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当前共找到 39702 篇文献,本页显示第 661 - 680 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
661 2026-05-20
Integrated single-cell transcriptomic atlas of human gastric and colorectal tissues across diverse phenotypes
2026-Mar-26, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 构建了涵盖多种表型的人类胃和结直肠组织的综合单细胞转录组图谱 首次整合大规模单细胞转录组数据,涵盖574,532个胃部细胞和479,629个结直肠细胞,跨越70种细胞类型和多种临床表型,并通过多种计算工具严格验证数据质量和细胞类型注释 未明确提及局限性 构建人类胃和结直肠组织的综合单细胞转录组图谱,以促进对胃癌和结直肠癌的元分析 来自229个人类胃组织和220个人类结直肠组织的细胞 数字病理学 胃癌, 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 229个胃组织样本(574,532个细胞)和220个结直肠组织样本(479,629个细胞) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
662 2026-05-20
Single cell transcriptomic atlas reveals distinct immune signatures following transfusion of COVID-19 convalescent plasma in severe COVID-19
2026-03, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 通过单细胞转录组图谱揭示新冠肺炎康复者血浆输注对重症COVID-19患者的免疫特征影响 首次在单细胞水平上分析重症COVID-19患者接受CCP输注前后的免疫细胞变化,发现S100A8在CD4记忆T细胞和B细胞中上调,以及CCP输注选择性地破坏NK细胞与TCR阴性T细胞和BCR阳性B细胞的通讯 样本量较小且仅观测了输注后24小时的时间点,可能未能完全反映长期免疫反应变化 阐明重症COVID-19患者接受康复者血浆输注后的免疫应答和促炎因子特征 重症COVID-19患者的PBMC样本 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 单细胞表达数据 重症COVID-19患者在CCP输注前后的PBMC样本 NA 单细胞RNA-seq NA 对PBMCs进行单细胞RNA测序
663 2026-05-20
Molecular profiling of sacral chordomas through methylation, spatial transcriptomics and multiplexed immunofluorescence
2026-Mar, ESMO rare cancers
研究论文 通过甲基化、空间转录组学和多重免疫荧光分析骶骨脊索瘤的分子特征 首次结合DNA甲基化谱、空间转录组学和多重免疫荧光对骶骨脊索瘤进行综合分子分析,发现两个不同的表观遗传聚类,并揭示肿瘤与基质区域间的差异基因表达及免疫检查点标志物的表达 样本量较小(29例患者),需要功能验证进一步证实研究结果 揭示骶骨脊索瘤的分子异质性及免疫微环境特征 29例骶骨脊索瘤患者的存档组织样本 数字病理学, 计算机视觉 脊索瘤(骶骨) DNA甲基化测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 无监督聚类, 多元线性回归 图像, 文本 29例骶骨脊索瘤患者,120个感兴趣区域 NA 空间转录组学, 多重免疫荧光 Digital Spatial Profiler (DSP) Digital Spatial Profiler (DSP) 用于基因表达分析,多重免疫荧光用于细胞群检测
664 2026-05-20
Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial
2026-01-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 一项评估新辅助改良FOLFIRINOX联合nivolumab治疗交界可切除胰腺导管腺癌的1期试验 首次在交界可切除胰腺导管腺癌中评价新辅助化疗联合免疫检查点抑制剂的安全性和病理反应率,并通过空间转录组学揭示治疗后的免疫微环境变化 单臂、样本量较小(28例),缺乏随机对照组,且分析为事后分析 评估新辅助改良FOLFIRINOX联合nivolumab在交界可切除胰腺导管腺癌患者中的安全性和疗效 交界可切除胰腺导管腺癌患者 肿瘤学 胰腺导管腺癌 空间转录组学、基因表达分析、免疫组化 NA 基因表达数据、病理学图像、空间转录组数据 28例患者 NA 空间转录组学 NA NA
665 2026-05-20
Tumor-Infiltrating Mast Cells Enhance Neoadjuvant Therapy Efficacy in ESCC via Modulation of the Desmoplastic Microenvironment
2026, OncoTargets and therapy IF:2.7Q3
研究论文 该研究通过整合单细胞RNA测序、免疫荧光分析和体外实验,揭示了肿瘤浸润性肥大细胞通过调节促结缔组织增生微环境增强食管鳞状细胞癌新辅助治疗疗效的作用机制 首次结合单细胞RNA测序与免疫荧光分析,发现肥大细胞通过非脱颗粒的LPS激活途径(上调CCL19等趋化因子)调节肿瘤基质,与新辅助治疗疗效及生存改善相关 单细胞测序仅来自1例患者配对样本,验证队列为回顾性且样本量较小(68例),机制研究仅停留在体外实验 探究肿瘤浸润性肥大细胞在局部晚期食管鳞状细胞癌新辅助治疗应答及预后中的作用 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤组织标本及肥大细胞 机器学习, 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序, 免疫荧光分析, 生物信息学分析 NA 基因表达数据, 图像数据 1例食管鳞状细胞癌患者新辅助治疗前后配对样本;68例初治食管鳞状细胞癌手术标本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
666 2026-05-20
Unraveling the indolence of papillary thyroid carcinoma: an exploratory study on B-cell subsets based on genetic predisposition and tumor immunity
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过孟德尔随机化、流式细胞术和单细胞转录组学,探索B细胞亚群在甲状腺乳头状癌惰性行为中的因果作用 首次整合孟德尔随机化和多组学数据,从遗传和免疫角度揭示外周和肿瘤浸润B细胞亚群与甲状腺乳头状癌惰性行为的因果关系 样本量较小且为探索性研究,结论需在大规模独立队列中验证 评估外周B细胞亚群作为区分惰性与进展性甲状腺乳头状癌的非侵入性生物标志物的潜力 甲状腺乳头状癌患者的外周血B细胞和肿瘤浸润B细胞 自然语言处理 甲状腺乳头状癌 NA NA 基因表达数据、流式细胞术数据、单细胞RNA测序数据 甲状腺乳头状癌患者外周血样本(惰性组与进展组比较)及TCGA-THCA队列样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
667 2026-05-20
Dual role of icaritin in attenuating allograft rejection and exerting antitumor effects in mice
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 探讨淫羊藿素在减轻小鼠同种异体移植排斥反应和发挥抗肿瘤作用中的双重角色 首次揭示淫羊藿素通过靶向CEBPB/PIM1轴抑制CD4+ T细胞活化和Th1分化,从而在减轻移植排斥的同时发挥抗肿瘤作用 研究仅在动物模型中进行,未涉及临床患者验证;具体分子机制需进一步深入探索 评估淫羊藿素是否具有免疫抑制和抗肿瘤的双重功效,并探索其潜在机制 BALB/c小鼠作为供体,C57BL/6J小鼠作为受体,进行异位心脏移植模型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、流式细胞术、分子对接、分子动力学模拟、细胞热移位分析 NA 图像、文本 涉及多组小鼠,具体样本量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
668 2026-05-20
Multi-omics and experimental validation identify USP54 as a prognostic deubiquitinase promoting pancreatic ductal adenocarcinoma progression within the immune microenvironment
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多组学整合分析结合实验验证,发现去泛素酶USP54在胰腺导管腺癌的免疫微环境中促进肿瘤进展,并可作为预后标志物和潜在治疗靶点 首次通过多组学策略(包括单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习)系统揭示去泛素酶USP54在PDAC免疫微环境中的促癌作用及其转录调控机制 研究基于公共数据集和有限细胞系验证,未在更大临床队列中验证USP54的预后价值,且KLF5作为USP54转录激活因子的直接证据需进一步实验确认 探究去泛素酶在胰腺导管腺癌免疫微环境中的整体活性及其驱动肿瘤进展的机制 胰腺导管腺癌肿瘤组织、BxPC-3和PANC-1细胞系、皮下移植瘤小鼠模型 机器学习, 数字病理学, 单细胞组学 胰腺导管腺癌 多组学分析, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 免疫组化 Coxnet, Fuzzy SVM, inferCNV, SCENIC, LIANA+, cell2location 转录组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 多种公共数据集(未明确具体样本数),BxPC-3和PANC-1细胞系,小鼠皮下移植瘤和尾静脉注射实验 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
669 2026-05-20
CX3CR1 identifies a potent effector CD8+ T cell subset associated with anti-PD-1 therapeutic efficacy in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多维度方法鉴定出CX3CR1+CD8+T细胞亚群与结直肠癌抗PD-1治疗效果相关 首次发现CX3CR1+CD8+T细胞亚群具有终末效应表型(Temra-like),具有强细胞毒性和低耗竭特征,并揭示ETS1、PRDM1和STAT1驱动的调控网络在PD-1抑制后增强代谢适应性和细胞招募 未明确说明局限性 解码肿瘤浸润CD8+T细胞的异质性,寻找驱动肿瘤控制的效应亚群以优化患者分层和治疗策略 结直肠癌肿瘤浸润的CX3CR1+CD8+T细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫组化(mIHC)、体内小鼠模型 SCENIC分析 基因表达数据、组织图像 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
670 2026-05-20
Prognostic biomarkers related to PANoptosis in esophageal cancer and their immune microenvironment: multi-omics analysis and therapeutic significance
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 通过多组学分析探讨食管癌中PANoptosis相关的预后生物标志物及其免疫微环境 首次系统性地识别食管癌中PANoptosis相关基因并构建预后模型,揭示CCT6A通过促进TAM-SPP1巨噬细胞分化抑制PANoptosis的新机制 研究主要基于公共数据库的二次分析,缺乏大规模前瞻性队列验证,且部分机制仅通过计算分析和分子对接初步探索 探索食管癌中PANoptosis的预后生物标志物及其潜在机制 食管鳞状细胞癌 机器学习 食管癌 RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, 机器学, 分子对接 Cox回归, 机器学习 转录组, 单细胞转录组 TCGA和GEO数据库中的食管癌样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
671 2026-05-20
Multi-omics integration identifies PGAP3 as a tumor-intrinsic factor associated with CD8+ T-cell exclusion in prostate cancer
2026, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 通过多组学整合分析,确定PGAP3为前列腺癌中与CD8+ T细胞排斥相关的肿瘤内在因子 首次将转录组范围的孟德尔随机化与多队列转录组数据整合,系统识别前列腺癌免疫逃逸的肿瘤内在关键基因PGAP3 缺乏免疫功能完整的体内模型验证,PGAP3的具体机制尚未在免疫活性系统中探索 识别前列腺癌中驱动免疫逃逸的肿瘤内在程序及其关键基因 前列腺癌患者样本数据及C4-2和DU145细胞系 人工智能在医疗中的应用 前列腺癌 转录组范围的孟德尔随机化、RNA测序、单细胞测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 多队列前列腺癌患者样本数据及两种细胞系 NA NA NA NA
672 2026-05-20
Heterogeneity of Microglia in Ischemic Stroke from the Perspective of Single-Cell RNA Sequencing: Subset Characteristics, Mechanisms and Therapeutic Potential
2026, Journal of central nervous system disease IF:2.6Q2
综述 从单细胞RNA测序角度系统探讨缺血性卒中中小胶质细胞的异质性,包括亚群特征、机制及治疗潜力 利用单细胞RNA测序技术揭示了传统M1/M2分类无法覆盖的小胶质细胞亚群功能多样性,并整合分析其在不同发育阶段和区域稳态下的异质性调控机制 NA 系统梳理单细胞RNA测序视角下小胶质细胞在缺血性卒中中的异质性及治疗策略 缺血性卒中模型动物及小胶质细胞亚群(如ISAM、SAM等) 单细胞转录组学 缺血性卒中 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
673 2026-05-20
Quercetin Ameliorates Skeletal Muscle Fibrosis After Injury by Interfering with Macrophage-Myofibroblast Transition
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 槲皮素通过干扰巨噬细胞-肌成纤维细胞转化改善损伤后骨骼肌纤维化 首次揭示槲皮素通过抑制C3a驱动的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化来减轻肌肉纤维化的机制 未提供具体局限性信息 研究槲皮素对急性骨骼肌损伤后纤维化的治疗潜力及其作用机制 小鼠骨骼肌组织及骨髓来源巨噬细胞 NA 肌肉纤维化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠肌肉挫伤模型及体外BMDM细胞实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
674 2026-05-20
Integrated analysis of programmed cell death-related genes identifies CORO1A as an apoptosis-associated gene in acute myeloid leukemia
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 整合程序性细胞死亡相关基因分析,鉴定CORO1A为急性髓系白血病中与凋亡相关的基因 首次整合单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据,系统刻画急性髓系白血病中程序性细胞死亡相关基因的景观,并基于多算法框架构建五基因预后模型,同时发现CORO1A作为促凋亡癌基因的潜在作用 研究依赖公开数据集,样本量有限;CORO1A的功能验证仅在细胞系中进行,缺乏体内实验支持 探索程序性细胞死亡相关基因在急性髓系白血病中的表达谱及其预后和免疫治疗意义 急性髓系白血病患者骨髓样本及正常骨髓样本 机器学习 急性髓系白血病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO, Cox比例风险模型, 多算法框架(10种学习器,117种组合) 基因表达数据 训练集来自TCGA,测试集来自GSE71014;单细胞数据来自GSE154109(包含AML骨髓样本);DepMap AML细胞系29个 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
675 2026-05-20
TNFAIP3 Reprograms T Cell Exhaustion and Restores Anti-Leukemia Immunity in Acute Myeloid Leukemia
2026, Cancer management and research IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现TNFAIP3在急性髓系白血病中调控T细胞耗竭并恢复抗白血病免疫 首次识别TNFAIP3为急性髓系白血病中T细胞耗竭的关键调控基因,并证明其过表达可逆转T细胞功能障碍,增强抗白血病免疫 研究样本量较小(24例患者和12例健康供者),且功能验证仅在体外进行,未开展体内动物模型实验 识别与急性髓系白血病中T细胞耗竭相关的免疫调控基因,并阐明其功能作用 急性髓系白血病患者的T细胞及健康供者的外周T细胞 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting、慢病毒介导的基因过表达 NA 单细胞RNA测序数据 24例急性髓系白血病患者和12例健康供者的外周血T细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
676 2026-05-20
Construction of an early diagnostic model for pulmonary hypertension based on aging-related signature genes and identification of potential therapeutic targets
2025-12-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 基于衰老相关特征基因构建肺动脉高压早期诊断模型并识别潜在治疗靶点 首次整合多数据集转录组分析,利用三种机器学习方法筛选衰老相关特征基因,构建高精度诊断列线图,并发现TUL-XXI039作为多靶点潜在治疗化合物 研究基于已有数据集和体外模型,缺乏大规模临床验证及体内实验证据 开发肺动脉高压早期诊断生物标志物并探索衰老靶向治疗策略 肺动脉高压患者转录组数据及体外缺氧诱导的肺动脉平滑肌细胞模型 数字病理学 肺动脉高压 转录组分析、单细胞RNA测序、qPCR、分子对接 LASSO回归、随机森林、支持向量机、列线图 基因表达数据 训练队列及多个独立验证队列(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
677 2026-05-20
Spatial transcriptomic profiling of decalcified murine musculoskeletal samples via Xenium Prime 5K
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 详细描述了利用Xenium Prime 5K平台对小鼠脱钙骨骼肌组织进行空间转录组分析的完整样本处理流程 首次提出针对小鼠骨骼肌组织的完整样本处理流程,包括经心灌注、固定、脱钙、石蜡处理及共嵌入策略,实现了高质量空间转录组数据生成,并保留了关键解剖背景 未提及明显的局限性,但可实现性可能受限于特定组织类型和平台成本 开发一个能够高效生成小鼠骨骼肌组织空间转录组数据的样本处理流程 成年小鼠完整膝关节、胫骨和腰椎骨样本 数字病理学 不适用 基于成像的空间转录组学 不适用 空间转录组数据 成年小鼠的多个肌肉骨骼组织样本 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Prime 5K 10x Genomics Xenium Prime 5K平台进行成像型空间转录组分析
678 2026-05-20
Resistance of endothelial cells to SARS-CoV-2 infection in vitro
2025-12-23, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究重新评估了内皮细胞对SARS-CoV-2的易感性,发现培养的或原位的内皮细胞均不容易被活病毒直接感染 首次在体外培养及人肺切片原位实验中证明,无论培养还是天然的人内皮细胞均不易直接受SARS-CoV-2感染,这挑战了之前认为内皮细胞是病毒靶点的观点 研究主要基于体外实验,可能无法完全模拟体内复杂环境;且样本量有限,结果需要进一步在动物模型或临床研究中验证 探讨内皮细胞对SARS-CoV-2的易感性,以澄清其在COVID-19血管炎症中的角色 人肺、主动脉内皮细胞、内皮祖细胞以及人肺切片中的原位内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、荧光成像、ELISA、RT-qPCR、假病毒试验 NA 图像、基因表达数据 内皮细胞来自肺、主动脉和祖细胞培养物,以及人肺切片中的原位细胞 NA 单细胞RNA测序 NA 用于人肺切片的单细胞RNA测序,捕获与SARS-CoV-2病毒基因组对齐的分子标识符
679 2026-05-20
PHD-MS: Multiscale Domain Identification for Spatial Transcriptomics via Persistent Homology
2025-Nov-11, ArXiv
PMID:41293536
研究论文 该论文提出一种基于持续同调的多尺度空间结构识别方法PHD-MS,用于空间转录组学数据中不同形态尺度的组织结构解析 首次将拓扑数据分析中的持续同调方法应用于空间转录组学领域,实现跨形态尺度的空间结构识别,超越了传统单尺度聚类方法的局限性 对前沿区域等异质性区域的结构解析可能仍需进一步优化 开发一种能同时识别空间转录组数据中多尺度组织结构的新算法 多种组织类型的空间转录组数据 机器学习 NA 空间转录组学 持续性同调 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
680 2026-05-20
Video - Visual Integration of Drosophila Enhancer Organization: A tool for integrating and visualizing chromatin accessibility, in vivo transcription factor binding and motif occurrence in tissue-specific differentially expressed genes
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍VIDEO工具,用于整合和可视化果蝇增强子组织中的染色质可及性、体内转录因子结合及基序出现情况 提供了首个交互式网络工具,能够整合染色质可及性、转录因子结合和基序出现数据,在组织特异性上下文中探索基因调控 未在正文中明确说明其局限性,但可能受限于果蝇模型及预设的数据类型和基因列表来源 开发一个网络分析工具,以可视化和整合组织特异性差异表达基因中保守转录因子结合基序、染色质可及性和转录因子结合数据 果蝇组织特异性差异表达基因及其近端增强子区域 生物信息学 NA RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 原位杂交, 微阵列, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据、染色质可及性数据、转录因子结合数据 NA(工具演示涉及唾液腺和胚胎后肠的特定基因集) NA NA NA NA
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