单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27271 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-04-18 |
Pdgfrβ marks distinct mesenchymal and pericyte populations within periosteum with overlapping cellular features
2025-Apr-16, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf020
PMID:40237625
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型，探讨了长骨骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性和功能特性 | 揭示了Pdgfrβ在骨膜中标记的不同间充质细胞和周细胞亚群及其重叠的细胞特征 | 研究仅在小鼠模型中进行，未验证人类骨膜中的Pdgfrβ阳性细胞 | 探究骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性和功能特性 | 小鼠长骨骨膜中的Pdgfrβ阳性细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、转基因小鼠模型 | Pdgfrβ-CreERT2-mT/mG报告小鼠 | 基因表达数据、组织学数据 | 转基因小鼠的长骨骨膜样本 |
| 662 | 2025-04-18 |
Practical microenvironment classification in diffuse large B cell lymphoma using digital pathology
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102030
PMID:40112808
|
研究论文 | 该研究利用数字病理学和免疫组织化学标记对弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的微环境进行分类，并与转录组分类进行对比 | 开发了一种基于免疫组织化学标记和数字病理学的DLBCL微环境分类方法，与转录组分类具有80%以上的一致性 | 将这种分类方法整合到临床实践中仍具挑战性 | 建立DLBCL的微环境分类系统，以指导精准医疗 | 弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)及其微环境 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 免疫组织化学染色、数字病理学、单细胞测序 | NA | 图像数据、转录组数据 | NA |
| 663 | 2025-04-18 |
Human long noncoding RNA VILMIR is induced by major respiratory viral infections and modulates the host interferon response
2025-Apr-15, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00141-25
PMID:40130878
|
研究论文 | 研究发现一种新型长链非编码RNA VILMIR在主要呼吸道病毒感染中被诱导表达，并调节宿主干扰素反应 | 首次鉴定出VILMIR是一种新型干扰素刺激基因(ISG)，在多种呼吸道病毒感染中上调表达并调控宿主干扰素反应 | 需要进一步机制研究以明确VILMIR的具体作用机制 | 探索长链非编码RNA在呼吸道病毒感染中的作用机制 | 人类呼吸道病毒感染的宿主反应 | 分子生物学 | 呼吸道病毒感染 | RNA-seq分析 | NA | 转录组数据 | 多种人类上皮细胞系(A549、SUP-T1、THP-1)和COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 664 | 2025-04-18 |
A spatially resolved transcriptome landscape during thyroid cancer progression
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102043
PMID:40157360
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，绘制了甲状腺癌进展过程中肿瘤微环境（TME）的空间动态变化图谱 | 揭示了甲状腺癌进展过程中分子和细胞的异质性，鉴定了三个不同的甲状腺细胞元簇，并建立了高置信度的细胞间相互作用 | NA | 探索甲状腺癌进展过程中肿瘤微环境的空间动态变化及其对诊断和治疗的意义 | 甲状腺癌的肿瘤微环境，包括旁甲状腺组织（PT）、乳头状甲状腺癌（PTC）、局部晚期PTC（LPTC）和未分化甲状腺癌（ATC） | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涵盖PT、PTC、LPTC和ATC四种组织类型 |
| 665 | 2025-04-18 |
ATM-dependent DNA damage response constrains cell growth and drives clonal hematopoiesis in telomere biology disorders
2025-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI181659
PMID:40179146
|
研究论文 | 该研究探讨了端粒生物学疾病（TBDs）中ATM依赖性DNA损伤反应对细胞生长的影响及其在克隆造血中的作用 | 揭示了端粒功能障碍通过ATM依赖性DNA损伤反应途径导致细胞衰老和凋亡的机制，并提出了ATM抑制作为潜在治疗干预的新策略 | 研究样本量相对有限（166例患者），且ATM抑制治疗的长期安全性和有效性尚未在临床中验证 | 理解TBD患者造血系统异常（如骨髓衰竭和髓系肿瘤风险增加）的分子机制 | 166例儿童和成人TBD患者的造血细胞 | 分子生物学 | 端粒生物学疾病 | 单细胞测序、ATM激活检测、端粒功能障碍诱导灶分析、细胞生长实验 | NA | 基因组数据、细胞功能数据 | 166例TBD患者（儿童和成人）的造血细胞样本 |
| 666 | 2025-04-18 |
Altered baseline immunological state and impaired immune response to SARS-CoV-2 mRNA vaccination in lung transplant recipients
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102050
PMID:40187358
|
研究论文 | 本研究探讨了肺移植受者在基线状态下及接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后的免疫状态，并与健康对照组进行比较 | 采用多组学方法揭示了肺移植受者基线免疫状态与疫苗接种后免疫反应的关联 | 研究样本仅限于肺移植受者，可能不适用于其他器官移植患者 | 评估肺移植受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的免疫反应 | 肺移植受者和健康对照组 | 免疫学 | COVID-19 | 多组学方法、单细胞RNA测序 | NA | 免疫学数据、基因表达数据 | 肺移植受者与健康对照组（具体人数未明确说明） |
| 667 | 2025-04-18 |
SMAD4 and KRAS Status Shapes Cancer Cell-Stromal Cross-Talk and Therapeutic Response in Pancreatic Cancer
2025-Apr-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2330
PMID:39841099
|
研究论文 | 研究SMAD4和KRAS状态如何影响胰腺癌细胞与基质的相互作用及治疗反应 | 揭示了SMAD4缺失在不同KRAS突变背景下对肿瘤微环境和治疗敏感性的不同影响 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类患者中的适用性需要进一步验证 | 探究胰腺癌中恶性细胞基因型对肿瘤微环境和治疗反应的影响 | Trp53突变小鼠模型驱动的KrasG12D或KrasG12V胰腺癌 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，但使用了多种基因型的小鼠模型 |
| 668 | 2025-04-18 |
Lineage Tracing and Single-Cell RNA Sequencing Reveal a Common Transcriptional State in Breast Cancer Tumor-Initiating Cells Characterized by IFN/STAT1 Activity
2025-Apr-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-4022
PMID:40230213
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了乳腺癌肿瘤起始细胞中与IFN/STAT1活性相关的共同转录状态 | 开发了STAT响应性谱系追踪系统，结合单细胞RNA测序技术，首次在乳腺癌肿瘤起始细胞中发现与IFN/STAT1信号通路相关的共同转录状态 | STAT信号通路在某些基底样三阴性乳腺癌异种移植模型中未能检测到肿瘤起始细胞，表明STAT信号通路具有肿瘤起始细胞相关和独立的功能 | 研究乳腺癌肿瘤起始细胞的分子表型及其治疗靶点 | 乳腺癌肿瘤起始细胞（TIC） | 癌症研究 | 乳腺癌 | 谱系追踪、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 基底样三阴性乳腺癌异种移植模型和临床样本 |
| 669 | 2025-04-18 |
Virus-associated inflammation imprints an inflammatory profile on monocyte-derived macrophages in the human liver
2025-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175241
PMID:40231469
|
research paper | 该研究探讨了慢性乙型肝炎患者的肝脏中，病毒相关炎症如何通过单核细胞来源的巨噬细胞（iMacs）塑造炎症表型，并影响肝脏疾病的进展 | 首次在人类肝脏中揭示了炎症环境对单核细胞来源巨噬细胞的长期表型印记，并发现这种印记在炎症消退后仍持续存在 | 研究样本仅限于慢性乙型肝炎患者，未涵盖其他类型的肝脏疾病 | 研究病毒相关炎症如何重塑肝脏巨噬细胞群体及其对疾病进展的影响 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏组织和血液样本 | 免疫学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 慢性乙型肝炎患者（具体数量未提及）的纵向肝脏和血液样本 |
| 670 | 2025-04-18 |
How is single-cell RNA sequencing contributing to the advancement of cancer therapeutics?
2025-Apr-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i4.103480
PMID:40235873
|
research paper | 该研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术研究了胃癌患者肿瘤微环境中细胞群体的分布和动态变化 | 通过scRNA-seq数据在临床环境中的应用讨论，为开发个性化胃癌治疗策略提供了新思路 | 研究未提及样本量大小或具体实验设计的局限性 | 探索scRNA-seq在癌症治疗领域的应用潜力 | 胃癌患者的肿瘤微环境 | digital pathology | gastric cancer | scRNA-seq | NA | RNA sequencing data | NA |
| 671 | 2025-04-18 |
Therapeutic and prognostic values of ferroptosis signature in glioblastoma
2025-Apr-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114597
PMID:40239336
|
研究论文 | 探讨铁死亡特征在胶质母细胞瘤中的治疗和预后价值 | 利用单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境的分子特征，引入铁死亡相关生物标志物通路和耐药机制，以改善患者治疗效果 | 铁死亡与胶质母细胞瘤免疫景观的关系复杂，可能产生积极或消极影响 | 研究铁死亡在胶质母细胞瘤中的作用及其潜在治疗策略 | 胶质母细胞瘤细胞及其肿瘤微环境 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 672 | 2025-04-18 |
Parallel comparison of T cell and B cell subpopulations of adenoid hypertrophy and tonsil hypertrophy of children
2025-Apr-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58094-w
PMID:40229254
|
研究论文 | 比较儿童腺样体肥大和扁桃体肥大的T细胞和B细胞亚群的差异 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了腺样体肥大和扁桃体肥大在免疫微环境中的差异 | 样本量相对较小（12对配对样本），且仅针对儿童患者 | 探究腺样体肥大和扁桃体肥大在免疫微环境中的差异 | 1209名1-15岁被诊断为腺样体肥大的儿科患者及其12对配对腺样体和扁桃体样本 | 免疫学 | 腺样体肥大和扁桃体肥大 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1209名儿科患者（流行病学数据）和12对配对样本（单细胞RNA测序） |
| 673 | 2025-04-18 |
Multi-omics analysis identifies diagnostic circulating biomarkers and potential therapeutic targets, revealing IQGAP1 as an oncogene in gastric cancer
2025-Apr-14, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00895-9
PMID:40229327
|
研究论文 | 本研究采用多组学整合方法，识别胃癌(GC)的循环生物标志物，并探讨其作为治疗靶点的潜力 | 通过多组学数据整合，识别出四个基因和四个蛋白质作为潜在的胃癌生物标志物，并揭示了IQGAP1在肿瘤生长中的关键作用 | NA | 识别胃癌的循环生物标志物并探索其治疗靶点潜力 | 胃癌患者的血浆和肿瘤组织样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因和蛋白质定量性状位点分析、孟德尔随机化 | NA | RNA测序数据、蛋白质数据 | 来自UK Biobank和FinnGen的数据 |
| 674 | 2025-04-18 |
A simplified preparation method for single-nucleus RNA-sequencing using long-term frozen brain tumor tissues
2025-Apr-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97053-9
PMID:40229354
|
research paper | 本文介绍了一种简化的单核RNA测序方法，适用于长期冷冻保存的脑肿瘤组织 | 优化了从长期冷冻的儿科胶质瘤组织中分离完整细胞核的方法，并改进了3'测序文库以包含更短的RNA片段 | 方法主要针对冷冻脑肿瘤组织，可能不适用于其他类型的组织或新鲜样本 | 提高对罕见肿瘤组织的研究能力，特别是冷冻保存的脑肿瘤样本 | 长期冷冻保存的儿科胶质瘤组织 | digital pathology | brain tumor | single-nucleus RNA-sequencing (snRNA-seq) | NA | RNA-seq data | 冷冻的原发性胶质瘤组织样本 |
| 675 | 2025-04-18 |
IL1RAP is an immunotherapeutic target for normal karyotype triple-mutated acute myeloid leukemia
2025-Apr-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00769-z
PMID:40229904
|
研究论文 | 该研究通过多组学分析发现IL1RAP是正常核型三重突变急性髓系白血病（NKt-AML）的免疫治疗靶点 | 首次将IL1RAP鉴定为NKt-AML的潜在免疫治疗靶点，并证明其与患者预后不良和治疗反应差相关 | 样本量相对较小（12例NKt-AML），需要进一步验证 | 寻找NKt-AML的新型免疫治疗靶点 | 正常核型三重突变急性髓系白血病（NKt-AML）患者样本 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 多组学分析、表面蛋白质组富集、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据 | 100例原发性AML样本（含12例NKt-AML）进行表面蛋白质组分析，691例AML样本进行转录组分析，23例AML样本进行单细胞RNA测序 |
| 676 | 2025-04-18 |
Extracellular vesicle-derived miRNA-mediated cell-cell communication inference for single-cell transcriptomic data with miRTalk
2025-Apr-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03566-x
PMID:40229908
|
研究论文 | 介绍了一种名为miRTalk的新方法，用于推断由细胞外囊泡（EVs）衍生的miRNA介导的细胞间通讯（CCC） | miRTalk是一种首创的方法，用于推断由EV衍生的miRNA-靶标相互作用（MiTIs）介导的CCC，并在模拟和真实数据集上表现出优越性能 | NA | 通过单细胞RNA测序技术解析细胞间通讯（CCC）的机制 | 细胞外囊泡（EVs）衍生的miRNA及其靶标相互作用（MiTIs） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | miRTalk | 单细胞转录组数据 | NA |
| 677 | 2025-04-18 |
Protocol for characterizing craniopharyngioma subtypes and their microenvironments using single-cell RNA sequencing and immunohistochemistry
2025-Apr-14, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103760
PMID:40238632
|
研究论文 | 本文提出了一种全面的单细胞RNA测序和免疫组化分析颅咽管瘤亚型及其微环境的方案 | 使用单细胞RNA测序和免疫组化技术详细分析颅咽管瘤亚型及其微环境 | NA | 分析颅咽管瘤亚型及其微环境 | 颅咽管瘤组织 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组化 | NA | RNA测序数据, 免疫组化图像 | NA |
| 678 | 2025-04-18 |
Comprehensive bioinformatics and immunohistochemical analyses identify phosphoinositide metabolism and PNPLA7 as potential biomarkers in urological cancers
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97118-9
PMID:40221501
|
研究论文 | 通过综合生物信息学和免疫组织化学分析，识别磷酸肌醇代谢和PNPLA7作为泌尿系统癌症的潜在生物标志物 | 首次探索磷酸肌醇代谢相关成分在泌尿系统癌症中的作用，并鉴定PNPLA7基因作为潜在生物标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 研究磷酸肌醇代谢在泌尿系统癌症中的贡献及其作为预后生物标志物的潜力 | 透明细胞肾癌、膀胱癌和前列腺腺癌 | 生物信息学 | 泌尿系统癌症 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学评估 | NA | 基因表达数据、临床样本 | 公共数据库中的多组数据及临床样本 |
| 679 | 2025-04-18 |
Exploring the tumor microenvironment of breast cancer to develop a prognostic model and predict immunotherapy responses
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97784-9
PMID:40221624
|
研究论文 | 通过探索乳腺癌肿瘤微环境，开发预后模型并预测免疫治疗反应 | 利用转录组和单细胞测序数据，结合多种分析方法，构建了一个能够准确区分高低风险患者并预测免疫治疗反应的预后模型 | 研究基于公共数据库数据，可能受限于数据的质量和样本量 | 开发乳腺癌预后模型并预测免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序、WGCNA、Cox回归、Lasso回归 | 预后模型 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 公共数据库中的乳腺癌患者数据 |
| 680 | 2025-04-18 |
Pan-cancer analysis reveals BAF complexes as immune-related biomarkers and validation in triple-negative breast cancer
2025-Apr-05, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123607
PMID:40194763
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析揭示了BAF复合物作为免疫相关生物标志物的潜力，并在三阴性乳腺癌中进行了验证 | 首次强调了新型BAFs模型对患者预后的重要性，并证实了BAFs作为免疫相关生物标志物在泛癌进展中的重要作用，特别是ACTL6A在三阴性乳腺癌中的双重角色 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制 | 解码特定BAFs在癌症病理学、免疫学和靶向治疗中的潜力 | BAF复合物（BAFs），特别是ACTL6A | 癌症基因组学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序 | BAFs模型和列线图 | 基因表达数据 | 来自The Cancer Genome Atlas、Gene Expression Omnibus和IMvigor210数据库的数据 |