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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-12-26 |
High throughput identification of genetic regulators of microglial inflammatory processes in Alzheimer's disease
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.09.642133
PMID:40161839
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研究论文 | 本研究通过CRISPRi筛选和单细胞RNA测序,系统探究了阿尔茨海默病GWAS变异如何调控人源诱导多能干细胞衍生小胶质细胞的炎症反应 | 首次将CRISPRi筛选与单细胞RNA测序(CROP-seq)结合,系统鉴定AD遗传风险因子对小胶质细胞炎症状态的调控功能 | 研究主要基于体外诱导的小胶质细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 阐明阿尔茨海默病遗传风险因子对小胶质细胞炎症反应的调控机制 | 人源诱导多能干细胞衍生的小胶质细胞 | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR抑制筛选, 单细胞RNA测序, CROP-seq | CRISPRi筛选模型 | 单细胞转录组数据 | 针对119个AD GWAS位点进行筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 662 | 2025-12-26 |
Stem Cell Niche: iPSC-Based Assembloids for Modeling Human Hematopoiesis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_629
PMID:40459837
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研究论文 | 本文介绍了一种基于诱导多能干细胞(iPSCs)生成患者特异性3D骨髓模拟组装体的协议,用于模拟人类造血过程 | 开发了一种可精确控制细胞组成和遗传背景的3D骨髓模拟组装体平台,能够重现骨髓微环境并模拟骨髓增殖性肿瘤特征 | 未明确提及样本量或具体实验验证范围,可能局限于体外模型的应用 | 研究骨髓微环境对造血过程的调控机制及疾病建模 | 诱导多能干细胞(iPSCs)、人类原代间充质基质细胞(MSCs)、内皮细胞 | 数字病理学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 3D组装体模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 663 | 2025-12-26 |
Identification of Novel Biomarkers and Potential Therapeutic Targets for Systemic Sclerosis: An Integrated Analysis of Plasma Proteome-Wide Mendelian Randomization and Transcriptome
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S561740
PMID:41431733
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研究论文 | 本研究通过整合血浆蛋白质组范围的孟德尔随机化与转录组分析,识别了系统性硬化症(SSc)的新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次结合血浆蛋白质组范围的孟德尔随机化与转录组数据,识别出CCL19和LOXL2作为SSc的新型生物标志物,并预测了潜在的治疗副作用 | 研究数据来源于公共数据库,缺乏实验验证,且样本量可能有限 | 识别系统性硬化症的新型生物标志物和潜在治疗靶点,并探索其潜在机制 | 系统性硬化症患者相关的血浆蛋白质和转录组数据 | 生物信息学 | 系统性硬化症 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序(scRNA-seq),差异表达基因分析 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 664 | 2025-12-25 |
Gut microbiota dysbiosis exacerbates acute pancreatitis via Escherichia coli-driven neutrophil heterogeneity and NETosis
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2606480
PMID:41439481
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研究论文 | 本研究揭示了肠道菌群失调通过大肠杆菌驱动的中性粒细胞异质性和NETosis加剧急性胰腺炎的机制 | 首次明确了特定革兰氏阴性菌(尤其是大肠杆菌)在急性胰腺炎恶化中的关键作用,并利用单细胞RNA测序揭示了菌群失调如何重塑局部和全身免疫景观,促进促炎性中性粒细胞亚群的扩增和NETosis相关通路的激活 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;特定细菌作用的分子机制细节仍需进一步阐明 | 探究肠道菌群失调加剧急性胰腺炎的具体微生物和分子机制 | 无菌小鼠、无特定病原体小鼠、急性胰腺炎患者粪便样本 | 微生物组学与免疫学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序、鸟枪法宏基因组测序、粪便微生物移植、抗生素调节、单菌定植实验 | NA | 基因表达数据、宏基因组数据 | 小鼠模型及急性胰腺炎患者粪便样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 宏基因组测序 | NA | NA |
| 665 | 2025-12-25 |
Opportunities for RNA sequencing in physiology: from big data to understanding homeostasis and heterogeneity
2026-Feb-01, Function (Oxford, England)
DOI:10.1152/function.019.2025
PMID:41401424
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综述 | 本文综述了RNA测序在生理学中的应用,从大数据分析到理解稳态和异质性 | 强调非编码RNA(如lncRNA)的重要性,并讨论单细胞和空间转录组学的最新进展 | NA | 探讨RNA测序在生理学中的机遇,以增强对疾病机制和个性化医疗的理解 | RNA分子,包括编码和非编码RNA,以及其在细胞、组织和器官生理学中的作用 | 自然语言处理 | NA | RNA测序,单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | RNA序列数据 | 超过百万个RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 666 | 2025-12-25 |
Fibroblast Dysregulation in Multiple Idiopathic External Cervical Resorption: Laboratory Investigation From a Rare Case of 13 Affected Teeth
2026-Jan, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70037
PMID:40988149
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研究论文 | 本研究通过全外显子组测序、单细胞RNA测序和体外实验,探讨了多发性特发性外部颈吸收的发病机制,特别是成纤维细胞异常活动的作用 | 首次结合全外显子组测序和单细胞RNA测序技术,揭示了GNAS错义突变和成纤维细胞异常增殖及破骨特性在MIECR发病中的关键作用 | 研究基于单个罕见病例,样本量有限,结果可能不具有普遍性 | 探究多发性特发性外部颈吸收的病因和发病机制 | 一名患有MIECR的药剂师患者的病变组织和健康牙龈组织 | 数字病理学 | 牙科疾病 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 组织病理学分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 组织图像 | 1名患者的病变组织和健康牙龈组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 667 | 2025-12-25 |
Endothelial Heterogeneity in Pulmonary Hypertension
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322482
PMID:41230600
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序揭示的肺内皮细胞异质性及其在肺动脉高压发病机制中的作用,并探讨了靶向内皮功能障碍的新型治疗策略 | 整合前沿技术(特别是单细胞RNA测序)来理解内皮异质性如何塑造肺动脉高压的疾病轨迹,为未来治疗创新开辟新途径 | NA | 阐明肺内皮细胞异质性在肺动脉高压发病机制中的作用,并探索靶向内皮功能障碍的治疗机会 | 肺内皮细胞及其在肺动脉高压中的功能亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 668 | 2025-12-25 |
Endothelial CEPT1 Promotes Angiogenesis Through PPARα and VEGF-A Signaling
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323302
PMID:41263082
|
研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞中CEPT1基因过表达通过PPARα和VEGF-A信号通路促进血管生成的作用 | 首次揭示了CEPT1在糖尿病背景下通过PPARα/VEGF-A信号轴促进缺血后血管生成的新机制,并利用单细胞RNA测序技术验证了其功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限,且糖尿病模型的复杂性可能影响机制解释 | 探究CEPT1在糖尿病缺血性血管疾病中促进血管生成和功能恢复的分子机制 | 人类外周动脉疾病患者样本、内皮细胞特异性Cept1过表达转基因小鼠、小鼠主动脉和内皮细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子通路分析、基因工程小鼠模型 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、功能实验数据 | 人类患者样本(未明确数量)、C57BL/6J小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 669 | 2025-12-25 |
The prognostic value of tumor macroscopic morphology in colorectal cancer
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102607
PMID:41319390
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研究论文 | 本研究评估了结直肠癌肿瘤宏观形态的预后价值,并探讨了不同形态背后的分子机制 | 提出了修订的结直肠癌肿瘤宏观形态分类系统,并首次将内镜和CT影像形态作为术前疾病无进展生存期的预测因子 | 研究包含回顾性和前瞻性队列,可能存在选择偏倚,且样本量相对有限 | 评估结直肠癌肿瘤宏观形态的预后价值并理解其分子机制 | 结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | RNA测序数据, 单细胞数据, 图像数据 | 642名患者(335名前瞻性研究,307名回顾性研究) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 670 | 2025-12-25 |
Pericytes and Lung Vascular Remodeling
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322518
PMID:41342143
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综述 | 本文综述了周细胞在肺血管重塑中的作用,特别是在肺动脉高压中的病理生物学机制 | 利用单细胞RNA测序技术识别了新的特异性周细胞标记物,揭示了周细胞亚型,并阐明了其在缺氧信号、TGF-β等机制下的表型转换 | 周细胞由于与其他壁细胞共享标记物和谱系关系,在单细胞数据集中存在识别重叠和代表性不足的问题 | 探讨周细胞在肺血管重塑和肺动脉高压病理生物学中的作用及潜在治疗靶点 | 周细胞(毛细血管壁细胞)及其在肺等器官中的功能 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 671 | 2025-12-25 |
Single-Cell Multi-Omics Reveals B2M-Mediated Myeloid Reprogramming and Constructs a Predictive Model for Early Hepatocellular Carcinoma Recurrence
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503144R
PMID:41427790
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学整合分析,揭示了B2M介导的髓系细胞重编程在肝细胞癌早期复发中的作用,并构建了一个预测模型 | 首次在单细胞分辨率下整合RNA测序、蛋白质组学、转录组学和临床特征,系统性地探索了肝细胞癌早期复发的驱动因素,并识别出B2M相关的髓系细胞重编程这一新机制 | 预测模型在训练和验证队列中的AUC仅大于0.65,性能为中等,需要进一步的外部验证和优化 | 探索肝细胞癌早期复发的分子机制并开发预测框架 | 肝细胞癌患者肿瘤组织 | 单细胞多组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 转录组学, LASSO回归 | LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 转录组数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 672 | 2025-12-25 |
Post-Translational Modification Mediated By Acylation Modification Related Genes Induces Immunosuppression and Immunotherapy Resistance in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec-26, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000594
PMID:41439580
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研究论文 | 本研究通过构建酰化修饰相关基因的评分系统(AM.score),揭示了其在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的预后价值及与免疫治疗反应的关系 | 首次系统整合11种酰化修饰类型,利用机器学习方法构建AM.score,并验证其在多个独立队列中预测HNSCC患者预后和免疫治疗疗效的能力 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源为公共数据库和内部队列,可能存在选择偏倚 | 探究酰化修饰相关基因在头颈鳞状细胞癌中的预后意义及其与免疫微环境和免疫治疗反应的关系 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | WGCNA、机器学习、scRNA-seq | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个队列(TCGA-HNSCC、GSE41613、GSE42743、GSE65858及内部队列) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 673 | 2025-12-25 |
Single-Cell Transcriptome Meta-Analysis Reveals Epigenomic and Chromatin Dysregulation in Developing Neurons Derived From Human ESCs With 1q21.1 CNVs
2025-Dec-24, Autism research : official journal of the International Society for Autism Research
IF:5.3Q1
DOI:10.1002/aur.70156
PMID:41437869
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组元分析,揭示了携带1q21.1拷贝数变异的人类胚胎干细胞来源发育神经元中的表观基因组和染色质调控异常 | 结合公共数据和内部疾病模型单细胞组学数据,开发了实用的分析流程,并首次将BPTF识别为与神经精神疾病相关的转录组变化潜在靶点 | NA | 阐明复杂人类神经精神疾病的分子基础 | 来自携带1q21.1拷贝数变异的人类胚胎干细胞模型的发育神经元 | 单细胞组学 | 自闭症谱系障碍、双相情感障碍、精神分裂症 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 674 | 2025-12-25 |
Senescent Mesenchymal Stromal Cells Differentially Alter Adipogenesis in Adipose Tissue, Skeletal Muscle, and Bone Marrow
2025-Dec-24, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.70119
PMID:41437892
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研究论文 | 本研究探讨了衰老的间充质基质细胞如何以组织特异性的方式调节脂肪生成,从而影响衰老过程中脂肪在脂肪组织、骨骼肌和骨髓中的重新分布 | 揭示了衰老MSCs通过旁分泌作用对脂肪生成产生组织特异性影响(促进骨髓MSCs的脂肪生成,但抑制脂肪组织和骨骼肌MSCs的脂肪生成),阐明了衰老相关脂肪重新分布的非细胞自主性机制 | 研究主要在体外和小鼠模型中进行,人体内的验证和具体信号通路有待进一步研究 | 探究衰老的间充质基质细胞如何调节不同组织中的脂肪生成,以阐明衰老相关脂肪重新分布的机制 | 从小鼠骨骼肌、脂肪组织和骨髓中分离的原代间充质基质细胞 | NA | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,体外脂肪生成分化实验,DNA损伤诱导衰老实验,条件培养基分析 | NA | RNA测序数据,细胞表型数据 | 来自小鼠三种组织(骨骼肌、脂肪组织、骨髓)的原代MSCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 675 | 2025-12-25 |
Mycn regulates vascular development through PI3K signaling pathway in zebrafish
2025-Dec-24, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70104
PMID:41439407
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和活体成像分析,确认了Mycn在斑马鱼血管生成过程中的表达,并利用基因工程突变体探究了Mycn在血管发育中的关键作用 | 首次在斑马鱼模型中证实Mycn通过PI3K信号通路调控血管发育,揭示了Mycn缺陷导致血管异常的具体机制 | 研究仅限于斑马鱼模型,未在哺乳动物或人类系统中验证 | 探究Mycn在血管发育中的具体作用机制 | 斑马鱼(Danio rerio) | 发育生物学 | 血管发育异常 | 单细胞RNA测序,活体成像,基因工程突变 | 斑马鱼遗传模型 | RNA-seq数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 676 | 2025-12-25 |
D-Mannose-Modified M2 Macrophage Membrane-Derived Decoy Nanovesicles for Synergistic Immunotherapy of Asthma
2025-Dec-24, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c04996
PMID:41441854
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研究论文 | 本研究开发了一种基于M2巨噬细胞膜衍生的纳米诱饵,用于协同免疫治疗哮喘 | 利用D-甘露糖修饰的M2巨噬细胞膜纳米诱饵,同时靶向多种2型细胞因子,并通过靶向甘露糖受体增强细胞因子的吞噬清除 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证 | 开发一种基于纳米技术的协同免疫疗法,用于治疗哮喘和其他2型炎症性疾病 | M2巨噬细胞膜衍生的纳米诱饵、D-甘露糖修饰的纳米囊泡 | 免疫治疗 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 677 | 2025-12-25 |
Single cell transcriptomic profiling uncovers shared inflammatory pathways and immune dysregulation underlying the asthma to lung cancer transition
2025-Dec-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04307-z
PMID:41441926
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肺癌免疫细胞景观的时空行为及关键基因表达,阐明了CXCL12-CXCR4信号轴在免疫微环境中的核心作用 | 利用单细胞转录组学结合空间分析,首次系统描绘了肺癌免疫细胞亚群的复杂空间分布模式及动态演变轨迹,并验证了关键基因的表达差异 | 研究主要基于单细胞测序数据,样本来源和数量可能有限,且体外细胞系验证未能完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 探究肺癌免疫微环境中免疫细胞的时空行为及关键基因表达模式,以理解疾病进展机制并发现潜在治疗靶点 | 肺癌免疫细胞亚群及关键基因(CXCL12、CXCR4、PD-L1) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR | UMAP、t-SNE | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及肺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 678 | 2025-12-25 |
Dual regulation of Atf3 and Lonp1 as therapeutic targets in cerebral ischaemia-reperfusion injury
2025-Dec-23, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2024-003324
PMID:40044488
|
研究论文 | 本研究探讨了Atf3和Lonp1在脑缺血再灌注损伤中的双重调控作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次结合单细胞转录组学和蛋白质组学分析,揭示了Atf3通过调控Lonp1表达影响线粒体功能和神经元存活的分子机制 | 研究主要基于分子机制探索,尚未进行临床验证;动物模型或细胞模型的特定局限性未明确说明 | 阐明Atf3和Lonp1在脑缺血再灌注损伤中的作用机制,寻找治疗缺血性脑损伤和神经退行性疾病的新靶点 | 脑缺血再灌注损伤模型中的神经元 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组学, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 679 | 2025-12-25 |
Intranasal booster drives class switching and homing of memory B cells for mucosal IgA response
2025-Dec-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198045
PMID:41433108
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研究论文 | 本研究揭示了鼻内加强免疫如何通过诱导记忆B细胞发生IgA类别转换和归巢,从而在上呼吸道产生黏膜分泌型IgA(sIgA)应答的机制 | 首次结合液相色谱-串联质谱免疫球蛋白肽段鉴定(MS Ig-Seq)和单细胞B细胞受体测序(scBCR-seq)技术,在人体内鉴定出鼻内加强免疫后产生的黏膜特异性sIgA单克隆抗体,并发现其对SARS-CoV-2变异株的中和能力比单体IgG和IgA亚型强高达100倍 | NA | 探究鼻内加强免疫诱导人体黏膜sIgA应答的机制 | 鼻内加强免疫后的人体黏膜免疫细胞(特别是记忆B细胞) | 免疫学 | COVID-19 | 液相色谱-串联质谱免疫球蛋白肽段鉴定(MS Ig-Seq),单细胞B细胞受体测序(scBCR-seq),深度测序,纵向分析 | NA | 蛋白质组学数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 680 | 2025-12-25 |
Nuclear Factor I-B Delays Liver Fibrosis by Inhibiting Chemokine Ligand 5 Transcription
2025-Dec-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511311
PMID:41436407
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子NFIB通过抑制趋化因子CCL5的表达来延缓肝纤维化的新机制 | 首次发现NFIB在肝星状细胞激活过程中显著下调,并阐明其通过直接结合CCL5启动子区域抑制其表达,从而减轻肝纤维化的新轴心机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在更广泛的临床人群中验证NFIB/CCL5轴的治疗潜力 | 探究转录因子NFIB在肝星状细胞分化和肝纤维化进程中的作用机制 | 肝星状细胞、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)患者的肝组织、小鼠肝纤维化模型 | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织样本 | MASH肝纤维化患者的肝组织样本、小鼠肝纤维化模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |