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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6761 | 2026-02-22 |
Integrative analysis of bulk multiomics and single-cell transcriptomics reveals the value of neddylation in Skin Cutaneous Melanoma
2026-Feb, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2025.12.003
PMID:41558945
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研究论文 | 本研究通过整合批量多组学和单细胞转录组学数据,揭示了neddylation在皮肤黑色素瘤中的预后价值 | 结合单细胞RNA测序和批量数据分析,首次在皮肤黑色素瘤中基于neddylation相关基因构建了预后模型,并识别了不同的neddylation细胞亚型 | 研究依赖于公共数据库数据,未进行独立队列验证,且机制探索有限 | 分析皮肤黑色素瘤的细胞异质性并构建neddylation相关预后模型 | 皮肤黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,批量多组学分析 | 非负矩阵分解聚类算法 | 转录组数据 | 31,894个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6762 | 2026-02-22 |
Multi-omics analysis reveals that ginsenoside Rb1 improves prognostic outcomes in sepsis by modulating mitochondrial metabolism MTHFD2 targets
2026-Feb-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37362-9
PMID:41622321
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示人参皂苷Rb1通过调控线粒体代谢基因MTHFD2改善脓毒症预后 | 首次结合公共数据库分析、单细胞测序和分子对接技术,发现MTHFD2作为脓毒症关键靶点,并验证人参皂苷Rb1的治疗潜力 | 动物实验仅为初步结果,需要更多临床研究验证 | 探索脓毒症预后改善的分子机制和潜在治疗靶点 | 脓毒症患者样本数据和CLP诱导的脓毒症大鼠模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 多组学分析、单细胞测序、分子对接 | 风险模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 公共数据库中的脓毒症与正常样本,未指定具体数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6763 | 2026-02-22 |
Oxidative stress-associated genes TPPP3 and VEGFA in COPD revealed by bulk and single-cell sequencing analysis
2026-Jan-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37375-4
PMID:41620539
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验方法,识别并验证了慢性阻塞性肺疾病(COPD)中与氧化应激相关的关键基因和通路 | 结合批量测序和单细胞RNA测序分析,首次在COPD中鉴定出TPPP3和VEGFA作为上皮细胞中富集的关键氧化应激相关基因,并进行了实验验证 | 研究主要基于公共数据库和细胞模型,缺乏体内实验或临床样本的直接验证,可能限制其临床转化潜力 | 识别和验证COPD中与氧化应激相关的关键基因及通路,以探索新的治疗策略和潜在生物标志物 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关的基因表达数据及人支气管上皮细胞(BEAS-2B) | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 随机森林 | 基因表达数据 | 未明确指定具体样本数量,但使用了公共GEO数据库中的多个COPD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6764 | 2026-02-22 |
A Single-Cell and Spatial 3D Multi-omic Atlas of Developing Human Basal Ganglia and Inhibitory Neurons
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.28.702385
PMID:41659519
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研究论文 | 本研究构建了发育中人类基底神经节和抑制性神经元的单细胞与空间3D多组学图谱 | 首次结合单核甲基-3C测序、高多重空间转录组学和染色质+RNA单分子成像技术,揭示了基底神经节发育中3D表观基因组的动态变化 | 研究主要关注围产期大脑,未涵盖更广泛的发育阶段或疾病状态 | 阐明基底神经节发育过程中表观基因组和3D基因组的动态变化 | 人类基底神经节、神经节隆起及其衍生的神经元 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单核甲基-3C测序, 空间转录组学, 染色质+RNA单分子成像 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据, 3D基因组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及发育中的人类大脑组织 | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6765 | 2026-02-22 |
The clinical significance of the Mediterranean fever gene MEFV variants in Castleman disease
2026-Jan-29, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01392-1
PMID:41611845
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研究论文 | 本研究探讨了地中海热基因MEFV变异在Castleman病(CD)中的临床意义,特别是在iMCD-TAFRO亚型中的作用 | 首次在较大队列中揭示MEFV变异在CD中的高流行率,并通过体外实验和单细胞RNA测序阐明了MEFV表达与IL-6通路激活的关联 | 样本量较小(37例患者),且为回顾性研究,可能限制结果的普遍性 | 阐明MEFV基因变异在Castleman病发病机制中的作用,特别是对iMCD-TAFRO亚型的影响 | Castleman病患者(包括iMCD-TAFRO亚型)及其血液/淋巴结活检样本 | 单细胞组学 | Castleman病 | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR, Luminex细胞因子检测 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 37例CD患者,包括一名青少年TAFRO患者及其无症状父母和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6766 | 2026-02-22 |
Machine learning identifies disulfidptosis-related gene signature for pancreatic cancer prognosis and immune infiltration
2026-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04463-w
PMID:41591656
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和单细胞分析,探索了与胰腺癌预后和免疫浸润相关的二硫死亡相关基因特征 | 首次将新型细胞死亡方式——二硫死亡相关基因特征应用于胰腺癌预后模型的构建,并结合单细胞RNA测序揭示了关键基因在肿瘤微环境中的表达模式 | 外部验证集的模型性能中等(C-index=0.6),表明模型有待进一步优化 | 识别胰腺癌的预后生物标志物和免疫浸润模式 | 胰腺癌患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 随机生存森林,StepCox | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6767 | 2026-02-22 |
Exploring the key molecular mechanisms and immune microenvironment of oxidative stress-related pathways in pancreatic neuroendocrine tumor combining scRNA-seq and bulk RNA
2026-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04515-1
PMID:41591671
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,系统探索了氧化应激相关通路在胰腺神经内分泌肿瘤中的关键分子机制和免疫微环境 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,系统阐明氧化应激通路通过BCL2L1和PHGDH等关键基因调控pNET进展的分子机制和免疫微环境相互作用 | 研究主要基于公共数据集的分析,缺乏实验验证;单细胞数据样本量相对有限(20个样本) | 阐明氧化应激相关通路如何驱动胰腺神经内分泌肿瘤进展的分子机制及其与肿瘤微环境的相互作用 | 胰腺神经内分泌肿瘤(pNET)样本 | 生物信息学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 差异表达分析, WGCNA, GO/KEGG富集分析, PPI网络, CIBERSORTx免疫浸润分析, ceRNA网络构建, 转录因子预测, 药物预测, 分子对接 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 预后列线图模型, ROC分析 | 基因表达数据(RNA-seq) | 批量RNA-seq数据集GSE73338包含63个pNET样本和5个对照样本;单细胞RNA-seq数据集GSE256136包含20个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6768 | 2026-02-22 |
KIF5B-driven unfolded protein response reprograms breast cancer immunosuppressive microenvironment for single-cell guided therapeutic targeting
2026-Jan-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04526-y
PMID:41587002
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据,揭示了KIF5B在乳腺癌中作为预后生物标志物和治疗靶点的作用,并探讨了其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次通过多模态数据分析,将KIF5B与未折叠蛋白反应、免疫浸润和药物敏感性联系起来,为乳腺癌的精准治疗提供了新见解 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;数据来源于多个数据集,可能存在批次效应 | 探究KIF5B在乳腺癌预后、肿瘤微环境和治疗反应中的综合作用 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | hdWGCNA, 共识聚类 | RNA-seq数据 | 多个数据集的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6769 | 2026-02-22 |
Intermittent fasting inhibits Tp53-driven glioma through gut microbiota-mediated methionine-m6A regulation
2026-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68512-2
PMID:41559043
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研究论文 | 本研究揭示了间歇性禁食(IF)通过肠道菌群介导的甲硫氨酸-m6A调控途径抑制Tp53驱动型胶质瘤的分子机制 | 首次发现IF的抗肿瘤效果与胶质母细胞瘤(GBM)亚型(Tp53型 vs CDKN2A型)相关,并通过多组学技术系统阐明了肠道菌群-甲硫氨酸-m6A修饰-TGF-β信号轴在其中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚需开展;对CDKN2A亚型GBM中IF效果不显著的机制未深入探讨 | 探究间歇性禁食抑制胶质母细胞瘤的亚型特异性机制 | Tp53驱动型和Cdkn2a驱动型胶质母细胞瘤小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 多组学测序(空间转录组、空间代谢组、单细胞转录组、单细胞RNA甲基化、代谢组、微生物组) | 小鼠肿瘤模型 | 多组学数据 | 未明确说明 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞转录组学, 单细胞RNA甲基化, 代谢组学, 微生物组学 | NA | NA |
| 6770 | 2026-02-22 |
Biologically interpretable deep learning-derived MRI phenotypes reveal lymph node involvement and neoadjuvant therapy response in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001671
