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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2026-05-31 |
Etiological basis for chronic pain genetic variation in brain and dorsal root ganglia cell types
2025-Jul-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.07.03.25330832
PMID:40630576
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研究论文 | 整合慢性疼痛GWAS数据与脑和背根神经节单细胞数据,揭示疼痛相关遗传变异的细胞类型特异性 | 首次将慢性疼痛遗传变异与人类脑和背根神经节单细胞RNA测序及染色质可及性数据相结合,精确定位细胞类型特异性富集模式 | 样本量有限(患者n=12),且仅限于宫颈背根神经节;小鼠数据可能不完全适用于人类 | 阐明慢性疼痛遗传变异的细胞类型基础,连接中枢和外周神经系统 | 人类脑和背根神经节细胞类型 | 机器学习 | 慢性疼痛 | 单细胞RNA测序,单细胞染色质可及性分析 | NA | 基因数据 | 慢性疼痛GWAS样本量1,235,695;急性或慢性疼痛患者宫颈背根神经节样本量12 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞染色质可及性测序 | NA | NA |
| 662 | 2026-05-31 |
A multi-step immune-competent genetic mouse model reveals phenotypic plasticity in uveal melanoma
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657841
PMID:40502063
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研究论文 | 开发了一种多步免疫健全的遗传小鼠模型,揭示了葡萄膜黑色素瘤的表型可塑性 | 首次利用内源位点条件性表达突变GNAQ并结合BAP1缺失和MYC激活,构建出具有转移潜力的完全外显免疫健全小鼠模型,并通过单细胞RNA测序揭示恶性细胞的转录异质性和分化可塑性 | 模型仅模拟了部分人类疾病关键遗传事件,且8号染色体额外驱动因子的协同作用机制尚待明确 | 构建生理相关且免疫健全的葡萄膜黑色素瘤小鼠模型,用于研究肿瘤生物学、特征化候选驱动基因及开发免疫治疗策略 | 葡萄膜黑色素瘤小鼠模型及人类葡萄膜黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 基因工程小鼠模型、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型(具体数量未在摘要中说明)及人类葡萄膜黑色素瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台进行单细胞RNA测序 |
| 663 | 2026-05-31 |
Neuroprotectin D1 and GPR37 protect against chemotherapy-induced peripheral neuropathy and the transition from acute to chronic pain
2025-06, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107746
PMID:40287118
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研究论文 | 研究揭示神经保护素D1及其受体GPR37在化疗诱导的周围神经病变和急性疼痛向慢性疼痛转化中的保护作用 | 首次发现GPR37在化疗诱导的周围神经病变中调控急性疼痛向慢性疼痛转化,并阐明NPD1通过GPR37保护感觉神经元和缓解神经病理性疼痛的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类DRG的空间转录组学分析仅为初步结果,GPR37在人类中的具体机制仍需进一步验证 | 探讨GPR37在化疗诱导的周围神经病变中的作用及NPD1通过GPR37的镇痛和神经保护机制 | 小鼠背根神经节神经元和巨噬细胞、人类DRG组织样本 | 机器学习 | 周围神经病变 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组学数据 | 小鼠(野生型和Gpr37敲除型)及人类DRG组织 | NA | 空间转录组学 | NA | 人类DRG的空间转录组学分析 |
| 664 | 2026-05-31 |
Targeting caseinolytic mitochondrial matrix peptidase, a novel contributor to the pathobiology of high-risk multiple myeloma
2025-May-29, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024781
PMID:39912779
|
research paper | 利用单细胞转录组学发现CLPP是高风险多发性骨髓瘤病理生物学的新贡献者,并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次确定酪蛋白水解线粒体基质肽酶(CLPP)在多发性骨髓瘤高危行为中的关键作用及其作为治疗靶点的可行性 | 对CLPP在骨髓瘤进展中的详细分子机制阐述可能不够深入,且临床前研究结果尚需临床验证 | 探究高风险多发性骨髓瘤的病理生物学机制及潜在治疗靶点 | 多发性骨髓瘤患者CD138+肿瘤浆细胞及正常浆细胞 | machine learning | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及新诊断和复发/难治性多发性骨髓瘤患者样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 665 | 2026-05-31 |
Exploring the co-morbid relationship between Alzheimer's disease and lung cancer in the 5xFAD transgenic mouse model
2025-05, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12527
PMID:39930922
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研究论文 | 本研究利用5xFAD转基因小鼠模型探讨阿尔茨海默病与肺癌之间的共病关系,并揭示AD抑制肺癌发展的潜在机制 | 首次通过共病小鼠模型结合单细胞测序技术,揭示阿尔茨海默病通过铁稳态失衡、氧化应激增强及免疫细胞浸润(CD8+ T细胞和自然杀伤细胞)抑制肺癌发展的机制 | 未提及具体局限性,但可能涉及模型转化到临床的适用性及样本量问题 | 探究阿尔茨海默病与肺癌之间拮抗关系的分子机制 | 5xFAD转基因小鼠模型中的阿尔茨海默病与肺癌共病现象 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病、肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | 未明确样本数量,涉及5xFAD转基因小鼠和野生型小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 666 | 2026-05-31 |
Atlas of Metastatic Gastric Cancer Links Ferroptosis to Disease Progression and Immunotherapy Response
2024-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.038
PMID:39097198
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研究论文 | 对转移性胃癌进行单细胞转录组和免疫图谱分析,揭示铁死亡在疾病进展和免疫治疗反应中的作用 | 首次构建大规模转移性胃癌的单细胞图谱,揭示铁死亡逃逸机制及其与免疫治疗联合的潜在治疗策略 | 主要基于治疗初治患者,可能无法完全反映治疗后的动态变化 | 通过单细胞和免疫图谱揭示转移性胃癌的肿瘤和免疫生物学特征,探索铁死亡在疾病进展中的作用及联合治疗策略 | 68对配对的治疗初治原发性转移性胃癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序, 免疫分析 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫数据 | 68对配对的治疗初治原发性转移性胃癌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 667 | 2026-05-31 |
Mucosal Single-Cell Profiling of Crohn's-Like Disease of the Pouch Reveals Unique Pathogenesis and Therapeutic Targets
2024-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.025
PMID:39084267
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示贮袋克罗恩样病的独特发病机制和治疗靶点 | 首次利用单细胞RNA测序和质谱流式技术对贮袋克罗恩样病患者黏膜细胞进行全面分析,发现其内质网应激升高可能是新型诊断标志物和治疗靶点 | 研究样本量有限(50例),且主要基于横断面分析,缺乏纵向动态观察 | 探究溃疡性结肠炎患者术后贮袋克罗恩样病的病理生理机制 | 贮袋克罗恩样病患者、正常贮袋患者、贮袋炎患者及家族性腺瘤性息肉病患者的黏膜细胞 | 单细胞分析 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、质谱流式技术、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、质谱流式数据 | 50例患者(包括正常和CDP组):其中部分样本进行单细胞RNA测序,部分进行质谱流式分析 | 10x Genomics, Fluidigm | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | 10x Chromium, CyTOF | 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒用于单细胞RNA测序;质谱流式技术使用CyTOF平台 |
| 668 | 2026-05-31 |
Identification of Key Genes in Fetal Gut Development at Single-Cell Level by Exploiting Machine Learning Techniques
2024-12, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400104
PMID:39324223
|
研究论文 | 利用机器学习技术对单细胞测序数据进行分析,识别胎儿肠道发育过程中的关键基因 | 采用了增量特征选择方法结合四种特征排序算法,从大规模单细胞数据中提取关键基因和分类规则,构建高效分类器 | 未提及明确的局限性 | 通过机器学习技术增强对胎儿肠道发育的理解 | 胎儿肠道发育过程中的细胞,包括结肠、十二指肠和回肠的上皮、免疫、间充质和血管细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 62,849个样本,每个样本有33,694个基因特征 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 669 | 2026-05-31 |
Cancer-Associated Endocrine Cells Participate in Pancreatic Carcinogenesis
2024-11, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.016
PMID:39048054
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研究论文 | 通过单细胞转录组、空间转录组和多重免疫组化技术,揭示胰腺导管腺癌中内分泌细胞的改变及其与癌细胞的相互作用机制 | 首次系统描绘胰腺内分泌细胞在PDAC中的改变,定义并表征癌症相关内分泌细胞,揭示内分泌-外分泌相互作用的旁分泌机制 | 尚未明确胰腺多肽阳性细胞在临床样本中的预后价值及具体分子机制细节 | 探究胰腺内分泌细胞在胰腺导管腺癌发生发展中的作用及其与外分泌部分的相互作用机制 | 胰腺内分泌细胞(包括α细胞、β细胞、胰腺多肽阳性细胞等)与胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序、多重免疫组化、原位移植小鼠模型、基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、组织切片图像 | 未提及具体样本数量,涉及原位移植小鼠、KrasLSL-G12DPdx1-Cre小鼠、KrasLSL-G12Dp53LoxPPdx1-CreER小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'和10x Visium空间转录组平台 |
| 670 | 2026-05-31 |
Ependymal cells undergo astrocyte-like reactivity in response to neuroinflammation
2024-10, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.16120
PMID:38702968
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学比较反应性室管膜细胞和反应性星形胶质细胞的转录组,发现神经炎症中室管膜细胞呈现星形胶质细胞样反应性,并鉴定保守的胶质反应性特征 | 首次直接比较反应性室管膜细胞与反应性星形胶质细胞的转录组,揭示了保守的胶质反应性基因特征,并证明该特征在多种神经炎症背景下存在 | 未来工作需要探索驱动室管膜反应性的机制及下游功能后果 | 研究神经炎症中室管膜细胞的反应性转录特征及其与星形胶质细胞反应性的相似性 | 室管膜细胞和星形胶质细胞 | 机器学习 | 神经炎症 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 671 | 2026-05-31 |
The temporal protein signature analyses of developing human deciduous molar tooth germ
2024-10, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202300396
PMID:38522031
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析揭示了人类发育中的乳磨牙牙胚的时相性蛋白特征 | 首次利用蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,系统分析了人类胚胎期乳磨牙从帽状期到钟状早期的时间依赖性蛋白质变化,并筛选出24个潜在的牙发育驱动蛋白 | 未提及具体局限性 | 探究人类乳磨牙牙胚发育过程中的时间依赖性蛋白质组变化,为牙齿发育和矿化组织畸形的机制研究提供资源 | 健康人类乳磨牙的牙胚组织 | 蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 人类胚胎期乳磨牙样本,涵盖帽状期到钟状早期 | NA | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 672 | 2026-05-31 |
Biomarker discovery in hepatocellular carcinoma (HCC) for personalized treatment and enhanced prognosis
2024-10, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2024.08.006
PMID:39191624
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综述 | 本文综述肝细胞癌生物标志物发现及其在个性化治疗和预后改善中的作用 | 系统整合了蛋白质组学技术、免疫标志物及新兴单细胞测序和机器学习在肝细胞癌生物标志物发现中的应用前景 | 生物标志物验证、标准化、临床整合及成本障碍仍存在挑战 | 探讨肝细胞癌生物标志物在早期检测、精确诊断和个性化治疗中的潜力 | 肝细胞癌患者及相关生物标志物(如甲胎蛋白、磷脂酰肌醇蛋白聚糖3、脱-γ-羧基凝血酶原、PD-L1、肿瘤浸润淋巴细胞等) | 机器学习 | 肝癌 | NGS, 质谱分析, 液体活检 | NA | NA | NA | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 673 | 2026-05-31 |
Single-cell proteomics by mass spectrometry: Advances and implications in cancer research
2024-06, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202300210
PMID:38727198
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研究论文 | 本文综述了单细胞蛋白质组学在癌症研究中的应用,并揭示了该技术的最新发展进展 | 本文重点介绍了单细胞蛋白质组学在癌症研究中的新兴应用,并分析了该领域的研究空白和未来方向 | 本文未明确指出局限性,但可能受限于单细胞蛋白质组学技术的当前发展水平和数据复杂性 | 总结单细胞蛋白质组学在癌症研究中的应用,并推动该技术在癌症研究中的进一步发展 | 单细胞蛋白质组学技术及癌症研究领域 | 机器学习 | 癌症 | 质谱法 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 674 | 2026-05-31 |
Advancing skeletal health and disease research with single-cell RNA sequencing
2024-05-30, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00538-3
PMID:38816888
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综述 | 全面介绍了单细胞RNA测序技术在骨骼健康与疾病研究中的应用,包括细胞获取方法、技术概述和生物信息学分析流程 | 提出了一种从骨骼组织中获取高质量单细胞的简化方法,并系统总结了scRNA-seq在脊柱、关节、骨、肌肉和肌腱疾病中的最新研究进展 | 高度矿化的骨骼组织在单细胞水平上研究机制仍面临技术挑战 | 推动对骨骼疾病细胞和分子水平病理过程的理解,发现新的治疗靶点 | 骨骼组织中的细胞,包括脊柱、关节、骨、肌肉和肌腱相关细胞 | 单细胞转录组学 | 退行性椎间盘疾病, 骨关节炎, 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 675 | 2026-05-31 |
Interferon-α stimulates DExH-box helicase 58 to prevent hepatocyte ferroptosis
2024-04-15, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00524-9
PMID:38622688
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研究论文 | 本研究揭示干扰素-α通过刺激DExH盒螺旋酶58防止肝细胞铁死亡,为肝缺血再灌注损伤提供潜在治疗策略 | 首次发现DHX58作为RNA结合蛋白,通过招募m6A读取器YTHDC2促进GPX4 mRNA翻译,以m6A依赖方式抑制铁死亡,并揭示IFN-α在其中的调控作用 | 未提及具体局限性 | 探究DEAD/DExH盒螺旋酶家族成员在肝缺血再灌注损伤中调控肝细胞铁死亡的机制 | 肝细胞特异性Dhx58敲除小鼠和肝脏I/R损伤模型 | 数字病理学 | 其他疾病(肝缺血再灌注损伤) | 转录组分析、单细胞RNA测序、RNA免疫沉淀测序、免疫沉淀质谱 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 肝细胞特异性Dhx58敲除小鼠;肝脏I/R损伤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 676 | 2026-05-31 |
The implications of single-cell RNA-seq analysis in prostate cancer: unraveling tumor heterogeneity, therapeutic implications and pathways towards personalized therapy
