单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-10-05 |
High expression of CCL3/CCL4/CCL5/CCR5 promotes exhausted CD8+ T cells terminal differentiation and is associated with poor prognosis in pediatric B-ALL patients
2025 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320251346823
PMID:40522146
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CCL3/CCL4/CCL5-CCR5轴在B-ALL细胞与终末耗竭CD8+T细胞相互作用中上调，并建立多变量Cox回归模型预测儿科B-ALL患者预后 | 首次报道CCL3/CCL4/CCL5-CCR5轴在B-ALL终末耗竭CD8+T细胞分化中的关键作用，并开发整合这些标志物的预后预测模型 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究不够深入 | 识别B-ALL细胞与耗竭CD8+T细胞间差异上调的配体-受体相互作用，开发儿科B-ALL患者生存预测模型 | 儿科B细胞急性淋巴细胞白血病患者，特别是其B-ALL细胞和耗竭CD8+T细胞 | 生物信息学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序，定量实时聚合酶链反应，多变量Cox回归分析 | 多变量Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据，临床预后数据 | 221例儿科B-ALL样本，另包含本中心成人B-ALL患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 662 | 2025-10-05 |
Blood memory CD8 T cell phenotypes in lung cancer patients predict immune checkpoint treatment responses
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1629802
PMID:40989699
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术分析肺癌患者外周血CD8+ T细胞表型，建立预测免疫检查点治疗反应的机器学习模型 | 首次在单细胞水平系统分析不同免疫治疗反应组患者的CD8+ T细胞表型特征，并开发出高精度的预测模型 | 研究样本量有限，需要在更大规模队列中验证模型的普适性 | 开发能够预测肺癌患者免疫检查点抑制剂治疗反应的生物标志物 | 非小细胞肺癌患者的外周血CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，TCR repertoire分析 | 机器学习 | 单细胞转录组数据，表面标志物表达数据，TCR序列数据 | 包含长期应答者、新治疗应答者和新治疗无应答者的患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 663 | 2025-10-05 |
Identification of Core SASP-Related Genes TGFBI and ANXA6 for Diagnosing Ulcerative Colitis-Related Colorectal Cancer Through Machine Learning
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S538960
PMID:40989757
|
研究论文 | 通过机器学习方法识别溃疡性结肠炎相关结直肠癌的核心SASP相关基因TGFBI和ANXA6作为诊断标志物 | 首次系统筛选SASP相关基因在UCRCC中的作用，并通过113种机器学习算法组合鉴定出核心基因TGFBI和ANXA6 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索衰老相关分泌表型在溃疡性结肠炎相关结直肠癌精准诊断和发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎和结直肠癌患者基因表达数据及小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | 差异表达基因分析，加权基因共表达网络分析，单细胞RNA测序，机器学习算法 | 10种机器学习算法的113种组合 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | UC和CRC数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 664 | 2025-10-05 |
Multi-omics reveals immune features in immune and non-immune cells, an IFN-γ/IFN-α-B2M positive feedback loop, and targeted metabolic therapy in multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1575079
PMID:40990011
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了多发性骨髓瘤中的免疫特征、IFN-γ/IFN-α-B2M正反馈环路及靶向代谢治疗策略 | 识别了新的MM亚群（骨髓瘤激活的造血干细胞和ISG15+ B细胞），发现了IFN-γ/IFN-α-B2M正反馈环路，并通过多组学整合筛选出四种候选药物 | NA | 建立多发性骨髓瘤的多组学图谱，表征驱动免疫逃逸和疾病进展的细胞亚群和信号通路 | 多发性骨髓瘤的免疫和非免疫细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞代谢分析, 批量RNA测序, 多重免疫荧光, CCK-8检测, 流式细胞术, Western blotting | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 单细胞代谢分析 | NA | NA |
| 665 | 2025-10-05 |
FCRLs and atypical transcriptional pattern in tumor infiltrating B cells from lung and renal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587088
PMID:40990023
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肺癌和肾癌中肿瘤浸润B细胞的功能差异及FCRL4作为功能失调标志物的重要性 | 发现sIgA+ B细胞中FCRL4、PDCD1和RUNX2的过表达特征，以及FCRL4/CD20表达比与生存率的相关性 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏功能性验证实验 | 探究肿瘤浸润B细胞中不同抗体亚型的功能差异及其在肿瘤进展中的作用 | 肺癌和肾癌中的肿瘤浸润B细胞，特别是表面IgA+和IgG+记忆B细胞 | 免疫学 | 肺癌, 肾癌 | 高维流式细胞术, 单细胞RNA测序, 批量转录组分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA LUAD队列及公共scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 666 | 2025-10-05 |
Glycolysis-Driven Immune Evasion in Microsatellite Instability-High Colorectal Cancer: An Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Study
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S538018
PMID:40990035
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了糖酵解驱动的免疫逃逸机制在微卫星高度不稳定结直肠癌中的作用 | 首次在微卫星高度不稳定结直肠癌中发现糖酵解富集的肿瘤亚群与免疫抑制微环境的共定位关系，并阐明乳酸分泌促进Treg分化和巨噬细胞极化的分子机制 | 研究样本量有限，需要更大规模队列验证；机制研究主要基于相关性分析，缺乏功能性实验验证 | 探究微卫星高度不稳定结直肠癌中肿瘤细胞功能异质性及其在免疫逃逸中的作用 | 微卫星高度不稳定结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 非负矩阵分解, 基因集富集分析 | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 667 | 2025-10-05 |
An aberrant immune-epithelial progenitor niche drives viral lung sequelae
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07926-8
PMID:39232171
|
研究论文 | 本研究通过建立小鼠模型揭示了病毒性肺后遗症中异常免疫-上皮祖细胞生态位驱动纤维化的机制 | 首次发现肺驻留CD8 T细胞-巨噬细胞相互作用通过IFNγ+TNF-IL-1β轴损害肺泡再生并驱动纤维化后遗症 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者样本验证仍需进一步扩展 | 阐明呼吸道病毒后遗症（PASC）的细胞分子机制 | 三个呼吸道PASC患者队列和病毒后肺病小鼠模型 | 空间转录组学 | COVID-19后遗症 | 空间转录组学、成像技术 | 小鼠疾病模型 | 空间转录组数据、图像数据 | 三个患者队列和相应小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 668 | 2025-10-05 |
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.16.611061
PMID:39345364
|
研究论文 | 本研究通过抑制TRPC3通道改善阿尔茨海默病模型中的突触功能障碍和记忆缺陷 | 首次发现TRPC3在AD兴奋性神经元中特异性上调，并鉴定出高效抑制剂JW-65能通过恢复钙信号通路发挥神经保护作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行临床试验验证 | 探究TRPC3通道在阿尔茨海默病发病机制中的作用及治疗潜力 | AD患者脑组织、AD小鼠模型、大鼠海马神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq、生物信息学分析、功能筛选、海马RNA-seq | NA | 基因表达数据、电生理数据、行为学数据 | AD患者队列、急性和慢性AD小鼠模型、培养的大鼠海马神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 669 | 2025-10-05 |
Coxsackievirus B infection invokes unique cell-type specific responses in primary human pancreatic islets
2024-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604861
PMID:39211206
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了柯萨奇病毒B感染在人类胰岛不同细胞类型中引发的特异性转录反应 | 首次在单细胞分辨率上系统揭示了CVB感染对不同胰岛细胞类型的特异性转录响应，并发现β细胞中长链非编码RNA与病毒感染的关系 | 使用尸体来源的胰岛样本，可能无法完全反映体内真实情况；研究时间点仅限于24和48小时 | 探究柯萨奇病毒B感染对人类胰岛不同细胞类型的特异性影响及其与1型糖尿病的关系 | 人类尸体来源的胰岛细胞 | 单细胞生物学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类尸体胰岛样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 670 | 2025-10-05 |
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to regulate cortical excitability in TDP-43 related neurodegeneration
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601396
PMID:39005475
|
研究论文 | 本研究揭示了杆状小胶质细胞通过与神经元树突相互作用调节TDP-43相关神经退行性疾病中皮层兴奋性的神经保护机制 | 首次发现具有独特形态和转录特征的杆状小胶质细胞亚群，并证明其通过调节兴奋性突触输入来抑制运动皮层过度活跃 | 研究仅限于TDP-43神经退行性疾病小鼠模型，尚未在人类或其他神经退行性疾病模型中验证 | 探究小胶质细胞在TDP-43相关神经退行性疾病运动皮层回路过度兴奋中的调控作用 | TDP-43神经退行性疾病小鼠模型(rNLS8)的运动皮层神经元和小胶质细胞 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症(ALS) | 多通道探针记录、纵向钙成像、空间转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 电生理信号、钙成像数据、转录组数据 | rNLS8转基因小鼠模型 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 671 | 2025-10-05 |
Technological innovations promote cancer stem cell-based translational research
2025-Oct-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217949
PMID:40712971
|
综述 | 本文综述了癌症干细胞研究领域的技术创新及其对转化医学的推动作用 | 系统整合单细胞测序、功能基因组学、器官芯片和人工智能等前沿技术用于癌症干细胞研究 | NA | 探讨技术创新如何促进基于癌症干细胞的转化研究 | 癌症干细胞及其肿瘤微环境 | 生物医学工程 | 癌症 | 单细胞测序, 功能基因组学, 器官芯片, 人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 672 | 2025-10-05 |
Radiotherapy in combination with PD-1 and TIGIT blockade mediate antitumor abscopal effects and immune memory via CD8+ T cells
2025-Oct-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217935
PMID:40714064
|
研究论文 | 本研究探讨放疗联合抗PD-1和抗TIGIT抗体通过CD8+ T细胞介导抗肿瘤远隔效应和免疫记忆的机制 | 首次揭示三重疗法通过激活CD8 T细胞和M1巨噬细胞极化增强抗肿瘤远隔效应和长期免疫记忆 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在临床试验中验证 | 探索放疗联合免疫检查点抑制剂增强抗肿瘤疗效的机制 | C57/BL6小鼠的四种皮下肿瘤模型（LLC、CMT-167、B16-F10、MC38） | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 流式细胞术、多色免疫荧光、单细胞转录组学、Luminex细胞因子分析 | NA | 细胞表型数据、基因表达数据、细胞因子数据 | 四种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 673 | 2025-10-05 |
Inhibition of ACVR1 in Cancer-Associated Fibroblasts Suppresses Colorectal Cancer Cell Growth
2025-Oct, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-17765-0
PMID:40745121
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现ACVR1-BMP7轴是结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的潜在治疗靶点 | 首次在二维类器官模型中揭示ACVR1-BMP7轴在癌症相关成纤维细胞与癌细胞相互作用中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的分子靶向治疗策略 | 结直肠癌细胞、癌症相关成纤维细胞、小鼠模型 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、类器官培养 | 二维类器官模型、小鼠异种移植模型 | 基因表达数据、生存数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 674 | 2025-10-05 |
Poor Collateralization in T2DM: Role of SLC4A10+ MAIT Cells
2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322718
PMID:40808651
|
研究论文 | 本研究探讨2型糖尿病患者中黏膜相关恒定T细胞对侧支循环形成的影响机制 | 首次发现MAIT细胞通过CCL3L1-CCR5轴驱动巨噬细胞向促炎表型极化，从而抑制侧支循环形成 | 样本量有限，需要更大规模研究验证MAIT细胞作为生物标志物的临床价值 | 探究2型糖尿病慢性完全闭塞患者免疫细胞动态与侧支循环形成的关系 | 2型糖尿病慢性完全闭塞患者和糖尿病小鼠模型 | 免疫学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 共培养实验, 缺血模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 两组不同侧支循环状态的2型糖尿病患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 675 | 2025-10-05 |
CXCL4-Induced PBMCs Modulate Vascular Extracellular Matrix via Wnt5a-Dependent Matrix Metalloproteinase-7 and Calcifying Extracellular Vesicle Release
2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322067
PMID:40836918
|
研究论文 | 本研究揭示了CXCL4诱导的单核细胞通过Wnt5a-CaMKII信号轴促进基质金属蛋白酶-7和钙化性细胞外囊泡释放，从而驱动血管细胞外基质重塑的新机制 | 首次发现CXCL4诱导的促炎单核细胞通过Wnt5a-CaMKII信号轴分泌MMP7+S100A8+钙化性细胞外囊泡，驱动血管钙化的新机制 | 研究主要基于体外实验和人类颈动脉斑块组织学验证，需要进一步在体实验确认机制 | 探究CXCL4诱导的单核细胞在血管炎症反应中促进细胞外基质重塑和钙化的分子机制 | 人类外周血单核细胞、血管平滑肌细胞、人类颈动脉斑块 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、细胞外囊泡分析、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | 人类颈动脉斑块样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 676 | 2025-10-05 |
Genomic Insights at the Maternal-Fetal Interface: Preeclampsia Subtypes and Clinical Implications
2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.321710
PMID:40874308
|
综述 | 通过单细胞转录组学揭示子痫前期在母胎界面的细胞特异性基因表达变化及其临床亚型 | 发现胎盘主导型和母体心血管主导型两种子痫前期亚型具有独特的病因学特征 | 未明确说明研究样本量及具体技术平台细节 | 探索子痫前期的基因组学机制及临床分型 | 母胎界面的细胞类型（合体滋养细胞、基质细胞、免疫细胞） | 基因组学 | 子痫前期 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 677 | 2025-10-05 |
Expression and Clinical Implications of LAG-3 in Small Cell Lung Cancer
2025-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502183R
PMID:40960909
|
研究论文 | 本研究评估了LAG-3在小细胞肺癌中的表达及其临床意义 | 首次系统评估28种免疫检查点分子在小细胞肺癌中的表达，发现LAG-3表达高于其他肺癌亚型和黑色素瘤，并验证其作为免疫治疗疗效预测标志物的潜力 | 研究基于多个数据集，可能存在样本异质性；需要进一步实验验证LAG-3作为生物标志物的临床实用性 | 探索PD-L1之外可用于免疫检查点抑制剂的分子标志物 | 小细胞肺癌细胞系和肿瘤组织 | 癌症免疫学 | 小细胞肺癌 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | 多个公共数据集和内部数据集（包括CCLE数据库、IMpower133数据集等） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 678 | 2025-10-05 |
Cyclic Heptapeptide FZ1 Acts as an Integrin αvβ3 Agonist to Facilitate Diabetic Skin Wound Healing by Enhancing Angiogenesis
2025-Sep-25, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c01734
PMID:40910702
|
研究论文 | 本研究揭示了环状七肽FZ1作为整合素αvβ3激动剂通过增强血管生成促进糖尿病皮肤伤口愈合的机制 | 首次发现靶向整合素αvβ3的肽类激动剂FZ1，并证明其在糖尿病伤口中的促愈合作用 | NA | 开发有效的糖尿病伤口治疗药物并阐明其调控机制 | 环状七肽FZ1及其在糖尿病伤口愈合中的作用机制 | 生物医学 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序,RNA干扰,表面等离子共振,分子对接 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 679 | 2025-10-05 |
Rolling circle amplification for next-generation molecular diagnostics, genome analysis, and spatial transcriptome profiling
2025-Sep-25, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr03032c
PMID:40917009
|
综述 | 本综述全面探讨滚环扩增技术的基本原理、设计改进及其在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用 | 将RCA与CRISPR检测、生物传感器和纳米颗粒辅助信号放大技术整合，显著提升了诊断潜力，实现核酸、蛋白质、细胞外囊泡和单细胞的超灵敏检测 | 面临反应特异性、自动化和成本效益等关键挑战 | 探索RCA技术在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用及未来发展 | 核酸、蛋白质、细胞外囊泡、单细胞和组织结构中的基因表达 | 分子诊断 | 癌症 | 滚环扩增、CRISPR检测、生物传感器、纳米颗粒辅助信号放大 | NA | DNA序列、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 680 | 2025-10-05 |
AURKA Enhances Antitumor Immunity by Activating CD4+ T Cell Proliferation in Colorectal Cancer
2025-Sep-25, Cancer investigation
IF:1.8Q3
DOI:10.1080/07357907.2025.2559403
PMID:40995659
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示AURKA在结直肠癌中通过激活CD4+ T细胞增殖增强抗肿瘤免疫的双重作用机制 | 首次整合空间转录组学与单细胞测序技术，发现AURKA在肿瘤周围T细胞富集区特异性表达并与免疫激活相关 | 研究样本量有限，需要更大规模队列验证AURKA作为免疫治疗生物标志物的临床价值 | 探究AURKA在结直肠癌肿瘤微环境中的双重调控作用及其免疫治疗意义 | 结直肠癌患者组织样本、免疫检查点抑制剂治疗队列、小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, IHC/HE染色, CIBERSORT/ssGSEA分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞测序数据, 临床病理数据 | 未明确具体样本数量，包含临床队列和动物模型 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |