单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
6761	2024-10-27	Neural stem cell metabolism revisited: a critical role for mitochondria 2023-08, Trends in endocrinology and metabolism: TEM DOI:10.1016/j.tem.2023.05.008 PMID:37380501	综述	本文综述了线粒体代谢在鼠和人类神经干细胞（NSCs）胚胎和成年大脑中的作用	本文重新审视了线粒体在神经干细胞代谢中的关键作用，并探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据在成年NSCs代谢特征中的应用	NA	探讨线粒体代谢在神经干细胞维持和命运决定中的作用	鼠和人类神经干细胞（NSCs）	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
6762	2024-10-27	Cloning a profibrotic stem cell variant in idiopathic pulmonary fibrosis 2023-04-26, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.abp9528 PMID:37099633	研究论文	研究通过单细胞克隆技术在特发性肺纤维化患者中鉴定出一种促纤维化干细胞变异体	首次通过单细胞克隆技术鉴定出特发性肺纤维化中的一种主要干细胞变异体，并发现其在体外能将正常肺成纤维细胞转化为病理性肌成纤维细胞，在体内能激活和招募肌成纤维细胞	研究样本量较小，且仅限于特发性肺纤维化患者和对照组，未涵盖其他肺部疾病	探讨特发性肺纤维化中干细胞变异体的特征及其在疾病发展中的作用	特发性肺纤维化患者的远端肺部基底干细胞	数字病理学	特发性肺纤维化	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	16名特发性肺纤维化患者和10名对照组
6763	2024-10-26	SRSF2 is essential for maintaining pancreatic beta-cell identity and regulating glucose homeostasis in mice 2024-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119845 PMID:39265887	研究论文	研究探讨了剪接因子SRSF2在维持胰腺β细胞身份和调节小鼠血糖稳态中的关键作用	首次揭示了SRSF2在胰腺β细胞生存和血糖稳态中的重要作用，并通过单细胞RNA测序分析了其对β细胞身份和功能的调控机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证SRSF2的作用	探讨SRSF2在胰腺β细胞功能和血糖稳态中的作用	胰腺β细胞和小鼠模型	NA	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及10个月龄的小鼠和Min6细胞
6764	2024-10-26	Interactions between polycyclic aromatic hydrocarbons and genetic variants in the cGAS-STING pathway affect the risk of colorectal cancer 2024-Dec, Archives of toxicology IF:4.8Q1 DOI:10.1007/s00204-024-03862-8 PMID:39287666	研究论文	研究多环芳烃与cGAS-STING通路基因变异在结直肠癌风险中的相互作用	首次探讨了cGAS-STING通路基因变异与多环芳烃暴露在结直肠癌风险中的相互作用	研究样本量较小，可能影响结果的普适性	探讨基因与环境因素在结直肠癌风险中的相互作用	cGAS-STING通路基因变异与多环芳烃暴露	NA	结直肠癌	RNA测序	NA	RNA	NA
6765	2024-10-26	In situ reprogramming of cardiac fibroblasts into cardiomyocytes in mouse heart with chemicals 2024-Nov, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41401-024-01308-6 PMID:38890526	研究论文	研究使用化学混合物在心脏原位将成纤维细胞重编程为心肌细胞	首次在全心脏水平上验证了使用小分子混合物诱导成纤维细胞原位重编程为心肌细胞的可行性	NA	探索化学混合物在心脏原位重编程成纤维细胞为心肌细胞的效果	小鼠心脏中的成纤维细胞和心肌细胞	NA	心血管疾病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	图像	两种遗传标记的小鼠
6766	2024-10-26	Tongmai Zhuke decoction restrains the inflammatory reaction of macrophages for carotid artery atherosclerosis by up-regulating lincRNA-Cox2 2024-Nov, Biotechnology & genetic engineering reviews DOI:10.1080/02648725.2023.2196489 PMID:37013943	研究论文	探讨通脉逐瘀汤通过上调lincRNA-Cox2抑制巨噬细胞炎症反应，从而治疗颈动脉粥样硬化的机制	发现通脉逐瘀汤通过上调lincRNA-Cox2抑制巨噬细胞炎症反应，为颈动脉粥样硬化的治疗提供了新的机制	研究仅基于体外实验数据，缺乏体内实验验证	探索通脉逐瘀汤治疗颈动脉粥样硬化的分子机制	颈动脉粥样硬化中的巨噬细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	两组深度转录组数据和两组单细胞RNA测序数据
6767	2024-10-26	Spatial Transcriptomic Approach to Understanding Coronary Atherosclerotic Plaque Stability 2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320330 PMID:39234691	研究论文	研究使用空间转录组学方法探讨冠状动脉粥样硬化斑块的稳定性	采用空间转录组学技术，结合GeoMx空间分析平台和全转录组图谱，对冠状动脉斑块进行细胞形态和空间转录组分析，揭示了斑块稳定性和不稳定性中的细胞特异性和区域性转录变化	研究样本量较小，仅包括5名患者，可能影响结果的普适性	探讨冠状动脉粥样硬化斑块稳定性的分子机制	冠状动脉斑块的稳定性和不稳定性	数字病理学	心血管疾病	空间转录组学	NA	转录组数据	5名患者
6768	2024-10-26	Hic-5 antisense oligonucleotide inhibits advanced hepatic fibrosis and steatosis in vivo 2024-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101195 PMID:39444410	研究论文	本研究探讨了Hic-5反义寡核苷酸在抑制体内晚期肝纤维化和脂肪变性中的临床应用	开发了针对Hic-5的反义寡核苷酸，并在MASH小鼠模型中验证了其治疗晚期肝纤维化和脂肪变性的潜力	NA	研究Hic-5在肝纤维化和脂肪性肝炎中的作用，并评估反义寡核苷酸作为治疗手段的潜力	人肝纤维化组织和MASH小鼠模型	NA	肝病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
6769	2024-10-26	Dissecting the role of transcription factor AP2-M in Babesia asexual replication 2024-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202400127RRR PMID:39441647	研究论文	本文研究了转录因子AP2-M在巴贝西虫无性复制中的作用	首次鉴定了巴贝西虫中的转录因子AP2-M，并揭示了其在红细胞入侵和细胞周期进展中的调控作用	NA	探讨转录因子AP2-M在巴贝西虫无性复制中的功能	巴贝西虫中的转录因子AP2-M及其靶基因	NA	NA	Cut-Tag, RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序	NA	DNA, RNA, 蛋白质	包含AP2-M基因敲除的巴贝西虫株
6770	2024-10-26	I-mfa, Mesangial Cell TRPC1 Channel, and Regulation of Glomerular Filtration Rate 2024-Oct-24, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.0000000533 PMID:39446484	研究论文	研究探讨了I-mfa蛋白在肾小球滤过率（GFR）调节中的作用	首次揭示了I-mfa通过抑制TRPC1介导的钙信号传导来正向调节GFR	研究仅在动物模型和体外细胞实验中进行，尚未在人体中验证	探讨I-mfa在肾小球滤过率调节中的作用	I-mfa蛋白、肾小球滤过率（GFR）、TRPC1通道	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Western blot、钙成像	NA	蛋白质、RNA	野生型（WT）和I-mfa敲除（KO）小鼠、人及小鼠系膜细胞
6771	2024-10-26	Senescence landscape in the liver following sepsis and senolytics as potential therapeutics 2024-Oct-23, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14354 PMID:39444093	研究论文	研究了败血症后肝脏中的细胞衰老现象，并探讨了衰老细胞作为潜在治疗靶点的可能性	首次描述了败血症肝脏中的衰老景观，并证明了衰老细胞在败血症恶化结果中的作用	NA	探讨败血症后肝脏中的细胞衰老现象及其对治疗的影响	败血症后的小鼠肝脏细胞	NA	NA	单细胞测序	NA	细胞	败血症诱导后的小鼠肝脏细胞
6772	2024-10-26	FABP5+ macrophages contribute to lipid metabolism dysregulation in type A aortic dissection 2024-Oct-23, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113438 PMID:39447410	研究论文	本文研究了FABP5+巨噬细胞在A型主动脉夹层中对脂质代谢失调的贡献	首次系统评估了非免疫细胞和免疫细胞在主动脉夹层中的相互作用及其对代谢的影响	NA	阐明A型主动脉夹层中脂质代谢的全面图景	FABP5+巨噬细胞在A型主动脉夹层中的作用	NA	心血管疾病	bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 脂质代谢组学	NA	RNA, 脂质	A型主动脉夹层模型小鼠和患者
6773	2024-10-26	IL-1β-induced epithelial cell and fibroblast transdifferentiation promotes neutrophil recruitment in chronic rhinosinusitis with nasal polyps 2024-Oct-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53307-0 PMID:39438439	研究论文	研究探讨了IL-1β诱导的上皮细胞和成纤维细胞转分化在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中促进中性粒细胞招募的作用	首次通过单细胞RNA测序揭示了IL-1信号诱导的LY6D杯状细胞和IDO1成纤维细胞在促进中性粒细胞招募中的作用	研究主要基于小鼠模型和人类样本，缺乏更大规模的临床验证	探讨IL-1β在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中促进中性粒细胞招募的机制	IL-1β诱导的上皮细胞和成纤维细胞转分化及其对中性粒细胞招募的影响	NA	慢性鼻窦炎伴鼻息肉	单细胞RNA测序	NA	RNA	来自慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的下鼻甲、中鼻甲和鼻息肉样本
6774	2024-10-26	Single-cell sequencing reveals immune features of treatment response to neoadjuvant immunochemotherapy in esophageal squamous cell carcinoma 2024-Oct-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52977-0 PMID:39438438	研究论文	研究使用单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了接受新辅助免疫化疗的食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境，揭示了治疗反应的免疫特征	首次揭示了CXCL13CD8 Tex细胞在治疗前后的变化及其作为治疗反应预测因子的潜力，并发现了与治疗抵抗相关的关键标记物	研究样本量较小，可能影响结果的普适性	探讨新辅助免疫化疗对食管鳞状细胞癌治疗反应的影响因素	食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	接受新辅助免疫化疗的食管鳞状细胞癌患者
6775	2024-10-26	Oxysterols contribute to immune cell recruitment in SLE skin lesions 2024-Oct-22, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s13075-024-03414-6 PMID:39438997	研究论文	研究探讨了氧化固醇在系统性红斑狼疮（SLE）皮肤病变中对免疫细胞招募的贡献	首次揭示了纤维细胞通过表达CH25H和CYP7B1促进SLE皮肤病变中免疫细胞招募的机制	NA	探讨氧化固醇在SLE皮肤病变中的作用及其机制	SLE患者的皮肤病变和氧化固醇代谢	NA	系统性红斑狼疮	液相色谱-质谱联用（LC-MS）、免疫组化染色、单细胞测序	NA	代谢物数据、基因表达数据	NA
6776	2024-10-26	Integrated immunogenomic analyses of single-cell and bulk profiling construct a T cell-related signature for predicting prognosis and treatment response in osteosarcoma 2024-Oct-22, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01461-8 PMID:39436466	研究论文	本研究通过整合单细胞和批量测序数据，构建了一个与T细胞相关的特征，用于预测骨肉瘤患者的预后和治疗反应	本研究首次通过单细胞RNA测序数据识别了与T细胞相关的基因，并构建了一个预测骨肉瘤患者预后的特征	本研究主要基于公共数据库的数据，未涉及临床试验验证	研究T细胞相关基因在骨肉瘤发病机制中的作用，并构建预测模型	骨肉瘤患者的T细胞相关基因和免疫反应	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	3000个高度可变基因，多个骨肉瘤细胞系
6777	2024-10-26	Single-cell transcriptomics reveals tumor microenvironment changes and prognostic gene signatures in hepatocellular carcinoma 2024-Oct-22, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113317 PMID:39447409	研究论文	本文利用单细胞RNA转录组数据研究了肝细胞癌（HCC）恶性进展过程中肿瘤微环境的变化及其与患者预后相关的基因标记	首次通过单细胞RNA转录组数据揭示了HCC进展过程中肿瘤微环境的主要成分变化，并识别了与预后相关的基因标记	研究基于公开的单细胞RNA转录组数据，样本量有限，可能影响结果的普适性	探究肝细胞癌恶性进展过程中肿瘤微环境的变化及其与患者预后相关的基因标记	肝细胞癌患者的单细胞RNA转录组数据	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	来自不同阶段的HCC患者样本，代表I-IV期
6778	2024-10-26	Isotope Encoded chemical Imaging Identifies Amyloid Plaque Age Dependent Structural Maturation, Synaptic Loss, and Increased Toxicity 2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.08.617019 PMID:39416086	研究论文	研究使用同位素编码的化学成像技术，追踪阿尔茨海默病中β-淀粉样蛋白斑块的形成和成熟过程，并分析其对神经元功能和毒性的影响	首次将动态MSI、结构斑块成像和全基因组空间转录组学在单个斑块水平上进行功能整合，提供了前所未有的时间和空间分辨率	NA	阐明早期β-淀粉样蛋白斑块形成过程中的生化过程，并研究斑块成熟对神经元功能和毒性的影响	β-淀粉样蛋白斑块的形成和成熟过程，以及其对神经元功能和毒性的影响	数字病理学	阿尔茨海默病	质谱成像(MSI)、代谢同位素标记、超光谱共聚焦显微镜	NA	图像、基因表达数据	使用敲入Aβ小鼠模型，样本包括10个月和18个月大的动物
6779	2024-10-26	Sex-dependent APOE4 neutrophil-microglia interactions drive cognitive impairment in Alzheimer's disease 2024-Oct, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-024-03122-3 PMID:38961225	研究论文	研究探讨了APOE4在阿尔茨海默病中通过中性粒细胞与小胶质细胞相互作用驱动认知障碍的性别依赖性	发现了APOE4女性携带者中与认知障碍相关的新型中性粒细胞亚群，并揭示了IL-17F在其中的作用机制	研究主要基于小鼠模型和独立人群，需要进一步在人类中验证	探讨APOE4在阿尔茨海默病中驱动认知障碍的机制，并寻找潜在的治疗靶点	APOE4女性携带者中的中性粒细胞与小胶质细胞相互作用	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞转录组学、多重流式细胞术	NA	基因表达数据	两个独立人群的APOE4女性携带者
6780	2024-10-26	Integrated immuno-transcriptomic analysis of ovarian cancer identifies a four-chemokine-dominated subtype with antitumor immune-active phenotype and favorable prognosis 2024-Oct, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-024-02803-7 PMID:39095528	研究论文	本研究通过整合免疫转录组分析卵巢癌样本，识别出一种以四种趋化因子为主的亚型，该亚型具有抗肿瘤免疫活性和良好的预后	本研究首次在卵巢癌中引入了一种基于四种趋化因子的免疫分类方法，并验证了其在多中心队列中的有效性	本研究的样本量虽然较大，但仍需在更多不同来源的样本中进一步验证	探讨卵巢癌中免疫活性肿瘤表型与临床结局之间的关系	卵巢癌样本及其免疫微环境	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	2850个卵巢癌样本和39个单细胞RNA测序样本