2024-04-11, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00526-7
PMID:38605399
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在揭示前列腺癌肿瘤异质性、治疗意义及个性化治疗路径中的应用 | 系统总结了单细胞RNA测序与其他单细胞技术在前列腺癌研究中的综合应用,特别是小鼠与人类前列腺癌差异及多组学整合分析 | 单细胞技术在前列腺癌中的应用仍有限,现有研究多集中于特定亚型,未来需扩大样本和数据类型 | 探讨单细胞RNA测序在前列腺癌基础与临床研究中的意义,并为个性化医疗提供新见解 | 前列腺癌肿瘤细胞及微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 677 | 2026-05-31 |
FOXO1 reshapes neutrophils to aggravate acute brain damage and promote late depression after traumatic brain injury
2024-03-31, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00523-w
PMID:38556884
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研究论文 | 通过单细胞转录组学、代谢组学和蛋白质组学分析,发现FOXO1高表达的中性粒细胞在创伤性脑损伤急性和慢性阶段的作用 | 首次揭示了FOXO1高表达中性粒细胞作为一种新型中性粒细胞表型,在创伤性脑损伤急性和慢性阶段通过不同机制促进脑损伤和晚期抑郁 | 未提及明显局限性,但可能需进一步验证机制在人体的普适性 | 探究中性粒细胞在创伤性脑损伤后的异质性、多功能性和时间依赖性调控,以及FOXO1在其中介导的脑损伤和行为结局 | 创伤性脑损伤患者和小鼠模型的中性粒细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、代谢组学、蛋白质组学、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、代谢组数据、蛋白质组数据 | 创伤性脑损伤患者和FOXO1条件性基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 678 | 2026-05-31 |
A single-cell atlas of the murine pancreatic ductal tree identifies novel cell populations with potential implications in pancreas regeneration and exocrine pathogenesis
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582044
PMID:38463969
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建小鼠胰腺导管树图谱,发现新的导管细胞群体及其在胰腺再生和外分泌病理中的潜在作用 | 首次在单细胞分辨率下全面描绘从小叶中心细胞到主导管的整个小鼠胰腺导管上皮图谱,鉴定出15个导管细胞群体及其器官形成和内分泌分化能力 | 未提供具体限制信息 | 探究胰腺导管细胞在单细胞水平上的异质性及其在胰腺再生和外分泌发病机制中的作用 | 小鼠胰腺导管上皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 健康小鼠胰腺样本、慢性胰腺炎和胰腺肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 679 | 2026-05-31 |
Targeting PLCG2 Suppresses Tumor Progression, Orchestrates the Tumor Immune Microenvironment and Potentiates Immune Checkpoint Blockade Therapy for Colorectal Cancer
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.98200
PMID:39494327
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研究论文 | 本文探究PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤免疫微环境和增强免疫检查点阻断治疗中的作用 | 首次发现PLCG2可作为结直肠癌精准生物标志物和治疗靶点,逆转免疫逃逸及免疫检查点阻断治疗耐药 | 未提及 | 研究PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤微环境及增强免疫检查点阻断治疗中的作用 | 结直肠癌患者及临床样本、细胞和动物模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq、单细胞转录组、空间转录组、蛋白印迹、定量逆转录PCR、多色免疫荧光、多重免疫组化、流式细胞术、动物模型 | NA | 基因表达数据、图像 | 结直肠癌患者样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 680 | 2026-05-31 |
Reconstruction of the Hepatic Microenvironment and Pathological Changes Underlying Type II Diabetes through Single-Cell RNA Sequencing
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.99176
PMID:39494341
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序重建II型糖尿病肝脏微环境及病理变化 | 首次利用单细胞RNA-seq技术系统性地探索了两种T2DM小鼠模型中肝脏微环境的变化,揭示了肝星状细胞活化、Kupffer细胞新亚群及细胞间相互作用在糖尿病性MAFLD进展中的动态作用 | 研究对象仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;对某些基因(如Tgfb1i1、Txnip)的功能机制仍需进一步探索 | 阐明II型糖尿病并发代谢相关脂肪性肝病在不同阶段的肝脏微环境变化和病理机制 | II型糖尿病小鼠模型(两种)的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | II型糖尿病、代谢相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 两种T2DM小鼠模型肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |