本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']
”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
6761 | 2025-10-06 |
Temporal multi-omics identifies LRG1 as a vascular niche instructor of metastasis
2021-Sep, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe6805
PMID:34516824
|
研究论文 | 本研究通过时序多组学分析发现LRG1是转移前血管微环境的关键调控因子 | 首次系统描绘早期原发性肿瘤诱导的血管变化图谱,并鉴定LRG1作为转移治疗新靶点 | 主要基于小鼠模型,临床验证仍需进一步研究 | 探索肿瘤转移过程中血管微环境的分子调控机制 | 肺转移模型中的内皮细胞和血清蛋白 | 多组学分析 | 癌症转移 | 单细胞转录组测序, bulk转录组测序, 血清蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 肺转移手术模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
6762 | 2025-10-06 |
Hepatitis B virus compartmentalization and single-cell differentiation in hepatocellular carcinoma
2021-09, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202101036
PMID:34290079
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究乙型肝炎病毒在肝细胞癌中的区室化和单细胞分化特征 | 首次在单细胞水平揭示HBV读段与癌细胞分化的显著相关性,发现病毒诱导的E2F和MYC靶标以及脂肪生成等新的致癌通路 | 对HBV致癌分子机制的理解仍不完全 | 研究HBV-HCC宿主细胞相互作用机制 | 患者来源的肝细胞癌组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 计算分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 两种互补的单细胞RNA测序方案 |
6763 | 2025-10-06 |
Downregulation of TGR5 (GPBAR1) in biliary epithelial cells contributes to the pathogenesis of sclerosing cholangitis
2021-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.03.029
PMID:33872692
|
研究论文 | 本研究揭示胆汁酸受体TGR5在胆管上皮细胞中的下调是硬化性胆管炎发病机制的关键因素 | 首次发现TGR5在PSC患者和Abcb4-/-小鼠胆管上皮细胞中表达降低,并阐明norUDCA通过恢复TGR5表达发挥治疗作用的新机制 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证仍需扩大;机制研究尚未完全阐明所有信号通路 | 探究TGR5在硬化性胆管炎发病机制中的作用及治疗靶点 | 胆管上皮细胞、PSC患者肝组织、Abcb4-/-基因敲除小鼠 | 分子病理学 | 硬化性胆管炎 | 单细胞转录组测序,免疫荧光染色,基因表达分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质水平数据,组织图像数据 | PSC患者肝组织、多种基因工程小鼠模型(Abcb4-/-, Abcb4-/-/Tgr5Tg等) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6764 | 2025-10-06 |
Progress in cardiac research: from rebooting cardiac regeneration to a complete cell atlas of the heart
2021-08-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab200
PMID:34114614
|
综述 | 回顾2020年心脏基础与转化研究的重要进展,涵盖心肌修复、单细胞测序和外泌体等领域 | 揭示了心脏细胞异质性、发现新型环状RNA circITCH、开发糖萼模拟物等创新方法 | NA | 总结心脏研究领域的最新科学发现和技术进展 | 心脏细胞(心肌细胞、周细胞、成纤维细胞)、外泌体、iPSC分化细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序、3D生物打印、组织工程 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6765 | 2025-10-06 |
Tumour-targeted interleukin-12 and entinostat combination therapy improves cancer survival by reprogramming the tumour immune cell landscape
2021-08-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25393-x
PMID:34446712
|
研究论文 | 本研究展示了恩替诺特与NHS-rmIL12联合疗法通过重编程肿瘤免疫细胞景观改善癌症生存率 | 首次发现组蛋白去乙酰化抑制剂恩替诺特可促进靶向白细胞介素12在肿瘤中积累,并通过CD8 T细胞和中性粒细胞协同作用驱动巨噬细胞M1样极化 | 研究基于实验小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 开发改善免疫检查点阻断疗法应答率的联合治疗策略 | 实验性小鼠结肠癌和低免疫原性乳腺癌模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌, 乳腺癌 | 单细胞转录组测序, 蛋白质组分析, 免疫细胞分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 免疫细胞数据 | 小鼠肿瘤模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
6766 | 2025-10-06 |
CD11b+ lung dendritic cells at different stages of maturation induce Th17 or Th2 differentiation
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25307-x
PMID:34413303
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肺脏CD11b+树突状细胞在不同成熟阶段分别诱导Th17或Th2分化的机制 | 首次发现肺脏cDC2细胞在逐步成熟过程中经历不同功能状态,其中部分成熟阶段特异性促进Th17分化,而完全成熟阶段则优先诱导Th2分化 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明肺脏树突状细胞诱导Th17和Th2细胞分化的机制 | 小鼠肺脏CD11b+常规树突状细胞(cDC2) | 免疫学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 过继转移实验, 伪时间分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肺脏cDC2细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6767 | 2025-10-06 |
Reactivation of the Hedgehog pathway in esophageal progenitors turns on an embryonic-like program to initiate columnar metaplasia
2021-08-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.03.019
