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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2026-04-14 |
Malignant triton tumor with thoracic region as the initial presentation: a case report
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1764543
PMID:41971419
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病例报告 | 本研究报告了一例罕见的以胸痛为首发症状的恶性蝾螈瘤病例,并回顾了相关文献以总结其临床特征和治疗策略 | 首次在恶性蝾螈瘤中应用单细胞RNA测序技术,结合CopyKAT算法区分恶性与非恶性细胞,揭示了由不同功能细胞群组成的异质性肿瘤微环境 | 本文为单病例报告,样本量有限,研究结果的外推性可能受限 | 报告一例罕见恶性蝾螈瘤病例,总结其临床特征、治疗策略,并探索其分子特征 | 一名患有1型神经纤维瘤病的23岁女性恶性蝾螈瘤患者 | 数字病理学 | 恶性蝾螈瘤 | 单细胞RNA测序,CopyKAT算法 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织病理学数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 662 | 2026-04-14 |
Cardiac fibroblast heterogeneity in cardiac fibrosis implication for cell-type-specific treatment
2026, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2026.1740147
PMID:41971660
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综述 | 本文综述了心脏成纤维细胞在心脏纤维化中的异质性及其对细胞类型特异性治疗的启示 | 利用谱系追踪和单细胞/空间转录组学揭示了心脏成纤维细胞的异质性及其在疾病中的特定激活轨迹,强调了免疫-成纤维细胞相互作用作为成纤维细胞命运的关键决定因素 | NA | 探讨心脏成纤维细胞异质性在心脏纤维化中的作用,以推动针对致病亚型的精准抗纤维化策略 | 心脏成纤维细胞及其在健康和疾病状态下的亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 谱系追踪,单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 663 | 2026-04-14 |
Ovarian tissue quality assessment and fertility preservation strategies enabled by multi-omics and artificial intelligence: current applications and clinical perspectives
2026, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2026.1789252
PMID:41971663
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综述 | 本文综述了多组学与人工智能在卵巢组织质量评估和生育力保存策略中的新兴应用及其临床转化潜力 | 整合多组学(如转录组学、单细胞测序、空间转录组学)与人工智能(AI)技术,实现卵巢组织的高分辨率表征和自动化评估,为个体化生育力保存决策提供智能框架 | NA | 探讨多组学与人工智能技术在卵巢组织质量评估和生育力保存策略中的应用前景 | 卵巢组织,特别是涉及癌症幸存者、青春期前女性和早发性卵巢功能不全高风险个体的生育力保存 | 数字病理学 | 卵巢相关疾病(包括癌症和早发性卵巢功能不全) | 转录组学,单细胞测序,蛋白质组学,空间转录组学 | NA | 多组学数据(转录组、蛋白质组等),组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 664 | 2026-04-14 |
Immune Cell-Mediated Retinoblastoma Development: Genetic and Molecular Mechanisms
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6303747
PMID:41971766
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研究论文 | 本研究通过双样本孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序数据,探讨了免疫细胞与RB1基因在视网膜母细胞瘤发展中的关联及潜在分子机制 | 首次结合孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序,系统性地揭示了28种免疫细胞与RB1基因的关联,并识别出EZH2、UBLCP1和HKDC1等关键基因在RB组织细胞中的差异表达 | 研究基于已发表的GWAS汇总统计数据和单细胞RNA测序数据,可能存在样本异质性或技术偏差,且分子机制的具体作用路径仍需进一步实验验证 | 探究免疫细胞如何通过影响RB1基因表达来介导视网膜母细胞瘤的发生发展 | 视网膜母细胞瘤(RB)相关的免疫细胞、RB1基因及RB组织细胞 | 生物信息学 | 视网膜母细胞瘤 | 双样本孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组关联研究汇总统计数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 665 | 2026-04-14 |
Integrative Learning of Disentangled Representations from Single-Cell RNA-Sequencing Datasets
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0015
PMID:41971949
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研究论文 | 提出了一种名为spVIPES的概率框架,用于从未配对、特征不匹配的单细胞RNA测序数据集中分解出共享和私有成分 | 开发了spVIPES框架,能够处理特征不匹配的未配对单细胞数据集,通过概率潜在变量模型分离数据集特异性与保守的细胞特征,并提供了有监督和无监督两种变体 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够整合未配对、特征不匹配单细胞RNA测序数据集的方法,以分离共享和私有的细胞特征 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分推断,专家乘积模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 666 | 2026-04-14 |
Integrative multi-omics dissection identifies ACO2, KLF5, and IMP4 as central regulators of the mitochondrial-immune axis in ulcerative colitis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1746810
PMID:41972123
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,揭示了ACO2、KLF5和IMP4作为溃疡性结肠炎中线粒体-免疫轴调控的关键基因 | 首次系统性地结合GWAS、eQTL、批量转录组和单细胞RNA测序数据,识别出连接线粒体代谢与免疫调控的枢纽基因,为UC的免疫代谢机制提供了新见解 | AGPS基因在UC组织中未显示一致的转录变化,其作用机制仍需进一步验证;研究主要基于现有数据集,缺乏实验功能验证 | 旨在识别溃疡性结肠炎中调控代谢-免疫轴的关键基因及其细胞机制 | 人类UC结肠组织样本、DSS诱导的小鼠结肠炎模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | GWAS、eQTL、批量RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据 | GWAS数据n=394,626;批量转录组数据n=349(215例病例和134例对照);单细胞RNA-seq数据n=30(18例病例和12例对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 667 | 2026-04-14 |
The construction of CD8+ T cell-associated molecular subtypes in esophageal squamous cell carcinoma reveals tumor heterogeneity, tumor microenvironment, and immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1775837
PMID:41972154
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研究论文 | 本研究通过CD8+ T细胞分化过程中的基因表达谱构建了食管鳞状细胞癌的新型分子亚型,并分析了这些亚型在肿瘤微环境、免疫治疗及预后中的作用 | 首次基于CD8+ T细胞分化基因构建ESCC分子亚型,结合单细胞测序与批量RNA分析,并通过孟德尔随机化与体外实验验证关键基因RHOB的功能 | 研究主要依赖公共数据集进行验证,样本来源可能有限,且体外实验结果需进一步体内验证 | 构建与CD8+ T细胞相关的分子亚型,以揭示ESCC的肿瘤异质性、微环境特征及免疫治疗反应 | 食管鳞状细胞癌患者样本及细胞系 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,孟德尔随机化分析,体外细胞实验(CCK-8、划痕实验、Transwell) | 非负矩阵分解,Seurat,Harmony,Monocle2 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 使用GSE53625队列进行验证,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 668 | 2026-04-14 |
Macrophage-associated prognostic modeling uncovers immunotherapy response mechanisms and defines HAGHL as a novel oncogenic driver in breast cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1776875
PMID:41972161
|
研究论文 | 本研究基于巨噬细胞相关基因构建了一个预后模型,用于预测乳腺癌患者的生存和免疫治疗反应,并鉴定HAGHL为新的致癌驱动因子 | 首次整合多组学数据开发基于巨噬细胞相关基因的预后模型,并发现HAGHL作为乳腺癌的潜在致癌基因 | 研究主要依赖公共数据库数据,实验验证部分有限,模型需进一步外部验证 | 探究巨噬细胞相关基因在乳腺癌中的表达模式、预后价值及与免疫微环境的关系 | 乳腺癌患者样本及细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 预后模型 | RNA测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 669 | 2026-04-14 |
Tumor lactate metabolism shapes immune suppression and therapeutic resistance revealed by integrative multi-omics and digital pathology
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1797798
PMID:41972178
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和数字病理学,开发了一种深度学习框架,能够直接从常规H&E全切片图像推断肿瘤乳酸代谢状态 | 首次开发了基于常规H&E病理切片的深度学习模型来推断肿瘤乳酸代谢状态,为临床提供了一种可扩展且成本低的代谢生物标志物评估方法 | 研究中使用的乳酸相关基因特征(59个基因)可能无法完全捕获乳酸代谢的复杂性,且模型性能在不同癌症类型间存在差异 | 开发一种临床可及且低成本的方法来评估肿瘤内乳酸活性,并研究其与肿瘤免疫微环境和治疗抵抗的关系 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,空间分析,计算分析 | 深度学习框架 | 图像,基因表达数据,蛋白质表达数据 | TCGA、GEO和单细胞RNA-seq数据集中的多个队列,以及独立的SAZHU-HNSCC真实世界队列 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 670 | 2026-04-14 |
Molecular insights into CRIP1 as an immunometabolic regulator revealed by CRIP1 knockout and single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1762474
PMID:41972184
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研究论文 | 本研究通过CRIP1基因敲除小鼠模型和单细胞转录组学分析,首次系统揭示了CRIP1在免疫调节和代谢中的基本功能 | 首次全面解析CRIP1在非恶性条件下的基本生物学功能,整合了代谢调控和免疫调节的双重视角,并利用单细胞转录组学在人类样本中验证其与炎症基因表达的关系 | 研究主要基于小鼠模型和体外分析,人类样本验证仅限于单细胞转录组数据分析,缺乏直接的体内功能验证 | 阐明CRIP1在免疫代谢调控中的基本生物学功能和作用机制 | CRIP1基因敲除小鼠、野生型小鼠、健康人和牙周炎患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周炎、肝癌、急性髓系白血病、多发性骨髓瘤、黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | CRIP1敲除和野生型小鼠的肝组织、健康人和牙周炎患者的外周血单个核细胞单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 671 | 2026-04-14 |
Correction: Mast cell marker gene signature: prognosis and immunotherapy response prediction in lung adenocarcinoma through integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1827500
PMID:41972190
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correction | 本文是对一篇关于肥大细胞标记基因特征在肺腺癌预后和免疫治疗反应预测中作用的研究文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | lung cancer | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 672 | 2026-04-14 |
Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted
2025-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08466-x
PMID:39843748
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研究论文 | 本研究探讨了小肠中组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的空间和时间印记机制 | 利用空间转录组学、小鼠模型和新型光学编码基因扰动策略,揭示了肠道结构区域化信号支持两种不同T细胞状态,并开发了计算方法来可视化细胞类型和基因表达的空间时间分布 | NA | 研究组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的起源和机制 | 人类样本和小鼠模型中的病原体特异性CD8 T细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 单转录本分辨率分析 | NA | 转录组数据, 空间位置数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 673 | 2026-04-14 |
Cell motility influences microfluidics capturing in scRNA-seq
2025, Open research Europe
DOI:10.12688/openreseurope.19781.2
PMID:41971304
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研究论文 | 本研究探讨了微流体捕获方法在单细胞RNA测序中对运动性细胞(如鞭毛寄生虫)的适用性,并提出了一种快速冷却策略以提高封装效率 | 首次系统研究了微流体系统对运动性细胞的捕获偏差,并开发了一种通过快速冷却至0°C来降低细胞运动性、避免转录组变化的优化方法 | 研究仅针对鞭毛寄生虫在10x Genomics平台上的应用,未涵盖其他运动性细胞类型或微流体系统,且样本规模可能有限 | 优化微流体单细胞RNA测序协议,以更准确地捕获和分析运动性细胞,避免因细胞运动性导致的亚群丢失偏差 | 鞭毛寄生虫(具体物种未在摘要中明确说明) | 单细胞测序技术 | 寄生虫感染(未指定具体疾病) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium(推断,基于平台描述) | 10x Genomics微流体单细胞RNA测序平台(具体配置未详细说明) |
| 674 | 2026-04-14 |
The periosteum provides a stromal defence against cancer invasion into the bone
2024-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07822-1
PMID:39169177
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研究论文 | 本研究揭示了骨膜通过形成基质屏障来抵御头颈部鳞状细胞癌骨侵袭的机制 | 首次证明骨膜反应是抵御癌症骨侵袭的天然防御机制,并发现HIF1α-TIMP1信号轴在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证相对有限 | 探究骨膜在癌症骨侵袭过程中的生理功能和分子机制 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的骨侵袭过程 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,组织学分析,基因编辑小鼠模型 | 基因可调控小鼠模型 | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 人类HNSCC病变样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 675 | 2026-04-14 |
Diversity of group 1 innate lymphoid cells in human tissues
2024-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01885-y
PMID:38956380
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究人类组织中第1组先天淋巴样细胞(ILC1s)的多样性,揭示了不同组织中ILC1亚型的高度可变性 | 首次通过单细胞RNA测序和流式细胞术系统性地描绘了人类组织中ILC1s的多样性,并识别出肠道上皮中富含成熟的EOMES ILC1s以及其他组织中表达ZNF683的NK细胞,这些发现为理解ILC1-NK谱系在疾病中的表型和功能变化奠定了基础 | NA | 研究人类组织中第1组先天淋巴样细胞(ILC1s)的多样性和分布 | 人类组织中的第1组先天淋巴样细胞(ILC1s)和自然杀伤(NK)细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 676 | 2026-04-14 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Immunomodulatory Effects of Stem Cell Factor and Granulocyte Colony-Stimulating Factor Treatment in the Brains of Aged APP/PS1 Mice
2024-07-10, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070827
PMID:39062541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了干细胞因子和粒细胞集落刺激因子联合治疗在老年APP/PS1小鼠大脑中的免疫调节作用 | 首次在单细胞水平上揭示了SCF+G-CSF治疗如何调节小胶质细胞和外周髓系细胞以减轻阿尔茨海默病病理 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;样本量较小(仅使用APP/PS1小鼠) | 探究SCF+G-CSF治疗在老年阿尔茨海默病大脑中的修复机制 | 28月龄APP/PS1小鼠大脑中的CD11b细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 28月龄APP/PS1小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 677 | 2026-04-14 |
West Nile Virus-Induced Expression of Senescent Gene Lgals3bp Regulates Microglial Phenotype within Cerebral Cortex
2024-07-08, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070808
PMID:39062523
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研究论文 | 本研究探讨了西尼罗河病毒感染如何通过诱导衰老相关基因Lgals3bp的表达来调控大脑皮层中小胶质细胞的表型 | 首次揭示了LGALS3BP蛋白在病毒感染诱导的小胶质细胞衰老和神经炎症调控中的关键作用,并证明其缺失可减轻神经炎症而不影响病毒控制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中得到验证;LGALS3BP的具体作用机制仍需进一步阐明 | 探究西尼罗河病毒感染与大脑小胶质细胞衰老之间的关系,以及LGALS3BP在调控神经炎症和小胶质细胞表型中的作用 | 成年和老年小鼠的大脑皮层小胶质细胞 | 神经科学 | 病毒感染相关神经系统疾病 | 空间转录组学, RNA测序, 流式细胞术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 成年和老年小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 678 | 2026-04-14 |
DeepIMAGER: Deeply Analyzing Gene Regulatory Networks from scRNA-seq Data
2024-06-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070766
PMID:39062480
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepIMAGER的先进计算工具,通过深度学习和数据整合来推断细胞特异性基因调控网络 | DeepIMAGER采用监督学习方法,将基因对的共表达模式转化为类图像表示,并整合转录因子结合信息进行模型训练,显著提高了基因调控网络推断的准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种能够从单细胞RNA测序数据中准确推断细胞特异性基因调控网络的工具 | 基因调控网络,涉及多种细胞类型,包括多发性骨髓瘤树突状细胞 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq, ChIP-seq | 深度学习 | 图像表示(由基因对共表达模式转化而来) | 六种细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 679 | 2026-04-14 |
Exploring the Molecular Mechanism of Comorbidity of Type 2 Diabetes Mellitus and Colorectal Cancer: Insights from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-06-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060693
PMID:38927096
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研究论文 | 本研究首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制,并识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3作为潜在的免疫生物标志物和药物靶点 | 首次整合bulk组学和单细胞测序验证来系统揭示T2DM与CRC共病的分子机制,识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3,并发现ENTPD3阳性的癌症相关成纤维细胞亚群具有独特的肿瘤抑制特征和免疫治疗预测价值 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏体内外实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制和免疫学基础 | 2型糖尿病和结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Connectivity Map, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 680 | 2026-04-14 |
Single-Nucleus RNA-Seq Reveals Spermatogonial Stem Cell Developmental Pattern in Shaziling Pigs
2024-05-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060607
PMID:38927011
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了沙子岭猪睾丸中精原干细胞(SSCs)的发育模式 | 首次在沙子岭猪中应用单细胞RNA测序技术构建睾丸组织细胞发育图谱,并识别了调控SSCs自我更新和维持的潜在标记基因及信号通路 | 研究样本仅来自沙子岭猪,可能限制了结果的普适性;且未进行功能验证实验 | 探究沙子岭猪睾丸发育,特别是精原干细胞的发育模式 | 沙子岭猪睾丸组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 来自9只沙子岭猪睾丸的82,027个单细胞,覆盖三个关键出生后发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |