性别偏倚表达数量性状位点（sb-eQTL），并发现这些sb-eQTL在多种疾病中富集 | NA | 揭示生物性别对基因组功能变异的影响及其在疾病中的作用 | 人类基因组中的性别偏倚基因和表达数量性状位点 | 基因组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 480个淋巴母细胞系 |
| 6789 | 2024-10-24 |
Spatially clustered type I interferon responses at injury borderzones
2024-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07806-1
PMID:39198639
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研究论文 | 研究心肌梗死后心肌细胞在梗死边缘区启动的I型干扰素反应 | 揭示了心肌细胞在心肌梗死边缘区启动的I型干扰素反应，并发现这种反应与心肌破裂和生存率有关 | 仅在啮齿动物模型中进行了研究，尚未在人类中验证 | 探讨心肌梗死后心肌细胞在边缘区的免疫反应及其对心脏功能的影响 | 心肌细胞、成纤维细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和内皮细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类样本 |
| 6790 | 2024-10-24 |
PoweREST: Statistical Power Estimation for Spatial Transcriptomics Experiments to Detect Differentially Expressed Genes Between Two Conditions
2024-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.30.610564
PMID:39257799
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PoweREST的统计功效估计工具，用于空间转录组学实验中检测两种条件下差异表达基因的统计功效 | PoweREST是首个专门为10X Genomics Visium数据设计的差异表达基因检测统计功效估计工具，支持实验前和初步数据收集后的功效估计 | NA | 开发一种工具，用于估计空间转录组学实验中差异表达基因检测的统计功效 | 空间转录组学数据中的差异表达基因 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6791 | 2024-10-24 |
Chronic social defeat stress induces meningeal neutrophilia via type I interferon signaling
2024-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.30.610447
PMID:39257811
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研究论文 | 研究慢性社会挫败压力通过I型干扰素信号通路诱导脑膜中性粒细胞增多 | 首次揭示了慢性社会挫败压力通过I型干扰素信号通路诱导脑膜中性粒细胞增多的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨慢性社会挫败压力对脑膜免疫反应的影响及其机制 | 小鼠脑膜中性粒细胞 | NA | NA | 流式细胞术、免疫组化、全组织清除、单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本 |
| 6792 | 2024-10-24 |
Variational inference of single cell time series
2024-Aug-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610389
PMID:39257806
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研究论文 | 提出了一种名为SNOW的深度学习算法，用于将单细胞时间序列数据分解为时间依赖和时间独立成分 | SNOW算法能够基于时间独立维度进行细胞类型注释，区分生物学时间变异和批次效应，并能在单细胞水平上生成时间序列 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中时间与细胞身份共同影响基因表达分析的挑战 | 单细胞时间序列RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 时间序列数据 | 三个不同的时间序列单细胞RNA测序研究数据 |
| 6793 | 2024-10-24 |
Targeting Liver Epsins Ameliorates Dyslipidemia in Atherosclerosis
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609742
PMID:39253478
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研究论文 | 研究肝脏epsins在促进PCSK9介导的LDLR降解和阻碍LDL-C清除中的作用，以推动动脉粥样硬化的发展 | 首次揭示了肝脏epsins通过调节LDLR的内吞和降解促进动脉粥样硬化的机制，并提出了靶向肝脏epsins作为治疗动脉粥样硬化的新策略 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证其有效性和安全性 | 探讨肝脏epsins在PCSK9介导的LDLR降解和LDL-C清除中的作用，以揭示其对动脉粥样硬化的影响 | 肝脏epsins、LDLR、PCSK9、动脉粥样硬化 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | scRNA-seq分析、MEBOCOST算法 | NA | 基因表达数据 | ApoE-/-和ApoE-/-/Liver-DKO小鼠 |
| 6794 | 2024-10-24 |
SPACE: Spatially variable gene clustering adjusting for cell type effect for improved spatial domain detection
2024-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.23.609477
PMID:39229093
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研究论文 | 提出了一种名为SPACE的框架，通过调整细胞类型效应对空间变异基因进行聚类，以改进空间域检测 | SPACE方法不需要预先知道基因簇数量、空间模式或细胞类型信息，通过调整细胞类型效应来分类空间变异基因，从而提高空间域检测的准确性 | NA | 改进空间变异基因的分类和空间域检测的准确性 | 空间变异基因及其在空间域检测中的应用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6795 | 2024-10-24 |
Microenvironment T-Type calcium channels regulate neuronal and glial processes to promote glioblastoma growth
2024-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.22.609229
PMID:39229003
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研究论文 | 研究探讨了微环境中的T型钙通道在调节神经元和胶质细胞过程中对胶质母细胞瘤生长的影响 | 首次揭示了微环境中的T型钙通道在促进胶质母细胞瘤进展中的作用，并发现抑制该通道可以增强TMZ和辐射的抗肿瘤效果 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类样本中验证结果 | 阐明微环境和内在T型钙通道在调节肿瘤生长和进展中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞、Cav3.2敲除小鼠、WT小鼠、神经元和胶质母细胞瘤干细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Cav3.2敲除小鼠和WT小鼠的肿瘤样本，以及神经元和胶质母细胞瘤干细胞的共培养样本 |
| 6796 | 2024-10-24 |
Tracking clonal evolution of drug resistance in ovarian cancer patients by exploiting structural variants in cfDNA
2024-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.21.609031
PMID:39229105
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研究论文 | 本文通过利用cfDNA中的结构变异，追踪卵巢癌患者药物耐药性的克隆进化 | 开发了一种基于克隆特异性结构变异的cfDNA混合捕获和深度测序方法，错误率远低于ctDNA中的单核苷酸变异检测 | 研究样本量较小，仅涉及19名患者，且仅限于高级别浆液性卵巢癌 | 探索肿瘤在药物耐药状态下进化的机制，并开发一种新的方法来追踪克隆进化 | 高级别浆液性卵巢癌患者的药物耐药性克隆进化 | 数字病理学 | 卵巢癌 | cfDNA混合捕获和深度测序 | Wright-Fisher模型 | cfDNA和单细胞全基因组测序数据 | 19名患者的基础数据，10名患者的长期监测数据 |
| 6797 | 2024-10-24 |
Description of Bacterial RNA Transcripts Detected in Mycobacterium tuberculosis - Infected Cells from Peripheral Human Granulomas using Single Cell RNA Sequencing
2024-Aug-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.20.608852
PMID:39229107
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研究论文 | 本文描述了在使用单细胞RNA测序技术从外周肉芽肿感染的结核分枝杆菌细胞中检测到的细菌RNA转录本 | 本文首次详细研究了在单细胞RNA测序中检测到的结核分枝杆菌转录本，并发现这些转录本与宿主细胞的独特分子标识符相关，表明宿主细胞被感染 | 研究仅限于来自巴布亚新几内亚的结核病患者样本，且样本量较小 | 研究结核分枝杆菌在感染宿主细胞中的RNA转录本及其变异情况 | 结核分枝杆菌感染的宿主细胞中的RNA转录本 | 数字病理学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自巴布亚新几内亚的结核病患者样本 |
| 6798 | 2024-10-24 |
Vaccines combining slow delivery and follicle targeting of antigens increase germinal center B cell clonal diversity and clonal expansion
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.19.608655
PMID:39229011
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研究论文 | 研究了一种结合缓慢释放和淋巴滤泡靶向抗原的疫苗，分析了其对生发中心B细胞克隆多样性和克隆扩增的影响 | 结合磷酸丝氨酸标记的免疫原和铝盐佐剂与皂苷纳米颗粒佐剂，显著增强了生发中心和抗体反应，并增加了生发中心B细胞克隆的多样性和扩增 | 研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨结合缓慢释放和淋巴滤泡靶向抗原的疫苗对生发中心B细胞反应的影响 | 生发中心B细胞的克隆多样性和克隆扩增 | 免疫学 | NA | scRNA-seq, scBCR-seq | NA | RNA序列, B细胞受体序列 | 老鼠模型 |
| 6799 | 2024-10-24 |
cytoKernel: Robust kernel embeddings for assessing differential expression of single cell data
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.16.608287
PMID:39229233
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研究论文 | 提出了一种基于核嵌入的单细胞数据差异表达评估方法cytoKernel | cytoKernel能够利用全概率分布模式评估单细胞RNA测序和高维流式或质谱细胞术数据的差异表达，检测包括聚合变化在内的多种模式 | NA | 开发一种新的方法来评估单细胞数据的差异表达 | 单细胞RNA测序和高维流式或质谱细胞术数据 | 生物信息学 | NA | 核嵌入 | NA | 单细胞RNA测序数据和高维流式或质谱细胞术数据 | 包括模拟数据和真实数据集 |
| 6800 | 2024-10-24 |
A Novel Human Extravascular Monocyte Subset with Antiviral Functions Is Crucial for Resolving Lung Tissue Infection
2024-Aug-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.08.583965
PMID:38496468
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研究论文 | 研究揭示了一种新型的人类血管外单核细胞亚群，具有抗病毒功能，对解决肺组织感染至关重要 | 发现了一种新型的人类肺部血管外炎症单核细胞（ExiMO），具有抗病毒功能，并揭示了其在SARS-CoV-2感染解决中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类实际情况存在差异 | 探讨人类免疫机制在无预先免疫背景下解决肺部感染的作用 | SARS-CoV-2感染及其解决机制 | 免疫学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | RNA | 小鼠模型与人类免疫系统的联合移植 |