PMID:33882290
|
研究论文 | 本研究揭示了食管祖细胞中Hedgehog通路激活如何通过启动胚胎样程序引发柱状化生 | 首次证明食管祖细胞可作为柱状化生来源,并阐明Hedgehog通路通过去分化和Sox9依赖的柱状转化机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型,人类临床样本验证尚需进一步研究 | 探究食管柱状化生的细胞起源和分子机制 | 食管祖细胞和柱状化生过程 | 发育生物学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,转录组分析,表观遗传分析 | 转基因小鼠模型,条件性基因敲除小鼠 | 基因表达数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6768 | 2025-10-06 |
Unfolded Protein Response as a Compensatory Mechanism and Potential Therapeutic Target in PLN R14del Cardiomyopathy
2021-08-03, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现未折叠蛋白反应在PLN R14del心肌病中具有保护作用,并探索了其治疗潜力 | 首次揭示未折叠蛋白反应在PLN R14del心肌病中的代偿性保护机制,并验证了通过小分子激活UPR可改善心肌收缩功能 | 研究主要基于hiPSC-CMs体外模型,需要进一步在体实验验证 | 探索PLN R14del心肌病的发病机制和潜在治疗方法 | 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞(hiPSC-CMs)和PLN R14del患者心脏组织 | 心血管疾病研究 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序, siRNA基因沉默, 2D和3D功能性收缩力测定 | hiPSC-CMs疾病模型 | 基因表达数据, 功能测定数据 | 同基因配对hiPSC-CMs和患者心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6769 | 2025-10-06 |
SARS-CoV-2 infection induces beta cell transdifferentiation
2021-08-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.05.015
PMID:34081913
|
研究论文 | 本研究揭示了SARS-CoV-2感染可诱导胰腺β细胞转分化为其他类型细胞 | 首次发现SARS-CoV-2感染可直接导致β细胞转分化,并证明该过程可通过trans-ISRIB抑制剂逆转 | 研究主要基于尸检样本和体外感染实验,缺乏在体动态观察数据 | 探究COVID-19与糖尿病关联的细胞分子机制 | 胰腺胰岛细胞,特别是β细胞 | 细胞生物学 | COVID-19, 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | COVID-19患者尸检胰腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6770 | 2025-10-06 |
A Transcriptionally Distinct Subpopulation of Healthy Acinar Cells Exhibit Features of Pancreatic Progenitors and PDAC
2021-08-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0427
PMID:34049974
|
研究论文 | 研究发现健康胰腺中存在转录特征独特的腺泡边缘细胞,这些细胞具有胰腺祖细胞特征并与胰腺癌发展相关 | 首次在健康胰腺中识别出具有胰腺祖细胞特征和致癌转录活性的腺泡边缘细胞亚群,并在多个器官中发现类似的边缘状态细胞 | 研究主要基于单细胞RNA-seq数据的重新分析,需要进一步实验验证这些细胞的生物学功能 | 探索健康胰腺中特殊细胞亚群与胰腺癌发生发展的关系 | 人类胰腺组织、胰腺导管腺癌(PDAC)样本以及肺、肝、前列腺和结肠组织 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个胰腺和PDAC单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6771 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome profiling of the human developing spinal cord reveals a conserved genetic programme with human-specific features
2021-08-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199711
PMID:34351410
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析人类胚胎发育期脊髓的细胞多样性和发育轨迹 | 首次系统描绘人类胚胎脊髓发育的单细胞转录组图谱,揭示人类特有的神经管发育特征 | 仅分析4个胚胎样本,样本量有限;仅关注颈胸段脊髓 | 解析人类胚胎期神经管细胞多样性和发育机制 | 人类胚胎脊髓颈段和胸段组织 | 单细胞组学 | 神经系统发育 | 单细胞mRNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4个人类胚胎(卡内基分期CS12、CS14、CS17、CS19,孕周4-7周) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6772 | 2025-10-06 |
Glucocorticoids and Androgens Protect From Gastric Metaplasia by Suppressing Group 2 Innate Lymphoid Cell Activation
2021-08, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.04.075
PMID:33971182
|
研究论文 | 本研究揭示了糖皮质激素和雄激素通过抑制2型先天淋巴细胞的活化来保护胃黏膜免受化生的新机制 | 首次发现雄激素在胃部炎症调节中的保护作用,并阐明其通过抑制ILC2细胞产生促炎细胞因子的具体机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 研究性别因素对胃部炎症调节的影响 | 小鼠胃部白细胞和2型先天淋巴细胞(ILC2s) | 免疫学 | 胃部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6773 | 2025-10-06 |
Variants in GCNA, X-linked germ-cell genome integrity gene, identified in men with primary spermatogenic failure
2021-Aug, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-021-02287-y
PMID:33963445
|
研究论文 | 本研究通过基因组分析发现X连锁生殖细胞核抗原(GCNA)基因变异与男性原发性生精功能障碍相关 | 首次将GCNA这一关键基因组完整性因子与人类男性不育联系起来,鉴定了7个可能具有临床相关性的GCNA变异 | 样本量相对有限,需要进一步功能验证研究 | 探索男性原发性生精功能障碍的遗传病因 | 患有生精功能障碍的男性患者 | 基因组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,计算建模 | 计算结构建模 | 基因组数据,基因表达数据 | 初始分析176例,后续研究2049例,对照组>5000例生物学父亲 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6774 | 2025-10-06 |
How should we define mammary stem cells?
2021-08, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2021.03.012
PMID:33902986
|
综述 | 重新评估乳腺干细胞的定义与概念框架 | 整合单细胞RNA测序、表观遗传分析等创新技术对乳腺干细胞层级提出新见解 | 未涉及具体实验数据验证,主要为概念性讨论 | 探讨乳腺干细胞的定义标准与研究方向 | 乳腺干细胞与祖细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 表观遗传分析, 深度组织成像, 活体成像 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6775 | 2025-10-06 |
Characterization of highly proliferative decidual precursor cells during the window of implantation in human endometrium
2021-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3367
PMID:33764639
|
研究论文 | 本研究鉴定并表征了人类子宫内膜着床窗口期存在的高度增殖性间充质细胞群,揭示了其作为蜕膜前体细胞的功能特性 | 首次发现并描述了人类子宫内膜中具有高度增殖能力的hPMC细胞群,证实其作为新型蜕膜前体细胞在胚胎着床过程中的关键作用 | 研究主要基于单细胞转录组学分析,需要进一步的功能实验验证hPMC的具体分化机制 | 探究人类子宫内膜在胚胎着床窗口期的细胞组成和分化机制 | 人类子宫内膜组织样本,特别是着床窗口期的子宫内膜细胞 | 生殖医学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6776 | 2025-10-06 |
De novo generation of macrophage from placenta-derived hemogenic endothelium
2021-07-26, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.06.005
PMID:34197725
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胎盘来源的内皮细胞具有造血潜能并能产生巨噬细胞 | 首次揭示胎盘内皮细胞具有造血潜能并能产生称为霍夫鲍尔细胞样细胞的胎盘巨噬细胞,并鉴定出两种亚型 | 研究仅限于小鼠模型,人类胎盘造血潜能尚需验证 | 探索胚胎其他部位是否能够产生巨噬细胞 | 小鼠胎儿胎盘造血系统 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
6777 | 2025-10-06 |
Inhibition of lung tumorigenesis by a small molecule CA170 targeting the immune checkpoint protein VISTA
2021-07-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02381-x
PMID:34302042
|
研究论文 | 本研究通过小分子CA170靶向免疫检查点蛋白VISTA抑制肺癌发生 | 首次使用三肽小分子VISTA拮抗剂CA170联合KRAS疫苗实现肺癌发生的几乎完全抑制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证 | 探索靶向VISTA的小分子拮抗剂在肺癌免疫治疗中的疗效 | 致癌物诱导的小鼠肺癌模型 | 癌症免疫治疗 | 肺癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠肺癌模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6778 | 2025-10-06 |
Human oral mucosa cell atlas reveals a stromal-neutrophil axis regulating tissue immunity
2021-07-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.05.013
PMID:34129837
|
研究论文 | 构建人类口腔黏膜单细胞转录组图谱,揭示基质细胞-中性粒细胞轴在组织免疫调控中的作用 | 首次系统揭示口腔黏膜基质细胞通过促进抗菌防御和中性粒细胞招募调控组织免疫平衡的新机制 | NA | 解析口腔黏膜组织特异性病理生理机制 | 健康个体和牙周炎患者的口腔黏膜组织 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6779 | 2025-10-06 |
Role of Tim4 in the regulation of ABCA1+ adipose tissue macrophages and post-prandial cholesterol levels
2021-07-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24684-7
PMID:34290249
|
研究论文 | 本研究探讨Tim4在脂肪组织巨噬细胞调控餐后胆固醇转运中的作用 | 首次发现Tim4通过调节溶酶体功能调控餐后高密度脂蛋白胆固醇释放的新机制 | 研究主要依赖小鼠模型,人类临床相关性尚需验证 | 阐明脂肪组织巨噬细胞调控餐后胆固醇转运的分子机制 | 脂肪组织巨噬细胞和餐后胆固醇代谢 | 免疫代谢 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,骨髓嵌合体模型,细胞清除实验 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6780 | 2025-10-06 |
Coordinated changes in gene expression kinetics underlie both mouse and human erythroid maturation
2021-07-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02414-y
PMID:34225769
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠和人类红细胞成熟过程中基因表达动力学的协调性阶跃变化 | 发现红细胞成熟过程中存在基因表达动力学的协调性阶跃变化,突破了当前RNA速度分析框架的假设限制 | 当前RNA速度分析工具无法处理表达动力学随时间变化的情况 | 研究红细胞成熟过程中的基因表达动力学特征 | 小鼠胚胎和人类胎儿肝细胞 | 单细胞基因组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | RNA速度分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎时间序列数据集和Gata1缺失嵌合体胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |