单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
6781	2024-12-08	The role of the tricellular junction protein ILDR2 in glomerulopathies: Expression patterns and functional insights 2024-Dec-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111329 PMID:39640577	研究论文	研究ILDR2蛋白在肾小球疾病中的表达模式和功能	首次探讨了ILDR2在足细胞中的作用及其在肾小球疾病中的保护作用	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本	探讨ILDR2在肾小球疾病中的作用及其对血滤的影响	ILDR2蛋白及其在足细胞中的表达和功能	NA	肾小球疾病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)、超分辨率显微镜、液相色谱-串联质谱 (LC-MS/MS)	NA	蛋白质	小鼠模型
6782	2024-12-08	Molecular and functional profiling of primary normal ovarian cells defines insights into cancer development and drug responses 2024-Dec-19, Molecular therapy. Oncology DOI:10.1016/j.omton.2024.200903 PMID:39634630	研究论文	研究通过分子和功能分析正常卵巢细胞，揭示了癌症发展和药物反应的见解	首次对正常卵巢细胞进行单细胞转录组学、高内涵图像细胞绘制和高通量药物测试的综合分析	研究仅限于两种正常卵巢细胞系和代表性的卵巢癌细胞系，可能无法完全代表所有卵巢癌的异质性	探讨正常卵巢细胞与卵巢癌细胞的分子特征差异，以及这些差异如何影响癌症发展和药物反应	正常卵巢细胞（HOSE1C和HOSE2C）和代表性的高级别浆液性卵巢癌细胞（HGSOC）	数字病理学	卵巢癌	单细胞转录组学、高内涵图像细胞绘制、高通量药物测试	NA	转录组数据、图像数据	两种正常卵巢细胞系（HOSE1C和HOSE2C）和代表性的卵巢癌细胞系
6783	2024-12-08	MAIT cell plasticity enables functional adaptation that drives antibacterial immune protection 2024-Dec-06, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adp9841 PMID:39642244	研究论文	研究了黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）的适应性功能及其在抗菌免疫保护中的作用	定义了干扰素-γ（IFN-γ）产生型MAIT1细胞和白细胞介素-17A（IL-17A）产生型MAIT17细胞在体内的可塑性，并发现MAIT17细胞在特定条件下可以转化为MAIT1细胞，从而在黏膜组织中发挥抗菌作用	NA	探讨MAIT细胞在抗感染中的作用及其在疫苗开发中的潜在应用	MAIT1和MAIT17细胞亚群的功能和可塑性	免疫学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
6784	2024-12-08	Targeting the Epigenetic Regulator CBX5 Promotes Fibroblast Metabolic Reprogramming and Inhibits Lung Fibrosis 2024-Dec-06, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2024-0255OC PMID:39642371	研究论文	研究揭示了表观遗传调控因子CBX5在促进成纤维细胞代谢重编程和抑制肺纤维化中的关键作用	首次阐明CBX5在肺纤维化过程中通过调节成纤维细胞代谢重编程促进纤维化的机制	研究主要集中在体外和离体实验，缺乏体内实验验证	探讨表观遗传调控因子CBX5在肺纤维化中的作用及其机制	特发性肺纤维化中的成纤维细胞	数字病理学	肺纤维化	scRNA-seq, 免疫组化, RNA-seq	NA	基因表达数据	包括体外培养的IPF成纤维细胞和离体的IPF肺组织
6785	2024-12-08	The CCL5/CCR5/SHP2 axis sustains Stat1 phosphorylation and activates NF-κB signaling promoting M1 macrophage polarization and exacerbating chronic prostatic inflammation 2024-Dec-05, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-024-01943-w PMID:39633456	研究论文	本研究旨在识别慢性前列腺炎（CP）中关键的细胞因子，并探讨其在驱动炎症反应中的作用	首次揭示了CCL5/CCR5/SHP2轴在维持Stat1磷酸化和激活NF-κB信号通路中的作用，促进M1巨噬细胞极化和加剧慢性前列腺炎炎症	NA	识别慢性前列腺炎中的关键细胞因子并探讨其驱动炎症反应的机制	慢性前列腺炎患者和实验性自身免疫性前列腺炎（EAP）模型小鼠	NA	前列腺疾病	细胞因子检测、实验性自身免疫性前列腺炎模型、药理学抑制、单细胞转录组学	NA	细胞因子、基因表达	48种细胞因子的检测面板，实验性自身免疫性前列腺炎模型小鼠，药理学抑制剂的使用
6786	2024-12-08	Single-cell immune profiling and validation of PBMCs in the onset of and recovery from herpes zoster 2024-Dec-04, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-07289-w PMID:39633072	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析了带状疱疹发病和恢复期间外周血单核细胞的免疫细胞谱	首次详细描述了带状疱疹发病和恢复期间免疫细胞亚群的比例变化，并通过流式细胞术和血液常规数据进行了验证	研究样本主要来自男性患者，可能存在性别偏倚	深入了解带状疱疹的发病机制	带状疱疹发病和恢复期间的外周血单核细胞	数字病理学	带状疱疹	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和ATAC测序	NA	转录组和表观基因组数据	主要来自男性患者的外周血单核细胞
6787	2024-12-08	Single-cell RNA sequencing analysis reveals potential key prognostic markers in hepatocellular carcinoma 2024-Dec-04, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01646-1 PMID:39633216	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了肝细胞癌中的潜在关键预后标志物	本研究首次通过单细胞RNA测序技术，识别出与肝细胞癌预后相关的566个基因，并筛选出11个关键基因用于预测患者的生存率	本研究的样本量较小，且仅基于GEO数据库的数据进行分析，可能存在一定的局限性	通过单细胞RNA测序分析，识别肝细胞癌患者的潜在预后标志物	肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	LASSO-Cox回归模型	RNA测序数据	2208个上调基因和1447个下调基因
6788	2024-12-08	Investigating the role of KARS in lung adenocarcinoma via single-cell RNA sequencing 2024-Dec-03, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01633-6 PMID:39625565	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了KARS在肺腺癌中的表达和功能	首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了KARS在肺腺癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系	研究主要基于已发表的数据集，缺乏体内实验验证	探讨KARS在肺腺癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力	KARS在肺腺癌中的表达及其与临床病理特征和患者预后的关系	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用了来自TCGA、GTEx和GEO的数据集
6789	2024-12-08	The characteristics and functional significance of disulfidptosis-related genes in head and neck squamous cell carcinoma 2024-Dec-03, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01629-2 PMID:39625660	研究论文	研究了二硫化物凋亡相关基因在头颈部鳞状细胞癌中的特征和功能意义	首次通过计算机辅助生物信息学分析，揭示了二硫化物凋亡相关基因在头颈部鳞状细胞癌中的表达特征和功能意义	研究主要基于TCGA数据和单细胞测序数据，可能存在样本偏差和数据局限性	探讨二硫化物凋亡相关基因在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其临床意义	头颈部鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境中的细胞	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	RNA测序	非负矩阵分解 (NMF)	RNA测序数据	TCGA数据库中的头颈部鳞状细胞癌患者数据和单细胞测序数据
6790	2024-12-08	Cross-species single-cell RNA-seq analysis reveals disparate and conserved cardiac and extracardiac inflammatory responses upon heart injury 2024-Dec-03, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-07315-x PMID:39627536	研究论文	研究通过跨物种单细胞RNA测序分析，揭示了心脏损伤后心脏和心脏外炎症反应的差异和保守性	首次在斑马鱼和小鼠中进行跨物种单细胞RNA测序，比较了心脏损伤后的炎症反应，并发现了不同物种间单核细胞/巨噬细胞的转录簇差异	研究仅限于斑马鱼和小鼠，未涉及人类样本，可能影响结果的普适性	研究心脏损伤后不同物种间的炎症反应差异，探讨其对再生和纤维化过程的影响	斑马鱼和小鼠的心脏损伤模型	心血管研究	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	斑马鱼和小鼠的多个样本
6791	2024-12-08	Single-cell view and a novel protective macrophage subset in perivascular adipose tissue in T2DM 2024-Dec-03, Cellular & molecular biology letters IF:9.2Q1 DOI:10.1186/s11658-024-00668-5 PMID:39627688	研究论文	研究探讨了2型糖尿病（T2DM）中血管周围脂肪组织（PVAT）的单细胞景观及其在血管病变中的作用	首次揭示了T2DM中PVAT中单细胞水平的显著变化，并发现了一种新的具有保护作用的Pdpn+巨噬细胞亚群	研究主要基于大鼠模型，未来需要进一步在人类样本中验证	探讨T2DM中PVAT的细胞组成和功能变化及其在血管病变中的机制	血管周围脂肪组织（PVAT）中的细胞组成和功能	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA	正常和T2DM大鼠的PVAT中的基质血管部分（SVF）
6792	2024-12-08	Ketogenic diet modulates immune cell transcriptional landscape and ameliorates experimental autoimmune uveitis in mice 2024-Dec-03, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-024-03308-z PMID:39627787	研究论文	研究探讨了生酮饮食对小鼠免疫细胞转录组景观的影响及其在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的缓解作用	首次系统研究了生酮饮食对免疫微环境的影响，特别是在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的作用	研究仅限于小鼠模型，结果的临床转化尚需进一步验证	探讨生酮饮食对免疫细胞功能和葡萄膜炎的影响	小鼠的淋巴结和视网膜免疫细胞	免疫学	葡萄膜炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和流式细胞术	NA	RNA	小鼠的淋巴结和视网膜样本
6793	2024-12-08	Cell type mapping reveals tissue niches and interactions in subcortical multiple sclerosis lesions 2024-Dec, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-024-01796-z PMID:39501036	研究论文	研究使用单核和空间转录组学技术，分析了多发性硬化症（MS）亚皮质病灶中的细胞类型及其相互作用	首次详细描述了MS病灶中特定组织微环境的细胞类型组成及其在慢性活动性和非活动性阶段的相互作用	NA	揭示多发性硬化症病灶中细胞类型的组成及其相互作用	多发性硬化症亚皮质病灶及其对照组织	数字病理学	多发性硬化症	单核和空间转录组学	NA	转录组数据	NA
6794	2024-12-08	A dataset examining technical factors on fixed white blood cell single-cell RNA-seq 2024-Dec, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.111096 PMID:39633974	研究论文	本文评估了两种商业平台在去红细胞全血细胞上的固定单细胞RNA测序性能	引入了固定单细胞RNA测序方法来解决脆弱细胞在测序中的挑战	需要进一步校正存储时间和固定细胞数量引入的批次和技术效应	评估固定单细胞RNA测序技术在脆弱细胞中的应用效果	去红细胞全血细胞，特别是中性粒细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA数据	NA
6795	2024-12-08	Integrating Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing Identifies and Validates Lactylation-Related Signatures for Intervertebral Disc Degeneration 2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70262 PMID:39636180	研究论文	研究揭示了乳酸化水平升高与椎间盘退变（IVDD）发展之间的复杂关联，并通过多种bulk RNA测序数据分析了相关基因的表达水平，建立了与IVDD相关的基因特征	首次系统分析了乳酸化相关基因（LRGs）在椎间盘退变中的作用，并确定了CBX3作为关键基因，以及atosiban acetate作为潜在的治疗候选药物	NA	探讨乳酸化在椎间盘退变中的作用及其相关基因特征	乳酸化相关基因（LRGs）及其在椎间盘退变中的表达和功能	数字病理学	椎间盘退变	RNA测序	NA	RNA	多种bulk RNA测序数据
6796	2024-12-08	Single-cell transcriptomic analysis of glioblastoma reveals pericytes contributing to the blood-brain-tumor barrier and tumor progression 2024-Dec, MedComm IF:10.7Q1 DOI:10.1002/mco2.70014 PMID:39640361	研究论文	本文通过单细胞转录组分析研究了胶质母细胞瘤中的周细胞，揭示了周细胞在血脑肿瘤屏障中的作用及其与肿瘤进展的关系	本文首次鉴定了与血脑肿瘤屏障功能相关的周细胞标记物PTH1R，并揭示了其在胶质母细胞瘤中的表达与预后的关联	本文主要基于单细胞RNA测序数据和细胞系实验，缺乏体内实验的直接证据	旨在识别与血脑肿瘤屏障相关的周细胞，并研究其在胶质母细胞瘤中的作用	胶质母细胞瘤中的周细胞及其在血脑肿瘤屏障中的作用	数字病理学	脑癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	多个胶质母细胞瘤样本和正常脑组织样本
6797	2024-12-08	Comprehensive gene set enrichment and variation analyses identify SUV39H1 as a potential prognostic biomarker for glioblastoma immunorelevance 2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.016 PMID:39640533	研究论文	本研究通过基因集富集分析和变异分析，识别出SUV39H1作为胶质母细胞瘤免疫相关性的潜在预后生物标志物	首次揭示了SUV39H1在胶质母细胞瘤中的高表达与不良预后和免疫细胞浸润的相关性，并验证了其作为预后预测和免疫治疗靶点的潜力	研究主要基于TCGA数据库的数据，体外实验验证样本量有限	探讨SUV39H1在胶质母细胞瘤中的作用及其作为预后生物标志物的潜力	胶质母细胞瘤患者样本及其免疫相关性	数字病理学	脑癌	基因集富集分析（GSEA）和基因集变异分析（GSVA）	NA	转录组数据	使用TCGA数据库中的胶质母细胞瘤转录组和临床数据，体外实验涉及U87和U251胶质母细胞瘤细胞系以及CSC1589和TS576胶质母细胞瘤干细胞系
6798	2024-12-08	Identification of PANoptosis-based signature for predicting the prognosis and immunotherapy response in AML 2024-Nov-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e40267 PMID:39634422	研究论文	本研究通过筛选PANoptosis相关基因，建立了PANoptosis风险特征，用于预测急性髓系白血病（AML）的预后和免疫治疗反应	首次探索了基于PANoptosis特征在AML中的作用，并验证了其作为独立预后因子的有效性	NA	建立和验证基于PANoptosis的风险特征，以预测AML患者的生存和免疫治疗反应	急性髓系白血病（AML）患者的预后和免疫治疗反应	数字病理学	白血病	LASSO回归分析、Cox回归分析、分子对接、分子动力学模拟	NA	RNA测序数据	使用了TCGA、bulk RNA测序和单细胞测序的数据
6799	2024-12-08	Pharmacological and toxicological characteristics of baicalin in preventing spontaneous abortion and recurrent pregnancy loss: A multi-level critical review 2024-Oct-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38633 PMID:39640688	综述	本文综述了黄芩苷在预防自然流产和反复妊娠丢失中的药理学和毒理学特性	提出了基于病理动力学的多模态立体测序研究，结合单细胞RNA测序、空间转录组学和单细胞多模态组学，深入探讨黄芩苷的保胎机制	从临床角度阐述了使用黄芩苷的局限性	探讨黄芩苷在母胎界面上的代谢、毒理学和药理学效应，以及其在预防自然流产和反复妊娠丢失中的作用机制	黄芩苷及其代谢产物黄芩素在母胎界面上的生物效应	NA	妊娠相关疾病	单细胞RNA测序、空间转录组学、单细胞多模态组学	NA	NA	NA
6800	2024-12-08	scACT: Accurate Cross-modality Translation via Cycle-consistent Training from Unpaired Single-cell Data 2024-Oct, Proceedings of the ... ACM International Conference on Information & Knowledge Management. ACM International Conference on Information and Knowledge Management DOI:10.1145/3627673.3679576 PMID:39628660	研究论文	本文介绍了一种名为scACT的深度生成模型，用于从未配对的单细胞数据中提取跨模态生物学见解	scACT通过对抗训练对齐未配对的多模态数据，利用循环一致训练实现无先验知识的跨模态翻译，并通过模拟扰动探索可解释的调控相互联系	NA	解决现有跨模态翻译方法依赖于稀缺的高质量共测数据的问题	单细胞数据中的跨模态翻译	机器学习	NA	深度生成模型	对抗训练和循环一致训练	单细胞数据	多种单细胞数据集