PMID:41525512
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SwinU-CliRad的深度学习模型,用于对肝内胆管癌的淋巴结受累风险进行分层,并评估其对新辅助治疗反应的预测能力 | 整合了基于Swin UNETR的MRI衍生输出与临床放射学特征,构建了可解释的深度学习模型,并探索了模型输出与肿瘤多组学特征的相关性 | 研究涉及多个队列,但外部验证队列样本量相对较小(n=88),且模型性能仍需在更广泛的多中心数据中进一步验证 | 开发一个模型以改进肝内胆管癌的淋巴结受累分层,并为治疗决策提供信息 | 肝内胆管癌患者 | 计算机视觉 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析 | Swin UNETR,SwinU-CliRad框架 | 磁共振成像,临床放射学特征 | 发现队列682例,内部测试队列204例,外部多中心队列88例,新辅助治疗队列145例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6771 | 2026-01-14 |
Decoding the tumor microenvironment remodeling orchestrated by CLEC3B+ inflammatory cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma immunotherapy: elucidation from pan-cancer spatially single-cell transcriptomics landscape
2026-Jan-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07677-2
PMID:41526921
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6772 | 2026-02-22 |
An unsupervised method for spatial transcriptomics analysis based on adversarial autoencoder
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag070
PMID:41712686
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研究论文 | 提出了一种基于对抗自编码器的无监督空间转录组学分析方法DACN,用于处理不同分辨率和通量的ST数据 | 首次将改进的对抗自编码器与图卷积网络集成,通过混合编码器结合多头注意力和残差连接,同时捕获局部表达模式和全局信息 | 未明确说明方法对特定组织类型或实验条件的适用性限制 | 开发鲁棒的空间转录组数据分析框架 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 对抗自编码器, 图卷积网络 | 基因表达空间数据 | 多个ST数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6773 | 2026-02-22 |
A cycling, progenitor-like cell population at the base of atypical teratoid rhabdoid tumor subtype differentiation trajectories
2025-Dec-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf179
PMID:40726147
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了非典型畸胎样横纹肌样瘤(ATRT)的亚型特异性分化轨迹及其共同的循环前体细胞群 | 首次构建了ATRT的单核转录组图谱,整合了单核ATAC-seq和空间转录组数据,并发现所有ATRT亚型中均存在共享的循环中间前体细胞群 | 研究主要基于患者来源的肿瘤类器官模型进行验证,仍需在更多临床样本和体内模型中进一步证实 | 深入理解ATRT的细胞异质性和发育起源,为开发亚型特异性治疗策略提供依据 | 非典型畸胎样横纹肌样瘤(ATRT)肿瘤样本和患者来源的肿瘤类器官 | 数字病理学 | 儿科中枢神经系统肿瘤 | 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | 多个ATRT患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6774 | 2026-02-22 |
Phase IB study of Avelumab and whole brain radiotherapy in patients with leptomeningeal disease from solid tumors: Results and molecular analyses
2025-Dec-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf183
PMID:40888040
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研究论文 | 本研究评估了Avelumab联合全脑放疗在实体瘤软脑膜转移患者中的安全性和疗效,并进行了分子分析 | 首次在软脑膜转移患者中评估Avelumab联合全脑放疗的联合疗法,并利用单细胞RNA测序分析治疗前后脑脊液中的免疫细胞变化 | 样本量较小(15例患者),且为单臂研究,缺乏对照组 | 评估Avelumab联合全脑放疗在软脑膜转移患者中的安全性和疗效,并探索免疫反应机制 | 实体瘤软脑膜转移患者,包括乳腺癌、肺癌、鼻咽癌、卵巢癌和胰腺癌患者 | 临床肿瘤学 | 实体瘤软脑膜转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 15例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6775 | 2026-02-22 |
MAP3K4 signaling regulates HDAC6 and TRAF4 coexpression and stabilization in trophoblast stem cells
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.108116
PMID:39710325
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研究论文 | 本研究揭示了MAP3K4信号通过调控HDAC6和TRAF4的共表达与稳定性,在滋养层干细胞中影响胎盘发育的机制 | 首次发现MAP3K4、TRAF4和HDAC6在滋养层干细胞中的共调控机制,以及它们在胎盘迷路分化过程中的表达转换 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类胎盘中的具体机制尚需进一步验证 | 探究MAP3K4信号在胎盘发育中的作用及其与TRAF4和HDAC6的调控关系 | 小鼠滋养层干细胞和胎盘组织 | 发育生物学 | 胎盘功能不全 | 单细胞RNA测序,shRNA敲低,蛋白质复合物分析 | NA | RNA测序数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6776 | 2026-02-22 |
Laser-capture microdissection for spatial transcriptomics of immunohistochemically detected neurons
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.108150
PMID:39736395
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研究论文 | 本文开发了一种名为IHC/LCM-Seq的空间转录组学方法,用于对免疫组化检测的神经元进行转录组分析 | 开发了一种创新的IHC/LCM-Seq方法,结合了免疫组化、激光捕获显微切割和RNA测序技术,首次实现了对免疫组化检测的神经元进行高灵敏度空间转录组分析 | 方法基于4%甲醛固定脑组织的游离切片,可能不适用于其他固定条件或组织类型 | 开发并验证一种用于免疫组化检测神经元空间转录组分析的新方法 | 纹状体胆碱能中间神经元和促性腺激素释放激素(GnRH)神经元 | 空间转录组学 | 不孕症 | 激光捕获显微切割,RNA测序,免疫组化 | NA | RNA测序数据 | 成年雄性大鼠和小鼠的GnRH神经元 | Illumina | bulk RNA-seq | NextSeq | Illumina NextSeq平台进行批量测序 |
| 6777 | 2026-02-22 |
Pluripotent stem cell-derived models of neurological diseases reveal early transcriptional heterogeneity
2021-03-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02301-6
PMID:33663567
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研究论文 | 本研究通过分析神经退行性疾病患者的单细胞RNA测序数据,揭示了疾病状态下神经元转录异质性的增加,并利用诱导多能干细胞模型验证了这一早期现象 | 首次在神经退行性疾病模型中系统性地展示了转录异质性在疾病早期阶段的增加,并关联到具体的基因功能类别如自噬和能量代谢 | 研究主要基于体外诱导多能干细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经退行过程 | 探究神经退行性疾病早期阶段的转录调控变化及其诊断价值 | 阿尔茨海默病和亨廷顿病患者的神经元细胞,以及诱导多能干细胞分化的神经元祖细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 诱导多能干细胞分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6778 | 2026-02-21 |
Aberrant epithelial differentiation may contribute to endometrial polyp formation: insights from single-cell analysis
2026-Dec, Systems biology in reproductive medicine
IF:2.1Q3
DOI:10.1080/19396368.2026.2628916
PMID:41712676
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析子宫内膜息肉与邻近子宫内膜的转录组差异,探讨息肉形成的分子机制 | 首次在单细胞水平揭示子宫内膜息肉中上皮细胞分化异常和血管重塑缺陷,通过伪时间分析发现上皮细胞成熟受阻 | 单细胞RNA测序仅局限于增殖期样本,可能限制结果的普适性 | 探究子宫内膜息肉形成和复发的分子机制 | 子宫内膜息肉及邻近子宫内膜组织 | 数字病理学 | 子宫内膜息肉 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 伪时间分析 | RNA测序数据 | 12名女性的配对子宫内膜息肉和邻近子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6779 | 2026-02-21 |
Exosome-related lactylation gene signature defines diagnostic biomarkers of periodontitis through integrative bulk and single-cell transcriptomics
2026-Apr, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 本研究通过整合批量与单细胞转录组学数据,构建了首个基于外泌体相关乳酸化基因的诊断模型,用于牙周炎诊断,并揭示了细胞类型特异性的乳酸化重塑机制 | 首次建立了基于外泌体相关乳酸化基因的诊断模型,并整合批量与单细胞转录组学数据解析了牙周炎中乳酸化修饰的细胞异质性 | 未明确提及样本量限制或模型在更广泛人群中的验证情况 | 探索外泌体相关乳酸化基因作为牙周炎潜在诊断生物标志物 | 牙周炎患者与健康组织的基因表达数据 | 自然语言处理 | 牙周炎 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及训练队列和两个独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6780 | 2026-02-21 |
ROS-responsive, brain- and M1 microglia-targeting modified ginkgetin-loaded smart liposomes ameliorate cerebral ischemia by HIF-1α-mediated negative regulation of microglia pyroptosis
2026-Apr, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2026.102870
PMID:41716338
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研究论文 | 本研究设计了一种ROS响应、靶向大脑和M1小胶质细胞的银杏双黄酮智能脂质体,通过抑制HIF-1α通路减轻小胶质细胞焦亡,从而改善脑缺血损伤 | 开发了具有ROS响应性和双重靶向功能(RVG29靶向大脑,MG1靶向小胶质细胞)的智能脂质体递送系统,用于精准递送银杏双黄酮至缺血病灶,并揭示了其通过HIF-1α/c-Myc/NLRP3轴抑制小胶质细胞焦亡的新机制 | 研究主要在动物模型中进行,尚未进行人体临床试验;长期安全性和免疫原性有待进一步评估;具体靶向效率和脱靶效应在复杂人体环境中的表现仍需验证 | 开发一种能够克服血脑屏障、精准靶向缺血病灶的纳米治疗策略,以改善脑缺血后的神经功能恢复 | 大脑、小胶质细胞、神经元、脑缺血损伤区域 | 神经科学、纳米医学、药物递送 | 脑缺血、缺血性卒中 | 单细胞RNA测序、共培养实验、动物模型(大脑中动脉闭塞/再灌注模型) | NA | 基因表达数据、组织病理学数据、行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |